Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3348
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3348, 703 aa
1>>>pF1KB3348 703 - 703 aa - 703 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8258+/-0.000953; mu= 17.5670+/- 0.057
mean_var=82.1628+/-16.535, 0's: 0 Z-trim(107.0): 79 B-trim: 61 in 1/50
Lambda= 0.141494
statistics sampled from 9232 (9311) to 9232 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 4.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 686) 4513 931.4 0
CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 653) 4256 878.9 0
CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 766) 1602 337.2 5.4e-92
CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 681) 1491 314.5 3.2e-85
CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 683) 1491 314.5 3.3e-85
CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6 ( 808) 1415 299.1 1.7e-80
CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 ( 738) 1147 244.3 4.8e-64
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 718) 1105 235.7 1.8e-61
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 735) 1105 235.7 1.8e-61
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 630) 1085 231.6 2.7e-60
CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 693) 1014 217.2 6.8e-56
CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257) 937 201.6 5.9e-51
CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280) 850 183.8 1.3e-45
CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232) 843 182.4 3.5e-45
CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279) 843 182.4 3.6e-45
CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286) 843 182.4 3.6e-45
CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321) 791 171.8 5.8e-42
CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2 ( 842) 724 158.0 5.2e-38
CCDS58286.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 703) 719 156.9 9.2e-38
CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464) 675 148.1 8.5e-35
CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492) 675 148.2 8.6e-35
CCDS43176.1 ABCC5 gene_id:10057|Hs108|chr3 (1437) 594 131.6 7.9e-30
CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 712) 580 128.6 3.2e-29
CCDS75994.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 713) 580 128.6 3.2e-29
CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 752) 580 128.6 3.4e-29
CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 753) 580 128.6 3.4e-29
CCDS10568.1 ABCC6 gene_id:368|Hs108|chr16 (1503) 568 126.3 3.3e-28
CCDS8694.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 568 126.3 3.3e-28
CCDS8693.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 563 125.3 6.8e-28
CCDS7484.1 ABCC2 gene_id:1244|Hs108|chr10 (1545) 552 123.1 3.2e-27
CCDS42122.1 ABCC1 gene_id:4363|Hs108|chr16 (1531) 548 122.2 5.6e-27
CCDS10730.1 ABCC12 gene_id:94160|Hs108|chr16 (1359) 513 115.1 7.2e-25
CCDS10732.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1382) 508 114.0 1.5e-24
CCDS32681.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 (1527) 487 109.8 3.1e-23
CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 812) 438 99.6 1.9e-20
CCDS55092.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 126) 359 83.0 2.9e-16
CCDS55091.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 131) 359 83.0 3e-16
CCDS10733.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1344) 321 75.9 4.5e-13
>>CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 (686 aa)
initn: 4513 init1: 4513 opt: 4513 Z-score: 4977.2 bits: 931.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4513; 99.9% identity (100.0% similar) in 686 aa overlap (1-686:1-686)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GGDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GGDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 FQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB3 HRLQAVQRAHQILVLQEGKLQKLAQLQEGQDLYSRLVQQRLMD
::::.:::::::::::::::::::::
CCDS78 HRLQTVQRAHQILVLQEGKLQKLAQL
670 680
>>CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 (653 aa)
initn: 4249 init1: 4249 opt: 4256 Z-score: 4694.0 bits: 878.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4256; 99.5% identity (99.5% similar) in 648 aa overlap (1-648:1-648)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GGDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GGDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 FQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS47 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQAKTLWKFMIF
610 620 630 640 650
670 680 690 700
pF1KB3 HRLQAVQRAHQILVLQEGKLQKLAQLQEGQDLYSRLVQQRLMD
>>CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 (766 aa)
initn: 1652 init1: 1478 opt: 1602 Z-score: 1765.1 bits: 337.2 E(32554): 5.4e-92
Smith-Waterman score: 1627; 40.9% identity (72.9% similar) in 663 aa overlap (69-702:89-743)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAP
.:: . . . .. :. . : : :
CCDS92 CLLLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRP----IRDP
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130
pF1KB3 WSWLL-----VGYGAAGLSWSLWAVLSP----------------PGAQEKEQDQVNNKVL
: : : .. ::. : : : ... : ::. . .:... .:
CCDS92 WFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATL
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 MWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVID--ILGGDFDPHAFASAIFF
. .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.:: .. ..: :..:. .
CCDS92 Q-KLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQ--FSTAVVI
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 MCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSS
.::...:::..:: ::: :: ..:.:.:.:. :: ::. :. .::.:..::.: :::.:
CCDS92 VCLLAIGSSFAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTS
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 DTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQ
:::..:. . : ::.::. :::.:. ::.:.: .:.:.... .:. . . ..:. ..
CCDS92 DTTMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYK
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 EVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERAL
.. .:.:.:.:::.....:......:::::. ::.:. : . :.: .: ..
CCDS92 RLSKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMY
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 YLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLS
:. . : ::. .: : . . .:..:.:.:..:.::. .:. .... .:. ...
CCDS92 YVWGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQ
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 NVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRP
.:::::::: ..::::.. :.::: :.: : :..:.:.: .:: ::....:.: :
CCDS92 GVGAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSP
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 GEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVL
:.:::::::.:::::. . .:.:.: ::.:::: :::: :.: ::: . :.:::::
CCDS92 GKVTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVL
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 FSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRL
:. :. .::.::: . . :. ::: :.: ::.:.. : :..::::.::..:::::.
CCDS92 FARSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRV
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 AIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGD---RTVLVIAHRLQAVQRAHQI
:.::::::.: ::::::::::::.. : .:. .:. .:::.:::::..:..:: :
CCDS92 AMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQ-AIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLI
660 670 680 690 700 710
680 690 700
pF1KB3 LVLQEGKLQKLA---QLQEGQDLYSRLVQQRLMD
.::..:.. . . :: ::..:::....
CCDS92 VVLDKGRVVQQGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
720 730 740 750 760
>>CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 (681 aa)
initn: 1528 init1: 1472 opt: 1491 Z-score: 1643.4 bits: 314.5 E(32554): 3.2e-85
Smith-Waterman score: 1516; 41.3% identity (72.9% similar) in 595 aa overlap (69-642:89-678)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAP
.:: . . . .. :. . : : :
CCDS58 CLLLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRP----IRDP
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130
pF1KB3 WSWLL-----VGYGAAGLSWSLWAVLSP----------------PGAQEKEQDQVNNKVL
: : : .. ::. : : : ... : ::. . .:... .:
CCDS58 WFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATL
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 MWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDILGGDFDPHAFASAIFFMC
. .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.:: . . . :..:. ..:
CCDS58 Q-KLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVC
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 LFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSSDT
:...:::..:: ::: :: ..:.:.:.:. :: ::. :. .::.:..::.: :::.:::
CCDS58 LLAIGSSFAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDT
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 TLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQEV
:..:. . : ::.::. :::.:. ::.:.: .:.:.... .:. . . ..:. ....
CCDS58 TMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRL
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 LREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERALYL
.:.:.:.:::.....:......:::::. ::.:. : . :.: .: .. :.
CCDS58 SKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYV
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 LVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLSNV
. : ::. .: : . . .:..:.:.:..:.::. .:. .... .:. ....:
CCDS58 WGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGV
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 GAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRPGE
::::::: ..::::.. :.::: :.: : :..:.:.: .:: ::....:.: ::.
CCDS58 GAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGK
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 VTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVLFS
:::::::.:::::. . .:.:.: ::.:::: :::: :.: ::: . :.::::::.
CCDS58 VTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFA
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 GSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRLAI
:. .::.::: . . :. ::: :.: ::.:.. : :..::::.::..:::::.:.
CCDS58 RSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAM
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 ARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIAHRLQAVQRAHQILVLQE
::::::.: ::::::::::::.. :
CCDS58 ARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLI
660 670 680
>>CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 (683 aa)
initn: 1528 init1: 1472 opt: 1491 Z-score: 1643.3 bits: 314.5 E(32554): 3.3e-85
Smith-Waterman score: 1516; 41.3% identity (72.9% similar) in 595 aa overlap (69-642:89-678)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAP
.:: . . . .. :. . : : :
CCDS58 CLLLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRP----IRDP
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130
pF1KB3 WSWLL-----VGYGAAGLSWSLWAVLSP----------------PGAQEKEQDQVNNKVL
: : : .. ::. : : : ... : ::. . .:... .:
CCDS58 WFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATL
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 MWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDILGGDFDPHAFASAIFFMC
. .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.:: . . . :..:. ..:
CCDS58 Q-KLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVC
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 LFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSSDT
:...:::..:: ::: :: ..:.:.:.:. :: ::. :. .::.:..::.: :::.:::
CCDS58 LLAIGSSFAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDT
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 TLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQEV
:..:. . : ::.::. :::.:. ::.:.: .:.:.... .:. . . ..:. ....
CCDS58 TMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRL
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 LREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERALYL
.:.:.:.:::.....:......:::::. ::.:. : . :.: .: .. :.
CCDS58 SKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYV
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 LVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLSNV
. : ::. .: : . . .:..:.:.:..:.::. .:. .... .:. ....:
CCDS58 WGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGV
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 GAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRPGE
::::::: ..::::.. :.::: :.: : :..:.:.: .:: ::....:.: ::.
CCDS58 GAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGK
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 VTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVLFS
:::::::.:::::. . .:.:.: ::.:::: :::: :.: ::: . :.::::::.
CCDS58 VTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFA
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 GSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRLAI
:. .::.::: . . :. ::: :.: ::.:.. : :..::::.::..:::::.:.
CCDS58 RSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAM
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 ARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIAHRLQAVQRAHQILVLQE
::::::.: ::::::::::::.. :
CCDS58 ARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLCAG
660 670 680
>>CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6 (808 aa)
initn: 1318 init1: 1096 opt: 1415 Z-score: 1558.4 bits: 299.1 E(32554): 1.7e-80
Smith-Waterman score: 1441; 39.0% identity (66.3% similar) in 721 aa overlap (12-698:88-801)
10 20 30
pF1KB3 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWL-LQGPLGTLLPQGLPGL--
:::.: .:: : .. :.: .:: :
CCDS47 RVPMASSRCPAPRGCRCLPGASLAWLGTVLLLLADWVLLRTALPRIFSLLVPTALPLLRV
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80
pF1KB3 WLEGTLRLGGLW----GLLKL-----------RGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALV
: : : . :: :.:. .: :. . : : :: : . .: :.
CCDS47 WAVGLSRWAVLWLGACGVLRATVGSKSENAGAQGWLAALKPLAAALGLALPGLALFRELI
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130
pF1KB3 A-GA-SRAPPARV---ASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLSP---PGAQEKEQDQVNNK
. :: . : .:. .: : . ..:.:.:: . .:: :. ::.: . :
CCDS47 SWGAPGSADSTRLLHWGSHP-TAFVVSYAAALPAAALWHKLGSLWVPGGQGGSGNPVR--
180 190 200 210 220 230
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 VLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDILGGDFDPHAFASAIFF
::: . : . ..::. ::: :: ..::. : . : . .:. . .
CCDS47 ----RLLGCLGSETRRLSLFLVLVVLSSLGEMAIPFFTGRLTDWILQDGSADTFTRNLTL
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 MCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSS
: .....:.. : .. ::.... ... ..:...:::. :::...::.. ::..
CCDS47 MSILTIASAVLEFVGDGIYNNTMGHVHSHLQGEVFGAVLRQETEFFQQNQTGNIMSRVTE
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 DTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQ
::. .:. : : ...: ::. . : :.:: : ::...:. .:. . : . .:
CCDS47 DTSTLSDSLSENLSLFLWYLVRGLCLLGIMLWGSVSLTMVTLITLPLLFLLPKKVGKWYQ
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 EVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERAL
. ......:...::. ::.... :::::. :: :. ...: :.. . : .. . :.
CCDS47 LLEVQVRESLAKSSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEAQKFREKLQEIKTLNQKEAVAYAV
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 YLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLS
. . . ... .: : : . .: ...:.:..:..:: . . :..:. :: . .
CCDS47 NSWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGAVSSGNLVTFVLYQMQFTQAVEVLLSIYPRVQK
480 490 500 510 520 530
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 NVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRP
::..::.: :.:: : : : :.: :.:.:.::::::::::::: ::.::::::::
CCDS47 AVGSSEKIFEYLDRTPRCPPSGLLTPLHLEGLVQFQDVSFAYPNRPDVLVLQGLTFTLRP
540 550 560 570 580 590
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 GEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVL
:::::::::::::::::::::::::::::::.::: ::. :::: ::: ::..::::: .
CCDS47 GEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHRQVAAVGQEPQV
600 610 620 630 640 650
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 FSGSVRNNIAYGL-QSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQR
:. :...:::::: :. ... ::: . : .::. . .: :.: : ::::..::.:
CCDS47 FGRSLQENIAYGLTQKPTMEEITAAAVKSGAHSFISGLPQGYDTEVDEAGSQLSGGQRQA
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 LAIARALVRDPRVLILDEATSALD----VQCEQALQDWNSRGDRTVLVIAHRLQAVQRAH
.:.::::.: : :::::.:::::: .: :: : . : .:.::.:...:. :..:
CCDS47 VALARALIRKPCVLILDDATSALDANSQLQVEQLLYESPERYSRSVLLITQHLSLVEQAD
720 730 740 750 760 770
680 690 700
pF1KB3 QILVLQEGKLQKLA---QLQEGQDLYSRLVQQRLMD
.:: :. : ... . ::.: . : .::
CCDS47 HILFLEGGAIREGGTHQQLMEKKGCYWAMVQAPADAPE
780 790 800
>>CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 (738 aa)
initn: 1111 init1: 398 opt: 1147 Z-score: 1263.3 bits: 244.3 E(32554): 4.8e-64
Smith-Waterman score: 1163; 34.0% identity (64.3% similar) in 718 aa overlap (2-700:35-733)
10 20 30
pF1KB3 MRLP-DLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTL
:.: .: :.:.: : :: :: . :
CCDS15 PAWPLRLLEPPSPAEPGRLLPVACVWAAASRVPGSLSPFTGL---RPARLWG-AGP-ALL
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80
pF1KB3 LPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVA-GASRA
: : : :: : ::.::.. :: : : . :... :: :
CCDS15 WGVGAARRWRSGCR--GGGPG--ASRGVLGLAR--LLGLWARGPGSCRCGAFAGPGAPRL
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 PPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLSPPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDL
: :: ..: . .: : : . .::: . . . . . .:: :. :.
CCDS15 PRARFPGGPAAAAWAGDEA----WRRGPA-APPGDKGRLRPAAAGLPEARKLLGLAYPER
120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 PLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDILGGDFDPHA-FASAIFFMCLFSFGSSLSAG
:.:: ::... . : . :..::.. . : . ... . .:: . : ..
CCDS15 RRLAAAVGFLTMSSVISMSAPFFLGKIIDVIYTN--PTVDYSDNLTRLCLGLSAVFLCGA
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 CRGGCFTYTMS----RINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWL
.. .: :. :: :.: .::::.:::...::..:.:::: .::::::.:.. .
CCDS15 AANAIRVYLMQTSGQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSV
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 PLNANVLLRSLVKV-VGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQD
: . ::. ... ::. ..:. .:: :. . : .: . .:. ... . ::
CCDS15 TENLSDGLRAGAQASVGI-SMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQD
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 AVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERALYLLVRRVL
..:.: :...: .:...:::.:: : :. .: ... :: .. . :: .. . .
CCDS15 SLAQATQLAEERIGNVRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFARAGFFGATGLS
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 HLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKV
. . .: : : ....: : : ::..: :: . : .:.......::. ..
CCDS15 GNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRL
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 FSYMDRQPNLP-SPGT-LAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRPGEVTAL
. ..:.:.:: . :. : ..::...:..: :::: ::. :... ..... : ::::
CCDS15 WELLEREPKLPFNEGVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTAL
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 VGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVLFSGSVR
:::.::::::: .:: ::.:..: . :: . : : . .:.:.. .:.:::.::: :.
CCDS15 VGPSGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKIGTVSQEPILFSCSIA
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KB3 NNIAYGLQ---SCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRLAIA
.::::: . : .... .:..:.: ::... .:. : ::::: :..:::::.:::
CCDS15 ENIAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIA
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 RALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSR--GDRTVLVIAHRLQAVQRAHQILVLQ
:::...:..:.:::::::::.. : .:. .: ::::::::::.... :... ::.
CCDS15 RALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLD
650 660 670 680 690 700
680 690 700
pF1KB3 EGKLQKLAQ----LQEGQDLYSRLVQQRLMD
.::. . .. :.. . .: .:....
CCDS15 QGKITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
710 720 730
>>CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 (718 aa)
initn: 1047 init1: 396 opt: 1105 Z-score: 1217.2 bits: 235.7 E(32554): 1.8e-61
Smith-Waterman score: 1113; 35.0% identity (65.6% similar) in 654 aa overlap (79-703:49-696)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRA-LVAGASRAPPA-RVASAPWSWL---L
::. : : ::: : : . . : :. :
CCDS59 LLPPLRFQTFSAVRYSDGYRSSSLLRAVAHLRSQLWAHLPRAPLAPRWSPSAWCWVGGAL
20 30 40 50 60 70
110 120 130 140 150
pF1KB3 VGYGAAGLSWSLWAVL------SPPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLL-KLSRPDLPLLVAAF
.: . . : : .::... .: .. . :.:. .. .: : .: .:
CCDS59 LGPMVLSKHPHLCLVALCEAEEAPPASSTP---HVVGSRFNWKLFWQFLHPHLLVLGVAV
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200
pF1KB3 FFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDILG-------GDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGC
. . :.: .. :: :....... :.: .. . .. :.. . :. :
CCDS59 VLALGAALVNVQIPLLLGQLVEVVAKYTRDHVGSFMTESQNLSTHLLILYGVQGLLTFG-
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 RGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNAN
.... :. . .:. :::::::::. ::. .:::.: :::..:. ... . : .
CCDS59 YLVLLSHVGERMAVDMRRALFSSLLRQDITFFDANKTGQLVSRLTTDVQEFKSSFKLVIS
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 VLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAG
::: ..:.: . .: ::::: .. : ... .... ... :. :. .:::
CCDS59 QGLRSCTQVAGCLVSLSMLSTRLTLLLMVATPALMGVGTLMGSGLRKLSRQCQEQIARAM
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 QVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLER--ALYLLVRRVLHLGV
:. ::.:...:::.:. :..: :: :: :: ..: : ::. . . .
CCDS59 GVADEALGNVRTVRAFAMEQREEERYGAELEACRCR--AEELGRGIALFQGLSNIAFNCM
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 QMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYM
. : : . . .:: :.:.::.. ...: . .: ..:... ...:. .:: ::
CCDS59 VLGTLFIGGSLVAGQQLTGGDLMSFLVASQTVQRSMANLSVLFGQVVRGLSAGARVFEYM
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 DRQPNLP-SPGTLAPTT-LQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPN
.: .: : : .: :.: : ::.: :.:: :: ::: .:.:: ::...:::: .
CCDS59 ALNPCIPLSGGCCVPKEQLRGSVTFQNVCFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKIVALVGQS
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 GSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVS-VGQEPVLFSGSVRNNI
:.::.:::.::. .:.::.: :.:: . . . .:..:::. ..::::::. .. .::
CCDS59 GGGKTTVASLLERFYDPTAGVVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMENI
500 510 520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 AYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRD
.: :..:..::. :.: .:: . .: : :::.:. :..::::::::::::...
CCDS59 RFGKLEASDEEVYTAAREANAHEFITSFPEGYNTVVGERGTTLSGGQKQRLAIARALIKQ
560 570 580 590 600 610
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 PRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGD--RTVLVIAHRLQAVQRAHQILVLQEGKLQK
: ::::::::::::.. :...:. .:.. ::::::::::..:. :: :.:. .:.. .
CCDS59 PTVLILDEATSALDAESERVVQEALDRASAGRTVLVIAHRLSTVRGAHCIVVMADGRVWE
620 630 640 650 660 670
690 700
pF1KB3 LA---QLQEGQDLYSRLVQQRLMD
. .: . ::..:.... .:
CCDS59 AGTHEELLKKGGLYAELIRRQALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
680 690 700 710
>>CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 (735 aa)
initn: 1047 init1: 396 opt: 1105 Z-score: 1217.0 bits: 235.7 E(32554): 1.8e-61
Smith-Waterman score: 1113; 35.0% identity (65.6% similar) in 654 aa overlap (79-703:66-713)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRA-LVAGASRAPPA-RVASAPWSWL---L
::. : : ::: : : . . : :. :
CCDS64 RNGKTGQLHKAEGEYSDGYRSSSLLRAVAHLRSQLWAHLPRAPLAPRWSPSAWCWVGGAL
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150
pF1KB3 VGYGAAGLSWSLWAVL------SPPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLL-KLSRPDLPLLVAAF
.: . . : : .::... .: .. . :.:. .. .: : .: .:
CCDS64 LGPMVLSKHPHLCLVALCEAEEAPPASSTP---HVVGSRFNWKLFWQFLHPHLLVLGVAV
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200
pF1KB3 FFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDILG-------GDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGC
. . :.: .. :: :....... :.: .. . .. :.. . :. :
CCDS64 VLALGAALVNVQIPLLLGQLVEVVAKYTRDHVGSFMTESQNLSTHLLILYGVQGLLTFG-
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 RGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNAN
.... :. . .:. :::::::::. ::. .:::.: :::..:. ... . : .
CCDS64 YLVLLSHVGERMAVDMRRALFSSLLRQDITFFDANKTGQLVSRLTTDVQEFKSSFKLVIS
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 VLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAG
::: ..:.: . .: ::::: .. : ... .... ... :. :. .:::
CCDS64 QGLRSCTQVAGCLVSLSMLSTRLTLLLMVATPALMGVGTLMGSGLRKLSRQCQEQIARAM
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 QVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLER--ALYLLVRRVLHLGV
:. ::.:...:::.:. :..: :: :: :: ..: : ::. . . .
CCDS64 GVADEALGNVRTVRAFAMEQREEERYGAELEACRCR--AEELGRGIALFQGLSNIAFNCM
340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 QMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYM
. : : . . .:: :.:.::.. ...: . .: ..:... ...:. .:: ::
CCDS64 VLGTLFIGGSLVAGQQLTGGDLMSFLVASQTVQRSMANLSVLFGQVVRGLSAGARVFEYM
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 DRQPNLP-SPGTLAPTT-LQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPN
.: .: : : .: :.: : ::.: :.:: :: ::: .:.:: ::...:::: .
CCDS64 ALNPCIPLSGGCCVPKEQLRGSVTFQNVCFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKIVALVGQS
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 GSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVS-VGQEPVLFSGSVRNNI
:.::.:::.::. .:.::.: :.:: . . . .:..:::. ..::::::. .. .::
CCDS64 GGGKTTVASLLERFYDPTAGVVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMENI
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 AYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRD
.: :..:..::. :.: .:: . .: : :::.:. :..::::::::::::...
CCDS64 RFGKLEASDEEVYTAAREANAHEFITSFPEGYNTVVGERGTTLSGGQKQRLAIARALIKQ
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 PRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGD--RTVLVIAHRLQAVQRAHQILVLQEGKLQK
: ::::::::::::.. :...:. .:.. ::::::::::..:. :: :.:. .:.. .
CCDS64 PTVLILDEATSALDAESERVVQEALDRASAGRTVLVIAHRLSTVRGAHCIVVMADGRVWE
630 640 650 660 670 680
690 700
pF1KB3 LA---QLQEGQDLYSRLVQQRLMD
. .: . ::..:.... .:
CCDS64 AGTHEELLKKGGLYAELIRRQALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
690 700 710 720 730
>>CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 (630 aa)
initn: 1047 init1: 396 opt: 1085 Z-score: 1195.9 bits: 231.6 E(32554): 2.7e-60
Smith-Waterman score: 1085; 36.4% identity (67.8% similar) in 574 aa overlap (147-703:39-608)
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 AVLSPPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRV
: :: ... . : :.: .. :: :..
CCDS64 AAPVLPRQHAGAFISGRDSGWPIPRQAATAPPLPDILSCQLALG-AALVNVQIPLLLGQL
10 20 30 40 50 60
180 190 200 210 220
pF1KB3 IDILG-------GDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQL
..... :.: .. . .. :.. . :. : .... :. . .:. :
CCDS64 VEVVAKYTRDHVGSFMTESQNLSTHLLILYGVQGLLTFG-YLVLLSHVGERMAVDMRRAL
70 80 90 100 110 120
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 FSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSIS
::::::::. ::. .:::.: :::..:. ... . : . ::: ..:.: . .:
CCDS64 FSSLLRQDITFFDANKTGQLVSRLTTDVQEFKSSFKLVISQGLRSCTQVAGCLVSLSMLS
130 140 150 160 170 180
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 PRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEE
::::: .. : ... .... ... :. :. .::: :. ::.:...:::.:. :.
CCDS64 TRLTLLLMVATPALMGVGTLMGSGLRKLSRQCQEQIARAMGVADEALGNVRTVRAFAMEQ
190 200 210 220 230 240
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 HEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLER--ALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQG
.: :: :: :: ..: : ::. . . . . : : . . .:: :
CCDS64 REEERYGAELEACRCRA--EELGRGIALFQGLSNIAFNCMVLGTLFIGGSLVAGQQLTGG
250 260 270 280 290 300
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 SLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLP-SPGTLAPTT-LQ
.:.::.. ...: . .: ..:... ...:. .:: :: .: .: : : .: :.
CCDS64 DLMSFLVASQTVQRSMANLSVLFGQVVRGLSAGARVFEYMALNPCIPLSGGCCVPKEQLR
310 320 330 340 350 360
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 GVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGG
: : ::.: :.:: :: ::: .:.:: ::...:::: .:.::.:::.::. .:.::.:
CCDS64 GSVTFQNVCFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKIVALVGQSGGGKTTVASLLERFYDPTAG
370 380 390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 QVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVS-VGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAH
:.:: . . . .:..:::. ..::::::. .. .:: .: :..:..::. :.
CCDS64 VVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMENIRFGKLEASDEEVYTAAREAN
430 440 450 460 470 480
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 ADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQA
: .:: . .: : :::.:. :..::::::::::::...: ::::::::::::.. :..
CCDS64 AHEFITSFPEGYNTVVGERGTTLSGGQKQRLAIARALIKQPTVLILDEATSALDAESERV
490 500 510 520 530 540
650 660 670 680 690
pF1KB3 LQDWNSRGD--RTVLVIAHRLQAVQRAHQILVLQEGKLQKLA---QLQEGQDLYSRLVQQ
.:. .:.. ::::::::::..:. :: :.:. .:.. . . .: . ::..:...
CCDS64 VQEALDRASAGRTVLVIAHRLSTVRGAHCIVVMADGRVWEAGTHEELLKKGGLYAELIRR
550 560 570 580 590 600
700
pF1KB3 RLMD
. .:
CCDS64 QALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
610 620 630
703 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:58:37 2016 done: Thu Nov 3 12:58:38 2016
Total Scan time: 4.120 Total Display time: 0.220
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]