Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3305
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3305, 577 aa
1>>>pF1KB3305 577 - 577 aa - 577 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9417+/-0.000863; mu= 12.5417+/- 0.052
mean_var=122.6906+/-25.585, 0's: 0 Z-trim(110.0): 63 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.115789
statistics sampled from 11214 (11275) to 11214 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.346), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 ( 577) 3747 637.2 1.7e-182
CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7 ( 579) 2815 481.5 1.2e-135
CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 ( 438) 1981 342.1 8.7e-94
CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 599) 1705 296.1 8.4e-80
CCDS77870.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 605) 1683 292.4 1.1e-78
CCDS77869.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 536) 1379 241.6 1.9e-63
CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 556) 917 164.4 3.4e-40
>>CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 (577 aa)
initn: 3747 init1: 3747 opt: 3747 Z-score: 3389.9 bits: 637.2 E(32554): 1.7e-182
Smith-Waterman score: 3747; 100.0% identity (100.0% similar) in 577 aa overlap (1-577:1-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQGPENGRRGGFGSRGQPRQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQGPENGRRGGFGSRGQPRQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 KVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAMSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 QSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPPPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPAQAVGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPPPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPAQAVGAI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 IGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKII
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB3 GHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKGQSNQAQARRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKGQSNQAQARRK
550 560 570
>>CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7 (579 aa)
initn: 2949 init1: 2709 opt: 2815 Z-score: 2548.5 bits: 481.5 E(32554): 1.2e-135
Smith-Waterman score: 2815; 74.4% identity (90.1% similar) in 585 aa overlap (1-577:1-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
:::::::::.:...:.:::..: . :: :: ::::.:::::::::: ::.::::..:::
CCDS53 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
.::.:: .:.::::::.:: ::.:::::::.:.::::::::.:::.::.::::::.::::
CCDS53 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB3 VVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQ-GPENGRRG--GFGSRGQP
:::::::...:.:::. :::: :::: .:::.:::::. :: .: . :: :.:.::.
CCDS53 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RQGSPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENA
::::: :. .::. :.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RQGSP---GSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 GAAEKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGR
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CCDS53 GAAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 NLKKVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAA
::::.::::.:::::: ::.:::::::::::::: .:.: .::.:::::.::.::::.:.
CCDS53 NLKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIAS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 MSLQSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPP---PPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPA
:.::.:::::::: :.:::: .:. :: :::..: :: .: :. : : :..::::
CCDS53 MNLQAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMT--PPYPQFEQS-ETETVHLFIPA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 QAVGAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKL
.:::::::.:::::::::::.::::::: :.::.::::::::::::::::::::::::.
CCDS53 LSVGAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 KEENFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQ
::::: .::::::::.:::::. :::::::::::::::::::..::::::::::::::::
CCDS53 KEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570
pF1KB3 VIVKIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQ-QHQKG-QSNQAQARRK
:.::: ::::: :.:::::..::.:::: :.::. ::. :.:::
CCDS53 VVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK
540 550 560 570
>>CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 (438 aa)
initn: 1972 init1: 1972 opt: 1981 Z-score: 1797.3 bits: 342.1 E(32554): 8.7e-94
Smith-Waterman score: 2547; 75.9% identity (75.9% similar) in 577 aa overlap (1-577:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQGPENGRRGGFGSRGQPRQG
:::::::::::::::
CCDS54 VVNVTYSNREQTRQA---------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA
CCDS54 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK
::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ----------------------------------DEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK
140 150 160
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 KVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAMSL
170 180 190 200 210 220
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 QSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPPPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPAQAVGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPPPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPAQAVGAI
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 IGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFF
290 300 310 320 330 340
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKII
350 360 370 380 390 400
550 560 570
pF1KB3 GHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKGQSNQAQARRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKGQSNQAQARRK
410 420 430
>>CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (599 aa)
initn: 2546 init1: 948 opt: 1705 Z-score: 1546.1 bits: 296.1 E(32554): 8.4e-80
Smith-Waterman score: 2557; 65.8% identity (85.6% similar) in 603 aa overlap (1-577:2-599)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSG
:::::::::. .:: ::...:...:. .:: :.:::::::: ::..::..::::.::
CCDS32 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 KVELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESET
::::.:: .:...:: :: ::::::::::::.:.:::::.:::::::::: :::::..::
CCDS32 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 AVVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQG--PENGRRGGFGSRGQP
:::::::..::... :. ::.:::.::...:.::::::.... :. ..:: .::
CCDS32 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSR---
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RQGSPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENA
.:: : :. .. .:.:.:::.:::::.::::::::: ::.::::::::..:.:::::.
CCDS32 EQGH--APGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 GAAEKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGR
::::: ...:.:::: : ::.::::::.::: .:: :.:.::::::::..::::::::::
CCDS32 GAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 NLKKVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAA
::::.:..: :::::::::::..:::::::::::..: : :: :::::.:::.:::. :
CCDS32 NLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB3 MSLQSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPP--PSSVTGAAPYSSFM---------------
.. :..:::::::.:.:.: .. :.. :: : .. :::: :
CCDS32 VNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB3 -------QAPEQEMVQVFIPAQAVGAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRM
. ::::.:..:::.::::::::::: :::::.:::.::::::: : :: . ::
CCDS32 GPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERM
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 VIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNEL
:::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.:.:::::::::::::::
CCDS32 VIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNEL
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 QNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKGQSNQAQ
::::.:::.::::::::::..:::.:::::.::: ::::::.:. :::::.:: .. :.
CCDS32 QNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVAS
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 ARRK
: :
CCDS32 QRSK
>>CCDS77870.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (605 aa)
initn: 2537 init1: 948 opt: 1683 Z-score: 1526.2 bits: 292.4 E(32554): 1.1e-78
Smith-Waterman score: 2535; 65.2% identity (84.7% similar) in 609 aa overlap (1-577:2-605)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSG
:::::::::. .:: ::...:...:. .:: :.:::::::: ::..::..::::.::
CCDS77 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 KVELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQV------
::::.:: .:...:: :: ::::::::::::.:.:::::.:::::::::: :::
CCDS77 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVFAFSLV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 NTESETAVVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQG--PENGRRGGF
::..:::::::::..::... :. ::.:::.::...:.::::::.... :. ..::
CCDS77 NTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 GSRGQPRQGSPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDV
.:: .:: : :. .. .:.:.:::.:::::.::::::::: ::.::::::::..:.
CCDS77 SSR---EQGH--APGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDI
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 HRKENAGAAEKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRL
:::::.::::: ...:.:::: : ::.::::::.::: .:: :.:.::::::::..::::
CCDS77 HRKENSGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 IGKEGRNLKKVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAY
::::::::::.:..: :::::::::::..:::::::::::..: : :: :::::.:::.
CCDS77 IGKEGRNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB3 ENDVAAMSLQSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPP--PSSVTGAAPYSSFM---------
:::. :.. :..:::::::.:.:.: .. :.. :: : .. :::: :
CCDS77 ENDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KB3 -------------QAPEQEMVQVFIPAQAVGAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETP
. ::::.:..:::.::::::::::: :::::.:::.::::::: : :
CCDS77 YPHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 DSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGG
: . :::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.:.:::::::::
CCDS77 DVSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGG
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 KTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKG
::::::::::.:::.::::::::::..:::.:::::.::: ::::::.:. :::::.::
CCDS77 KTVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKY
540 550 560 570 580 590
570
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.. :. : :
CCDS77 PQGVASQRSK
600
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:::::::::::.:.:::::.::::::::::
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:::::..:::::::::..::... :. ::.:::.::...:.::::::.... :. ..
CCDS77 VEQVNTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQ
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:: .:: .:: : :. .. .:.:.:::.:::::.::::::::: ::.::::::::
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..:.:::::.::::: ...:.:::: : ::.::::::.::: .:: :.:.::::::::..
CCDS77 RVDIHRKENSGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGL
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::::::::::::::.:..: :::::::::::..:::::::::::..: : :: :::::.
CCDS77 VGRLIGKEGRNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKL
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:::.:::. :.. :..:::::::.:.:.: .. :.. :: : .. :::: :
CCDS77 REAFENDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGY
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. ::::.:..:::.::::::::::: :::::.:::.:::::::
CCDS77 FSSLYPHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAP
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: :: . :::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.:.:::::
CCDS77 AEGPDVSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVI
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pF1KB3 GKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQ
::::::::::::::.:::.::::::::::..:::.:::::.::: ::::::.:. :::::
CCDS77 GKGGKTVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQ
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570
pF1KB3 HQKGQSNQAQARRK
.:: .. :. : :
CCDS77 EQKYPQGVASQRSK
530
>>CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (556 aa)
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10 20 30 40 50
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:::::::::. .:: ::...:...:. .:: :.:::::::: ::..::..::::.::
CCDS33 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
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pF1KB3 KVELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESET
::::.:: .:...:: :: ::::::::::::.:.:::::.:::::::::: :::::..::
CCDS33 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 AVVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQG--PENGRRGGFGSRGQP
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CCDS33 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSR---
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CCDS33 EQGH--APGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENS
180 190 200 210 220 230
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CCDS33 GAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGR
240 250 260 270 280 290
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CCDS33 VNTHS-----------GYF---SSLYPHHQFG-----PFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]