FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3218, 896 aa 1>>>pF1KB3218 896 - 896 aa - 896 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0608+/-0.00116; mu= -3.6478+/- 0.069 mean_var=429.7067+/-90.684, 0's: 0 Z-trim(112.7): 49 B-trim: 93 in 1/53 Lambda= 0.061871 statistics sampled from 13365 (13404) to 13365 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.412), width: 16 Scan time: 5.260 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1 ( 896) 5879 540.1 6.7e-153 CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 864) 1223 124.5 8.4e-28 CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 910) 1223 124.5 8.7e-28 CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 754) 1202 122.6 2.8e-27 CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 601) 1055 109.3 2.1e-23 >>CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1 (896 aa) initn: 5879 init1: 5879 opt: 5879 Z-score: 2858.5 bits: 540.1 E(32554): 6.7e-153 Smith-Waterman score: 5879; 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CCDS58 KEIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMV 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 PPSDRASLQKNIIGSSPVADFSAIKELDTLNNEIVDLQREKNNVEQDLKEKEDTIKQRTS :::.:.. . :: ..:...:::: ...::..::::: ..:::..:::..:.:.:: CCDS58 PPSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTS 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 EVQDLQDEVQRENTNLQKLQAQKQQVQELLDELDEQKAQLEEQLKEVRKKCAEEAQLISS :::.::....::...::.:.::::..:. :::.:.:::.:...:..::.:: .:.:.::: CCDS58 EVQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISS 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 LKAELTSQESQISTYEEELAKAREELSRLQQETAELEESVESGKAQLEPLQQHLQDSQQE ::... ::::.... :..: .:. ::.::::: ..::.:...:..::: . . :...:.: CCDS58 LKTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDE 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 ISSMQMKLMEMKD--LENHNSQLNWCSSPHSILVNGATDYCSLSTSSSETANLNEHVEGQ :.. . :: .... : : : .. ...:: ..: .. :::.: : CCDS58 INQARSKLSQLHESRQEAHRSL-----EQYDQVLDGAH-----GASLTDLANLSEGV--- 540 550 560 570 580 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 SNLESEPIHQESPARSSPELLPSGVTDENEVTTAVTEKVCSELDNNRHSKEEDPFNVDSS : : :. :. . :. ..:: . . :::... 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