Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1042
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1042, 953 aa
1>>>pF1KA1042 953 - 953 aa - 953 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2536+/-0.00103; mu= 4.1517+/- 0.062
mean_var=223.1151+/-46.030, 0's: 0 Z-trim(111.7): 51 B-trim: 120 in 2/51
Lambda= 0.085864
statistics sampled from 12577 (12612) to 12577 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.387), width: 16
Scan time: 5.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43072.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3 ( 953) 6206 782.4 0
CCDS74922.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3 ( 670) 3561 454.6 2.9e-127
CCDS2695.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3 ( 686) 3561 454.6 2.9e-127
CCDS58826.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3 ( 556) 3059 392.4 1.3e-108
CCDS2347.1 TRAK2 gene_id:66008|Hs108|chr2 ( 914) 1815 238.4 4.7e-62
>>CCDS43072.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3 (953 aa)
initn: 6206 init1: 6206 opt: 6206 Z-score: 4166.9 bits: 782.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6206; 100.0% identity (100.0% similar) in 953 aa overlap (1-953:1-953)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAESPDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAESPDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLTP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGDHISLPRLATSTPVQHPETSAHHPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGDHISLPRLATSTPVQHPETSAHHPGK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 CMSQTNSTFTFTTCRILHPSDELTRVTPSLNSAPTPACGSTSHLKSTPVATPCTPRRLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CMSQTNSTFTFTTCRILHPSDELTRVTPSLNSAPTPACGSTSHLKSTPVATPCTPRRLSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 AESFTNTRESTTTMSTSLGLVWLLKERGISAAVYDPQSWDRAGRGSLLHSYTPKMAVIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AESFTNTRESTTTMSTSLGLVWLLKERGISAAVYDPQSWDRAGRGSLLHSYTPKMAVIPS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 TPPNSPMQTPTSSPPSFEFKCTSPPYDNFLASKPASSILREVREKNVRSSESQTDVSVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPPNSPMQTPTSSPPSFEFKCTSPPYDNFLASKPASSILREVREKNVRSSESQTDVSVSN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LNLVDKVRRFGVAKVVNSGRAHVPTLTEEQGPLLCGPPGPAPALVPRGLVPEGLPLRCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LNLVDKVRRFGVAKVVNSGRAHVPTLTEEQGPLLCGPPGPAPALVPRGLVPEGLPLRCPT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KA1 VTSAIGGLQLNSGIRRNRSFPTMVGSSMQMKAPVTLTSGILMGAKLSKQTSLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VTSAIGGLQLNSGIRRNRSFPTMVGSSMQMKAPVTLTSGILMGAKLSKQTSLR
910 920 930 940 950
>>CCDS74922.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3 (670 aa)
initn: 3561 init1: 3561 opt: 3561 Z-score: 2398.3 bits: 454.6 E(32554): 2.9e-127
Smith-Waterman score: 3561; 99.8% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (96-654:22-580)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERD
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MQKFIEADYYELDWYYEECSDVLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERD
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEES
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 EPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKE
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 QQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVEN
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHS
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAESPDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLTPSPMNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAESPDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLTPSPMNI
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSKKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSKKPG
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTESIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTESIM
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGILDPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGILDPRP
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGDHISLPRLATSTPVQHPETSAHHPGKCMSQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGDHISLPRLATSTPVQHPETSGERSQARVTVS
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 NSTFTFTTCRILHPSDELTRVTPSLNSAPTPACGSTSHLKSTPVATPCTPRRLSLAESFT
CCDS74 GSRSYPSRPQASPEEMQEPPAATEEEEEEEEEEGSGEGTTISPVNLAPFPEAEFWAILTS
600 610 620 630 640 650
>>CCDS2695.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3 (686 aa)
initn: 3561 init1: 3561 opt: 3561 Z-score: 2398.2 bits: 454.6 E(32554): 2.9e-127
Smith-Waterman score: 3562; 95.4% identity (96.5% similar) in 593 aa overlap (62-654:13-596)
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADTIYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEET
. :: .: . : . :: .::
CCDS26 MSLRDKGGEEECFEYDCQDEERKPTHRQHDTQDL----LEE-
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLE
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 ----VLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLE
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 EQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 EQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLD
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 SLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKEQQLVNDCVKELRDANVQIASISEELA
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 KKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 KKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELED
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 KYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 KYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHSLGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEA
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 ESPDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLTPSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 ESPDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLTPSPMNIPGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYG
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 SDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLS
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 ERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 ERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLP
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 EKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 EKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGILDPRPGVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEED
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 DTGDHISLPRLATSTPVQHPETSAHHPGKCMSQTNSTFTFTTCRILHPSDELTRVTPSLN
:::::::::::::::::::::::
CCDS26 DTGDHISLPRLATSTPVQHPETSGERSQARVTVSGSRSYPSRPQASPEEMQEPPAATEEE
580 590 600 610 620 630
>>CCDS58826.1 TRAK1 gene_id:22906|Hs108|chr3 (556 aa)
initn: 3059 init1: 3059 opt: 3059 Z-score: 2063.4 bits: 392.4 E(32554): 1.3e-108
Smith-Waterman score: 3059; 99.8% identity (100.0% similar) in 487 aa overlap (96-582:22-508)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERD
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MQKFIEADYYELDWYYEECSDVLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLEEKERD
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTSAAEES
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 EPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETITYEEKE
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 QQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QQLVNDCVKELRDANVQIASISEELAKKTEDAARQQEEITHLLSQIVDLQKKAKACAVEN
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTSRRYHS
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAESPDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLTPSPMNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGLFPMDSLAAEIEGTMRKELQLEEAESPDITHQKRVFETVRNINQVVKQRSLTPSPMNI
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSKKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGSNQSSAMNSLLSSCVSTPRSSFYGSDIGNVVLDNKTNSIILETEAADLGNDERSKKPG
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTESIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLQELAEKGELRSGSLTPTESIM
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGSATLHHWQQLAQPHLGGILDPRP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGDHAGPRPLSVLLGDSLWSLIHLR
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GVVTKGFRTLDVDLDEVYCLNDFEEDDTGDHISLPRLATSTPVQHPETSAHHPGKCMSQT
CCDS58 KAGHLCHAYSFFFRDSHPRCWFEFL
540 550
>>CCDS2347.1 TRAK2 gene_id:66008|Hs108|chr2 (914 aa)
initn: 2299 init1: 1319 opt: 1815 Z-score: 1227.5 bits: 238.4 E(32554): 4.7e-62
Smith-Waterman score: 2484; 49.2% identity (71.7% similar) in 939 aa overlap (31-943:31-909)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALVFQFGQPVRAQPLPGLCHGKLIRTNACDVCNSTDLPEVEIISLLEEQLPHYKLRADT
:::.. ::::::..::::::::.:.:..::
CCDS23 MSQSQNAIFTSPTGEENLMNSNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYRLKVDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 IYGYDHDDWLHTPLISPDANIDLTTEQIEETLKYFLLCAERVGQMTKTYNDIDAVTRLLE
.. :...:: ..: :. :. :::..:..: ..:: :::::::::: ::.::
CCDS23 LFLYENQDWTQSPHQRQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EKERDLELAARIGQSLLKKNKTLTERNELLEEQVEHIREEVSQLRHELSMKDELLQFYTS
:..:::::::::::.:::.:..:.:.:: ::::. . ..:.::.::: :::::.. .
CCDS23 ERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNESLEEQLGQAFDQVNQLQHELCKKDELLRIVSI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AAEESEPESVCSTPLKRNESSSSVQNYFHLDSLQKKLKDLEEENVVLRSEASQLKTETIT
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CCDS23 YEEKEQQLVSDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEELSSLLSQIVDLQHKLKE
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pF1KA1 CAVENEELVQHLGAAKDAQRQLTAELRELEDKYAECMEMLHEAQEELKNLRNKTMPNTTS
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CCDS23 ETFLQEMY--GLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKRLGIARVVKNPGAQENGRCQEAE----
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CCDS23 C-TSSPKMGVLKED
910
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]