Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA2003
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA2003, 437 aa
1>>>pF1KSDA2003 437 - 437 aa - 437 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0651+/-0.00249; mu= 16.1378+/- 0.150
mean_var=330.5422+/-59.788, 0's: 0 Z-trim(103.6): 949 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.070544
statistics sampled from 6430 (7496) to 6430 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 3073 327.8 1.3e-89
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 1818 200.4 4.1e-51
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 1711 189.3 7.2e-48
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 1711 189.4 7.5e-48
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 1711 189.4 7.5e-48
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 1711 189.5 7.6e-48
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 1711 189.5 7.8e-48
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 1711 189.5 7.9e-48
CCDS12962.2 ZNF776 gene_id:284309|Hs108|chr19 ( 518) 1603 178.4 1.5e-44
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 1598 177.8 2e-44
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 1598 177.8 2e-44
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 1598 177.8 2.1e-44
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 1598 177.8 2.1e-44
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 1598 177.9 2.1e-44
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 1598 177.9 2.1e-44
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1545 172.7 9.9e-43
CCDS12440.2 ZNF792 gene_id:126375|Hs108|chr19 ( 632) 1536 171.7 1.8e-42
CCDS74469.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 574) 1530 171.0 2.7e-42
CCDS12965.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 575) 1530 171.0 2.7e-42
CCDS56110.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 574) 1528 170.8 3.1e-42
CCDS12964.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 575) 1528 170.8 3.1e-42
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1523 170.2 4e-42
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1477 165.7 1.1e-40
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1477 165.8 1.2e-40
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1477 165.8 1.2e-40
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1473 165.4 1.6e-40
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1473 165.4 1.6e-40
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1464 164.5 3.1e-40
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1460 164.0 3.8e-40
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1460 164.0 3.9e-40
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1460 164.1 4.1e-40
CCDS46209.1 ZNF548 gene_id:147694|Hs108|chr19 ( 533) 1453 163.1 5.9e-40
CCDS54324.1 ZNF548 gene_id:147694|Hs108|chr19 ( 545) 1453 163.2 5.9e-40
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1441 162.0 1.5e-39
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1441 162.1 1.5e-39
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1441 162.1 1.5e-39
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1441 162.1 1.5e-39
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 1428 160.5 3.2e-39
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1425 160.5 4.7e-39
CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10 ( 441) 1413 158.9 9.1e-39
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1412 159.1 1.1e-38
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1412 159.3 1.2e-38
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1407 158.5 1.6e-38
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1407 158.6 1.6e-38
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1407 158.6 1.6e-38
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1402 158.0 2.2e-38
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1398 157.2 2.4e-38
CCDS82408.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 432) 1399 157.5 2.4e-38
CCDS82407.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 474) 1399 157.5 2.5e-38
CCDS33135.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 487) 1399 157.6 2.6e-38
>>CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 (437 aa)
initn: 3073 init1: 3073 opt: 3073 Z-score: 1722.5 bits: 327.8 E(32554): 1.3e-89
Smith-Waterman score: 3073; 99.8% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAATLRTPTQGTVTFEDVAVHFSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHRQKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS42 MAAATLRTPTQGTVTFEDVAVHFSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHHQKQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HLGEKHFRSNVGRALFVKTCTFHVSGEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HLGEKHFRSNVGRALFVKTCTFHVSGEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DGGAISHRGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DGGAISHRGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGK
370 380 390 400 410 420
430
pF1KSD SFSHNSSLIKHQRIHSR
:::::::::::::::::
CCDS42 SFSHNSSLIKHQRIHSR
430
>>CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 (627 aa)
initn: 5628 init1: 1552 opt: 1818 Z-score: 1031.0 bits: 200.4 E(32554): 4.1e-51
Smith-Waterman score: 1818; 63.2% identity (82.2% similar) in 399 aa overlap (38-436:117-514)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD TPTQGTVTFEDVAVHFSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHRQKQHLGEKHF
:: : .. .:. ..::::.:.:::
CCDS12 QKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHF
90 100 110 120 130 140
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RSNVGRALFVKTCTFHVSGEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISH
::: :: .:...:::.:::.: ::.:::::::.. ::.:::::: ..:: .. ... :
CCDS12 RSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHTRKKSN-RTKSAVAFH
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEK
:.::: :: .:::: ::. ::.: : :: :.::::::::: : ::.:: :.::.::
CCDS12 SVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEK
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYEC
:: : :::::.::::::: :::.::.::::.::::::::. : .:. :.:::::::::.:
CCDS12 PYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKC
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECG
::::::::. :.:. :. .::: :::::::::: : . :::: ::.::.:.::: :::::
CCDS12 SECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECG
330 340 350 360 370 380
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFP
:::::. ::.:.:.: :: ::.:::::: :. :: ..::. :::: : .:: ::::.:
CCDS12 KSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFS
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSS
. .: :.::::: ::::::::::::: .: ::.: .:::: .:::: ::::::.:.:.
CCDS12 RKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSST
450 460 470 480 490 500
430
pF1KSD LIKHQRIHSR
:..:::.:.
CCDS12 LLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKH
510 520 530 540 550 560
>--
initn: 1191 init1: 628 opt: 628 Z-score: 376.5 bits: 79.3 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 628; 73.5% identity (90.3% similar) in 113 aa overlap (185-297:515-627)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAV
::.:::: :::: : ::::::.::: ::.
CCDS12 HTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGE
490 500 510 520 530 540
220 230 240 250 260 270
pF1KSD RPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYE
::.::.:: : :::.:.:.::::::::::::::::::::::: : : .:. .:.::::::
CCDS12 RPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYE
550 560 570 580 590 600
280 290 300 310 320 330
pF1KSD CSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSEC
::.::::::..:.:.:::.::.:
CCDS12 CSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
610 620
>>CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 (503 aa)
initn: 3103 init1: 1700 opt: 1711 Z-score: 972.9 bits: 189.3 E(32554): 7.2e-48
Smith-Waterman score: 1711; 61.7% identity (82.9% similar) in 381 aa overlap (56-436:91-471)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHRQKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTCTFHVS
..:.::. : ::: : : :...: :::
CCDS58 ILHLAEHQGTNCGQKLHTCGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCIVHVS
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KSD GEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCGEHTKAFSGK
.: ::::. :::::.. ::::.:..:::. :... .. . ::.:.: :. .::::
CCDS58 EKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSKAFSHI
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KSD HTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLI
::::.:: :: : . ::.:::. .. .: .: ..:. :.:::: :::: : ::.:
CCDS58 DTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYSSFI
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KSD QHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRG
:.::::. ::. : :::: ::. .: .::.::::::::::.:::::::::: :.:::
CCDS58 IHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNLMQHRR
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD VHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTG
::::::::::::::: :. . ::: ::.::.: ::.::.:::::::..::::.:.:.:::
CCDS58 VHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTG
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD ERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPY
::::.::.:::::.: :.. .:: :::::::: :.:::: : .::.:..::::::: ::
CCDS58 ERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGERPV
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430
pF1KSD ECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR
:::::.:::. .:.:::: ::::::.::::.:::::::..::::.:.:.:.
CCDS58 ECSECSKSFSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRPYQCSQ
430 440 450 460 470 480
CCDS58 CGKSFGCKSVLIQHQRVHIGEKP
490 500
>>CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 (555 aa)
initn: 3103 init1: 1700 opt: 1711 Z-score: 972.6 bits: 189.4 E(32554): 7.5e-48
Smith-Waterman score: 1711; 61.7% identity (82.9% similar) in 381 aa overlap (56-436:143-523)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHRQKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTCTFHVS
..:.::. : ::: : : :...: :::
CCDS58 ILHLAEHQGTNCGQKLHTCGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCIVHVS
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KSD GEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCGEHTKAFSGK
.: ::::. :::::.. ::::.:..:::. :... .. . ::.:.: :. .::::
CCDS58 EKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSKAFSHI
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KSD HTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLI
::::.:: :: : . ::.:::. .. .: .: ..:. :.:::: :::: : ::.:
CCDS58 DTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYSSFI
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KSD QHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRG
:.::::. ::. : :::: ::. .: .::.::::::::::.:::::::::: :.:::
CCDS58 IHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNLMQHRR
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330 340 350 360 370 380
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CCDS58 ERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGERPV
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10 20 30 40 50
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CCDS46 MAAAALRDPAQGYVTFEDVAVYFSQEEWRLLDDAQRLLYRNVMLENFTLLASLGCWHGAE
10 20 30 40 50 60
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..:::: ::: .. . ::. ...: :.: . :::::
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.: . : :..:..::::.:. .: . : :: ::.:.: :::. :. :::.:: .
CCDS46 ALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSSKSREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHA
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.. : :::::: : .: : .::::.:: : .::::: ... ::.:.::::. .:
CCDS46 GKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQIVHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKP
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:.:::: : ..:.:..:...::: :::::::::: :: :.:..:. .:::::::.::
CCDS46 FTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTGVRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRIHTGERPYKCS
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pF1KSD ECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGK
:::::....:.:::: .::.: :::.::.::: :.: :::..:..:::::.:.::.:::.
CCDS46 ECGKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPYKCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGR
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD SFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQ
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CCDS46 FFRENSTLVRHQRVHTGAKPYECRECGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKPFKCNECGRLFRE
370 380 390 400 410 420
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::.:.::.::::: ::::: :::: : :::::.::.:::.
CCDS46 NSSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKFFRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
430 440 450 460
437 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:58:31 2016 done: Thu Nov 3 07:58:31 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]