FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1433, 639 aa 1>>>pF1KSDA1433 639 - 639 aa - 639 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.9743+/-0.000429; mu= -25.1749+/- 0.027 mean_var=468.9089+/-96.874, 0's: 0 Z-trim(123.5): 22 B-trim: 687 in 1/61 Lambda= 0.059228 statistics sampled from 43506 (43533) to 43506 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.51), width: 16 Scan time: 12.870 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016857295 (OMIM: 615100) PREDICTED: CTTNBP2 N-t ( 639) 4105 365.1 4.3e-100 NP_061174 (OMIM: 615100) CTTNBP2 N-terminal-like p ( 639) 4105 365.1 4.3e-100 XP_011540083 (OMIM: 615100) PREDICTED: CTTNBP2 N-t ( 639) 4105 365.1 4.3e-100 XP_011514920 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b ( 932) 833 85.6 8.9e-16 XP_016868196 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1118) 833 85.6 1e-15 XP_011514918 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1358) 833 85.6 1.2e-15 XP_016868195 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1595) 833 85.7 1.4e-15 XP_005250691 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1645) 833 85.7 1.5e-15 XP_011514917 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-b (1645) 833 85.7 1.5e-15 NP_219499 (OMIM: 609772) cortactin-binding protein (1663) 833 85.7 1.5e-15 XP_005248772 (OMIM: 607307) PREDICTED: filamin-A-i (1154) 503 57.4 3.3e-07 NP_001287795 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting (1177) 503 57.4 3.4e-07 NP_056502 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting pro (1213) 503 57.4 3.4e-07 XP_005248770 (OMIM: 607307) PREDICTED: filamin-A-i (1213) 503 57.4 3.4e-07 NP_001276916 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting (1216) 503 57.4 3.5e-07 NP_001035924 (OMIM: 612993) filamin A-interacting (1133) 497 56.9 4.6e-07 NP_878913 (OMIM: 612993) filamin A-interacting pro (1135) 497 56.9 4.6e-07 >>XP_016857295 (OMIM: 615100) PREDICTED: CTTNBP2 N-termi (639 aa) initn: 4105 init1: 4105 opt: 4105 Z-score: 1917.9 bits: 365.1 E(85289): 4.3e-100 Smith-Waterman score: 4105; 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100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MNLEKLSKPELLTLFSILEGELEARDLVIEALKAQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD FETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD RHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 RHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD MLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MLVLECKKATNKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAERKRGLQTEAQVEKQLS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD EFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVTVSKGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVTVSKGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD ATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTTR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYSYAKTNGHCDPEIQTTR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD ELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPVPMPSPLSSSGSSLSPSSTAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPVPMPSPLSSSGSSLSPSSTAS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD SSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQ 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD SPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTA 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KSD NPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSATTPLT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KSD KTHSQAASLTTAEDLASSCSSNTVVANGKDVELLLPTSS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KTHSQAASLTTAEDLASSCSSNTVVANGKDVELLLPTSS 610 620 630 >>XP_011514920 (OMIM: 609772) PREDICTED: cortactin-bindi (932 aa) initn: 1263 init1: 464 opt: 833 Z-score: 404.3 bits: 85.6 E(85289): 8.9e-16 Smith-Waterman score: 1314; 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XP_011 TEMEAQMEKQLSEFDTEREQLRAKLNREEAHTTDLKEEIDKMRKMIEQLKRGSD-SKPSL 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KSD QLKKPVT----VSKGTATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNIAKMTNTGLPGPATPAYS .: . . :: ...:: . :: :::. . : ... .: :. ..: : XP_011 SLPRKTKDRRLVSISVGTEGTVTRSVACQTDLVTENADHMKKLP-LTMPVKPSTGSPLVS 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KSD YAKTNGHCDPEIQTT----RELTAGNNVENQVPPREKSVALAQEKPVENGGCPVGIETPV .. : .. :. . :. . .:: : .: ::: : :: XP_011 ANAKGSVCTSATMARPGIDRQASYGDLIGASVPAFPPPSA---NKIEENG--PSTGSTPD 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 pF1KSD PMPS--PLSSSGSSLSPSSTASSSLTSSPCSSPVLTKRLLGSSASSPGYQSSYQVGINQR : : :: :... : .. . ... . ..: . : :: ..: . :.: : XP_011 PTSSTPPLPSNAA---PPTAQTPGIAPQNSQAPPM------HSLHSPCANTSLHPGLNPR 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KSD FHAARHKFQSQA-DQDQQASGLQSPPSRDLSPTLIDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQG ..::: .::..: : ::... :::::::.::: :: .:::::::::::.:::::: :. 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NP_219 KKTNELEEELSAEKRRSTEMEAQMEKQLSEFDTEREQLRAKLNREEAHTTDLKEEIDKMR 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 pF1KSD KIVKDLEASHQHSSPNEQLKKPVT----VSKGTATEPLMLMSVFCQTESFPAERTHGSNI :....:. . . :.:. .: . . :: ...:: . :: :::. . : ... 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