Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDA1264
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1264, 719 aa
  1>>>pF1KSDA1264 719 - 719 aa - 719 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5596+/-0.00114; mu= -0.8715+/- 0.067
 mean_var=256.1064+/-58.315, 0's: 0 Z-trim(110.4): 686  B-trim: 303 in 1/49
 Lambda= 0.080143
 statistics sampled from 10821 (11610) to 10821 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.357), width:  16
 Scan time:  3.540

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20         ( 719) 4871 577.3 2.7e-164
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19         ( 438) 1730 214.0 3.9e-55
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19         ( 591) 1726 213.6 6.8e-55
CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15         ( 681) 1542 192.4 1.9e-48
CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15         ( 636) 1082 139.2 1.9e-32
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11           ( 545) 1065 137.2 6.5e-32
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 544) 1064 137.1   7e-32
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 559) 1064 137.1 7.2e-32
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 565) 1064 137.1 7.2e-32
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX           ( 580) 1064 137.1 7.4e-32
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3            ( 524) 1031 133.2 9.6e-31
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11          ( 553) 1005 130.2   8e-30
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 491)  674 91.9 2.4e-18
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2         ( 873)  679 92.7 2.5e-18
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 519)  674 91.9 2.5e-18
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2          ( 894)  679 92.7 2.6e-18
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20          ( 487)  671 91.6 3.1e-18
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13          ( 443)  670 91.4 3.1e-18
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13         ( 431)  662 90.5 5.8e-18
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11        ( 812)  664 90.9   8e-18
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11         ( 820)  664 90.9   8e-18
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX         ( 416)  645 88.5 2.2e-17
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2          ( 426)  632 87.0 6.3e-17
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19       ( 821)  632 87.2   1e-16
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19       ( 833)  632 87.3 1.1e-16
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5          ( 968)  618 85.7 3.6e-16
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10           (1204)  617 85.6 4.7e-16
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10            (1235)  617 85.7 4.8e-16
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12         ( 898)  600 83.6 1.5e-15
CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17        ( 853)  575 80.7   1e-14
CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17        (1001)  575 80.7 1.2e-14
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16         (1049)  568 79.9 2.1e-14
CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16         (1122)  568 80.0 2.2e-14
CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16         (1235)  568 80.0 2.4e-14
CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1268)  551 78.0 9.6e-14
CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1276)  551 78.0 9.7e-14
CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1297)  551 78.0 9.8e-14
CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1305)  551 78.0 9.8e-14
CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1323)  551 78.0 9.9e-14
CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1331)  551 78.0   1e-13
CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1352)  551 78.1   1e-13
CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1360)  551 78.1   1e-13
CCDS48168.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX         ( 339)  533 75.5 1.5e-13
CCDS63200.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2         ( 349)  520 74.0 4.3e-13
CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17        (1303)  528 75.4 6.2e-13
CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17        (1312)  528 75.4 6.2e-13
CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17        (1332)  528 75.4 6.3e-13
CCDS82487.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2         (1165)  522 74.6 9.2e-13
CCDS56130.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2         (1239)  522 74.7 9.7e-13
CCDS74546.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2         (1273)  522 74.7 9.9e-13


>>CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20              (719 aa)
 initn: 4871 init1: 4871 opt: 4871  Z-score: 3063.0  bits: 577.3 E(32554): 2.7e-164
Smith-Waterman score: 4871; 100.0% identity (100.0% similar) in 719 aa overlap (1-719:1-719)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MFGKKKKKIEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MFGKKKKKIEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGHA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD EENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPYYRGSHAAKQNGHVMKMKHGEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPYYRGSHAAKQNGHVMKMKHGEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD YYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPSRTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPSRTA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQTSPQPTMRQRSRSGSGLQEPMMPFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQTSPQPTMRQRSRSGSGLQEPMMPFG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDYDRAQMVLSPPLSGSDTYPRGPAKLPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDYDRAQMVLSPPLSGSDTYPRGPAKLPQS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWGSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWGSSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD DQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD DLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD NEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710         
pF1KSD PRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH
              670       680       690       700       710         

>>CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19              (438 aa)
 initn: 2085 init1: 1681 opt: 1730  Z-score: 1103.3  bits: 214.0 E(32554): 3.9e-55
Smith-Waterman score: 1732; 65.6% identity (77.4% similar) in 425 aa overlap (302-717:23-436)

             280       290       300       310       320       330 
pF1KSD YLNQTSPQPTMRQRSRSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKV
                                     ..:  : :  .     .  : : .   :: 
CCDS33         MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKP
                       10        20        30        40        50  

             340           350           360       370       380   
pF1KSD DYDRAQMVL----SPPLSGSDTYPRGPAK----LPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLY
         : : ..     .:     :. : ::.     .:::      :::: . :.  . :   
CCDS33 LVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQS------SSSSSRPPTRARGA---
             60        70        80              90       100      

           390       400        410       420       430       440  
pF1KSD HHPSLQSSSQYISTASYLS-SLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSP
         ::    . . :  .    . . .. . : :    : ...:.:::::::::::::::.:
CCDS33 --PSPGVLGPHASEPQLAPPACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDP
             110       120       130       140       150       160 

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD GDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYH
       :::: :: ::::::::::::::::: . .:: :::::::::::::::::::::::::::.
CCDS33 GDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQ
             170       180       190       200       210       220 

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD HDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQ
       :.:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.::: :: :
CCDS33 HENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQ
             230       240       250       260       270       280 

            570       580       590       600       610       620  
pF1KSD GVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGT
       ::::::::::::::: :::.::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::: 
CCDS33 GVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGP
             290       300       310       320       330       340 

            630       640       650       660       670       680  
pF1KSD EVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLV
       ::::::::::::::.::::::::::::.::. :::.::::.:.:::::  :.:::: .::
CCDS33 EVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLV
             350       360       370       380       390       400 

            690       700       710         
pF1KSD REPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH
       :.:.::::: ::: ::::  ::::. ::::::: :  
CCDS33 RDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
             410       420       430        

>>CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19              (591 aa)
 initn: 2262 init1: 1681 opt: 1726  Z-score: 1099.0  bits: 213.6 E(32554): 6.8e-55
Smith-Waterman score: 2115; 52.8% identity (67.1% similar) in 724 aa overlap (1-717:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MFGKKKKKIEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCIT
       ::::.::..:::.::::::::::::: .::::::::.::.::. ..: ::::.:::.:::
CCDS12 MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGHA
        :: .  ::::::.:  :. ... ::..:.:.:::::::::..::: : ..         
CCDS12 SIQPGAPKTIVRGSKGAKDGALTLLLDEFENMSVTRSNSLRRDSPPPPARAR--------
               70        80        90       100       110          

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD EENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPYYRGSHAAKQNGHVMKMKHGEA
       .:::.        :  :::                     ::.              :.:
CCDS12 QENGM------PEEPATTA---------------------RGGP-------------GKA
                  120                                         130  

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD YYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPSRTA
                .. .::..  ::.                                    ..
CCDS12 ---------GSRGRFAG--HSE------------------------------------AG
                     140                                           

              250       260       270       280        290         
pF1KSD GTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQTSPQPTMR-QRSRSGSGLQEPMMPF
       : ::  ...        ::     ..:::::  .. .:: . : .:  ::  .  :. : 
CCDS12 GGSGDRRRA--------GP-----EKRPKSSREGSGGPQESSRDKRPLSGPDVGTPQ-PA
         150                    160       170       180        190 

     300       310       320       330        340       350        
pF1KSD GASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDYDR-AQMVLSPPLSGSDTYPRGPAK--
       : ..      :. .:.:            :..: :. .. . . :    :. : ::.   
CCDS12 GLASGAKLAAGRPFNTY------------PRADTDHPSRGAQGEP---HDVAPNGPSAGG
             200                   210       220          230      

          360       370       380       390       400        410   
pF1KSD --LPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLS-SLSLSSSTYPP
         .:::      :::: . :.  . :     ::    . . :  .    . . .. . : 
CCDS12 LAIPQS------SSSSSRPPTRARGA-----PSPGVLGPHASEPQLAPPACTPAAPAVPG
        240             250            260       270       280     

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD PSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGK
       :    : ...:.:::::::::::::::.::::: :: ::::::::::::::::: . .::
CCDS12 PPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGK
         290       300       310       320       330       340     

           480       490       500       510       520       530   
pF1KSD QVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTD
        :::::::::::::::::::::::::::.:.:::.::.::::::::::::::::::::::
CCDS12 LVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTD
         350       360       370       380       390       400     

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD IVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQV
       :::::::::::::.:::.::.::: :: :::::::::::::::: :::.:::::::::::
CCDS12 IVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQV
         410       420       430       440       450       460     

           600       610       620       630       640       650   
pF1KSD SKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMR
       :::::.::::::::::::::.::::::: ::::::::::::::.::::::::::::.::.
CCDS12 SKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMK
         470       480       490       500       510       520     

           660       670       680       690       700       710   
pF1KSD RIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLM
        :::.::::.:.:::::  :.:::: .:::.:.::::: ::: ::::  ::::. :::::
CCDS12 MIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLM
         530       540       550       560       570       580     

             
pF1KSD RQYRHH
       :: :  
CCDS12 RQNRTR
         590 

>>CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15              (681 aa)
 initn: 1716 init1: 1518 opt: 1542  Z-score: 983.2  bits: 192.4 E(32554): 1.9e-48
Smith-Waterman score: 1922; 46.8% identity (68.3% similar) in 739 aa overlap (1-719:1-677)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD MFGKKKKK-IEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCI
       :: :::::  :::.:.::.:::::.:::.: ::.::: ::...: ::  ::::.:::: :
CCDS10 MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNIL-DTLRRPKPVVDPSRI
               10        20        30        40         50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD TPIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGH
       : .:: ::::.:::.    .  :.:::.:....::  ::.:: .:: .  .         
CCDS10 TRVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRR---------
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150         160       170       
pF1KSD AEENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPY--YRGSHAAKQNGHVMKMKH
       :.  :..   ..... :    :      :..      ::.  : . ...   ::  .:  
CCDS10 AQSLGLLGDEHWATDPDM---YLQSPQSERT------DPHGLYLSCNGGTPAGH-KQMPW
              120          130             140       150        160

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD GEAYYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPS
        :    .: :  . .:       .. .::. :.:..  .   ::  .   :   .: .: 
CCDS10 PEPQSPRVLP--NGLA-------AKAQSLG-PAEFQGAS---QRCLQ---LGACLQSSPP
              170                180           190          200    

       240       250       260       270               280         
pF1KSD RTAGTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQT--------SPQPTMRQRS---
        ..  .: .....  ..        . . ::.:  ....        ::.:  :. :   
CCDS10 GASPPTGTNRHGMKAAKH------GSEEARPQSCLVGSATGRPGGEGSPSPKTRESSLKR
          210       220             230       240       250        

           290       300       310       320       330          340
pF1KSD ---RSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDY---DRAQMVL
          ::         : ..:     ::..  .:.  :. ..:   . :..    :.   ..
CCDS10 RLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVAKAQSLPSDQPVGTF
      260       270       280       290       300       310        

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD SPPLSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASY
       :: :. :::   .: :  ..   .: .  ... :.:  ..    : ....:. :.     
CCDS10 SP-LTTSDT--SSPQKSLRTAPATG-QLPGRSSPAGSPRTW---HAQISTSNLYLPQD--
      320          330       340        350          360           

              410       420       430       440       450       460
pF1KSD LSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGST
                  :  . :. . .. . :.::::.:::..::. ::::  : ...:::::::
CCDS10 -----------PTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGST
                370       380       390       400       410        

              470       480       490       500       510       520
pF1KSD GIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELW
       ::::.: :::.:.::::: ::::::::::::::::::::::.: :::.::.:::::.:::
CCDS10 GIVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELW
      420       430       440       450       460       470        

              530       540       550       560       570       580
pF1KSD VVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDG
       :.::::.::::::::...:.::::::::: .::.::.::: :::::::::::::::: ::
CCDS10 VLMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDG
      480       490       500       510       520       530        

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD RIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGE
       :.::::::::::.::.:::::::::::::::::::::  :.:::::::::::::::.:::
CCDS10 RVKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGE
      540       550       560       570       580       590        

              650       660       670       680       690       700
pF1KSD PPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFL
       ::::.. :.:::.:.::: ::..:. :::: ::: ::. ::::.:..:::::::: ::::
CCDS10 PPYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFL
      600       610       620       630       640       650        

              710             
pF1KSD KLAGPPSCIVPLMRQYRHH    
         .: : :.:::.. ::..    
CCDS10 LQTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
      660       670       680 

>>CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15              (636 aa)
 initn: 1461 init1: 1065 opt: 1082  Z-score: 696.1  bits: 139.2 E(32554): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1569; 42.4% identity (62.7% similar) in 739 aa overlap (1-719:1-632)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD MFGKKKKK-IEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCI
       :: :::::  :::.:.::.:::::.:::.: ::.::: ::...: ::  ::::.:::: :
CCDS61 MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNIL-DTLRRPKPVVDPSRI
               10        20        30        40         50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD TPIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGH
       : .:: ::::.:::.    .  :.:::.:....::  ::.:: .:: .  .         
CCDS61 TRVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRR---------
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150         160       170       
pF1KSD AEENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPY--YRGSHAAKQNGHVMKMKH
       :.  :..   ..... :    :      :..      ::.  : . ...   ::  .:  
CCDS61 AQSLGLLGDEHWATDPDM---YLQSPQSERT------DPHGLYLSCNGGTPAGH-KQMPW
              120          130             140       150        160

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD GEAYYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPS
        :    .: :  . .:       .. .::. :.:..  .   ::  .   :   .: .: 
CCDS61 PEPQSPRVLP--NGLA-------AKAQSLG-PAEFQGAS---QRCLQ---LGACLQSSPP
              170                180           190          200    

       240       250       260       270               280         
pF1KSD RTAGTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQT--------SPQPTMRQRS---
        ..  .: .....  ..        . . ::.:  ....        ::.:  :. :   
CCDS61 GASPPTGTNRHGMKAAKH------GSEEARPQSCLVGSATGRPGGEGSPSPKTRESSLKR
          210       220             230       240       250        

           290       300       310       320       330          340
pF1KSD ---RSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDY---DRAQMVL
          ::         : ..:     ::..  .:.  :. ..:   . :..    :.   ..
CCDS61 RLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVAKAQSLPSDQPVGTF
      260       270       280       290       300       310        

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD SPPLSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASY
       :: :. :::   .: :  ..   .: .  ... :.:  ..    : ....:. :.     
CCDS61 SP-LTTSDT--SSPQKSLRTAPATG-QLPGRSSPAGSPRTW---HAQISTSNLYLPQD--
      320          330       340        350          360           

              410       420       430       440       450       460
pF1KSD LSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGST
                  :  . :. . .. . :.::::.:::..::. ::::  : ...:::::::
CCDS61 -----------PTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGST
                370       380       390       400       410        

              470       480       490       500       510       520
pF1KSD GIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELW
       ::::.: :::.:.::::: ::::::::::::::::::::::.: :::.::.:::::.:::
CCDS61 GIVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELW
      420       430       440       450       460       470        

              530       540       550       560       570       580
pF1KSD VVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDG
       :.::::.::::::::...:.::::::::: .::.::.::: :::::::::::::::: ::
CCDS61 VLMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDG
      480       490       500       510       520       530        

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD RIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGE
       :.::::::::::.::.:::::::::::::::::::::  :.:::                
CCDS61 RVKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEV----------------
      540       550       560       570       580                  

              650       660       670       680       690       700
pF1KSD PPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFL
                                    : ::: ::. ::::.:..:::::::: ::::
CCDS61 -----------------------------SPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFL
                                         590       600       610   

              710             
pF1KSD KLAGPPSCIVPLMRQYRHH    
         .: : :.:::.. ::..    
CCDS61 LQTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
           620       630      

>>CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11                (545 aa)
 initn: 1201 init1: 1024 opt: 1065  Z-score: 686.4  bits: 137.2 E(32554): 6.5e-32
Smith-Waterman score: 1067; 38.0% identity (65.9% similar) in 508 aa overlap (209-713:60-534)

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD EAYYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPSR
                                     :.. .. : : .:   : : :    :  . 
CCDS82 DAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILPGDKTNKKKEKERPEISLPSD----FEHTI
      30        40        50        60        70        80         

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD TAGTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQTSPQPTMRQRSRSGSGLQEPMMP
        .: .. . :  .. : .:.  :.  .   . .  :  .   ...  . . .. .. .: 
CCDS82 HVGFDAVTGEFTGMPE-QWARLLQTSNITKSEQKKNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMS
          90       100        110       120       130       140    

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD FGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDYDRAQMVLSPPLSGSDTYPRGPAKLP
       :     :.  . .: :. .   .:: :  .: :. :. .       . .:. :  :.  :
CCDS82 FTD---KSAEDYNSSNALNVKAVSE-TPAVPPVSEDEDD-------DDDDATP-PPVIAP
             150       160        170              180        190  

      360        370       380       390       400       410       
pF1KSD QSQ-SKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWG
       . . .:: :. :  . :       :   :. . ... :: .         ..: :: .  
CCDS82 RPEHTKSVYTRSVIE-P-------LPVTPTRDVATSPISPTE--------NNTTPPDALT
            200               210       220               230      

       420         430       440       450       460       470     
pF1KSD SSSDQQPSR--VSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQV
        ....: ..  .: :..   :. .:: :::..  . : :::.:..: :  : .  ::..:
CCDS82 RNTEKQKKKPKMSDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEV
        240       250       260       270       280       290      

         480       490       500       510       520       530     
pF1KSD AVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIV
       :.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::::::.: ::.:::.:
CCDS82 AIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVV
        300       310       320       330       340       350      

         540       550       560       570       580       590     
pF1KSD THTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSK
       :.: :.: :::.::   :.:: .::.. :::::::::.:::  :: .::.:::::::.. 
CCDS82 TETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITP
        360       370       380       390       400       410      

         600       610       620       630       640       650     
pF1KSD EVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRI
       :  ::...:::::::::::..:  :: .:::::::::.::::.:::::.:: ::.:.  :
CCDS82 EQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLI
        420       430       440       450       460       470      

         660       670       680       690       700       710     
pF1KSD RDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQ
         .  :.... .:.:...: ::.  :  .  .:..:.::: : :::.: : : ..::.  
CCDS82 ATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAA
        480       490       500       510       520       530      

                
pF1KSD YRHH     
                
CCDS82 AKEATKNNH
        540     

>>CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (544 aa)
 initn: 1212 init1: 1036 opt: 1064  Z-score: 685.8  bits: 137.1 E(32554): 7e-32
Smith-Waterman score: 1064; 46.2% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (374-713:193-532)

           350       360       370       380       390       400   
pF1KSD LSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSS
                                     :   :  ..: .  ..: ..     . .. 
CCDS14 EPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP
            170       180       190       200       210       220  

           410       420       430       440       450       460   
pF1KSD LSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIV
        :  ...      ... ... :... :..   :. .:: :::..  . : :::.:..: :
CCDS14 PSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTV
            230       240       250       260       270       280  

           470       480       490       500       510       520   
pF1KSD CIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVM
         : .  ::..::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .::::::::::::
CCDS14 YTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVM
            290       300       310       320       330       340  

           530       540       550       560       570       580   
pF1KSD EFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIK
       :.: ::.:::.::.: :.: :::.::   :.::..::.. :::::::::.:::  :: .:
CCDS14 EYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVK
            350       360       370       380       390       400  

           590       600       610       620       630       640   
pF1KSD LSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPY
       :.:::::::.. :  ::...:::::::::::..:  :: .:::::::::.:::..:::::
CCDS14 LTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPY
            410       420       430       440       450       460  

           650       660       670       680       690       700   
pF1KSD FNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLA
       .:: ::.:.  :  .  :.... ...:.:.: ::.  :  . ..:..:.::: :::::::
CCDS14 LNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLA
            470       480       490       500       510       520  

           710               
pF1KSD GPPSCIVPLMRQYRHH      
        : : ..::.            
CCDS14 KPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
            530       540    

>>CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX                (559 aa)
 initn: 1187 init1: 1036 opt: 1064  Z-score: 685.7  bits: 137.1 E(32554): 7.2e-32
Smith-Waterman score: 1064; 46.2% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (374-713:208-547)

           350       360       370       380       390       400   
pF1KSD LSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSS
                                     :   :  ..: .  ..: ..     . .. 
CCDS48 EPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP
       180       190       200       210       220       230       

           410       420       430       440       450       460   
pF1KSD LSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIV
        :  ...      ... ... :... :..   :. .:: :::..  . : :::.:..: :
CCDS48 PSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTV
       240       250       260       270       280       290       

           470       480       490       500       510       520   
pF1KSD CIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVM
         : .  ::..::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .::::::::::::
CCDS48 YTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVM
       300       310       320       330       340       350       

           530       540       550       560       570       580   
pF1KSD EFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIK
       :.: ::.:::.::.: :.: :::.::   :.::..::.. :::::::::.:::  :: .:
CCDS48 EYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVK
       360       370       380       390       400       410       

           590       600       610       620       630       640   
pF1KSD LSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPY
       :.:::::::.. :  ::...:::::::::::..:  :: .:::::::::.:::..:::::
CCDS48 LTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPY
       420       430       440       450       460       470       

           650       660       670       680       690       700   
pF1KSD FNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLA
       .:: ::.:.  :  .  :.... ...:.:.: ::.  :  . ..:..:.::: :::::::
CCDS48 LNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLA
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CCDS48 LNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLA
      500       510       520       530       540       550        

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pF1KSD GPPSCIVPLMRQYRHH      
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CCDS48 KPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
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719 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Thu Nov  3 05:39:23 2016 done: Thu Nov  3 05:39:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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