Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDA1130
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1130, 542 aa
  1>>>pF1KSDA1130 542 - 542 aa - 542 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4773+/-0.000865; mu= 17.8228+/- 0.052
 mean_var=73.8378+/-14.999, 0's: 0 Z-trim(106.7): 32  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.149257
 statistics sampled from 9113 (9144) to 9113 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.281), width:  16
 Scan time:  3.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32107.1 GALNT16 gene_id:57452|Hs108|chr14      ( 558) 3489 760.9       0
CCDS58705.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2       ( 532) 1996 439.4 5.1e-123
CCDS1773.2 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2        ( 552) 1996 439.4 5.3e-123
CCDS58706.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2       ( 557) 1822 401.9  1e-111
CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1          ( 571) 1775 391.8 1.2e-108
CCDS5930.1 GALNT11 gene_id:63917|Hs108|chr7        ( 608) 1300 289.5 7.5e-78
CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2       ( 556) 1253 279.4 7.7e-75
CCDS77472.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2      ( 561) 1253 279.4 7.8e-75
CCDS4325.1 GALNT10 gene_id:55568|Hs108|chr5        ( 603) 1231 274.7 2.2e-73
CCDS11915.1 GALNT1 gene_id:2589|Hs108|chr18        ( 559) 1230 274.4 2.4e-73
CCDS34104.1 GALNTL6 gene_id:442117|Hs108|chr4      ( 601) 1218 271.9 1.5e-72
CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12        ( 578) 1204 268.8 1.2e-71
CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12   ( 575) 1197 267.3 3.4e-71
CCDS6737.1 GALNT12 gene_id:79695|Hs108|chr9        ( 581) 1184 264.5 2.4e-70
CCDS8813.1 GALNT6 gene_id:11226|Hs108|chr12        ( 622) 1140 255.1 1.8e-67
CCDS2203.1 GALNT5 gene_id:11227|Hs108|chr2         ( 940) 1136 254.3 4.6e-67
CCDS2226.1 GALNT3 gene_id:2591|Hs108|chr2          ( 633) 1133 253.6 5.2e-67
CCDS81755.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12       ( 603) 1040 233.5 5.3e-61
CCDS5929.1 GALNTL5 gene_id:168391|Hs108|chr7       ( 443) 1005 225.9 7.6e-59
CCDS82742.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3      ( 617)  966 217.6 3.4e-56
CCDS33711.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3      ( 639)  966 217.6 3.5e-56
CCDS5540.1 WBSCR17 gene_id:64409|Hs108|chr7        ( 598)  955 215.2 1.7e-55
CCDS7807.1 GALNT18 gene_id:374378|Hs108|chr11      ( 607)  938 211.6 2.2e-54
CCDS3815.1 GALNT7 gene_id:51809|Hs108|chr4         ( 657)  751 171.3 3.1e-42
CCDS8533.1 GALNT8 gene_id:26290|Hs108|chr12        ( 637)  728 166.4 9.3e-41
CCDS41866.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12       ( 237)  335 81.5 1.2e-15


>>CCDS32107.1 GALNT16 gene_id:57452|Hs108|chr14           (558 aa)
 initn: 3489 init1: 3489 opt: 3489  Z-score: 4059.2  bits: 760.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3489; 100.0% identity (100.0% similar) in 513 aa overlap (1-513:1-513)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLWQDNRAHAASSGGRGAQRAGRRSEQLREDRTIPLIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLWQDNRAHAASSGGRGAQRAGRRSEQLREDRTIPLIV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD TGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD KCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPII
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD DVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVID
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD KSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PELTVPVKEALPGIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFSDHLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PELTVPVKEALPGIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFSDHLI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD QQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQPEGPCLRVADLGRRA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
CCDS32 QQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQKWRRKGSFIQHSVSGLCLETKPAQLVT
              490       500       510       520       530       540

                         
pF1KSD PD                
                         
CCDS32 SKCQADAQAQQWQLLPHT
              550        

>>CCDS58705.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2            (532 aa)
 initn: 1971 init1: 1868 opt: 1996  Z-score: 2322.0  bits: 439.4 E(32554): 5.1e-123
Smith-Waterman score: 1996; 61.6% identity (83.0% similar) in 448 aa overlap (68-513:36-480)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KSD RGAQRAGRRSEQLREDRTIPLIVTGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESD
                                     :::. ::.::. ..:.:::. .:::: ::.
CCDS58 SLARSSVPFADSGLSSSQPSDADWDDLWDQFDERRYLNAKKWRVGDDPYKLYAFNQRESE
          10        20        30        40        50        60     

       100       110       120       130       140       150       
pF1KSD KLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQE
       ..: .: : ::::  :  . : .::: ::.:::::::::::::::..:::::::..::.:
CCDS58 RISSNRAIPDTRHLRCTLLVYCTDLPPTSIIITFHNEARSTLLRTIRSVLNRTPTHLIRE
          70        80        90       100       110       120     

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD IILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVN
       ::::::::.::.::  : ..::::::::..:.::.:::.::::.: .:.:::::::::::
CCDS58 IILVDDFSNDPDDCKQLIKLPKVKCLRNNERQGLVRSRIRGADIAQGTTLTFLDSHCEVN
         130       140       150       160       170       180     

       220       230       240       250       260       270       
pF1KSD TEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQK
        .:: :.:.:::::.:::: :.::.:.::.:.:. ....:::::::::::.:::.  :::
CCDS58 RDWLQPLLHRVKEDYTRVVCPVIDIINLDTFTYIESASELRGGFDWSLHFQWEQLSPEQK
         190       200       210       220       230       240     

       280       290       300       310       320       330       
pF1KSD MTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEI
         : :::.:::::.::::.:::::.::..::::: .::::::::::.:::::::::::::
CCDS58 ARRLDPTEPIRTPIIAGGLFVIDKAWFDYLGKYDMDMDIWGGENFEISFRVWMCGGSLEI
         250       260       270       280       290       300     

       340       350       360       370       380       390       
pF1KSD VPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSV
       ::::::::::::.::: ::.::: :::.:::::::::::::::::: ::: :. . ::.:
CCDS58 VPCSRVGHVFRKKHPYVFPDGNANTYIKNTKRTAEVWMDEYKQYYYAARPFALERPFGNV
         310       320       330       340       350       360     

       400       410       420       430        440       450      
pF1KSD ATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVYPELTVPVKEALP-GIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLG
        .:.. ::.. :.::.:::::.::::..: . ..  : :.:  .::::: ::.     : 
CCDS58 ESRLDLRKNLRCQSFKWYLENIYPELSIPKESSIQKGNIRQRQKCLESQRQNNQETPNLK
         370       380       390       400       410       420     

        460       470        480       490       500       510     
pF1KSD MGICRGSAKNPQPAQAWLFS-DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVS
       .. :     .   .:.: :.  . : :.  ::.. . .   ::.::.: .:.  . .:  
CCDS58 LSPCAKVKGEDAKSQVWAFTYTQQILQEELCLSVITLF---PGAPVVLVLCKNGDDRQQW
         430       440       450       460          470       480  

         520       530       540                         
pF1KSD LLASGPEAQQPEGPCLRVADLGRRAPD                       
                                                         
CCDS58 TKTGSHIEHIASHLCLDTDMFGDGTENGKEIVVNPCESSLMSQHWDMVSS
            490       500       510       520       530  

>>CCDS1773.2 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2             (552 aa)
 initn: 1971 init1: 1868 opt: 1996  Z-score: 2321.8  bits: 439.4 E(32554): 5.3e-123
Smith-Waterman score: 1996; 61.6% identity (83.0% similar) in 448 aa overlap (68-513:56-500)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KSD RGAQRAGRRSEQLREDRTIPLIVTGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESD
                                     :::. ::.::. ..:.:::. .:::: ::.
CCDS17 VTKRKLEVPTGPEVQTPKPSDADWDDLWDQFDERRYLNAKKWRVGDDPYKLYAFNQRESE
          30        40        50        60        70        80     

       100       110       120       130       140       150       
pF1KSD KLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQE
       ..: .: : ::::  :  . : .::: ::.:::::::::::::::..:::::::..::.:
CCDS17 RISSNRAIPDTRHLRCTLLVYCTDLPPTSIIITFHNEARSTLLRTIRSVLNRTPTHLIRE
          90       100       110       120       130       140     

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD IILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVN
       ::::::::.::.::  : ..::::::::..:.::.:::.::::.: .:.:::::::::::
CCDS17 IILVDDFSNDPDDCKQLIKLPKVKCLRNNERQGLVRSRIRGADIAQGTTLTFLDSHCEVN
         150       160       170       180       190       200     

       220       230       240       250       260       270       
pF1KSD TEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQK
        .:: :.:.:::::.:::: :.::.:.::.:.:. ....:::::::::::.:::.  :::
CCDS17 RDWLQPLLHRVKEDYTRVVCPVIDIINLDTFTYIESASELRGGFDWSLHFQWEQLSPEQK
         210       220       230       240       250       260     

       280       290       300       310       320       330       
pF1KSD MTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEI
         : :::.:::::.::::.:::::.::..::::: .::::::::::.:::::::::::::
CCDS17 ARRLDPTEPIRTPIIAGGLFVIDKAWFDYLGKYDMDMDIWGGENFEISFRVWMCGGSLEI
         270       280       290       300       310       320     

       340       350       360       370       380       390       
pF1KSD VPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSV
       ::::::::::::.::: ::.::: :::.:::::::::::::::::: ::: :. . ::.:
CCDS17 VPCSRVGHVFRKKHPYVFPDGNANTYIKNTKRTAEVWMDEYKQYYYAARPFALERPFGNV
         330       340       350       360       370       380     

       400       410       420       430        440       450      
pF1KSD ATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVYPELTVPVKEALP-GIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLG
        .:.. ::.. :.::.:::::.::::..: . ..  : :.:  .::::: ::.     : 
CCDS17 ESRLDLRKNLRCQSFKWYLENIYPELSIPKESSIQKGNIRQRQKCLESQRQNNQETPNLK
         390       400       410       420       430       440     

        460       470        480       490       500       510     
pF1KSD MGICRGSAKNPQPAQAWLFS-DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVS
       .. :     .   .:.: :.  . : :.  ::.. . .   ::.::.: .:.  . .:  
CCDS17 LSPCAKVKGEDAKSQVWAFTYTQQILQEELCLSVITLF---PGAPVVLVLCKNGDDRQQW
         450       460       470       480          490       500  

         520       530       540                         
pF1KSD LLASGPEAQQPEGPCLRVADLGRRAPD                       
                                                         
CCDS17 TKTGSHIEHIASHLCLDTDMFGDGTENGKEIVVNPCESSLMSQHWDMVSS
            510       520       530       540       550  

>>CCDS58706.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2            (557 aa)
 initn: 1804 init1: 1677 opt: 1822  Z-score: 2119.2  bits: 401.9 E(32554): 1e-111
Smith-Waterman score: 1822; 62.5% identity (83.4% similar) in 403 aa overlap (113-513:106-505)

             90       100       110       120       130       140  
pF1KSD EDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRT
                                     :  . : .::: ::.:::::::::::::::
CCDS58 TGGHLAVCHFPCLLQEAQFHLQTQVFLQVRCTLLVYCTDLPPTSIIITFHNEARSTLLRT
          80        90       100       110       120       130     

            150       160       170       180       190       200  
pF1KSD VKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVA
       ..:::::::..::.:::::::::.::.::  : ..::::::::..:.::.:::.::::.:
CCDS58 IRSVLNRTPTHLIREIILVDDFSNDPDDCKQLIKLPKVKCLRNNERQGLVRSRIRGADIA
         140       150       160       170       180       190     

            210       220       230       240       250       260  
pF1KSD AATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFD
        .:.::::::::::: .:: :.:.:::::.:::: :.::.:.::.:.:. ....::::::
CCDS58 QGTTLTFLDSHCEVNRDWLQPLLHRVKEDYTRVVCPVIDIINLDTFTYIESASELRGGFD
         200       210       220       230       240       250     

            270       280       290       300       310       320  
pF1KSD WSLHFKWEQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENF
       :::::.:::.  :::  : :::.:::::.::::.:::::.::..::::: .:::::::::
CCDS58 WSLHFQWEQLSPEQKARRLDPTEPIRTPIIAGGLFVIDKAWFDYLGKYDMDMDIWGGENF
         260       270       280       290       300       310     

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD ELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYY
       :.:::::::::::::::::::::::::.::: ::.::: :::.:::::::::::::::::
CCDS58 EISFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKKHPYVFPDGNANTYIKNTKRTAEVWMDEYKQYY
         320       330       340       350       360       370     

            390       400       410       420       430        440 
pF1KSD YEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVYPELTVPVKEALP-GIIKQGVNC
       : ::: :. . ::.: .:.. ::.. :.::.:::::.::::..: . ..  : :.:  .:
CCDS58 YAARPFALERPFGNVESRLDLRKNLRCQSFKWYLENIYPELSIPKESSIQKGNIRQRQKC
         380       390       400       410       420       430     

             450       460       470        480       490       500
pF1KSD LESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFS-DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSP
       :::: ::.     : .. :     .   .:.: :.  . : :.  ::.. . .   ::.:
CCDS58 LESQRQNNQETPNLKLSPCAKVKGEDAKSQVWAFTYTQQILQEELCLSVITLF---PGAP
         440       450       460       470       480          490  

              510       520       530       540                    
pF1KSD VILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQPEGPCLRVADLGRRAPD                  
       :.: .:.  . .:                                               
CCDS58 VVLVLCKNGDDRQQWTKTGSHIEHIASHLCLDTDMFGDGTENGKEIVVNPCESSLMSQHW
            500       510       520       530       540       550  

>>CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1               (571 aa)
 initn: 1067 init1: 921 opt: 1775  Z-score: 2064.4  bits: 391.8 E(32554): 1.2e-108
Smith-Waterman score: 1807; 51.5% identity (76.6% similar) in 530 aa overlap (1-513:1-520)

               10        20        30        40          50        
pF1KSD MRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLWQDNRAHAASSGGRGAQRAGRRSE--QLRE------
       ::. :.  .  ..  :.::  ::... . .  :...: :: :    .:   ...      
CCDS15 MRR-RSRMLLCFAFLWVLGIAYYMYSGGGSALAGGAGGGAGRKEDWNEIDPIKKKDLHHS
                10        20        30        40        50         

               60            70        80        90       100      
pF1KSD --DRTIPLIVTGTPSK----GFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIR
         ..    . :  :.:     :...::... ....:.::: .. :::.:::::  :: : 
CCDS15 NGEEKAQSMETLPPGKVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIP
      60        70        80        90       100       110         

        110       120       130       140       150       160      
pF1KSD DTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSS
       :::: .:   ..  :::::::.:::::::::.::::: :::...: .::.:::::::.:.
CCDS15 DTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSN
     120       130       140       150       160       170         

        170       180       190       200       210       220      
pF1KSD DPEDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQ
       ::::  :: .: ::. :::::::::.::::::::.: : :::::::::: : .:: :.:.
CCDS15 DPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLE
     180       190       200       210       220       230         

        230       240       250       260       270       280      
pF1KSD RVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRT-DPTR
       :: ::.:::::::::::..::: :..:::::.:::::.: :::. .  ::. .:  .:. 
CCDS15 RVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVA
     240       250       260       270       280       290         

         290       300       310       320       330       340     
pF1KSD PIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGH
       ::.::.::::.::.:: .:..::::: .::.:::::.:.:::::.:::::::.:::::::
CCDS15 PIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGH
     300       310       320       330       340       350         

         350       360       370       380       390       400     
pF1KSD VFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRK
       ::::.:::.:: :.. .. :::.:.:::::::::..:: : ::: .  .:.. .:.: ::
CCDS15 VFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRK
     360       370       380       390       400       410         

         410       420       430        440       450       460    
pF1KSD KMNCKSFRWYLENVYPELTVPVKEALP-GIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSA
       :..:: :.:::::::::: :: .. .  : ..::.:::.. :. . :  ..:.  :....
CCDS15 KLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADG--VVGVYECHNAG
     420       430       440       450       460         470       

          470        480       490       500       510       520   
pF1KSD KNPQPAQAW-LFSDHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVSLLASGPEA
        :    : : : ... ....  ::....    .::: . :: :   ...:          
CCDS15 GN----QEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDR---APGSLIKLQGCRENDSRQKWEQIEGNSK
           480       490       500          510       520       530

           530       540                        
pF1KSD QQPEGPCLRVADLGRRAPD                      
                                                
CCDS15 LRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLNLQQ
              540       550       560       570 

>>CCDS5930.1 GALNT11 gene_id:63917|Hs108|chr7             (608 aa)
 initn: 1006 init1: 503 opt: 1300  Z-score: 1511.2  bits: 289.5 E(32554): 7.5e-78
Smith-Waterman score: 1365; 44.3% identity (70.7% similar) in 485 aa overlap (86-539:114-588)

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD IPLIVTGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPS
                                     :..::::.: ::.:.  : . :::. .:  
CCDS59 VEDPEEGHLKFSSELGMIFNERDQELRDLGYQKHAFNMLISDRLGYHRDVPDTRNAACKE
            90       100       110       120       130       140   

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD VSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDC----
         :  ::::.::.: :.::: :.:::::.::..::::.:..::::::: .:: .:     
CCDS59 KFYPPDLPAASVVICFYNEAFSALLRTVHSVIDRTPAHLLHEIILVDD-DSDFDDLKGEL
           150       160       170       180       190        200  

                180       190       200       210       220        
pF1KSD --LLLTRIP-KVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRV
          .   .: :.: .:: .::::::.:. ::  :.. ::.:::::::::. :: :.:  .
CCDS59 DEYVQKYLPGKIKVIRNTKREGLIRGRMIGAAHATGEVLVFLDSHCEVNVMWLQPLLAAI
            210       220       230       240       250       260  

      230       240       250       260       270       280        
pF1KSD KEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRTDPTRPIR
       .::.  :: :.::.:: :..:: ..:  .::::.:.:::::. .:: .       : ::.
CCDS59 REDRHTVVCPVIDIISADTLAY-SSSPVVRGGFNWGLHFKWDLVPLSELGRAEGATAPIK
            270       280        290       300       310       320 

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD TPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFR
       .:..:::.:......:..::.::. ::::::::.:.:::.:::::.: :.:::::::.::
CCDS59 SPTMAGGLFAMNRQYFHELGQYDSGMDIWGGENLEISFRIWMCGGKLFIIPCSRVGHIFR
             330       340       350       360       370       380 

      350       360       370       380       390       400        
pF1KSD KRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMN
       ::.::. :::.  :. .:. : :.::.::::. :.  ::.   :..:... :.: :::..
CCDS59 KRRPYGSPEGQD-TMTHNSLRLAHVWLDEYKEQYFSLRPDLKTKSYGNISERVELRKKLG
             390        400       410       420       430       440

      410       420             430                     440        
pF1KSD CKSFRWYLENVYPELTV------PVKEAL-------PGIIKQGV-------NCLESQGQN
       ::::.:::.:::::. .      : .  .       : ....:        .:: .::. 
CCDS59 CKSFKWYLDNVYPEMQISGSHAKPQQPIFVNRGPKRPKVLQRGRLYHLQTNKCLVAQGRP
              450       460       470       480       490       500

      450       460       470         480       490       500      
pF1KSD TAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFSDH--LIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMC
       .    :. .  :  :    .: : :.....  :. ..  ::  . :  :.:  : ... :
CCDS59 SQKGGLVVLKACDYS----DPNQIWIYNEEHELVLNSLLCLDMSETRSSDP--PRLMK-C
              510           520       530       540         550    

        510       520        530        540                   
pF1KSD NPREGKQVSLLASGPEAQQPE-GPCLRVAD-LGRRAPD                 
       .   :.:   .... .  :   : :::..: ::..                    
CCDS59 HGSGGSQQWTFGKNNRLYQVSVGQCLRAVDPLGQKGSVAMAICDGSSSQQWHLEG
           560       570       580       590       600        

>>CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2            (556 aa)
 initn: 1183 init1: 600 opt: 1253  Z-score: 1457.1  bits: 279.4 E(32554): 7.7e-75
Smith-Waterman score: 1254; 42.8% identity (68.6% similar) in 488 aa overlap (46-514:33-504)

          20        30        40        50          60        70   
pF1KSD WILGTFYYLWQDNRAHAASSGGRGAQRAGRRSEQLREDRTIPLI--VTGTPSKGFDE--K
                                     . .. .:   .: .  : .  ..:  :  :
CCDS21 RFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAVISRNQEGPGEMGK
             10        20        30        40        50        60  

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pF1KSD AYLSAK--QLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVII
       : :  :  : :  :  .. . :: . :: .. .: . :.:  .: .  : ..:: :::.:
CCDS21 AVLIPKDDQEKMKEL-FKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTSVVI
             70         80        90       100       110       120 

     130       140       150       160       170               180 
pF1KSD TFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLT--------RIPKVK
       .::::: ::::::: ::.::.:  :..:.::::: :   .: : ::        ..: ::
CCDS21 VFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDAS--ERDFLKLTLENYVKNLEVP-VK
             130       140       150         160       170         

             190       200       210       220       230       240 
pF1KSD CLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIID
        .: ..: ::::.:.::: .. . :.::::.::: .  :: :.: :.:::.  :: ::::
CCDS21 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
      180       190       200       210       220       230        

             250       260       270       280         290         
pF1KSD VISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRT--DPTRPIRTPVIAGGIFVI
       ::: :.: :.:.:    :::.:.:.:.:  .: ...: :   : : :.:::..:::.: :
CCDS21 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVP-QREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSI
      240       250       260       270        280       290       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD DKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGN
       :...:...: ::: ::::::::.:.:::.:.:::::::: ::.:::::::  ::.:: :.
CCDS21 DRNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGT
       300       310       320       330       340       350       

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENV
       . .  .:..: :::::::.:...:   :...   .:.:..:   :....:: : :::::.
CCDS21 GHVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENI
       360       370       380       390       400       410       

     420       430         440       450       460       470       
pF1KSD YPELTVPVKEALPGIIK--QGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFS-
       ::.  .: .    : :.  .  .::...:..   .  .:.  :.: . :    :.. .. 
CCDS21 YPDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKE--NEKVGIFNCHGMGGN----QVFSYTA
       420       430       440         450       460           470 

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQPEGPCLRVADL
       :. :. .  ::      .:  ..:::.  :.  .:.:.                      
CCDS21 DKEIRTDDLCLD-----VSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAERLTLRHVNSNQCLDEP
             480            490       500       510       520      

        540                          
pF1KSD GRRAPD                        
                                     
CCDS21 SEEDKMVPTMQDCSGSRSQQWLLRNMTLGT
        530       540       550      

>>CCDS77472.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2           (561 aa)
 initn: 1183 init1: 600 opt: 1253  Z-score: 1457.0  bits: 279.4 E(32554): 7.8e-75
Smith-Waterman score: 1254; 42.8% identity (68.6% similar) in 488 aa overlap (46-514:33-504)

          20        30        40        50          60        70   
pF1KSD WILGTFYYLWQDNRAHAASSGGRGAQRAGRRSEQLREDRTIPLI--VTGTPSKGFDE--K
                                     . .. .:   .: .  : .  ..:  :  :
CCDS77 RFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAVISRNQEGPGEMGK
             10        20        30        40        50        60  

                80        90       100       110       120         
pF1KSD AYLSAK--QLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVII
       : :  :  : :  :  .. . :: . :: .. .: . :.:  .: .  : ..:: :::.:
CCDS77 AVLIPKDDQEKMKEL-FKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTSVVI
             70         80        90       100       110       120 

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pF1KSD TFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLT--------RIPKVK
       .::::: ::::::: ::.::.:  :..:.::::: :   .: : ::        ..: ::
CCDS77 VFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDAS--ERDFLKLTLENYVKNLEVP-VK
             130       140       150         160       170         

             190       200       210       220       230       240 
pF1KSD CLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIID
        .: ..: ::::.:.::: .. . :.::::.::: .  :: :.: :.:::.  :: ::::
CCDS77 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
      180       190       200       210       220       230        

             250       260       270       280         290         
pF1KSD VISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRT--DPTRPIRTPVIAGGIFVI
       ::: :.: :.:.:    :::.:.:.:.:  .: ...: :   : : :.:::..:::.: :
CCDS77 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVP-QREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSI
      240       250       260       270        280       290       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD DKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGN
       :...:...: ::: ::::::::.:.:::.:.:::::::: ::.:::::::  ::.:: :.
CCDS77 DRNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGT
       300       310       320       330       340       350       

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENV
       . .  .:..: :::::::.:...:   :...   .:.:..:   :....:: : :::::.
CCDS77 GHVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENI
       360       370       380       390       400       410       

     420       430         440       450       460       470       
pF1KSD YPELTVPVKEALPGIIK--QGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFS-
       ::.  .: .    : :.  .  .::...:..   .  .:.  :.: . :    :.. .. 
CCDS77 YPDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKE--NEKVGIFNCHGMGGN----QVFSYTA
       420       430       440         450       460           470 

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQPEGPCLRVADL
       :. :. .  ::      .:  ..:::.  :.  .:.:.                      
CCDS77 DKEIRTDDLCLD-----VSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAESCLSVNKVADGSQHPT
             480            490       500       510       520      

        540                               
pF1KSD GRRAPD                             
                                          
CCDS77 VETCNDSTLQKWLLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
        530       540       550       560 

>>CCDS4325.1 GALNT10 gene_id:55568|Hs108|chr5             (603 aa)
 initn: 1210 init1: 407 opt: 1231  Z-score: 1430.9  bits: 274.7 E(32554): 2.2e-73
Smith-Waterman score: 1249; 38.7% identity (65.8% similar) in 571 aa overlap (8-539:11-572)

                  10        20          30        40           50  
pF1KSD    MRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLWQ--DNRAHAASSGGRGAQ---RAGRRSEQLRE
                 :.:.. .: .:     ::    .:   .. :: ::     ::. :.. :.
CCDS43 MRRKEKRLLQAVALVLAALVLLPNVGLWALYRERQPDGTPGGSGAAVAPAAGQGSHS-RQ
               10        20        30        40        50          

             60        70          80                      90      
pF1KSD DRTIPLIVTGTPSKGFDEKAYL--SAKQLKAGED--PY------------RQHAFNQLES
        .:. ..  :   : . .:  .  .:...  ::.  ::            :...::   :
CCDS43 KKTF-FLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAERVDQAYRENGFNIYVS
      60         70        80        90       100       110        

        100       110       120       130       140       150      
pF1KSD DKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQ
       ::.: .: . : :: .: :  :   :: ::.:: ::::. :.:::::.:::::.: .:. 
CCDS43 DKISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVA
      120       130       140       150       160       170        

        160             170       180       190       200       210
pF1KSD EIILVDDFSS-----DP-EDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFL
       ::.::::::.      : :: . :  .:.:. ::. .::::::.:. ::.::.. :.:::
CCDS43 EIVLVDDFSDREHLKKPLEDYMAL--FPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFL
      180       190       200         210       220       230      

              220       230       240       250        260         
pF1KSD DSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASAD-LRGGFDWSLHFKW
       :::::.:..::::.:.:. ...  .: :.::::. :.: : . ..: .::.::: ...: 
CCDS43 DSHCEANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMYYK-
        240       250       260       270       280       290      

     270       280       290       300       310       320         
pF1KSD EQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVW
        .::.  .. ..::. :...::.:::.:..:..:: .:: ::  ..:::::..:.::.::
CCDS43 -RIPIPPELQKADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVW
          300       310       320       330       340       350    

     330       340       350       360       370       380         
pF1KSD MCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSA
       :::: .: .:::::::..::  ::. : : .:.  :: ::.:::::::: .: :. ::  
CCDS43 MCGGRMEDIPCSRVGHIYRKYVPYKVPAGVSLA--RNLKRVAEVWMDEYAEYIYQRRPEY
          360       370       380         390       400       410  

     390       400       410          420         430        440   
pF1KSD IGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENV---YPELTVPVKE--ALPGIIKQ-GVN-CL
          . :.::.. . :...:::::.:.. ..    :..  ::.   :  : :.. :.. : 
CCDS43 RHLSAGDVAVQKKLRSSLNCKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPAAAWGEIRNVGTGLCA
            420       430       440       450       460       470  

            450       460        470       480       490           
pF1KSD ESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNP-QPAQAWLFSDHLIQQQGKCLAATSTLMS--SPGS
       ... ... :. :   :  :: ..   .  :.. :. .   . :    . .  ..  :  :
CCDS43 DTK-HGALGSPLRLEGCVRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKFCFDAISHTS
             480       490       500       510       520       530 

     500       510       520        530       540                  
pF1KSD PVILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQP-EGPCLRVADLGRRAPD                
       :: :  :.  .:.:.    .     .:  : :.  ..  .:                   
CCDS43 PVTLYDCHSMKGNQLWKYRKDKTLYHPVSGSCMDCSESDHRIFMNTCNPSSLTQQWLFEH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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