Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0780
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0780, 1047 aa
1>>>pF1KSDA0780 1047 - 1047 aa - 1047 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3717+/-0.00123; mu= 12.1120+/- 0.073
mean_var=127.8925+/-24.671, 0's: 0 Z-trim(106.0): 58 B-trim: 198 in 1/52
Lambda= 0.113410
statistics sampled from 8677 (8731) to 8677 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16
Scan time: 3.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056) 6867 1136.0 0
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 813) 5531 917.3 0
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 835) 5531 917.3 0
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096) 2145 363.4 1.5e-99
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064) 2041 346.4 2e-94
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11 ( 523) 1734 296.0 1.4e-79
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 ( 506) 1692 289.1 1.6e-77
CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 151) 992 174.3 1.8e-43
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12 (1690) 458 87.5 2.7e-16
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1379) 444 85.1 1.1e-15
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1559) 444 85.2 1.2e-15
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1560) 444 85.2 1.2e-15
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1570) 444 85.2 1.2e-15
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1482) 440 84.5 1.8e-15
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1539) 440 84.5 1.9e-15
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1544) 434 83.5 3.8e-15
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1580) 434 83.5 3.8e-15
CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119) 428 82.5 5.7e-15
CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213) 428 82.5 6.1e-15
CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1214) 428 82.5 6.1e-15
CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1220) 428 82.5 6.1e-15
CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1058) 411 79.7 3.7e-14
CCDS77686.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1189) 411 79.7 4.1e-14
CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX ( 823) 385 75.4 5.8e-13
CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6 (1205) 379 74.5 1.6e-12
CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 790) 374 73.6 1.9e-12
CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 791) 374 73.6 1.9e-12
CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 834) 374 73.6 2e-12
CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093) 373 73.5 2.9e-12
CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027) 369 72.8 4.3e-12
CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1068) 369 72.8 4.4e-12
CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 509) 350 69.5 2e-11
CCDS75191.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 830) 350 69.6 3.1e-11
CCDS34062.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 842) 350 69.6 3.1e-11
>>CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056 aa)
initn: 6867 init1: 6867 opt: 6867 Z-score: 6076.3 bits: 1136.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6867; 99.7% identity (99.9% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-1001)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLE
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSS
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD NEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD CCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD AVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AVTSQTFYEVMFDDGSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AVTSQTFYEVMFDDGSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD NIAHMYQVEFEDGSQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFVSAGRCHLGTCQVNSLSSPHVS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:
CCDS64 NIAHMYQVEFEDGSQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFSTASDMRFEDTFYGADIIQGER
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KSD QAQQETYLGFWINSKKSQCNIFLSGTY
CCDS64 KRQRVLSSRFKNEYVADPVYRTFLKSSFQKKCQKRQ
1030 1040 1050
>>CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (813 aa)
initn: 5531 init1: 5531 opt: 5531 Z-score: 4896.7 bits: 917.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5531; 99.9% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-808)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
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pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
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pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
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310 320 330 340 350 360
pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
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370 380 390 400 410 420
pF1KSD QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSI
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pF1KSD SSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLE
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLE
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pF1KSD PGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD CCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD AVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTC
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLGRLGI
790 800 810
>>CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (835 aa)
initn: 5531 init1: 5531 opt: 5531 Z-score: 4896.5 bits: 917.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5531; 99.9% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:23-830)
10 20 30
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MKHYGLPWKRTEEAAADTALTIMEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMES
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD KGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD FRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD DIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLST
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD ESNGVLTEGEESDVESHGNGLEPGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ESNGVLTEGEESDVESHGNGLEPGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRP
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KSD PARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATV
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KSD ARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENI
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KSD EYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLC
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KSD NLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLGRLGI
790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
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CCDS12 MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
:::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::
CCDS12 YDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
::::::::::.:::::::.::.::. : .:::. : :.::.::.::: :::::::::::
CCDS12 RKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYF
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pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS12 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
::::::::: .::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS12 RHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWID
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
::::: :::::::::::::.::: .::.::.:::::::. ..:::.:: ..::...:
CCDS12 YGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWS
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KSD QRRRKVR-KASRSFQCARSTSKRPKADE---------------------EEEVSDEVDGA
: ... : : . :: :.:: .. .::.. :::
CCDS12 ASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPE
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EV---PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSC
: :.: . . .:. .. ::: :.:.::..... . : .. ..
CCDS12 EEEEEPQPLPHGREAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEA
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD L--STSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPE-
: . . . :. .:. . . .: ::. : :. .
CCDS12 LWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKA
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KSD -------SCSSVAE---SNGVLTEGEESDVESHG--NGLEPGEIPAVPSGERNSF-KVPS
::... : ..: . : .: : .: . . . : . ..::
CCDS12 AFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPS
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD -IAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLI
... . . .:: ::::.:::.:::...:::.: :::: .: ::.: . .. .::.
CCDS12 TFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASP-FSGEEDVSDPDAL-RPLL
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KSD HL-WQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEEND-ARWETKLDEVV
: :.... .: ::...::..:: .:.::::::..:: . ....: : ..
CCDS12 SLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATL
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TSEG--KTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPS
:.. ::.:::::::: . :: : : :... .:::: ::.:.:::..::::::::
CCDS12 PSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRP
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KSD HEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERT
. . .:: :.:: .::::::::::::::::..: . .: ::.::.::::.:: :: ::
CCDS12 ELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERH
780 790 800 810 820 830
800 810 820 830 840 850
pF1KSD QIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
.:.. :: :: ::::..::.:.:.:::::::::: .: .::::::::::::::::::::
CCDS12 PVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KSD YVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVMFDD
:::.:::..:: . .. . ...:.::.::::.:: :: :::....::: ::: :::
CCDS12 YVVSITCLKHKSGGHAVQLL--RAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDD
900 910 920 930 940 950
920 930 940 950 960 970
pF1KSD GSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGSNIAHMYQVEFEDGS
::.: . .::.:.::::..::::.:::.:...: ::.:: ::...: .:.:::::::::
CCDS12 GSYSDNLYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGS
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980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD QIAMKREDIYTLDEELPKRVKARF-VSAGRCHLGTCQVNSLSSPHVSQAQQETYLGFWIN
:...:: ::.::.:::::::..:. .:.:
CCDS12 QLTVKRGDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAKRPRVGTPLATEDSGR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
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CCDS49 MASESET-LNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRAS
10 20 30 40 50
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pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
:::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::.:::..::: ::::::: ..:.::
CCDS49 YDDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELE
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pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
::::::::: ::::::.::..:.. ::::::.:: :.::.::.: ::.:::::::::::
CCDS49 RKYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYF
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:::::.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::.::::.:.:.:.:::
CCDS49 GMWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFL
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pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
::::::::: .::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.
CCDS49 RHKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIE
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pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
::: : ::.:::::::::::.:::::::.::.::: ::: .:::: :: ::. .:
CCDS49 YGKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPT----PEAAEFL
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pF1KSD QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEE--------------------EVSDEVDGAEV
.. . .:. .: . . . :: :. .::. .:.
CCDS49 KESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSEL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD -PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTS
:. : ... ...: : . .: :..: .. .. . . :: ... . ...
CCDS49 FPKEDLSSEQYEMTECPAALAPVRPTHSSVRQVEDGLTFP---DYSDSTEVKFEELKNVK
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KSD VTEDIKTEDDKAYAYR-SVPSIS---------SEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPK
. :. . :.. : : :: : :. .: :..: . :. :: :
CCDS49 LEEEDEEEEQAAAALDLSVNPASVGGRLVFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSISSDSETS---
480 490 500 510 520
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pF1KSD SPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNG---LEPGEIPAVPSGERN-SFKVPSIAE---
: :: . ... :::: :.:...: . :: . .: ::. .::
CCDS49 EPLSCRAQGQT-GVLT------VHSYAKGDGRVTVGEPCTRKKGSAARSFSERELAEVAD
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KSD ------GENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKP
::: ::. :.:::. : . :..: :. ::.: : :. :::.::::.::::
CCDS49 EYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPLVL--QECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKP
590 600 610 620 630
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pF1KSD LIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVV
: .:::.. ::: ::.:.: :.:.. ::::.: ... ::. . .. ... . ....
CCDS49 LSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIFQTYHQVEFGGFNQNC---GNASDLA
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TSEGKTKPLIPEMCFIYS--EENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPS
.. .:::::::::: . .:. : : .:::::::.:.:: :: :::::::::.:
CCDS49 PQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTP--YLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPP
700 710 720 730 740 750
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pF1KSD HEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERT
. . :.:.::. :: .::::.::::::.......:.:: ::::. :.::.:. ::.
CCDS49 AKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAERS
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pF1KSD QIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
.::..::: :.:::::::..: ::..: :.:::.::::..:::.::.::::.:.:::::
CCDS49 PVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDDWP
820 830 840 850 860 870
860 870 880 890 900 910
pF1KSD YVVNITCFRHKVNPNV-KSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVMFD
.:: :::::::. ::. ..:. . :..:: ::.::.: :.:.:.:. .:..::::: ::
CCDS49 FVVFITCFRHKI-PNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNFD
880 890 900 910 920 930
920 930 940 950 960 970
pF1KSD DGSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGSNIAHMYQVEFEDG
::::: . .::::::.:::..:::::::::::.: ::..::::. .:. .:::::::::
CCDS49 DGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFEDG
940 950 960 970 980 990
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pF1KSD SQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFVSAGRCHLGTCQVNSLSSPHVSQAQQETYLGFWIN
::...::.:.::::::::::::.:. :
CCDS49 SQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRFNEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYREDY
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pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPR
::.:.:: :.:. ::: .:.::.:::::.:::::::::.::::::: :
CCDS83 METMKSKANCAQNPNCNIMIFHPTKEEFNDFDKYIAYMESQGAHRAGLAKIIPPKEWKAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYED
. ::.:...:: .:.::...:..:.::::. .:::::: :.:.:::: :: :: . ..::
CCDS83 ETYDNISEILIATPLQQVASGRAGVFTQYHKKKKAMTVGEYRHLANSKKYQTPPHQNFED
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYL
:::::::: . .:::::::.::..::.. .::...:.:. :..:.:::. :::::::::
CCDS83 LERKYWKNRIYNSPIYGADISGSLFDENTKQWNLGHLGTIQDLLEKECGVVIEGVNTPYL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDA
:::::::::::::::::::::::::.::::.::..:::::.::::::. .::.::.:: :
CCDS83 YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHLGEPKTWYVVPPEHGQRLERLARELFPGSSRGCGA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRW
:::::..::::.:::. ::::..:::::::::.::::::::::::::::::. :::: ::
CCDS83 FLRHKVALISPTVLKENGIPFNRITQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRW
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKP-TPAS---TP
:::::.:. :.: . : .::: ::: .::.::.:::.:.: ..:: .: .::: .
CCDS83 IDYGKMASQCSCGEARVTFSMDAFVRILQPERYDLWKRGQDRAVVDHMEPRVPASQELST
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVKAWLQRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSE
. .. : :: . . . :: : : : . . . .: ..:. ...
CCDS83 QKEVQLPRRAALGLRQLPSHWARH-SPWPMAARSGTRCHTLVCSSLPRRSAVSG--TATQ
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KSD KSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDH-------IKLSGNS-CLSTSVTEDI--
:::. . .:. . . :. . . . :: .. :.: . . .
CCDS83 PRAAAVHSSKKPSSTPSSTPGPSAQIIHPSNGRRGRGRPPQKLRAQELTLQTPAKRPLLA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD -KTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGV
: .. . .: .. : .::: : ..: :. : :: :
CCDS83 GTTCTASGPEPEPLPEDGALMDKPVPLSPGLQHPVKA--SGCSWAPVP
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LTEGEESDVESHGNGLEPGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSP
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
:: : : :::: :.:::: .:: :.:::::.:::.::::::::::::: ::
CCDS44 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
::::...:: .:.::...::.:.::::. .:::: : ..:.:::: :: :: . .. :::
CCDS44 YDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHQNFADLE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
..:::. :::::::.::...:.. .::...:.:.::..:.:::. :::::::::::
CCDS44 QRYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYF
120 130 140 150 160 170
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CCDS44 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFL
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:::..::::.:::. ::::. .::::::::.::::::::::::::::::. :::: ::::
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CCDS44 YGKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWR
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CCDS44 DDIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSL
360 370 380 390 400 410
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CCDS78 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
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CCDS78 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEVHSYLQ
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CCDS41 LVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNM
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.. . : . ...: :...:.:: :: ..: :: :: :::::::.::::.::..:
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pF1KSD EHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPY
. ...::.. . . : .. .:.. .:...:.:: ..:.: . .: ::::..:::
CCDS41 HAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPR
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CCDS41 AYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLD
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70 80 90 100 110
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CCDS55 EIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTE
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.:...:. .. . :::::... . : .:. . : .:.
CCDS55 LVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVM
360 370 380 390 400 410
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CCDS55 PVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPS
420 430 440 450 460 470
220 230 240 250 260 270
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CCDS55 AYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]