Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0470
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0470, 1460 aa
1>>>pF1KSDA0470 1460 - 1460 aa - 1460 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5706+/-0.00109; mu= 8.6433+/- 0.066
mean_var=171.0230+/-34.557, 0's: 0 Z-trim(107.7): 51 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.098072
statistics sampled from 9734 (9766) to 9734 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44338.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1460) 9409 1344.8 0
CCDS44337.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1486) 7242 1038.2 0
CCDS44339.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1584) 4452 643.5 1.5e-183
CCDS45175.1 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1554) 635 103.4 5.5e-21
CCDS45176.2 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1519) 400 70.1 5.6e-11
>>CCDS44338.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1460 aa)
initn: 9409 init1: 9409 opt: 9409 Z-score: 7199.8 bits: 1344.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9409; 99.9% identity (100.0% similar) in 1460 aa overlap (1-1460:1-1460)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCSIDAKQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDAKQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DQAVVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DQAVVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD WTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIRER
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD STISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRSTD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD VGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELAD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD ADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD RTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASALKTTRLQSAGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASALKTTRLQSAGSA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD MPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAHREEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAHREEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD TTVSTAATTPGSAIDTREEVGDLHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TTVSTAATTPGSAIDTREEVGDLHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD GDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD DKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD NMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADF
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460
pF1KSD SIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
::::::::::::::::::::
CCDS44 SIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
1450 1460
>>CCDS44337.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1486 aa)
initn: 8757 init1: 7242 opt: 7242 Z-score: 5542.6 bits: 1038.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9224; 96.9% identity (96.9% similar) in 1496 aa overlap (1-1460:1-1486)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCSIDAKQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDAKQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DQAVVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DQAVVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD WTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIRER
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD STISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRSTD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD VGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELAD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD ADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120
pF1KSD RTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSAS-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASVNSRWRRFPTDYA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160
pF1KSD -----------------------ALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STSEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD REEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREEVGDLH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 REEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREE-----
1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD GEMHKLVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -----LVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSR
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD DEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKT
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD SSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHH
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KSD SPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
1440 1450 1460 1470 1480
>>CCDS44339.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1584 aa)
initn: 8743 init1: 4442 opt: 4452 Z-score: 3408.8 bits: 643.5 E(32554): 1.5e-183
Smith-Waterman score: 8579; 90.5% identity (90.6% similar) in 1528 aa overlap (67-1460:67-1584)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLF
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTE
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KSD ALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCSIDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS44 ALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDA
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAG
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KSD HASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADW
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATL
340 350 360 370 380 390
400 410 420
pF1KSD EEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQDQAV--------------------------------
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQDQAVTSSAHHRGGHGVPHGKLLKQKSEEPSVSIPFL
400 410 420 430 440 450
pF1KSD ------------------------------------------------------------
CCDS44 QTALLRSSGSLGHRPSQEMDKMLKNQATSATSEKDNDDDQSDKGTYTIELENPNSEEVEA
460 470 480 490 500 510
430 440 450 460 470
pF1KSD ------VFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKMIDKVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTS
520 530 540 550 560 570
480 490 500 510 520 530
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSGSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLAS
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540 550 560 570 580 590
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QGERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PLSKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQWTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEIL
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720 730 740 750 760 770
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KSQTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIR
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pF1KSD ERSESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERSESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TASTISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TDVGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTP
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pF1KSD LTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSEL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KSD ADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSA
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pF1KSD SSRTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSAS-----------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSRTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASVNSRWRRFPTD
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pF1KSD -------------------------ALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YASTSEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWT
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AHREEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREE---
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pF1KSD LHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -------LVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTW
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pF1KSD SRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIV
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pF1KSD KTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNN
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pF1KSD HHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
1530 1540 1550 1560 1570 1580
>--
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
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::::::
CCDS44 GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
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10 20 30 40 50 60
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pF1KSD GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
::::::::::.:::.: :.::::.: .:::::.:.... . . :::::::::::.: :::
CCDS45 GSLNGTFVNDMRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLERVQHRVPEEALKHEKYTSQLQ
70 80 90 100 110 120
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.: :. . :.. .. .... : :.... .: : :::::::
CCDS45 VSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPE---------KGDRRPGTEAASYR-TPLYGQP
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pF1KSD SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCSIDAKQVEEQSA--AANEEVLFPFCREP
::::.:. . . .:.: . .. ..: : . : : : :::
CCDS45 SWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKG-------PVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFRREP
180 190 200 210 220
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pF1KSD SYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGA----GHASFTIEFDDSTPGKVTI
::::::::: :::: : ::.::::. .. .: .:::::::::: .:::. :
CCDS45 SYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGKMKI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RDHVTKFTSDQRHK-SKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEED
.::.:::. ::. .:...:: :.. :.::::::.::.: . .:
CCDS45 KDHITKFSLRQRRPPGKEATPGE---------MVSAETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDD
290 300 310 320 330
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pF1KSD SKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLE---EHLRRHHSEHKKL
.: :::.::. . :::.::.::::::::. :. . . :: :..: ... ..
CCDS45 RHSTKSDLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAASAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450
pF1KSD QKVQATEKHQDQAVV---FGVDD-----NQDYNR-----PVINEKHKDLIKDWALSSAAA
:.. :..:: : : : .:.... : .... : :. :
CCDS45 QELL----HNQQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRRGPTPADRDRPSVPA
400 410 420 430 440 450
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pF1KSD VMEE--RK--PLTTSGFHH--SEE--GTSSSGSKRWVSQWASLAA-NHTRHDQEERIMEF
.. :. : ...... .:: :. : .:. . ..:.. .. .: . ..
CCDS45 PVQAGGRSSGPQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRRSRLAQDFMAQCLRE
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KSD SAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQGERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQR
:.: . .. . . ... .. : ::: . .:. :. . .
CCDS45 SSPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKARKQEEDDSLSDAGTY
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD SEIGEKQDTELQEK-----------ETPT----------QVYQKDKQDAD----------
. : ::::..: :.: : . :....:
CCDS45 TIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVIRGDRDESDDGGVAQRMAL
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630
pF1KSD ------RPLSKMNRAVNGETLKTG--GDNKTLLHLGS-----SAPGKEKSETDK-----E
:::. .: . : : .: . . .: : :: .. . :
CCDS45 LQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPGLTEDGLGRRGGEPE
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KSD TSLVKQTLAKLQQ-QEQREEAQWTPTKLSSKNVSGQTDKCREET---FKQESQPPEKNSG
:: . .: : .: .. : . : .. : . :. : :: :.. :
CCDS45 GSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPES-SRRSGPGPPELDSEQPSRLFGQEELDPDSLSD
700 710 720 730 740
700 710 720 730
pF1KSD HSTSKGDR-----VAQSESKRRKAEE------------ILKSQTP-------KGGDKKES
: : : : : ..:.::. .: :: ..:: :
CCDS45 ASGSDGGRGPEPGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLS
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740 750
pF1KSD SKSLVRQGSFT----IEKPSP------------NIPIELIP-----------------HI
: :. :. .::: . :.: : .
CCDS45 RKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGRSPEPDGPAPAFLRQESF
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760 770 780 790 800 810
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.:. .: : . . ..: ... :. .: :. :: ::::.::...: :::.:
CCDS45 TKEPASGPPAPGKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQ-DTHLILKETETALAALEARL
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.:..: :: .:: .: ..: .::::::::.:: .: :: . . : .
CCDS45 L-SNSVDAECEGGSTPRPPED-ALSGDSDVDTASTVSLRSG----KSGPSPTTPQPLRAQ
930 940 950 960 970 980
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pF1KSD RCSTGSP--SKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSR--STDVGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVD
. . :: ..: .. .:::. .. . ::.: :. . :. . :.:
CCDS45 KEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSAIRRGHRPRGSLD
990 1000 1010 1020 1030 1040
930 940 950 960 970
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.... . : ::.:.:..:: :: : . . . .. . ..:
CCDS45 WPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPAAREEQSRSSASS
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pF1KSD KTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELADADKASVASEVSTTSSTSK
. .: . ..:..: :::::.: :::::::.:::.: ::....:... ...
CCDS45 QKGP---QALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNP----EPVGR
1110 1120 1130 1140 1150
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pF1KSD PPTGR-RNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASSRTAEAIIRSGARLVPSD
: . . ...::.:.::.::. : ::... :: ::. .:.: :.:..: : .
CCDS45 PAAEQAKKLSRLDILAMPRK-RAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEA
1160 1170 1180 1190 1200 1210
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pF1KSD KFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASALKTTRLQSAGSA------MPTSSSFKHRI
. : ::. . . . : . . ::: .::. :::. : .
CCDS45 RAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARS-GSARYTSTTQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDE
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD KEQEDY-IRDWTAHREEIARISQ----DLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTA
.: . : . ::. ::::.:: :.:..:.::.::::. :.. :: : :...:.
CCDS45 EEPDPYGFIVQTAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNM
1280 1290 1300 1310 1320 1330
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pF1KSD ATTPGSAIDTREEVGDLHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPP-LVHSKTPEGNNGRSGDPRP
.::.:.:..::: ::.:. . ::::.:.:: ..:. . : . : .
CCDS45 PSTPASTISAREE----------LVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCE---
1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KSD QAAEPPDHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRN
: :. .. : .:.::. :::.:. : :.:. ::.. .. : :..:::.. :
CCDS45 ------DALA-NKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRA
1390 1400 1410 1420 1430
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD WDDIESKLRAESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFP
:.:.:... ::.::::.:::. ::::::.::.::.:::..:::..::.:.:. :
CCDS45 WEDLEARINAENEVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSGSLDLLTGNRSL
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD SAMLPSPPKQKSSPVNNHHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFN
CCDS45 ASSAQPGLGKGRVAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFL
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:::.: :::.: :. . :.. ..
CCDS45 KLNDVIRFGYDSNMYVLERVQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYC
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pF1KSD KVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPE
.... : :.... .: : :::::::::::.:. . . .:.:
CCDS45 EASNPRPE---------KGDRRPGTEAASYR-TPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPY
80 90 100 110 120
210 220 230 240 250
pF1KSD EKNHEAGTSGCSIDAKQVEEQSA--AANEEVLFPFCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTI
. .. ..: : . : : : :::::::::::: :::: :
CCDS45 PERPKG-------PVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPA
130 140 150 160 170
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pF1KSD HEIPTKDTPSSHITGA----GHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHK-SKKSSP
::.::::. .. .: .:::::::::: .:::. :.::.:::. ::. .:...:
CCDS45 HEMPTKDAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGKMKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATP
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD GTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHD
: :.. :.::::::.::.: . .: .: :::.::. . :::.::.
CCDS45 GE---------MVSAETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKSDLPVHTRTLKGHKHE
240 250 260 270 280
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CCDS45 DFDQNMNDSCE---------DALA-NKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]