Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDA0142
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0142, 646 aa
  1>>>pF1KSDA0142 646 - 646 aa - 646 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3894+/-0.0012; mu= -1.9328+/- 0.072
 mean_var=339.4403+/-71.017, 0's: 0 Z-trim(111.5): 97  B-trim: 320 in 1/53
 Lambda= 0.069613
 statistics sampled from 12368 (12453) to 12368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.383), width:  16
 Scan time:  2.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9521.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13        ( 646) 4257 441.9 1.3e-123
CCDS45069.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13       ( 753) 3688 384.8 2.3e-106
CCDS32009.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13       ( 782) 3688 384.8 2.4e-106
CCDS45068.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13       ( 803) 3688 384.8 2.4e-106
CCDS81781.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13       ( 547) 3044 320.0 5.5e-87
CCDS78509.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX        ( 622) 1867 201.8 2.3e-51
CCDS14660.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX        ( 776) 1867 201.9 2.7e-51


>>CCDS9521.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13             (646 aa)
 initn: 4257 init1: 4257 opt: 4257  Z-score: 2332.6  bits: 441.9 E(32554): 1.3e-123
Smith-Waterman score: 4257; 100.0% identity (100.0% similar) in 646 aa overlap (1-646:1-646)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD REVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 REVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 RPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 TLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 ELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 NVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 SENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 SHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD PPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 PPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD AYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 AYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640      
pF1KSD VQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVRKVLKNMNDPAWDETNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 VQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVRKVLKNMNDPAWDETNL
              610       620       630       640      

>>CCDS45069.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13            (753 aa)
 initn: 3730 init1: 3688 opt: 3688  Z-score: 2022.9  bits: 384.8 E(32554): 2.3e-106
Smith-Waterman score: 3688; 99.8% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:129-683)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
      100       110       120       130       140       150        

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
      160       170       180       190       200       210        

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
      220       230       240       250       260       270        

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
      280       290       300       310       320       330        

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
      340       350       360       370       380       390        

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
      400       410       420       430       440       450        

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
      460       470       480       490       500       510        

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
      520       530       540       550       560       570        

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
      580       590       600       610       620       630        

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.               
CCDS45 PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADD
      640       650       660       670       680       690        

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD KIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVR
                                                                   
CCDS45 DQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSCCSYISHQN     
      700       710       720       730       740       750        

>>CCDS32009.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13            (782 aa)
 initn: 3730 init1: 3688 opt: 3688  Z-score: 2022.7  bits: 384.8 E(32554): 2.4e-106
Smith-Waterman score: 3688; 99.8% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:158-712)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
       130       140       150       160       170       180       

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
       190       200       210       220       230       240       

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
       250       260       270       280       290       300       

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
       310       320       330       340       350       360       

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
       370       380       390       400       410       420       

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
       430       440       450       460       470       480       

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
       490       500       510       520       530       540       

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
       550       560       570       580       590       600       

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
       610       620       630       640       650       660       

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.               
CCDS32 PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADD
       670       680       690       700       710       720       

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD KIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVR
                                                                   
CCDS32 DQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSCCSYISHQN     
       730       740       750       760       770       780       

>>CCDS45068.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13            (803 aa)
 initn: 3730 init1: 3688 opt: 3688  Z-score: 2022.6  bits: 384.8 E(32554): 2.4e-106
Smith-Waterman score: 3688; 99.8% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:179-733)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
      150       160       170       180       190       200        

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
      210       220       230       240       250       260        

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
      270       280       290       300       310       320        

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
      330       340       350       360       370       380        

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
      390       400       410       420       430       440        

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
      450       460       470       480       490       500        

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
      510       520       530       540       550       560        

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
      570       580       590       600       610       620        

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
      630       640       650       660       670       680        

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.               
CCDS45 PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADD
      690       700       710       720       730       740        

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD KIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVR
                                                                   
CCDS45 DQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSCCSYISHQN     
      750       760       770       780       790       800        

>>CCDS81781.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13            (547 aa)
 initn: 3086 init1: 3044 opt: 3044  Z-score: 1675.2  bits: 320.0 E(32554): 5.5e-87
Smith-Waterman score: 3044; 99.8% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (96-555:18-477)

          70        80        90       100       110       120     
pF1KSD SEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81              MGSCSSQSVQKTRRGRKVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQT
                            10        20        30        40       

         130       140       150       160       170       180     
pF1KSD SEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLT
        50        60        70        80        90       100       

         190       200       210       220       230       240     
pF1KSD YCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERH
       110       120       130       140       150       160       

         250       260       270       280       290       300     
pF1KSD MEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYM
       170       180       190       200       210       220       

         310       320       330       340       350       360     
pF1KSD SQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHR
       230       240       250       260       270       280       

         370       380       390       400       410       420     
pF1KSD NAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVT
       290       300       310       320       330       340       

         430       440       450       460       470       480     
pF1KSD PSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRP
       350       360       370       380       390       400       

         490       500       510       520       530       540     
pF1KSD SAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTS
       410       420       430       440       450       460       

         550       560       570       580       590       600     
pF1KSD AKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELR
       :::::::::.                                                  
CCDS81 AKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADDDQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAH
       470       480       490       500       510       520       

>>CCDS78509.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX             (622 aa)
 initn: 2736 init1: 1452 opt: 1867  Z-score: 1035.6  bits: 201.8 E(32554): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 2669; 62.9% identity (84.3% similar) in 645 aa overlap (1-638:1-608)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYV
       ::.:...::.:.:.:::.::::::::  :::.:.::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD REVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYL
       ::.:.::.:.:::.       :::.:. ..:.::.:::::::.::.::.::::..: :::
CCDS78 REIKSSERPLSPKA------VKGFETAPLTKNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYL
               70              80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMK
       ::::....::..... :.::.::.:.::: : :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:
CCDS78 RPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFK
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLK
       ..::.:::::::::::::.::.:: .:::..::::::::.:::.::::::::.:: :::.
CCDS78 SMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMENQGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQ
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLG
       :::::::: : :.::: :...:::.: .:::..::::.::::::.: :. :::.:::.::
CCDS78 ELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLG
          240       250       260       270       280       290    

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLED
       :: .::::..: .. :::.::::.:: :::.::::::::::::::::.: .: ..:.:..
CCDS78 NVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVLIMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDE
          300       310       320       330       340       350    

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLP
        :..  .:::.:. .:::.: :::.::.:::.:.:..  .    :               
CCDS78 IEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQEWLEQLNRLIR----G---------------
          360       370       380       390                        

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPA
            :.:  . :: .  . . :.    :  : :.     ::::::.  :::::::::::
CCDS78 -----PASCSSLSKTSSSSCSAHS--SFSSTGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPA
              400       410         420            430       440   

              490              500       510       520       530   
pF1KSD PPLRPSAALCYKEDLS-------KSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDA
       ::::::::: ::: .:       ::::::::.: ::: :::::.::.. :::::::::::
CCDS78 PPLRPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDA
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       :::::::::::::. .:  .::.::.: ::::::::::.:.:::.:::::..::::::::
CCDS78 QILKVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDT
           510       520       530       540       550       560   

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CCDS78 VYALKDEVRELKQENKRMKQCLEEELKSRRDLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
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CCDS14 LSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKG
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       :.:.::::::::::::::::::::::::::::.:.::.:.:::.       :::.:. ..
CCDS14 DIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKA------VKGFETAPLT
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       :.::.:::::::.::.::.::::..: :::::::....::..... :.::.::.:.::: 
CCDS14 KNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQT
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       : :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..::.:::::::::::::.::.:: .:::.
CCDS14 LCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMEN
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       .::::::::.:::.::::::::.:: :::.:::::::: : :.::: :...:::.: .::
CCDS14 QGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQC
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       :..::::.::::::.: :. :::.:::.:::: .::::..: .. :::.::::.:: :::
CCDS14 QDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVL
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       .::::::::::::::::.: .: ..:.:.. :..  .:::.:. .:::.: :::.::.::
CCDS14 IMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQE
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       :.:.:..  .    :                    :.:  . :: .  . . :.    : 
CCDS14 WLEQLNRLIR----G--------------------PASCSSLSKTSSSSCSAHS--SFSS
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CCDS14 TGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMK
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CCDS14 KFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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