Result of FASTA (ccds) for pFN21AB3497
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3497, 1437 aa
  1>>>pF1KB3497 1437 - 1437 aa - 1437 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7389+/-0.00106; mu= 4.8861+/- 0.065
 mean_var=256.7960+/-50.397, 0's: 0 Z-trim(112.2): 65  B-trim: 6 in 1/52
 Lambda= 0.080035
 statistics sampled from 12925 (12977) to 12925 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.399), width:  16
 Scan time:  4.700

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43729.1 WHSC1L1 gene_id:54904|Hs108|chr8       (1437) 9958 1164.2       0
CCDS6105.1 WHSC1L1 gene_id:54904|Hs108|chr8        ( 645) 4086 485.9 1.6e-136
CCDS33940.1 WHSC1 gene_id:7468|Hs108|chr4          (1365) 2691 325.1 8.7e-88
CCDS4413.1 NSD1 gene_id:64324|Hs108|chr5           (2427) 2608 315.7   1e-84
CCDS4412.1 NSD1 gene_id:64324|Hs108|chr5           (2696) 2608 315.7 1.1e-84
CCDS2749.2 SETD2 gene_id:29072|Hs108|chr3          (2564)  672 92.2 2.1e-17
CCDS1113.2 ASH1L gene_id:55870|Hs108|chr1          (2964)  658 90.6 7.4e-17
CCDS46999.1 WHSC1 gene_id:7468|Hs108|chr4          ( 629)  560 78.8 5.6e-14
CCDS3356.1 WHSC1 gene_id:7468|Hs108|chr4           ( 647)  560 78.8 5.7e-14


>>CCDS43729.1 WHSC1L1 gene_id:54904|Hs108|chr8            (1437 aa)
 initn: 9958 init1: 9958 opt: 9958  Z-score: 6224.0  bits: 1164.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9958; 100.0% identity (100.0% similar) in 1437 aa overlap (1-1437:1-1437)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MDFSFSFMQGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDFSFSFMQGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 ATTEDLPPLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ATTEDLPPLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNTR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 QASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPRE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 EPVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 NTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 PQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKTR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 RPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEIRRHSQRRHTSAEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEIRRHSQRRHTSAEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 ASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 DRLIISTPNQRNEKPTQSVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRLIISTPNQRNEKPTQSVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 KEQVETVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KEQVETVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 LQVGFGKQVDSPSATADADVSDVQSMDSSLSRRGTGMSKKDTVCQICESSGDSLIPCEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQVGFGKQVDSPSATADADVSDVQSMDSSLSRRGTGMSKKDTVCQICESSGDSLIPCEGE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 CCKHFHLECLGLASLPDSKFICMECKTGQHPCFSCKVSGKDVKRCSVGACGKFYHEACVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CCKHFHLECLGLASLPDSKFICMECKTGQHPCFSCKVSGKDVKRCSVGACGKFYHEACVR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 KFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSMEKDIHKASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSMEKDIHKASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSMLV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 SSYILICSNHSKRSSNSSAVNVGFCFVCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSYILICSNHSKRSSNSSAVNVGFCFVCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 LMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCCESCPASFHPECLSIEMPEGCWNCNDCKAGKKLHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCCESCPASFHPECLSIEMPEGCWNCNDCKAGKKLHY
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 KQIVWVKLGNYRWWPAEICNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KQIVWVKLGNYRWWPAEICNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 EGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANK
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 VIGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADENPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VIGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADENPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB3 KRLYPDAEIIKTERRGWGLRTKRSIKKGEFVNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRLYPDAEIIKTERRGWGLRTKRSIKKGEFVNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFY
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB3 MLTVTKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLTVTKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB3 YNLDCLGNGRTECHCGADNCSGFLGVRPKSACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YNLDCLGNGRTECHCGADNCSGFLGVRPKSACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMH
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB3 EDYCFQCGDGGELVMCDKKDCPKAYHLLCLNLTQPPYGKWECPWHQCDECSSAAVSFCEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDYCFQCGDGGELVMCDKKDCPKAYHLLCLNLTQPPYGKWECPWHQCDECSSAAVSFCEF
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430       
pF1KB3 CPHSFCKDHEKGALVPSALEGRLCCSEHDPMAPVSPEYWSKIKCKWESQDHGEEVKE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CPHSFCKDHEKGALVPSALEGRLCCSEHDPMAPVSPEYWSKIKCKWESQDHGEEVKE
             1390      1400      1410      1420      1430       

>>CCDS6105.1 WHSC1L1 gene_id:54904|Hs108|chr8             (645 aa)
 initn: 4188 init1: 4086 opt: 4086  Z-score: 2564.6  bits: 485.9 E(32554): 1.6e-136
Smith-Waterman score: 4086; 99.5% identity (100.0% similar) in 622 aa overlap (1-622:1-622)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MDFSFSFMQGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDFSFSFMQGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 ATTEDLPPLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ATTEDLPPLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNTR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 QASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPRE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 EPVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EPVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 NTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPR
              310       320       330       340       350       360

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKTR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEIRRHSQRRHTSAEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DRLIISTPNQRNEKPTQSVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIK
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CCDS61 KEQVETVPQATVKTGLQKGSADRGVQGSVRFSDSSVSAAIEETVD               
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CCDS33 PSCEVNRECSVFLSKAQLSSSLQEGVMQKFNGHDAL-PFIPADKLKDLTSRVFNGEPGAH
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CCDS33 DAKLR-FESQEMKGIGTPPNTTPIKNGSPEIKLKITKTYMNGKPLFESSICGDSAADVSQ
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       ::.. .: :.. ...::.: :.::   .      . .           .... :.:  . 
CCDS33 SEENGQKPENKARRNRKRSIKYDSLLEQGLVEAALVS-----------KISSPSDK--KI
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CCDS33 PAKKESCPNTG-------RDKDHLLKYNVGDLVWSKVSGYPWWPCMVSADPLLHSYTKLK
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pF1KB3 --TRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKP
          ..::.::::::.. :::::. :: .  ..:. :.:.:  :..::: ...:: :. ::
CCDS33 GQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESAKQAPTKAEKIKLLKP
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pF1KB3 RPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKT
          . ::::..::..::.: .:. :::  ..::.:.  : .   . ::..  .   . . 
CCDS33 ISGKLRAQWEMGIVQAEEAASMSVEERKAKFTFLYVGDQLHLNPQVAKEAGIAAESLGEM
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pF1KB3 RRPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEI---RRHSQRRHTSAEEEEPPP---VKIAWKTA
        .  .:      . .:.:  .:.    :   ::.  .  .:::  :  :    .   :::
CCDS33 AESSGV------SEEAAENPKSVREECIPMKRRRRAKLCSSAETLESHPDIGKSTPQKTA
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pF1KB3 AA--RKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGI-G
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CCDS33 EADPRRGVGSPPGRKKTTVSMPRSRKGDAASQFLVFCQ-------KHRDEVVAEHPDASG
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pF1KB3 NKTEISVRGQDRLIISTPNQRNEKPTQ-SVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEK
       .. :  .:.:  :.  . .:: .  :. .. .:  .  ..:.:. :.. .. : .. .: 
CCDS33 EEIEELLRSQWSLL--SEKQRARYNTKFALVAPVQAEEDSGNVNGKKRNHTKRIQDPTED
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pF1KB3 S-TEVVPKKKIKKEQ-----VETVPQATVKTGL------------QKGASEISDSCKPLK
       . .: .:.:... ..      .:. . :..:.             : .....::.:::::
CCDS33 AEAEDTPRKRLRTDKHSLRKRDTITDKTARTSSYKAMEAASSLKSQAATKNLSDACKPLK
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pF1KB3 KRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSDLQVGFGKQ-VDSPSATADADVSDVQSMDSSL
       ::.:::: .  . .  ...: : :   .... . : .  .::  .::   ..: :..:. 
CCDS33 KRNRASTAASSALGFSKSSSPSASLTENEVSDSPGDEPSESPYESADETQTEV-SVSSKK
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pF1KB3 SRRGTGMSKKDTVCQICESSGDSLIPCEGECCKHFHLECLGLASLPDSKFICMECKTGQH
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CCDS33 SERGV-TAKKEYVCQLCEKPG-SLLLCEGPCCGAFHLACLGLSRRPEGRFTCSECASGIH
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pF1KB3 PCFSCKVSGKDVKRCSVGACGKFYHEACVRKFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSMEKDIH-
        :: :: :  ::::: :  ::::::::::.:.: ..:::.::::: : : .:   .  . 
CCDS33 SCFVCKESKTDVKRCVVTQCGKFYHEACVKKYPLTVFESRGFRCPLHSCVSCHASNPSNP
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pF1KB3 KASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSMLVSSYILICSNH---SKRSSNSSAVNVGFCF
       . :::.::::.::::::::::::.:::  ...:  .::. :    : . . . :::..::
CCDS33 RPSKGKMMRCVRCPVAYHSGDACLAAGCSVIASNSIICTAHFTARKGKRHHAHVNVSWCF
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pF1KB3 VCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAELMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCC
       ::.                                                 ::: ::::
CCDS33 VCS-------------------------------------------------KGGSLLCC
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pF1KB3 ESCPASFHPECLSIEMPEGCWNCNDCKAGKKLHYKQIVWVKLGNYRWWPAEICNPRSVPL
       :::::.:::.::.::::.: : ::::.::::::...:.:::::::::::::.:.:..:: 
CCDS33 ESCPAAFHPDCLNIEMPDGSWFCNDCRAGKKLHFQDIIWVKLGNYRWWPAEVCHPKNVPP
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pF1KB3 NIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYVEGDK-SFAEGQTSINKTFKKALEEAA
       ::: .::..:.::::::::.::::.::.:::::.:::. :  .:  .:...::.::.:: 
CCDS33 NIQKMKHEIGEFPVFFFGSKDYYWTHQARVFPYMEGDRGSRYQGVRGIGRVFKNALQEAE
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pF1KB3 KRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANKVIGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADE
        ::.:.: :::..:. : :   ::::::::::.::  ::::: .::.::::.:::::.::
CCDS33 ARFREIKLQREARETQESE---RKPPPYKHIKVNKPYGKVQIYTADISEIPKCNCKPTDE
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pF1KB3 NPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFTKRLYPDAEIIKTERRGWGLRTKRSI
       ::::..::::::::..::::::::::. ::::::::: ::...::::. .:::: .::.:
CCDS33 NPCGFDSECLNRMLMFECHPQVCPAGEFCQNQCFTKRQYPETKIIKTDGKGWGLVAKRDI
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pF1KB3 KKGEFVNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFYMLTVTKDRIIDAGPKGNYSRFMNHS
       .::::::::::::::::::  :::.::::..:.:::::. ::::::::::::::::::::
CCDS33 RKGEFVNEYVGELIDEEECMARIKHAHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNYSRFMNHS
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pF1KB3 CNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFNYNLDCLGNGRTECHCGADNCSGFLG
       :.::::: :::::::.::::::.:::::: ::::::::::::: .: :.:::.:::::::
CCDS33 CQPNCETLKWTVNGDTRVGLFAVCDIPAGTELTFNYNLDCLGNEKTVCRCGASNCSGFLG
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pF1KB3 VRPKSACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMHEDYCFQCGDGGELVMCDKKDCPKAY
        :::.. . ..:::.:..: : .::. : : :.. :: ::.:::::.::.::.: : :::
CCDS33 DRPKTSTTLSSEEKGKKTKKKTRRRRAKGEGKRQSEDECFRCGDGGQLVLCDRKFCTKAY
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pF1KB3 HLLCLNLTQPPYGKWECPWHQCDECSSAAVSFCEFCPHSFCKDHEKGALVPSALEGRLCC
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CCDS33 HLSCLGLGKRPFGKWECPWHHCDVCGKPSTSFCHLCPNSFCKEHQDGTAFSCTPDGRSYC
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pF1KB3 SEHDPMAPVSPEYWSKIKCKWESQDHGEEVKE          
        :::                                      
CCDS33 CEHDLGAASVRSTKTEKPPPEPGKPKGKRRRRRGWRRVTEGK
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>>CCDS4413.1 NSD1 gene_id:64324|Hs108|chr5                (2427 aa)
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pF1KB3 QGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYPATTEDLPP
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CCDS44 KTRDSSDIETAVVKHVLSELKELSYRSLGEDVSDSGTSKPSKPLL---FS-SASSQNHIP
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pF1KB3 LTNGYPSSI------SVYETQTKYQSYNQYPN---GSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNT
       .   :  :       ......:: :      :     . : :   . ::.   .  . . 
CCDS44 IEPDYKFSTLLMMLKDMHDSKTKEQRLMTAQNLVSYRSPGRGDCSTNSPVGVSKVLVSGG
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CCDS44 CHAANPANVSASKGRLMRCVRCPVAYHANDFCLAAGSKILASNSIICPNHFTPRRGCRNH
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CCDS44 APNCSGFLGVRPKNQPIATEEKSKKFKKKQQGKRRTQGEITKEREDECFSCGDAGQLVSC
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CCDS44 KKPGCPKVYHADCLNLTKRPAGKWECPWHQCDICGKEAASFCEMCPSSFCKQHREGMLFI
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CCDS44 SKLDGRLSCTEHDPCGPNPLEPGEIREYVPPPVPLPPGPSTHLAEQSTGMAAQAPKMSDK
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       : :   :.      ...:    . ..  ..: . .. . . ...  :.  .:.    .. 
CCDS44 PKKKQKKVQEQVHKVSSRCEEESLLARGRSSAQNKQVDENSLISTKEEPPVLER---EAP
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pF1KB3 FIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQDRLIISTPNQRNEKPTQSVSSPEATSGSTGSVEKKQQ
       :..  . ...  :...:.      .: .:.:   . .:  .. : :    . :. :.:.:
CCDS44 FLEGPLAQSELGGGHAELP-----QLTLSVPVAPEVSPRPALESEELLVKTPGNYESKRQ
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       :.  .   ::.  .   .:::    ..:.     ..:.    .  :. .:    :...: 
CCDS44 RKPTKKLLESNDLDPGFMPKKGDLGLSKKCYEAGHLENGITESCATSYSKDFGGGTTKIF
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       :  :: :.. .  . ..:  .  .. ..:     :. ..   . . ::. :..  :    
CCDS44 D--KPRKRKRQRHAAAKMQCKKVKNDDSSKEIPGSEGELMPHRTATSPKETVEEGVEHDP
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       .: .:    ..:: : . :..::: ::. :. :. ::..::  ::::::::. .: .:::
CCDS44 GMPASKKMQGERGGGAALKENVCQNCEKLGELLL-CEAQCCGAFHLECLGLTEMPRGKFI
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       : ::.:: : :: :: ::.::::: .  ::::::: ::.:.: .....:::::  : : .
CCDS44 CNECRTGIHTCFVCKQSGEDVKRCLLPLCGKFYHEECVQKYPPTVMQNKGFRCSLHICIT
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pF1KB3 CSMEKDIH-KASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSMLVSSYILICSNH--SKRSS-NS
       :   .  . .:::::.:::.:::::::..: :.:::: ...:  .:: ::   .:.  : 
CCDS44 CHAANPANVSASKGRLMRCVRCPVAYHANDFCLAAGSKILASNSIICPNHFTPRRGCRNH
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pF1KB3 SAVNVGFCFVCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAELMKLPMIPSSSASKKKC
         :::..::::.                                                
CCDS44 EHVNVSWCFVCS------------------------------------------------
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        .:: ::::.::::.:: :::.:..::: : ::::::::: ::..:::::.: :::::::
CCDS44 -EGGSLLCCDSCPAAFHRECLNIDIPEGNWYCNDCKAGKKPHYREIVWVKVGRYRWWPAE
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pF1KB3 ICNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYVEGDKSFAEGQ-TSINKT
       ::.::.:: ::. ..::.:.:::.::::.:: :.::.:::::.::: :  . .  ... :
CCDS44 ICHPRAVPSNIDKMRHDVGEFPVLFFGSNDYLWTHQARVFPYMEGDVSSKDKMGKGVDGT
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pF1KB3 FKKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANKVIGKVQIQVADLSEIP
       .::::.::: ::.:::::.: ..  : .::..:::::::::.:. ::.::: .:::::::
CCDS44 YKKALQEAAARFEELKAQKELRQLQEDRKNDKKPPPYKHIKVNRPIGRVQIFTADLSEIP
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pF1KB3 RCNCKPADENPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFTKRLYPDAEIIKTERRG
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CCDS44 RCNCKATDENPCGIDSECINRMLLYECHPTVCPAGGRCQNQCFSKRQYPEVEIFRTLQRG
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       :::::: .::::::::::::::::::::: ::. :.:...:::::::. :::::::::::
CCDS44 WGLRTKTDIKKGEFVNEYVGELIDEEECRARIRYAQEHDITNFYMLTLDKDRIIDAGPKG
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pF1KB3 NYSRFMNHSCNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFNYNLDCLGNGRTECHCG
       ::.::::: :.::::::::.::::.::::::: :: :: ::::::::.:::::.: :.::
CCDS44 NYARFMNHCCQPNCETQKWSVNGDTRVGLFALSDIKAGTELTFNYNLECLGNGKTVCKCG
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pF1KB3 ADNCSGFLGVRPKSACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMHEDYCFQCGDGGELVMC
       : :::::::::::.   .:.:.. :  : .: .:. . :  . .:: ::.:::.:.:: :
CCDS44 APNCSGFLGVRPKNQPIATEEKSKKFKKKQQGKRRTQGEITKEREDECFSCGDAGQLVSC
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CCDS44 KKPGCPKVYHADCLNLTKRPAGKWECPWHQCDICGKEAASFCEMCPSSFCKQHREGMLFI
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pF1KB3 SALEGRLCCSEHDPMAPVSPEYWSKIKCKWESQDHGEEVKE                   
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CCDS44 SKLDGRLSCTEHDPCGPNPLEPGEIREYVPPPVPLPPGPSTHLAEQSTGMAAQAPKMSDK
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>>CCDS2749.2 SETD2 gene_id:29072|Hs108|chr3               (2564 aa)
 initn: 843 init1: 587 opt: 672  Z-score: 425.8  bits: 92.2 E(32554): 2.1e-17
Smith-Waterman score: 672; 35.8% identity (66.2% similar) in 293 aa overlap (1021-1313:1433-1712)

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CCDS27 PLKKRRQEIESDSESDGELQDRKKVRVEVEQGETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKE
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pF1KB3 LKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANKVIGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADENPCGL
          : .    ... ...      :. :... : ..: . . ::.  : .     :  :: 
CCDS27 CAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQ----GEIACG-
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pF1KB3 ESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFTKRLYPDAEIIKTERRGWGLRTKRSIKKGEF
         .::::.:. ::  . :: :: :.:. : .. . :.:.: ::..:::::. ... .. :
CCDS27 -EDCLNRLLMIECSSR-CPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTF
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       : :: ::..:..: . :.:.  .:.  ..:.... .:.::::  ::: ::::::::.:::
CCDS27 VLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNC
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       :::::::::..:::.:.   .:.: ::::.:...  :.   .: ::. :: :.:: . . 
CCDS27 ETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRV
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pF1KB3 ACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMHEDYCFQCGDGGELVMCDKKDCPKAYHLLCL
       .       .: ..:.:..: . :                                     
CCDS27 SI------RAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLE
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>>CCDS1113.2 ASH1L gene_id:55870|Hs108|chr1               (2964 aa)
 initn: 500 init1: 332 opt: 658  Z-score: 416.1  bits: 90.6 E(32554): 7.4e-17
Smith-Waterman score: 658; 38.3% identity (69.0% similar) in 261 aa overlap (1068-1321:2062-2316)

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pF1KB3 KKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKP--PPYKHIKANKVIGKVQIQVADLS--
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CCDS11 IHVGKYLRQKRIDFQLPYDILWQWKHNQLYKKPDVPLYKKIRSN-----VYVDVKPLSGY
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pF1KB3 EIPRCNCK-PADENPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFTKRLYPDA-EIIK
       :   :::: : :..  :  ..:::::.  :: :..:: :..: :: . .. . .  : ..
CCDS11 EATTCNCKKPDDDTRKGCVDDCLNRMIFAECSPNTCPCGEQCCNQRIQRHEWVQCLERFR
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pF1KB3 TERRGWGLRTKRSIKKGEFVNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFYMLTVTKDRIID
       .:..:::.:::. .: :.:. ::.::...:.: : :. . ..:  .. : :.. .  .::
CCDS11 AEEKGWGIRTKEPLKAGQFIIEYLGEVVSEQEFRNRMIEQYHNH-SDHYCLNLDSGMVID
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pF1KB3 AGPKGNYSRFMNHSCNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFNYNLDCLGNGRT
       .   :: .::.::::.:::: :::.:::  :.::.:: :.::: :::..::.  ..  . 
CCDS11 SYRMGNEARFINHSCDPNCEMQKWSVNGVYRIGLYALKDMPAGTELTYDYNFHSFNVEKQ
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pF1KB3 E-CHCGADNCSGFLGVRPKSACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMHEDYCFQCGDG
       . :.:: ..: :..: . . . . :. ....    ..:  . : . :. :.         
CCDS11 QLCKCGFEKCRGIIGGKSQRVNGLTSSKNSQPMATHKKSGRSKEKRKSKHKLKKRRGHLS
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pF1KB3 GELVMCDKKDCPKAYHLLCLNLTQPPYGKWECPWHQCDECSSAAVSFCEFCPHSFCKDHE
                                                                   
CCDS11 EEPSENINTPTRLTPQLQMKPMSNRERNFVLKHHVFLVRNWEKIRQKQEEVKHTSDNIHS
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>>CCDS46999.1 WHSC1 gene_id:7468|Hs108|chr4               (629 aa)
 initn: 776 init1: 323 opt: 560  Z-score: 364.4  bits: 78.8 E(32554): 5.6e-14
Smith-Waterman score: 772; 31.1% identity (59.3% similar) in 604 aa overlap (98-663:66-628)

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pF1KB3 PLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYH---SEIPNTRP--H
                                     ::  :.  : :.:  .   :.. : .:  :
CCDS46 PSCEVNRECSVFLSKAQLSSSLQEGVMQKFNGHDAL-PFIPADKLKDLTSRVFNGEPGAH
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CCDS46 DAKLR-FESQEMKGIGTPPNTTPIKNGSPEIKLKITKTYMNGKPLFESSICGDSAADVSQ
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       ::.. .: :.. ...::.: :.::   .      . .           .... :.:  . 
CCDS46 SEENGQKPENKARRNRKRSIKYDSLLEQGLVEAALVS-----------KISSPSDK--KI
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       :. ::         : :.:  . .  .:..:::::::::. :::::::::.:: :. .::
CCDS46 PAKKE---------SCPNTGRDKDHLLKYNVGDLVWSKVSGYPWWPCMVSADPLLHSYTK
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       ..   ..::.::::::.. :::::. :: .  ..:. :.:.:  :..::: ...:: :. 
CCDS46 LKGQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESAKQAPTKAEKIKLL
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       ::   . ::::..::..::.: .:. :::  ..::.:.  : .   . ::..  .   . 
CCDS46 KPISGKLRAQWEMGIVQAEEAASMSVEERKAKFTFLYVGDQLHLNPQVAKEAGIAAESLG
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       .  .  .:      . .:.:  .:.    :   ::.  .  .:::  :  :    .   :
CCDS46 EMAESSGV------SEEAAENPKSVREECIPMKRRRRAKLCSSAETLESHPDIGKSTPQK
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       :: :  :... .    .: .... .   . ...   ::  ..        :. :      
CCDS46 TAEADPRRGVGSPPGRKKTTVSMPRSRKGDAASQFLVFCQKHR-------DEVVAEHPDA
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pF1KB3 -GNKTEISVRGQDRLIISTPNQRNEKPTQ-SVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSES
        :.. :  .:.:  :.  . .:: .  :. .. .:  .  ..:.:. :.. .. : .. .
CCDS46 SGEEIEELLRSQWSLL--SEKQRARYNTKFALVAPVQAEEDSGNVNGKKRNHTKRIQDPT
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       : . .: .:.:... ..      .:. . :..:.             : .....::.:::
CCDS46 EDAEAEDTPRKRLRTDKHSLRKRDTITDKTARTSSYKAMEAASSLKSQAATKNLSDACKP
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       ::::.:::: .  .:.   . :.: : .:.. .:                          
CCDS46 LKKRNRASTAA--SSALGFSKSSSPSASLTENEVK                         
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CCDS33 PSCEVNRECSVFLSKAQLSSSLQEGVMQKFNGHDAL-PFIPADKLKDLTSRVFNGEPGAH
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CCDS33 SEENGQKPENKARRNRKRSIKYDSLLEQGLVEAALVS-----------KISSPSDK--KI
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CCDS33 GQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESAKQAPTKAEKIKLLKP
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CCDS33 AESSGV------SEEAAENPKSVREECIPMKRRRRAKLCSSAETLESHPDIGKSTPQKTA
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CCDS33 EADPRRGVGSPPGRKKTTVSMPRSRKGDAASQFLVFC-------QKHRDEVVAEHPDASG
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CCDS33 EEIEELLRSQWSLL--SEKQRARYNTKFALVAPVQAEEDSGNVNGKKRNHTKRIQDPTED
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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