Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1682
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1682, 747 aa
1>>>pF1KA1682 747 - 747 aa - 747 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6497+/-0.00093; mu= 18.1039+/- 0.056
mean_var=70.1534+/-13.883, 0's: 0 Z-trim(106.2): 26 B-trim: 350 in 1/49
Lambda= 0.153126
statistics sampled from 8841 (8866) to 8841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 2.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34138.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 747) 5097 1135.5 0
CCDS77998.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 693) 3459 773.7 0
CCDS75230.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 637) 3063 686.2 4.3e-197
CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 ( 777) 1199 274.4 4.6e-73
CCDS72901.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 640) 619 146.3 1.5e-34
CCDS72902.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 709) 619 146.3 1.6e-34
CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 ( 549) 426 103.6 8.7e-22
CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 571) 392 96.1 1.6e-19
CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 643) 392 96.1 1.8e-19
CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 665) 392 96.1 1.9e-19
CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 673) 392 96.1 1.9e-19
CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX ( 603) 387 95.0 3.7e-19
CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX ( 704) 384 94.4 6.7e-19
CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 ( 621) 373 91.9 3.3e-18
CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161) 374 92.3 4.8e-18
CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170) 374 92.3 4.8e-18
CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198) 374 92.3 4.9e-18
CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195) 352 87.4 1.4e-16
CCDS31427.1 SBF2 gene_id:81846|Hs108|chr11 (1849) 350 87.0 2.8e-16
CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 ( 660) 337 84.0 8.5e-16
CCDS14091.2 SBF1 gene_id:6305|Hs108|chr22 (1893) 319 80.2 3.3e-14
>>CCDS34138.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 (747 aa)
initn: 5097 init1: 5097 opt: 5097 Z-score: 6079.3 bits: 1135.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5097; 100.0% identity (100.0% similar) in 747 aa overlap (1-747:1-747)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 YVQEDSCQHGVYGRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YVQEDSCQHGVYGRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 FDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LFLFSYATAAQNNTVTDPKNHTVMFDTLKDWCWELERTKGNMKYKAVSVNEGYKVCERLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFLFSYATAAQNNTVTDPKNHTVMFDTLKDWCWELERTKGNMKYKAVSVNEGYKVCERLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 AYFVVPTPLPEENVQRFQGHGIPIWCWSCHNGSALLKMSALPKEQDDGILQIQKSFLDGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AYFVVPTPLPEENVQRFQGHGIPIWCWSCHNGSALLKMSALPKEQDDGILQIQKSFLDGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSLQEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSLQEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SWLDIIRRCLKKAIEITECMEAQNMNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SWLDIIRRCLKKAIEITECMEAQNMNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQNDKEEVPVFLLFLDCVWQLVHQHPPAFEFTETYLTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQNDKEEVPVFLLFLDCVWQLVHQHPPAFEFTETYLTVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SDSLYIPIFSTFFFNSPHQKDTNMGREGQDTQSKPLNLLTVWDWSVQFEPKAQTLLKNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDSLYIPIFSTFFFNSPHQKDTNMGREGQDTQSKPLNLLTVWDWSVQFEPKAQTLLKNPL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 YVEKPKLDKGQRKGMRFKHQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKNLLGKRISKLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YVEKPKLDKGQRKGMRFKHQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKNLLGKRISKLIN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SSDELQDNFREFYDSWHSKSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSDELQDNFREFYDSWHSKSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LSKLLEMMEEVQSLQEKIDERHHSQQAPQAEAPCLLRNSARLSSLFPFALLQRHSSKPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSKLLEMMEEVQSLQEKIDERHHSQQAPQAEAPCLLRNSARLSSLFPFALLQRHSSKPVL
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KA1 PTSGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PTSGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
730 740
>>CCDS77998.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 (693 aa)
initn: 4710 init1: 3455 opt: 3459 Z-score: 4124.2 bits: 773.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4606; 92.8% identity (92.8% similar) in 747 aa overlap (1-747:1-693)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 YVQEDSCQHGVYGRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YVQEDSCQHGVYGRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 FDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LFLFSYATAAQNNTVTDPKNHTVMFDTLKDWCWELERTKGNMKYKAVSVNEGYKVCERLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LFLFSYATAAQNNTVTDPKNHTVMFDTLKDWCWELERTKGNMKYKAVSVNEGYKVCERLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 AYFVVPTPLPEENVQRFQGHGIPIWCWSCHNGSALLKMSALPKEQDDGILQIQKSFLDGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AYFVVPTPLPEENVQRFQGHGIPIWCWSCHNGSALLKMSALPKEQDDGILQIQKSFLDGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSLQEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSLQEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SWLDIIRRCLKKAIEITECMEAQNMNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SWLDIIRRCLKKAIEITECMEAQNMNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQNDKEEVPVFLLFLDCVWQLVHQHPPAFEFTETYLTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQNDKEEVPVFLLFLDCVWQLVHQHPPAFEFTETYLTVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SDSLYIPIFSTFFFNSPHQKDTNMGREGQDTQSKPLNLLTVWDWSVQFEPKAQTLLKNPL
::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SDSLYIPIFSTFFFNSPHQKDTNM------------------------------------
490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 YVEKPKLDKGQRKGMRFKHQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKNLLGKRISKLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ------------------HQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKNLLGKRISKLIN
510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SSDELQDNFREFYDSWHSKSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSDELQDNFREFYDSWHSKSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVAT
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LSKLLEMMEEVQSLQEKIDERHHSQQAPQAEAPCLLRNSARLSSLFPFALLQRHSSKPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LSKLLEMMEEVQSLQEKIDERHHSQQAPQAEAPCLLRNSARLSSLFPFALLQRHSSKPVL
610 620 630 640 650 660
730 740
pF1KA1 PTSGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PTSGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
670 680 690
>>CCDS75230.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 (637 aa)
initn: 3063 init1: 3063 opt: 3063 Z-score: 3652.0 bits: 686.2 E(32554): 4.3e-197
Smith-Waterman score: 4102; 85.3% identity (85.3% similar) in 747 aa overlap (1-747:1-637)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 YVQEDSCQHGVYGRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YVQEDSCQHGVYGRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 FDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LFLFSYATAAQNNTVTDPKNHTVMFDTLKDWCWELERTKGNMKYKAVSVNEGYKVCERLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LFLFSYATAAQNNTVTDPKNHTVMFDTLKDWCWELERTKGNMKYKAVSVNEGYKVCERLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 AYFVVPTPLPEENVQRFQGHGIPIWCWSCHNGSALLKMSALPKEQDDGILQIQKSFLDGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AYFVVPTPLPEENVQRFQGHGIPIWCWSCHNGSALLKMSALPKEQDDGILQIQKSFLDGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSLQEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSLQEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SWLDIIRRCLKKAIEITECMEAQNMNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SWLDIIRRCLKKAIEITECMEAQNMNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQNDKEEVPVFLLFLDCVWQLVHQHPPAFEFTETYLTVL
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQNDKEE--------------------------------
430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SDSLYIPIFSTFFFNSPHQKDTNMGREGQDTQSKPLNLLTVWDWSVQFEPKAQTLLKNPL
CCDS75 ------------------------------------------------------------
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 YVEKPKLDKGQRKGMRFKHQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKNLLGKRISKLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ------------------HQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKNLLGKRISKLIN
450 460 470 480 490
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SSDELQDNFREFYDSWHSKSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSDELQDNFREFYDSWHSKSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVAT
500 510 520 530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LSKLLEMMEEVQSLQEKIDERHHSQQAPQAEAPCLLRNSARLSSLFPFALLQRHSSKPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LSKLLEMMEEVQSLQEKIDERHHSQQAPQAEAPCLLRNSARLSSLFPFALLQRHSSKPVL
560 570 580 590 600 610
730 740
pF1KA1 PTSGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PTSGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
620 630
>>CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 (777 aa)
initn: 1027 init1: 402 opt: 1199 Z-score: 1425.1 bits: 274.4 E(32554): 4.6e-73
Smith-Waterman score: 1538; 36.2% identity (65.4% similar) in 768 aa overlap (14-722:5-755)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTE---KEVTLHLLPGEQLLCEAST
: :::.: ::. : .:..: .: :.. ::::: .. :..
CCDS45 MFSLKPPKPTFRSYLLPPP-QTDDKINSEPKIKKLEPVLLPGEIVVNEVNF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 VLKYVQEDSCQHGVYGRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQI
: : . :. :. ..:.:.:..:::.:. :: :. . ...: ..::.:. : :..::
CCDS45 VRKCIATDTSQYDLWGKLICSNFKISFITDDPMPLQ--KFHYRNLLLGEHDVPLTCIEQI
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 YGVFDEKKKT-LFG---QLKKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQ
: :.:.: ..: .:: : .:::.:::.:. .: . . : .:.. .: :..:
CCDS45 VTVNDHKRKQKVLGPNQKLKFNPTELIIYCKDFRIVRFRFDESGPESAKKVCLAIAHYSQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210
pF1KA1 APKLLKRLFLFSYATAAQNNTVTD----PKN------------------HTVMFDTLKDW
: :. :: : :. .:... :.. .: .:.: .::
CCDS45 -PTDLQLLFAFEYVGKKYHNSANKINGIPSGDGGGGGGGGNGAGGGSSQKTPLFETYSDW
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KA1 CWELERTKGNMKYKAVSVNEGYKVCERLPAYFVVPTPLPEENVQRFQ----GHGIPIWCW
:..:: : ... :.:::: . :: :.:::. : ..... :. :. .:.:::
CCDS45 DREIKRT-GASGWRVCSINEGYMISTCLPEYIVVPSSLADQDLKIFSHSFVGRRMPLWCW
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 SCHNGSALLKMSALPKEQDDGILQ---IQKSFLDGIYKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSL
: :::::..: :: :. .:: :.. . ..: :. : : : ::.... ..
CCDS45 SHSNGSALVRM-ALIKD----VLQQRKIDQRICNAITKS-H-PQRSDVYKSDLDKTLPNI
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 QEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESSSWLDIIRRCLKKAIEITECMEAQN
::.:.:. :.::: . . : .:. ::.: ::.. ::. .: ::.. :.. .:...
CCDS45 QEVQAAFVKLKQLCV---NEPFEETEEKWLSSLENTRWLEYVRAFLKHSAELVYMLESKH
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 MNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQSLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQN
..:.: ::.. :: : ..::::.:.::. :: ::::::::::::.:. ::::::::...
CCDS45 LSVVLQEEEGRDLSCCVASLVQVMLDPYFRTITGFQSLIQKEWVMAGYQFLDRCNHLKRS
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 DKEEVPVFLLFLDCVWQLVHQHPPAFEFTETYLTVLSDSLYIPIFSTFFFNSPHQK----
.:: :.:::::: .:::..:.: ::::.::::.:: :: : .:.::.::::::.
CCDS45 EKES-PLFLLFLDATWQLLEQYPAAFEFSETYLAVLYDSTRISLFGTFLFNSPHQRVKQS
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510 520 530 540 550
pF1KA1 -DTNMGREGQDTQSKPLNLLTVWDWSVQFEPKAQTLLKNPLYVEK--PKLDKGQRKGMRF
. .... : . : :.. .:::::.:: : .::..::.:. : : ...:. :...
CCDS45 TEFAISKNIQLGDEKGLKFPSVWDWSLQFTAKDRTLFHNPFYIGKSTPCIQNGSVKSFK-
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560 570 580 590 600 610
pF1KA1 KHQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKN-LLGKRISKLINSSDELQDNFREFYDSW
. ... : : :. : :.. .. .: :. : ...: ... .... :
CCDS45 RTKKSYSSTLRGMPSALKNGIISDQELLPRRNSLILKPKPDPAQQTDSQNSDTEQYFREW
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pF1KA1 HSKSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVATLSKLLEMMEEVQSLQE
:: .. ::..::.. : .::.: :.::.::::: ::..... :: . .::. :..
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680 690 700 710 720
pF1KA1 KIDERH------------HSQQAPQAEAPCLLRNSAR---LSSLFPFALLQRHSSKPVLP
. ... .:.. .: .: .:. ::: :::. . . .:
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:
CCDS45 TPLSKFLSGAKIWLSTETLANED
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.. : ...: .: :: :: : . ... .::: . : :: :: ::. .
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. .:.: ::.: : : .:: ::. ... .: . .:. : . .. :
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.: ::.:: .:. . .. .:.: :.. :: :.::::::. :. :: .:::::.:.
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::: .:: :: : . . .::.:::::::::::::..: : :::.: .: .: ::.
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: ..:: : . : : . : . : .. : .... .: . . . .
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. .. . . ::. : :. . . : . ::::: ::.:..: . ::: :
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:.:. : .. :.: : . . ..: : .: : .. . . : . : .......
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pF1KA1 ALLQRHSSKPVLPTSGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
CCDS72 QSHPFWITRC
640
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: ..:: : . : : . : . : .. : .... .: . . . .
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CCDS72 RAEGDLG
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: ::.:.:: :.. : : ..:.. .. ..:. ...: ..::.:....:. :
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CCDS59 FNENFLIMLFEHAYASQFGTFLGNNESE------RCKLKLQQKTMSL---WSWVNQ--PS
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CCDS59 ELSKFTNPLFEANNLVIWPSVAPQSLPLWEGIFLRWNRSSKYLDEAYEEMVNIIEYNKEL
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CCDS83 DEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNA
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.. :. :: . : ..:: .: ::....:.. ....: ..
CCDS83 QSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVY
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CCDS83 PNIE----ETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQL
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.::..::.: . :: ::. :..:::. :: : : .: .: : .. :::: :.:::
CCDS83 TSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCV
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pF1KA1 WQLVHQHPPAFEFTETYLTVLSDSLYIPIFSTFFFNSPHQKDTNMGREGQDTQSKPLNLL
::...: : ::::.: .: .. : :: .:.::. :: .:. :.:. : .
CCDS83 WQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQR----GKENL-----PKRTV
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pF1KA1 TVWDW-SVQFEPKAQTLLKNPLYVEKPKLDKGQRKGMRFKHQRQLSLPLTQSKSSPKRGF
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CCDS83 SLWSYINSQLED-----FTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPI
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pF1KA1 APKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLKYVQEDSCQH--GVY
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CCDS83 DSISTSADNFSPDLRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVT-YI----CPFTGAVR
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pF1KA1 GRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGVFDEKKKTLFGQL
: :. :.... : .... : . .: ... :..: :. . . .. .:
CCDS83 GTLTVTNYRLYF-----KSMERDPPFVLDASLG----VINRVEKIGGA-SSRGENSYG--
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: :::.: ..: . : ...: . . . : . . : ::.. .
CCDS83 ------LETVCKDIRNLRFA--HKPEGRTRRSIFENLMKYAFP-VSNNLPLFAF----EY
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. : :.: ..: : .. : .: : ... ...:: :..:. :: .:::. .:
CCDS83 KEVF-PENGWKLYDPLLEY-----RRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIP
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