Result of FASTA (omim) for
pFN21AA1331
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1331, 589 aa
1>>>pF1KA1331 589 - 589 aa - 589 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7111+/-0.000402; mu= 17.8400+/- 0.025
mean_var=93.0693+/-18.678, 0's: 0 Z-trim(113.6): 66 B-trim: 45 in 1/52
Lambda= 0.132945
statistics sampled from 22926 (22992) to 22926 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 7.370
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_067640 (OMIM: 608261) sentrin-specific protease ( 589) 3987 775.4 0
XP_005247748 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 474) 3206 625.6 1.2e-178
XP_005247747 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 545) 2496 489.4 1.3e-137
XP_016862462 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 430) 1715 339.5 1.3e-92
XP_016874729 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 432) 1005 203.4 1.3e-51
XP_016874725 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 631) 1005 203.5 1.7e-51
XP_016874726 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 631) 1005 203.5 1.7e-51
XP_011536546 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 663) 1005 203.5 1.8e-51
XP_016874719 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 694) 1005 203.5 1.9e-51
XP_006719425 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51
XP_016874727 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51
XP_016874728 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51
XP_016874724 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7 3e-51
XP_016874722 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7 3e-51
XP_016874723 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7 3e-51
NP_001254524 (OMIM: 612157) sentrin-specific prote ( 644) 1001 202.7 3e-51
NP_001254523 (OMIM: 612157) sentrin-specific prote ( 644) 1001 202.7 3e-51
XP_011536547 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 660) 1001 202.7 3.1e-51
XP_016874721 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 675) 1001 202.8 3.1e-51
XP_016874720 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 675) 1001 202.8 3.1e-51
XP_006719424 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 676) 1001 202.8 3.1e-51
XP_016874718 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 707) 1001 202.8 3.2e-51
NP_056485 (OMIM: 612844) sentrin-specific protease ( 574) 494 105.5 5.2e-22
NP_689912 (OMIM: 612845) sentrin-specific protease ( 755) 488 104.4 1.4e-21
XP_011510846 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 755) 488 104.4 1.4e-21
XP_005269367 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 727) 341 76.2 4.2e-13
XP_011510847 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 643) 209 50.8 1.6e-05
>>NP_067640 (OMIM: 608261) sentrin-specific protease 2 [ (589 aa)
initn: 3987 init1: 3987 opt: 3987 Z-score: 4136.8 bits: 775.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3987; 99.8% identity (99.8% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MYRWLVRILGTIFRFCDRSVPPARALLKRRRSDSTLFSTVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MYRWLVRILGTIFRFCDRSVPPARALLKRRRSDSTLFSTVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 NSLYNAASLFGFPFQLTTKPMVTSACNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 NSLYNAASLFGFPFQLTTKPMVTSACNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 NKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 QEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 SSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 TMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 RTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 NLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 LVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KA1 QQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 QQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
550 560 570 580
>>XP_005247748 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-specifi (474 aa)
initn: 3206 init1: 3206 opt: 3206 Z-score: 3328.5 bits: 625.6 E(85289): 1.2e-178
Smith-Waterman score: 3206; 99.8% identity (99.8% similar) in 474 aa overlap (116-589:1-474)
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 CNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLGNKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRV
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLKLGNKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRV
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 LPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKPQEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKPQEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVE
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 EGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKT
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 TQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTETMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEV
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 SARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQ
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 DEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPK
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 LKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 EILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPI
400 410 420 430 440 450
570 580
pF1KA1 TFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
::::::::::::::::::::::::
XP_005 TFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
460 470
>>XP_005247747 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-specifi (545 aa)
initn: 2480 init1: 2480 opt: 2496 Z-score: 2591.7 bits: 489.4 E(85289): 1.3e-137
Smith-Waterman score: 3594; 92.4% identity (92.4% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MYRWLVRILGTIFRFCDRSVPPARALLKRRRSDSTLFSTVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MYRWLVRILGTIFRFCDRSVPPARALLKRRRSDSTLFSTVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 NSLYNAASLFGFPFQLTTKPMVTSACNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NSLYNAASLFGFPFQLTTKPMVTSACNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYM
:::::::::: ::::::
XP_005 RTDDLLELTE--------------------------------------------VINFYM
370
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWS
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIP
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580
pF1KA1 QQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
500 510 520 530 540
>>XP_016862462 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-specifi (430 aa)
initn: 1699 init1: 1699 opt: 1715 Z-score: 1783.5 bits: 339.5 E(85289): 1.3e-92
Smith-Waterman score: 2813; 90.5% identity (90.5% similar) in 474 aa overlap (116-589:1-430)
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 CNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLGNKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRV
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLKLGNKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRV
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 LPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKPQEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKPQEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVE
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 EGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKT
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 TQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
XP_016 TQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTETMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEV
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 SARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTE---------------
220 230 240 250
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 DEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPK
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 -----------------------------VINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPK
260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 LKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 EILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPI
350 360 370 380 390 400
570 580
pF1KA1 TFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
410 420 430
>>XP_016874729 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi (432 aa)
initn: 975 init1: 975 opt: 1005 Z-score: 1047.6 bits: 203.4 E(85289): 1.3e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:94-432)
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
..: : : :.: .. . :..: ..
XP_016 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
70 80 90 100 110 120
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
.. . . .: : :. . . . . . .: ......:. : . : .. . :
XP_016 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
130 140 150 160 170
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
.::. :.... . ..: . .:.. :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_016 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
180 190 200 210 220 230
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
.:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_016 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
240 250 260 270 280 290
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
..:::::::::: :..: .:.::::: ::: :.:.:.::: . : :::: ... :.:
XP_016 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
300 310 320 330 340 350
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
:::::..:: :. .... : : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_016 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
360 370 380 390 400 410
570 580
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
::..:: :::.:::::::..::
XP_016 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
420 430
>>XP_016874725 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi (631 aa)
initn: 1047 init1: 975 opt: 1005 Z-score: 1045.3 bits: 203.5 E(85289): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:293-631)
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
..: : : :.: .. . :..: ..
XP_016 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
.. . . .: : :. . . . . . .: ......:. : . : .. . :
XP_016 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
.::. :.... . ..: . .:.. :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_016 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
.:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_016 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
..:::::::::: :..: .:.::::: ::: :.:.:.::: . : :::: ... :.:
XP_016 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
:::::..:: :. .... : : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_016 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
550 560 570 580 590 600
570 580
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
::..:: :::.:::::::..::
XP_016 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
610 620 630
>>XP_016874726 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi (631 aa)
initn: 1047 init1: 975 opt: 1005 Z-score: 1045.3 bits: 203.5 E(85289): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:293-631)
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
..: : : :.: .. . :..: ..
XP_016 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
.. . . .: : :. . . . . . .: ......:. : . : .. . :
XP_016 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
.::. :.... . ..: . .:.. :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_016 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
.:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_016 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
..:::::::::: :..: .:.::::: ::: :.:.:.::: . : :::: ... :.:
XP_016 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
:::::..:: :. .... : : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_016 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
550 560 570 580 590 600
570 580
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
::..:: :::.:::::::..::
XP_016 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
610 620 630
>>XP_011536546 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi (663 aa)
initn: 1047 init1: 975 opt: 1005 Z-score: 1045.0 bits: 203.5 E(85289): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:325-663)
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
..: : : :.: .. . :..: ..
XP_011 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
.. . . .: : :. . . . . . .: ......:. : . : .. . :
XP_011 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
.::. :.... . ..: . .:.. :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_011 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
.:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_011 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
470 480 490 500 510 520
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
..:::::::::: :..: .:.::::: ::: :.:.:.::: . : :::: ... :.:
XP_011 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
530 540 550 560 570 580
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
:::::..:: :. .... : : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_011 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
590 600 610 620 630 640
570 580
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
::..:: :::.:::::::..::
XP_011 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
650 660
>>XP_016874719 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi (694 aa)
initn: 1047 init1: 975 opt: 1005 Z-score: 1044.7 bits: 203.5 E(85289): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:356-694)
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
..: : : :.: .. . :..: ..
XP_016 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
.. . . .: : :. . . . . . .: ......:. : . : .. . :
XP_016 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
.::. :.... . ..: . .:.. :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_016 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
.:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_016 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
500 510 520 530 540 550
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
..:::::::::: :..: .:.::::: ::: :.:.:.::: . : :::: ... :.:
XP_016 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
560 570 580 590 600 610
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
:::::..:: :. .... : : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_016 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
620 630 640 650 660 670
570 580
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
::..:: :::.:::::::..::
XP_016 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
680 690
>>XP_006719425 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi (445 aa)
initn: 975 init1: 975 opt: 1001 Z-score: 1043.2 bits: 202.6 E(85289): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1001; 48.1% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (282-589:146-445)
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 TKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENES
: :. . . . . . .: ......:.
XP_006 SDSVILLKVKDSQTPTPSSTFFQAELWIKELTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ-
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 RRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTED
: . : .. . : .::. :.... . ..: . .:.. :.. :.::.
XP_006 -RLQEREHSVHDSVELHLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEE
180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 MEKEISNALGHGPQDEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQG
:::::.:.. .: :::.:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..:
XP_006 MEKEIKNVFRNGNQDEVLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKG
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 YPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCL
:..:.:.:::. :::..:::::::::: :..: .:.::::: ::: :.:.:.::: .
XP_006 LPSVHAFNTFFFTKLKTAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNI
290 300 310 320 330 340
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 KYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMF
: :::: ... :.::::::..:: :. .... : : : .:::::.::::::::
XP_006 TYYDSMGGINNEACRILLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMF
350 360 370 380 390 400
560 570 580
pF1KA1 TCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
.::::: :..:.::.:::..:: :::.:::::::..::
XP_006 ACKYADCITKDRPINFTQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
410 420 430 440
589 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:58:54 2016 done: Wed Nov 2 20:58:55 2016
Total Scan time: 7.370 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]