Result of FASTA (omim) for pFN21AA1144
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1144, 477 aa
  1>>>pF1KA1144 477 - 477 aa - 477 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4173+/-0.000425; mu= 16.7074+/- 0.026
 mean_var=79.6517+/-15.915, 0's: 0 Z-trim(110.9): 268  B-trim: 205 in 1/52
 Lambda= 0.143707
 statistics sampled from 18923 (19312) to 18923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  7.610

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated c ( 477) 3168 667.2 2.8e-191
XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 1703 363.5 7.7e-100
NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated c ( 491) 1703 363.5 7.7e-100
NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491) 1703 363.5 7.7e-100
XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 1703 363.5 7.7e-100
NP_758857 (OMIM: 607603) potassium voltage-gated c ( 519) 1002 218.1 4.5e-56
NP_598004 (OMIM: 607604,610356) potassium voltage- ( 545)  989 215.5   3e-55
XP_011527105 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513)  960 209.4 1.9e-53
XP_011527102 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513)  960 209.4 1.9e-53
XP_006723848 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513)  960 209.4 1.9e-53
XP_011527106 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513)  960 209.4 1.9e-53
XP_011527107 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513)  960 209.4 1.9e-53
XP_011527108 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513)  960 209.4 1.9e-53
XP_011527103 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513)  960 209.4 1.9e-53
NP_002228 (OMIM: 603788) potassium voltage-gated c ( 513)  960 209.4 1.9e-53
XP_011527104 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513)  960 209.4 1.9e-53
NP_001309728 (OMIM: 602905) potassium voltage-gate ( 526)  944 206.1 1.9e-52
NP_002242 (OMIM: 602905) potassium voltage-gated c ( 526)  944 206.1 1.9e-52
XP_016883335 (OMIM: 602905) PREDICTED: potassium v ( 527)  944 206.1 1.9e-52
NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated c ( 911)  864 189.7 2.9e-47
XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858)  861 189.1 4.2e-47
NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage- ( 858)  861 189.1 4.2e-47
XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858)  861 189.1 4.2e-47
NP_579875 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 436)  812 178.7 2.9e-44
NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated c ( 494)  756 167.1 9.8e-41
XP_016869470 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666)  682 151.9 5.1e-36
XP_016869471 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666)  682 151.9 5.1e-36
XP_016856702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  662 147.6 7.3e-35
XP_011539702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  662 147.6 7.3e-35
XP_011539700 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  662 147.6 7.3e-35
XP_011539698 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  662 147.6 7.3e-35
NP_004965 (OMIM: 176262,616366) potassium voltage- ( 499)  662 147.6 7.3e-35
XP_011539701 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  662 147.6 7.3e-35
XP_011539699 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  662 147.6 7.3e-35
NP_758847 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 425)  645 144.1 7.4e-34
NP_005540 (OMIM: 602420) potassium voltage-gated c ( 511)  644 143.9 9.9e-34
NP_114092 (OMIM: 176268) potassium voltage-gated c ( 456)  633 141.6 4.4e-33
XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466)  625 140.0 1.4e-32
NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated c ( 466)  625 140.0 1.4e-32
XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466)  625 140.0 1.4e-32
XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466)  625 140.0 1.4e-32
XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 509)  625 140.0 1.5e-32
NP_000208 (OMIM: 160120,176260) potassium voltage- ( 495)  616 138.1 5.4e-32
NP_002224 (OMIM: 176266) potassium voltage-gated c ( 653)  605 135.9 3.2e-31
NP_002223 (OMIM: 176263) potassium voltage-gated c ( 575)  594 133.6 1.4e-30
XP_006710694 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 510)  568 128.2 5.4e-29
XP_006710693 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 636)  568 128.2 6.5e-29
NP_751948 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 636)  568 128.2 6.5e-29
NP_004971 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 655)  568 128.2 6.6e-29
XP_005270908 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655)  568 128.2 6.6e-29


>>NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated chann  (477 aa)
 initn: 3168 init1: 3168 opt: 3168  Z-score: 3555.1  bits: 667.2 E(85289): 2.8e-191
Smith-Waterman score: 3168; 100.0% identity (100.0% similar) in 477 aa overlap (1-477:1-477)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 YSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 GYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFTF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 ELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRLM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 RIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLAT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 IPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       
pF1KA1 KQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
              430       440       450       460       470       

>>XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium volta  (491 aa)
 initn: 1723 init1: 798 opt: 1703  Z-score: 1913.4  bits: 363.5 E(85289): 7.7e-100
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)

               10         20        30        40        50         
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
                     .: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
XP_011    MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
                  10        20        30        40        50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
       :::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
XP_011 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
        60        70        80        90       100       110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
       :  :. :: : ... ::..: . :: :::.:   : ..  :::   .:..:...:. ..:
XP_011 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
       120       130       140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
       :.: . .....: :. ::..::..::..:. .::  :.. .   :: .: ::   :::::
XP_011 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
       180       190       200       210          220       230    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
        ::..:.:.::   ::.:: ::.::..::.::: ::.:.   : .  . :.:.:.:.:::
XP_011 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
          240       250       260       270       280       290    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
       :::::::::::::.:::::::::..::.:::::::.::::::::::. :..::... . :
XP_011 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
          300       310       320       330       340       350    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
       ..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
XP_011 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
          360       370       380       390       400       410    

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR 
       .::...  . : :  .  .:.:  :.:: ::........::...                
XP_011 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
          420       430       440       450       460       470    

XP_011 DNEDICNTTSLENCTAK
          480       490 

>>NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated chann  (491 aa)
 initn: 1723 init1: 798 opt: 1703  Z-score: 1913.4  bits: 363.5 E(85289): 7.7e-100
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)

               10         20        30        40        50         
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
                     .: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
NP_002    MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
                  10        20        30        40        50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
       :::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
NP_002 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
        60        70        80        90       100       110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
       :  :. :: : ... ::..: . :: :::.:   : ..  :::   .:..:...:. ..:
NP_002 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
       120       130       140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
       :.: . .....: :. ::..::..::..:. .::  :.. .   :: .: ::   :::::
NP_002 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
       180       190       200       210          220       230    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
        ::..:.:.::   ::.:: ::.::..::.::: ::.:.   : .  . :.:.:.:.:::
NP_002 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
          240       250       260       270       280       290    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
       :::::::::::::.:::::::::..::.:::::::.::::::::::. :..::... . :
NP_002 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
          300       310       320       330       340       350    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
       ..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
NP_002 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
          360       370       380       390       400       410    

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR 
       .::...  . : :  .  .:.:  :.:: ::........::...                
NP_002 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
          420       430       440       450       460       470    

NP_002 DNEDICNTTSLENCTAK
          480       490 

>>NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated ch  (491 aa)
 initn: 1723 init1: 798 opt: 1703  Z-score: 1913.4  bits: 363.5 E(85289): 7.7e-100
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)

               10         20        30        40        50         
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
                     .: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
NP_001    MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
                  10        20        30        40        50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
       :::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
NP_001 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
        60        70        80        90       100       110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
       :  :. :: : ... ::..: . :: :::.:   : ..  :::   .:..:...:. ..:
NP_001 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
       120       130       140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
       :.: . .....: :. ::..::..::..:. .::  :.. .   :: .: ::   :::::
NP_001 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
       180       190       200       210          220       230    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
        ::..:.:.::   ::.:: ::.::..::.::: ::.:.   : .  . :.:.:.:.:::
NP_001 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
          240       250       260       270       280       290    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
       :::::::::::::.:::::::::..::.:::::::.::::::::::. :..::... . :
NP_001 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
          300       310       320       330       340       350    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
       ..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
NP_001 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
          360       370       380       390       400       410    

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR 
       .::...  . : :  .  .:.:  :.:: ::........::...                
NP_001 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
          420       430       440       450       460       470    

NP_001 DNEDICNTTSLENCTAK
          480       490 

>>XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium volta  (491 aa)
 initn: 1723 init1: 798 opt: 1703  Z-score: 1913.4  bits: 363.5 E(85289): 7.7e-100
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)

               10         20        30        40        50         
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
                     .: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
XP_016    MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
                  10        20        30        40        50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
       :::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
XP_016 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
        60        70        80        90       100       110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
       :  :. :: : ... ::..: . :: :::.:   : ..  :::   .:..:...:. ..:
XP_016 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
       120       130       140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
       :.: . .....: :. ::..::..::..:. .::  :.. .   :: .: ::   :::::
XP_016 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
       180       190       200       210          220       230    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
        ::..:.:.::   ::.:: ::.::..::.::: ::.:.   : .  . :.:.:.:.:::
XP_016 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
          240       250       260       270       280       290    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
       :::::::::::::.:::::::::..::.:::::::.::::::::::. :..::... . :
XP_016 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
          300       310       320       330       340       350    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
       ..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
XP_016 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
          360       370       380       390       400       410    

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR 
       .::...  . : :  .  .:.:  :.:: ::........::...                
XP_016 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
          420       430       440       450       460       470    

XP_016 DNEDICNTTSLENCTAK
          480       490 

>>NP_758857 (OMIM: 607603) potassium voltage-gated chann  (519 aa)
 initn: 862 init1: 358 opt: 1002  Z-score: 1127.6  bits: 218.1 E(85289): 4.5e-56
Smith-Waterman score: 1003; 38.6% identity (69.4% similar) in 438 aa overlap (8-428:51-476)

                                      10        20        30       
pF1KA1                        MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLR
                                     :.: ....  :: ::::: .  :   :: :
NP_758 SPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKK-EILINVGGRRYLLPWSTLDR
               30        40        50         60        70         

        40        50        60        70        80        90       
pF1KA1 FPETRLGRLLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELC
       :: .::..: ::.: : :..::::::. ..::.:::.:  :  .. :  .::: .. :.:
NP_758 FPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMC
      80        90       100       110       120       130         

       100       110       120       130       140       150       
pF1KA1 VFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYND
       ..::..:. ::::.:  .. ::  .   ::.:  .:    .  .:..  .  :     . 
NP_758 ALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLL-RKLEELEEL--AKLHREDVLRQQRETRRPASH
     140       150       160        170         180       190      

       160       170       180       190       200       210       
pF1KA1 ASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDS
       .:.. :  .. .:...    .::  .. ..::. :::: :  . ...:....::..  ..
NP_758 SSRW-GLCMNRLREMV----ENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEED
        200        210           220       230       240       250 

       220        230       240       250       260       270      
pF1KA1 QGNPGEDPRF-EIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLV
       ::. ..   .  ::: . .:::..:.  ::. : :  .::.. ::.::...: :.:..:.
NP_758 QGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLA
             260       270       280       290       300       310 

        280                 290       300       310       320      
pF1KA1 VNLVVESTPT----------LANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSY
       :.   :  :           : ..: : .::: .::. ...::::: ::..:: :..   
NP_758 VS---EEPPEDGERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCT
                320       330       340       350       360        

        330       340       350         360       370       380    
pF1KA1 KEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGL--ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGT
       .: :::::.:.:.:..:: ..:. ::: .. :  ..::: .::: .:::::::::.:: .
NP_758 REFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRS
      370       380       390       400       410       420        

          390       400       410           420       430       440
pF1KA1 TAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFY----RRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVP
       . :...: . ::.:::....: : ::. ::: :    ..:.::.. .:            
NP_758 VPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECE
      430       440       450       460       470       480        

              450       460       470       
pF1KA1 SVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
                                            
NP_758 LLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM      
      490       500       510               

>>NP_598004 (OMIM: 607604,610356) potassium voltage-gate  (545 aa)
 initn: 1008 init1: 301 opt: 989  Z-score: 1112.8  bits: 215.5 E(85289): 3e-55
Smith-Waterman score: 989; 39.2% identity (67.8% similar) in 416 aa overlap (19-424:99-507)

                           10        20        30        40        
pF1KA1             MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
                                     . .:::: . .:    :  ::.::::::  
NP_598 DDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLAT
       70        80        90       100       110       120        

       50        60        70        80        90       100        
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
         ::   : :::::..   :..:::.: .:  : .:: .: : :.  ::   : .:. ::
NP_598 STSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYW
      130       140       150       160       170       180        

      110       120       130       140       150       160        
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN
       :.   .   ::   .. :. :  .:.   : . ..  .. .:   .. :  .: : :   
NP_598 GVRLKYTPRCCRICFEERRDE-LSERLKIQHELRAQ-AQVEEAEELFRDM-RFYG-PQ--
      190       200        210       220        230        240     

      170       180       190       200       210       220        
pF1KA1 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGED--PR
        ::.::  ...:  :: ...... :   :. :.... ::.. ..:  ..::. : :  : 
NP_598 -RRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRPI
             250       260       270       280       290       300 

        230       240       250       260       270       280      
pF1KA1 FEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVV----E
       .: :: . ...::.: . :.: .::. .: ..::::.::..:.:.:. :...  .    .
NP_598 LEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGHQ
             310       320       330       340       350       360 

            290          300       310       320       330         
pF1KA1 STPTLANLGRVAQVLR---LMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVG
          :....:.:.::::   ::::::::::::::::::..: ::.  :..:: :::....:
NP_598 RGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAMG
             370       380       390       400       410       420 

     340       350        360       370       380       390        
pF1KA1 ISIFSVVAYTIEKE-ENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG
       :  ::...:..:..  . ...:::  ::::.::..::::::. : :  :.. :  ::  :
NP_598 IFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAFG
             430       440       450       460       470       480 

      400       410       420       430       440       450        
pF1KA1 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS
       :..  .::....:::: .: . :  :                                  
NP_598 IILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLTP
             490       500       510       520       530       540 

>>XP_011527105 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium volta  (513 aa)
 initn: 855 init1: 351 opt: 960  Z-score: 1080.6  bits: 209.4 E(85289): 1.9e-53
Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (19-422:65-472)

                           10        20        30        40        
pF1KA1             MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
                                     : :::::.:  :   :: .:: ::::.:  
XP_011 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
           40        50        60        70        80        90    

       50        60        70        80        90       100        
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
       : . . ::..::::: .  ::.:::::  :  .: : ..:::... :.:..::..:. ::
XP_011 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW
          100       110       120       130       140       150    

      110       120       130            140       150       160   
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG
       :: :  .:.::.  :  .:.:      :.:. :.  :.:.  :         .  .. .:
XP_011 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG
          160       170        180       190                200    

           170       180       190       200       210       220   
pF1KA1 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE
       . ::   :.:   .. :  .. ..::. ::.: :  . ... ...::...  . ::. ..
XP_011 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ
           210       220       230       240       250       260   

            230       240       250       260       270       280  
pF1KA1 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
             :::   ..::..:.. :.  ::. . :... :.::::..:.:.::::.:. .. 
XP_011 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
           270       280       290       300       310       320   

                   290       300       310       320       330     
pF1KA1 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY
       .   :  .:     .: : .::: .::. ...::::: ::..:: : .   .: :::::.
XP_011 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF
           330       340       350       360       370       380   

         340       350         360       370       380       390   
pF1KA1 LSVGISIFSVVAYTIEKEENEG--LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASA
       : :.:..:. . :.::.:  ..  ...::::.:::...::::::::.:: .: :...: .
XP_011 LCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALS
           390       400       410       420       430       440   

           400       410       420       430       440       450   
pF1KA1 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK
        ::.:::....:.: ::. ::. : . ::                               
XP_011 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG
           450       460       470       480       490       500   

>>XP_011527102 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium volta  (513 aa)
 initn: 855 init1: 351 opt: 960  Z-score: 1080.6  bits: 209.4 E(85289): 1.9e-53
Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (19-422:65-472)

                           10        20        30        40        
pF1KA1             MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
                                     : :::::.:  :   :: .:: ::::.:  
XP_011 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
           40        50        60        70        80        90    

       50        60        70        80        90       100        
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
       : . . ::..::::: .  ::.:::::  :  .: : ..:::... :.:..::..:. ::
XP_011 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW
          100       110       120       130       140       150    

      110       120       130            140       150       160   
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG
       :: :  .:.::.  :  .:.:      :.:. :.  :.:.  :         .  .. .:
XP_011 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG
          160       170        180       190                200    

           170       180       190       200       210       220   
pF1KA1 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE
       . ::   :.:   .. :  .. ..::. ::.: :  . ... ...::...  . ::. ..
XP_011 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ
           210       220       230       240       250       260   

            230       240       250       260       270       280  
pF1KA1 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
             :::   ..::..:.. :.  ::. . :... :.::::..:.:.::::.:. .. 
XP_011 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
           270       280       290       300       310       320   

                   290       300       310       320       330     
pF1KA1 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY
       .   :  .:     .: : .::: .::. ...::::: ::..:: : .   .: :::::.
XP_011 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF
           330       340       350       360       370       380   

         340       350         360       370       380       390   
pF1KA1 LSVGISIFSVVAYTIEKEENEG--LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASA
       : :.:..:. . :.::.:  ..  ...::::.:::...::::::::.:: .: :...: .
XP_011 LCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALS
           390       400       410       420       430       440   

           400       410       420       430       440       450   
pF1KA1 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK
        ::.:::....:.: ::. ::. : . ::                               
XP_011 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG
           450       460       470       480       490       500   

>>XP_006723848 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium volta  (513 aa)
 initn: 855 init1: 351 opt: 960  Z-score: 1080.6  bits: 209.4 E(85289): 1.9e-53
Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (19-422:65-472)

                           10        20        30        40        
pF1KA1             MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
                                     : :::::.:  :   :: .:: ::::.:  
XP_006 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
           40        50        60        70        80        90    

       50        60        70        80        90       100        
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
       : . . ::..::::: .  ::.:::::  :  .: : ..:::... :.:..::..:. ::
XP_006 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW
          100       110       120       130       140       150    

      110       120       130            140       150       160   
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG
       :: :  .:.::.  :  .:.:      :.:. :.  :.:.  :         .  .. .:
XP_006 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG
          160       170        180       190                200    

           170       180       190       200       210       220   
pF1KA1 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE
       . ::   :.:   .. :  .. ..::. ::.: :  . ... ...::...  . ::. ..
XP_006 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ
           210       220       230       240       250       260   

            230       240       250       260       270       280  
pF1KA1 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
             :::   ..::..:.. :.  ::. . :... :.::::..:.:.::::.:. .. 
XP_006 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
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