Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1047
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1047, 2337 aa
1>>>pF1KA1047 2337 - 2337 aa - 2337 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7990+/-0.00105; mu= -2.3793+/- 0.064
mean_var=339.2463+/-68.906, 0's: 0 Z-trim(114.3): 33 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.069633
statistics sampled from 14806 (14829) to 14806 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.456), width: 16
Scan time: 7.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54095.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17 (2337) 15543 1576.8 0
CCDS11175.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17 (2440) 7525 771.4 0
CCDS54094.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17 ( 914) 5821 599.9 1.8e-170
CCDS41857.2 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12 (2458) 3013 318.1 3.3e-85
CCDS55892.1 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12 (2504) 3013 318.1 3.3e-85
CCDS41858.2 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12 (2514) 2808 297.5 5.3e-79
>>CCDS54095.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17 (2337 aa)
initn: 15543 init1: 15543 opt: 15543 Z-score: 8446.5 bits: 1576.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 15543; 100.0% identity (100.0% similar) in 2337 aa overlap (1-2337:1-2337)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 YLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 RAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 GSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRAT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 TESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQES
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 RKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 ENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRT
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 PVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 AMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKER
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 ERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVI
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 TPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKEISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKEISS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 HRYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQES
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 PSPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQN
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 SPSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVS
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA1 SEPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SEPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSP
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA1 MVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGL
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA1 EDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCK
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA1 PKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQF
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330
pF1KA1 PYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD
2290 2300 2310 2320 2330
>>CCDS11175.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17 (2440 aa)
initn: 8164 init1: 7374 opt: 7525 Z-score: 4093.0 bits: 771.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 14529; 94.3% identity (94.3% similar) in 2369 aa overlap (1-2250:1-2353)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENPEDSE----------------VEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 YLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 RAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVK
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 GSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRAT
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 TESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQES
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 RKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVP
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 ENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRT
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 PVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 AMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKER
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 ERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVI
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1810 1820 1830 1840 1850
pF1KA1 TPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKE---
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKESKH
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
CCDS11 EAARLEENLRSRSAAVSEQQQLEQKTLEVEKRSVQCLYTSSAFPSGKPQPHSSVVYSEAG
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1860
pF1KA1 --------------------------------------------------------ISSH
.:::
CCDS11 KDKGPPPKSRYEEELRTRGKTTITAANFIDVIITRQIASDKDARERGSQSSDSSSSLSSH
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 RYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQESP
1970 1980 1990 2000 2010 2020
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 SPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQNS
2030 2040 2050 2060 2070 2080
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 PSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVSS
2090 2100 2110 2120 2130 2140
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA1 EPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSPM
2150 2160 2170 2180 2190 2200
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA1 VKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGLE
2210 2220 2230 2240 2250 2260
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA1 DIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKP
2270 2280 2290 2300 2310 2320
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA1 KLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQFP
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQFP
2330 2340 2350 2360 2370 2380
>--
initn: 616 init1: 616 opt: 616 Z-score: 341.9 bits: 77.3 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 616; 100.0% identity (100.0% similar) in 87 aa overlap (2251-2337:2354-2440)
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA1 PKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQF
2330 2340 2350 2360 2370 2380
2290 2300 2310 2320 2330
pF1KA1 PYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD
2390 2400 2410 2420 2430 2440
>>CCDS54094.1 NCOR1 gene_id:9611|Hs108|chr17 (914 aa)
initn: 5821 init1: 5821 opt: 5821 Z-score: 3174.1 bits: 599.9 E(32554): 1.8e-170
Smith-Waterman score: 5846; 89.3% identity (89.3% similar) in 1021 aa overlap (1-1021:1-912)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQ------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQ
CCDS54 ------------------------------------------------------------
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 -------------------------DPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEE
40 50 60 70
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIY
80 90 100 110 120 130
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
140 150 160 170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQ
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM
260 270 280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYL
320 330 340 350 360 370
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDE
380 390 400 410 420 430
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
440 450 460 470 480 490
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEA
500 510 520 530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEE
560 570 580 590 600 610
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTS
620 630 640 650 660 670
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV
680 690 700 710 720 730
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCS
740 750 760 770 780 790
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCT
800 810 820 830 840 850
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREW
860 870 880 890 900 910
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 EVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGT
:
CCDS54 EGR
>>CCDS41857.2 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12 (2458 aa)
initn: 3208 init1: 1955 opt: 3013 Z-score: 1643.3 bits: 318.1 E(32554): 3.3e-85
Smith-Waterman score: 4928; 42.0% identity (62.9% similar) in 2435 aa overlap (1-2170:1-2339)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
::.: : : .:: ::::::..: .: . . .. .:. : . ::.: .
CCDS41 MSGSTQPVAQTWRATEP-RYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQ--HHSRDYASHLSPGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQER--RTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSH
: ::::::::::.::..: :: : . . : . . . .:::::::: . :
CCDS41 IIQPQRRRPSLLSEFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPD--
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 FQRVSAAVLPLVHPLP---EGLRA-SADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPS
::..: : : : : : :: .. :: : : :: : . . :
CCDS41 ---------PLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRSLTGKLE-PVSPPSPPHTDPELELVPP
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRS
.::::::::.::::::::. ::::: :::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS41 RLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFK
.::::::::::::: ::.:.:::::.::::::::::::. :::::: ::.:::::::.::
CCDS41 LVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 RRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQRE
:::::::: :::.:::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS41 RRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 QQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRR
:::.:::::::.::: . ::::::.:::::::::::: :::::::.:::::..::.:.:
CCDS41 LQERMQRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 VKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDC
.::::::::: :::::::::: ::.:...::: :..::.:::::::::::.::::.: .:
CCDS41 IKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAEC
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 VLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEED--KAEKTEKKEEEK
::::::::::::::.::::.: .:::..:: . .:... ..... .. . :: :.::
CCDS41 VLYYYLTKKNENYKSLVRRSY-RRRGKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKEK
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KA1 KDEEEKDEKEDSKENTKE---KDKIDGTA-EETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRS
. : ::.:.. :: :: :.: : :. :...:.: .. .::::::::::::::::::
CCDS41 EKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRS
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 MTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWA
:.::: .:: : : : : :.:::::::::.:::::.::::::.
CCDS41 MANEAN---------SEEAITP-QQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNWS
590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 AIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSA
:::.:::.:. .::::::::::.:.:::..::::: : .. .: .. ..:: .:
CCDS41 AIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEAA
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750
pF1KA1 ----QEDEDIEAS----NEEENPEDSEGA-ENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATS
:::..::: :::: :..:.. .::::::: ::: : ....:. ..
CCDS41 FPPVVEDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEATVNNSSDTESIPSPHTEAAKDTGQNGPKPPAT
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 RG-NTEPAVELEPTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQE
: . : : : : .:. .:... : . . : :: ...:
CCDS41 LGADGPPPGPPTPPPEDIP--APTEPTPASE-ATGAPTPPPAPPSPSAPPPVVPKEEKEE
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 HSA-----EEGSVCDPPPATK--ADSVDVEVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVE-
..: ::: :: : . .:. .: : . . ..: .: .: . : .:
CCDS41 ETAAAPPVEEGEEQKPPAAEELAVDTGKAEEPVKSECTEEAEEGPAKGKDAEAAEATAEG
820 830 840 850 860 870
880 890 900 910 920
pF1KA1 ---PRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEP-ERQRMFPMDSKPSLLNP
. .. .. .:. .:.:::::::::: ..: ...:. .. .::::.:
CCDS41 ALKAEKKEGGSGRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVDEAEGGDKNRL--LSPRPSLLTP
880 890 900 910 920
930 940 950 960 970
pF1KA1 TGSILVS-SPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPM----VSCTPCN-------IPIGTPVSGYA
::. .. :: :: ::: ::..:::.:::. : : . : . :
CCDS41 TGDPRANASPQKP--LDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPREDAAPTKPAPPAPPPPQNL
930 940 950 960 970 980
980 990 1000 1010
pF1KA1 LYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSST---------------SPCGTS--KSPN
. . :. ..:. : : .. . :: :: :
CCDS41 QPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAEKPVFFPAFAAEAQKLPGDPPCWTSGLPFPV
990 1000 1010 1020 1030 1040
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 REWEVLQPAPH----QVITNLPEGVRLP-----TTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEK-PSF
::.. .:: .... : : :: :.::. : :: : . ..: : ::
CCDS41 PPREVIKASPHAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTARPVLPRPPTISNPPPLISSAKHPSV
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 I--MGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEE
. . :.:::: .. . .. :.... : :: ...::: .. : : . .:::.
CCDS41 LERQIGAISQG-----MSVQLHVPYSEHAKAP-VGPVTMGLPLPMDPKKLAPFSGVKQEQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 FSPRSQNSQPEGLLV-RAQHEGVVRGTA-GAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQ
.:::.: . ::.: : ::. .:.:::: :.. ::::.: :.... .: . :::::.
CCDS41 LSPRGQAGPPESLGVPTAQEASVLRGTALGSVPGGSITKGIPSTRVPSDSAITYRGSITH
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA1 GTPALPQTGIPTEALVKGSISRMPIEDSSP--EKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDN-
:::: ..: ::.:.:. ::: ..:::.. :::::::::.::.:::..
CCDS41 GTPA--------DVLYKGTITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGKKGHVLSYEGG
1230 1240 1250 1260 1270
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 ---IKNAREGTRSPR-TAHEISL-KRSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALP-
. ..: :: :: . ::.:. .:: . ...: :: .:::. ::.:
CCDS41 MSVTQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAIS------SASIEGLMGRAIPP
1280 1290 1300 1310 1320
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA1 -RGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKYP-KQIKRES-----PPIRAFEGA
: ::: :::. . ::: :: ::. .:. :: :. : .:::. :: : . :
CCDS41 ERHSPHH-LKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPSRDLTEA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA1 IT-------KGKP-YDG-ITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQSTRPIIEGSI
: :: ..: ..:.:: :::::::::... :.:::. . ::. ::::
CCDS41 YKTQALGPLKLKPAHEGLVATVKEAGRSIHEIPREEL-----RHTPELPLAPRPLKEGSI
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA1 SQGTPIKFDNNSGQS-AIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVERGKYEDVKAG
.::::.:.:.... . . ::.:.::: .:.. . ::... . ...::. ::
CCDS41 TQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPVHPLDVMADA-RALERACYE-----
1450 1460 1470 1480 1490
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KA1 ETVRSRHTSVVSSGPSVLRST---LHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSYQNTMSRGSPM
:...:: .. ::: :. :.. . : : . :: :.: .: : . . . ::::.
CCDS41 ESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLTYEDHGA---P--FAGHLPRGSPV
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 MNRT-----SDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH--SPFDPHH
.: .. ..::.:.. ..:: : :: . . : .: :: : : ::..
CCDS41 TTREPTPRLQEGSLSSSKAS-QDRKLTSTPREIAKSP-HSTVPEHHP---HPISPYEHLL
1560 1570 1580 1590 1600
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 RGSTAGEVYRSHLPTHLDP-AMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY------
:: .. ..::::.: .:: ..: :: ::::: . :.:.:.: :: : :
CCDS41 RGVSGVDLYRSHIPLAFDPTSIPRGIPLD-AAAAYYLPRHLAPNPTYPHLYPPYLIRGYP
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA1 ---AMENTRQTILNDYITSQQMQVNL------RPDVARGLSPREQPLGLPYPA-TRGIID
:.:: ::::.:::::::::. : : :. :::::::. :.: : : :::::
CCDS41 DTAALEN-RQTIINDYITSQQMHHNAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALNYAAGPRGIID
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1680 1690 1700 1710 1720
pF1KA1 LTNMPPT-ILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLA---AAA
:...: .::: :: . :::..:.: . : : ..:. .::: ::::. ...
CCDS41 LSQVPHLPVLVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQPFSSR-HSSSPLSPGGPTHLTKPTTTS
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1730 1740 1750 1760
pF1KA1 SAEREREREREKERERER---IAAASSDL----YLRPGSEQPG-----------RPGSHG
:.::::.:.::..:.::: : .... . :::.:: . ::.::.
CCDS41 SSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGSSGGGGGSSSRPASHS
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA1 YVRSPSP-SVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQ--LR-------IMPL----
.... :: : :::.. :::::::...:. ..:: ..:.. :: . :
CCDS41 HAHQHSPISPRTQDA-LQQRPSVLHNTGMKGIITAVEPSTPTVLRSTSTSSPVRPAATFP
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1820 1830 1840 1850
pF1KA1 -----PAGG------PSISQG--LPAS----------RYNTAADALAALVDAAASAPQMD
: :: :.. . :: : .:. :: .. : .
CCDS41 PATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEAPRVARPERPRADTGHAFLAKPPARSGLEPASS
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1860 1870 1880
pF1KA1 VSKTKE-------ISSHRY--ETPSD--AIEVISPASSPAPP-------QEKLQT-----
:: .: .:.: .::. : . :: . :::: .:: :.
CCDS41 PSKGSEPRPLVPPVSGHATIARTPAKNLAPHHASP-DPPAPPASASDPHREKTQSKPFSI
1970 1980 1990 2000 2010 2020
1890 1900 1910 1920
pF1KA1 --------------YQPEVVKANQAENDPTRQYEG--PLH-------HY----RPQQESP
:.:: :. . ..:. .. : : : ::.: .:
CCDS41 QELELRSLGYHGSSYSPEGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLEGELRPKQPGP
2030 2040 2050 2060 2070 2080
1930 1940 1950 1960
pF1KA1 ----SPQQQLP-----PSSQAEG---MGQVP--RTH-RLITLADHICQIITQDFARNQVS
. .:: : :: . . .: . : :..:::.:: ..::::..:.. .
CCDS41 VKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGVKGHQRVVTLAQHISEVITQDYTRHHPQ
2090 2100 2110 2120 2130 2140
1970 1980 1990 2000 2010 2020
pF1KA1 SQTPQQP-PTSTFQNSPSALVSTPV---RTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLV
. . : : .: :.: : :: : :. : : . : : .: ::.
CCDS41 QLSAPLPAPLYSF---PGA--SCPVLDLRRPPSDLYLPPPD-----HGAP-ARGSPH---
2150 2160 2170 2180
2030 2040 2050 2060 2070
pF1KA1 DKSRGSRPGKSPERSHV---SSEPYEPISPPQ--VPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRN
:.:.. . :... : . . ::.:::. . : .. :: . : . .:
CCDS41 --SEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVYPLLYRDGEQTEPSRM
2190 2200 2210 2220 2230 2240
2080 2090 2100 2110 2120 2130
pF1KA1 DARSPGSISYLPSFFTKL-ENTSPMVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLP
..:::. : :.::.:: :..: ::::::::: .:::. . .. .. .::::::::.:
CCDS41 GSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNISQPGTEIFNMP
2250 2260 2270 2280 2290 2300
2140 2150 2160 2170 2180 2190
pF1KA1 AVTTSGSVSSRGHSFADPAS-NLGLEDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTAN
:.: .: .. :... . :: :.::: ::::::::
CCDS41 AITGTGLMTYRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLAS
2310 2320 2330 2340 2350 2360
2200 2210 2220 2230 2240 2250
pF1KA1 TSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHS
CCDS41 GDRPPSVSSVHSEGDCNRRTPLTNRVWEDRPSSAGSTPFPYNPLIMRLQAGVMASPPPPG
2370 2380 2390 2400 2410 2420
>>CCDS55892.1 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12 (2504 aa)
initn: 3247 init1: 1955 opt: 3013 Z-score: 1643.1 bits: 318.1 E(32554): 3.3e-85
Smith-Waterman score: 4940; 42.0% identity (62.9% similar) in 2438 aa overlap (1-2173:1-2342)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
::.: : : .:: ::::::..: .: . . .. .:. : . ::.: .
CCDS55 MSGSTQPVAQTWRATEP-RYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQ--HHSRDYASHLSPGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQER--RTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSH
: ::::::::::.::..: :: : . . : . . . .:::::::: . :
CCDS55 IIQPQRRRPSLLSEFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPD--
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 FQRVSAAVLPLVHPLP---EGLRA-SADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPS
::..: : : : : : :: .. :: : : :: : . . :
CCDS55 ---------PLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRSLTGKLE-PVSPPSPPHTDPELELVPP
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRS
.::::::::.::::::::. ::::: :::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS55 RLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFK
.::::::::::::: ::.:.:::::.::::::::::::. :::::: ::.:::::::.::
CCDS55 LVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 RRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQRE
:::::::: :::.:::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS55 RRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 QQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRR
:::.:::::::.::: . ::::::.:::::::::::: :::::::.:::::..::.:.:
CCDS55 LQERMQRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 VKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDC
.::::::::: :::::::::: ::.:...::: :..::.:::::::::::.::::.: .:
CCDS55 IKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAEC
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 VLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEED--KAEKTEKKEEEK
::::::::::::::.::::.: .:::..:: . .:... ..... .. . :: :.::
CCDS55 VLYYYLTKKNENYKSLVRRSY-RRRGKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKEK
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KA1 KDEEEKDEKEDSKENTKE---KDKIDGTA-EETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRS
. : ::.:.. :: :: :.: : :. :...:.: .. .::::::::::::::::::
CCDS55 EKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRS
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 MTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWA
:.::: .:: : : : : :.:::::::::.:::::.::::::.
CCDS55 MANEAN---------SEEAITP-QQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNWS
590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 AIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSA
:::.:::.:. .::::::::::.:.:::..::::: : .. .: .. ..:: .:
CCDS55 AIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEAA
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750
pF1KA1 ----QEDEDIEAS----NEEENPEDSEGA-ENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATS
:::..::: :::: :..:.. .::::::: ::: : ....:. ..
CCDS55 FPPVVEDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEATVNNSSDTESIPSPHTEAAKDTGQNGPKPPAT
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 RG-NTEPAVELEPTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQE
: . : : : :. :. .:... : . . : :: ...:
CCDS55 LGADGPPPGPPTPPPEDIPA--PTEPTPASE-ATGAPTPPPAPPSPSAPPPVVPKEEKEE
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 HSA-----EEGSVCDPPPATK--ADSVDVEVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVE-
..: ::: :: : . .:. .: : . . ..: .: .: . : .:
CCDS55 ETAAAPPVEEGEEQKPPAAEELAVDTGKAEEPVKSECTEEAEEGPAKGKDAEAAEATAEG
820 830 840 850 860 870
880 890 900 910 920
pF1KA1 ---PRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEP-ERQRMFPMDSKPSLLNP
. .. .. .:. .:.:::::::::: ..: ...:. .. .::::.:
CCDS55 ALKAEKKEGGSGRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVDEAEGGDKNRL--LSPRPSLLTP
880 890 900 910 920
930 940 950 960 970
pF1KA1 TGSILVS-SPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPM----VSCTPCN-------IPIGTPVSGYA
::. .. :: : :::: ::..:::.:::. : : . : . :
CCDS55 TGDPRANASPQK--PLDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPREDAAPTKPAPPAPPPPQNL
930 940 950 960 970 980
980 990 1000 1010
pF1KA1 LYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSST---------------SPCGTS--KSPN
. . :. ..:. : : .. . :: :: :
CCDS55 QPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAEKPVFFPAFAAEAQKLPGDPPCWTSGLPFPV
990 1000 1010 1020 1030 1040
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 REWEVLQPAPH----QVITNLPEGVRLP-----TTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEK-PSF
::.. .:: .... : : :: :.::. : :: : . ..: : ::
CCDS55 PPREVIKASPHAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTARPVLPRPPTISNPPPLISSAKHPSV
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 I--MGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEE
. . :.:::: .. . .. :.... : :: ...::: .. : : . .:::.
CCDS55 LERQIGAISQG-----MSVQLHVPYSEHAKAP-VGPVTMGLPLPMDPKKLAPFSGVKQEQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 FSPRSQNSQPEGLLV-RAQHEGVVRGTA-GAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQ
.:::.: . ::.: : ::. .:.:::: :.. ::::.: :.... .: . :::::.
CCDS55 LSPRGQAGPPESLGVPTAQEASVLRGTALGSVPGGSITKGIPSTRVPSDSAITYRGSITH
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA1 GTPALPQTGIPTEALVKGSISRMPIEDSSP--EKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDN-
:::: ..: ::.:.:. ::: ..:::.. :::::::::.::.:::..
CCDS55 GTPA--------DVLYKGTITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGKKGHVLSYEGG
1230 1240 1250 1260 1270
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 ---IKNAREGTRSPR-TAHEISL-KRSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALP-
. ..: :: :: . ::.:. .:: . ...: :: .:::. ::.:
CCDS55 MSVTQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAIS------SASIEGLMGRAIPP
1280 1290 1300 1310 1320
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA1 -RGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKYP-KQIKRES-----PPIRAFEGA
: ::: :::. . ::: :: ::. .:. :: :. : .:::. :: : . :
CCDS55 ERHSPHH-LKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPSRDLTEA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA1 IT-------KGKP-YDG-ITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQSTRPIIEGSI
: :: ..: ..:.:: :::::::::... :.:::. . ::. ::::
CCDS55 YKTQALGPLKLKPAHEGLVATVKEAGRSIHEIPREEL-----RHTPELPLAPRPLKEGSI
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA1 SQGTPIKFDNNSGQS-AIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVERGKYEDVKAG
.::::.:.:.... . . ::.:.::: .:.. . ::... . ...::. ::
CCDS55 TQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPVHPLDVMADA-RALERACYE-----
1450 1460 1470 1480 1490
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KA1 ETVRSRHTSVVSSGPSVLRST---LHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSYQNTMSRGSPM
:...:: .. ::: :. :.. . : : . :: :.: .: : . . . ::::.
CCDS55 ESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLTYEDHGA---P--FAGHLPRGSPV
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 MNRT-----SDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSH--SPFDPHH
.: .. ..::.:.. ..:: : :: . . : .: :: : : ::..
CCDS55 TTREPTPRLQEGSLSSSKAS-QDRKLTSTPREIAKSP-HSTVPEHHP---HPISPYEHLL
1560 1570 1580 1590 1600
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 RGSTAGEVYRSHLPTHLDP-AMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLY------
:: .. ..::::.: .:: ..: :: ::::: . :.:.:.: :: : :
CCDS55 RGVSGVDLYRSHIPLAFDPTSIPRGIPLD-AAAAYYLPRHLAPNPTYPHLYPPYLIRGYP
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA1 ---AMENTRQTILNDYITSQQMQVNL------RPDVARGLSPREQPLGLPYPA-TRGIID
:.:: ::::.:::::::::. : : :. :::::::. :.: : : :::::
CCDS55 DTAALEN-RQTIINDYITSQQMHHNAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALNYAAGPRGIID
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1680 1690 1700 1710 1720
pF1KA1 LTNMPPT-ILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLA---AAA
:...: .::: :: . :::..:.: . : : ..:. .::: ::::. ...
CCDS55 LSQVPHLPVLVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQPFSSR-HSSSPLSPGGPTHLTKPTTTS
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1730 1740 1750 1760
pF1KA1 SAEREREREREKERERER---IAAASSDL----YLRPGSEQPG-----------RPGSHG
:.::::.:.::..:.::: : .... . :::.:: . ::.::.
CCDS55 SSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGSSGGGGGSSSRPASHS
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA1 YVRSPSP-SVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQ--LR-------IMPL----
.... :: : :::.. :::::::...:. ..:: ..:.. :: . :
CCDS55 HAHQHSPISPRTQDA-LQQRPSVLHNTGMKGIITAVEPSTPTVLRSTSTSSPVRPAATFP
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1820 1830 1840 1850
pF1KA1 -----PAGG------PSISQG--LPAS----------RYNTAADALAALVDAAASAPQMD
: :: :.. . :: : .:. :: .. : .
CCDS55 PATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEAPRVARPERPRADTGHAFLAKPPARSGLEPASS
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1860 1870 1880
pF1KA1 VSKTKE-------ISSHRY--ETPSD--AIEVISPASSPAPP-------QEKLQT-----
:: .: .:.: .::. : . :: . :::: .:: :.
CCDS55 PSKGSEPRPLVPPVSGHATIARTPAKNLAPHHASP-DPPAPPASASDPHREKTQSKPFSI
1970 1980 1990 2000 2010 2020
1890 1900 1910 1920
pF1KA1 --------------YQPEVVKANQAENDPTRQYEG--PLH-------HY----RPQQESP
:.:: :. . ..:. .. : : : ::.: .:
CCDS55 QELELRSLGYHGSSYSPEGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLEGELRPKQPGP
2030 2040 2050 2060 2070 2080
1930 1940 1950 1960
pF1KA1 ----SPQQQLP-----PSSQAEG---MGQVP--RTH-RLITLADHICQIITQDFARNQVS
. .:: : :: . . .: . : :..:::.:: ..::::..:.. .
CCDS55 VKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGVKGHQRVVTLAQHISEVITQDYTRHHPQ
2090 2100 2110 2120 2130 2140
1970 1980 1990 2000 2010 2020
pF1KA1 SQTPQQP-PTSTFQNSPSALVSTPV---RTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLV
. . : : .: :.: : :: : :. : : . : : .: ::.
CCDS55 QLSAPLPAPLYSF---PGA--SCPVLDLRRPPSDLYLPPPD-----HGAP-ARGSPH---
2150 2160 2170 2180
2030 2040 2050 2060 2070
pF1KA1 DKSRGSRPGKSPERSHV---SSEPYEPISPPQ--VPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRN
:.:.. . :... : . . ::.:::. . : .. :: . : . .:
CCDS55 --SEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVYPLLYRDGEQTEPSRM
2190 2200 2210 2220 2230 2240
2080 2090 2100 2110 2120 2130
pF1KA1 DARSPGSISYLPSFFTKL-ENTSPMVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLP
..:::. : :.::.:: :..: ::::::::: .:::. . .. .. .::::::::.:
CCDS55 GSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNISQPGTEIFNMP
2250 2260 2270 2280 2290 2300
2140 2150 2160 2170 2180 2190
pF1KA1 AVTTSGSVSSRGHSFADPAS-NLGLEDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTAN
:.: .: .. :... . :: :.::: ::::::::..:
CCDS55 AITGTGLMTYRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGKYDQWEESPPLSANAFNPLNASASL
2310 2320 2330 2340 2350 2360
2200 2210 2220 2230 2240 2250
pF1KA1 TSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHS
CCDS55 PAAMPITAADGRSDHTLTSPGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGDRPPSVSSVHSEG
2370 2380 2390 2400 2410 2420
>>CCDS41858.2 NCOR2 gene_id:9612|Hs108|chr12 (2514 aa)
initn: 2344 init1: 1139 opt: 2808 Z-score: 1531.8 bits: 297.5 E(32554): 5.3e-79
Smith-Waterman score: 4914; 41.9% identity (62.6% similar) in 2448 aa overlap (1-2173:1-2352)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQ
::.: : : .:: ::::::..: .: . . .. .:. : . ::.: .
CCDS41 MSGSTQPVAQTWRATEP-RYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQ--HHSRDYASHLSPGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 QQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQER--RTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSH
: ::::::::::.::..: :: : . . : . . . .:::::::: . :
CCDS41 IIQPQRRRPSLLSEFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPD--
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 FQRVSAAVLPLVHPLP---EGLRA-SADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPS
::..: : : : : : :: .. :: : : :: : . . :
CCDS41 ---------PLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRSLTGKLE-PVSPPSPPHTDPELELVPP
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRS
.::::::::.::::::::. ::::: :::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS41 RLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFK
.::::::::::::: ::.:.:::::.::::::::::::. :::::: ::.:::::::.::
CCDS41 LVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 RRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQRE
:::::::: :::.:::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS41 RRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 QQERFQ-RVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQR
:::.: ::::::.::: . ::::::.:::::::::::: :::::::.:::::..::.:.
CCDS41 LQERMQSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPD
:.::::::::: :::::::::: ::.:...::: :..::.:::::::::::.::::.: .
CCDS41 RIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 CVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEED--KAEKTEKKEEE
:::::::::::::::.::::.: .:::..:: . .:... ..... .. . :: :.:
CCDS41 CVLYYYLTKKNENYKSLVRRSY-RRRGKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKE
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KA1 KKDEEEKDEKEDSKENTKE---KDKIDGTA-EETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITR
:. : ::.:.. :: :: :.: : :. :...:.: .. .:::::::::::::::::
CCDS41 KEKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITR
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 SMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNW
::.::: .:: : : : : :.:::::::::.:::::.::::::
CCDS41 SMANEAN---------SEEAITP-QQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNW
590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 AAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVS
.:::.:::.:. .::::::::::.:.:::..::::: : .. .: .. ..:: .
CCDS41 SAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEA
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740
pF1KA1 A----QEDEDIEAS----NEEENPEDSE-----GAE-------------NSSDTESAPSP
: :::..::: :::: :..: : : ::::::: :::
CCDS41 AFPPVVEDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEALHASGNEVPRGECSGPATVNNSSDTESIPSP
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 SPVEAVKPSEDSPENATSRG-NTEPAVELEPTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQV
: ....:. .. : . : : : :. :. .:... : . .
CCDS41 HTEAAKDTGQNGPKPPATLGADGPPPGPPTPPPEDIPA--PTEPTPASE-ATGAPTPPPA
760 770 780 790 800 810
810 820 830 840 850
pF1KA1 NDSISAETAEQMDVDQQEHSA-----EEGSVCDPPPATK--ADSVDVEVRVPENHASKVE
: :: ...:..: ::: :: : . .:. .: : . . ..:
CCDS41 PPSPSAPPPVVPKEEKEEETAAAPPVEEGEEQKPPAAEELAVDTGKAEEPVKSECTEEAE
820 830 840 850 860 870
860 870 880 890 900
pF1KA1 GDNTKERDLDRASEKVE----PRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEP
.: .: . : .: . .. .. .:. .:.:::::::::: ..:
CCDS41 EGPAKGKDAEAAEATAEGALKAEKKEGGSGRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVDEAEG
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 -ERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVS-SPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPM----VSCTPCN
...:. .. .::::.:::. .. :: : :::: ::..:::.:::. : : .
CCDS41 GDKNRL--LSPRPSLLTPTGDPRANASPQK--PLDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPRE
940 950 960 970 980
970 980 990 1000
pF1KA1 -------IPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTS-------P
: . : . . :. ..:. : : .. . :
CCDS41 DAAPTKPAPPAPPPPQNLQPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAFAAEAQKLPGDPP
990 1000 1010 1020 1030 1040
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 CGTS--KSPNREWEVLQPAPH----QVITNLPEGVRLP-----TTRPTRPPPPLIPSSKT
: :: : ::.. .:: .... : : :: :.::. : :: : .
CCDS41 CWTSGLPFPVPPREVIKASPHAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTARPVLPRPPTISNPPP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 TVASEK-PSFI--MGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKS
..: : :: . . :.:::: .. . .. :.... : :: ...::: .. :
CCDS41 LISSAKHPSVLERQIGAISQG-----MSVQLHVPYSEHAKAP-VGPVTMGLPLPMDPKKL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 ATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLV-RAQHEGVVRGTA-GAIQEGSITRGTPTSKISVES
: . .:::..:::.: . ::.: : ::. .:.:::: :.. ::::.: :.... .:
CCDS41 APFSGVKQEQLSPRGQAGPPESLGVPTAQEASVLRGTALGSVPGGSITKGIPSTRVPSDS
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 IPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVKGSISRMPIEDSSP--EKGREEAASKGHVIYEGK
. :::::.:::: ..: ::.:.:. ::: ..:::.. :::::::::
CCDS41 AITYRGSITHGTPA--------DVLYKGTITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGK
1230 1240 1250 1260 1270
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA1 SGHILSYDN----IKNAREGTRSPR-TAHEISL-KRSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPL
.::.:::.. . ..: :: :: . ::.:. .:: . ...: :: .
CCDS41 KGHVLSYEGGMSVTQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAIS------SASI
1280 1290 1300 1310 1320
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA1 EGLICRALP--RGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKYP-KQIKRES----
:::. ::.: : ::: :::. . ::: :: ::. .:. :: :. : .:::.
CCDS41 EGLMGRAIPPERHSPHH-LKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 -PPIRAFEGAIT-------KGKP-YDG-ITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQ
:: : . : : :: ..: ..:.:: :::::::::... :.:::.
CCDS41 PPPSRDLTEAYKTQALGPLKLKPAHEGLVATVKEAGRSIHEIPREEL-----RHTPELPL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 STRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQS-AIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVE
. ::. ::::.::::.:.:.... . . ::.:.::: .:.. . ::... . ...:
CCDS41 APRPLKEGSITQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPVHPLDVMADA-RALE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 RGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRST---LHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSY
:. :: :...:: .. ::: :. :.. . : : . :: :.: .: : .
CCDS41 RACYE-----ESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLTYEDHGA---P--F
1510 1520 1530 1540 1550
1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA1 QNTMSRGSPMMNRT-----SDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVS
. . ::::. .: .. ..::.:.. ..:: : :: . . : .: :: :
CCDS41 AGHLPRGSPVTTREPTPRLQEGSLSSSKAS-QDRKLTSTPREIAKSP-HSTVPEHHP---
1560 1570 1580 1590 1600
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA1 H--SPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDP-AMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQ
: ::.. :: .. ..::::.: .:: ..: :: ::::: . :.:.:.: ::
CCDS41 HPISPYEHLLRGVSGVDLYRSHIPLAFDPTSIPRGIPLD-AAAAYYLPRHLAPNPTYPHL
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1620 1630 1640 1650 1660
pF1KA1 YQLY---------AMENTRQTILNDYITSQQMQVNL------RPDVARGLSPREQPLGLP
: : :.:: ::::.:::::::::. : : :. :::::::. :.:
CCDS41 YPPYLIRGYPDTAALEN-RQTIINDYITSQQMHHNAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALN
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 YPA-TRGIIDLTNMPPT-ILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHP
: : ::::::...: .::: :: . :::..:.: . : : ..:. .::: :
CCDS41 YAAGPRGIIDLSQVPHLPVLVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQPFSSR-HSSSPLSPGGP
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1720 1730 1740 1750 1760
pF1KA1 THLA---AAASAEREREREREKERERER---IAAASSDL----YLRPGSEQPG-------
:::. ...:.::::.:.::..:.::: : .... . :::.:: .
CCDS41 THLTKPTTTSSSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGSSGGGG
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA1 ----RPGSHGYVRSPSP-SVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQ--LR-----
::.::..... :: : :::.. :::::::...:. ..:: ..:.. ::
CCDS41 GSSSRPASHSHAHQHSPISPRTQDA-LQQRPSVLHNTGMKGIITAVEPSTPTVLRSTSTS
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1820 1830 1840
pF1KA1 --IMPL---------PAGG------PSISQG--LPAS----------RYNTAADALAALV
. : : :: :.. . :: : .:. ::
CCDS41 SPVRPAATFPPATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEAPRVARPERPRADTGHAFLAKPP
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1850 1860 1870 1880
pF1KA1 DAAASAPQMDVSKTKE-------ISSHRY--ETPSD--AIEVISPASSPAPP-------Q
.. : . :: .: .:.: .::. : . :: . :::: .
CCDS41 ARSGLEPASSPSKGSEPRPLVPPVSGHATIARTPAKNLAPHHASP-DPPAPPASASDPHR
1970 1980 1990 2000 2010 2020
1890 1900 1910
pF1KA1 EKLQT-------------------YQPEVVKANQAENDPTRQYEG--PLH-------HY-
:: :. :.:: :. . ..:. .. : : :
CCDS41 EKTQSKPFSIQELELRSLGYHGSSYSPEGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLE
2030 2040 2050 2060 2070 2080
1920 1930 1940 1950
pF1KA1 ---RPQQESP----SPQQQLP-----PSSQAEG---MGQVP--RTH-RLITLADHICQII
::.: .: . .:: : :: . . .: . : :..:::.:: ..:
CCDS41 GELRPKQPGPVKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGVKGHQRVVTLAQHISEVI
2090 2100 2110 2120 2130 2140
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA1 TQDFARNQVSSQTPQQP-PTSTFQNSPSALVSTPV---RTKTSNRYSPESQAQSVHHQRP
:::..:.. .. . : : .: :.: : :: : :. : : . : :
CCDS41 TQDYTRHHPQQLSAPLPAPLYSF---PGA--SCPVLDLRRPPSDLYLPPPD-----HGAP
2150 2160 2170 2180 2190
2020 2030 2040 2050 2060
pF1KA1 GSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHV---SSEPYEPISPPQ--VPVVHEKQDSLLLLSQ
.: ::. :.:.. . :... : . . ::.:::. . : .. :: .
CCDS41 -ARGSPH-----SEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVYPLLYR
2200 2210 2220 2230 2240
2070 2080 2090 2100 2110 2120
pF1KA1 RGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKL-ENTSPMVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAA
: . .: ..:::. : :.::.:: :..: ::::::::: .:::. . .. .. .
CCDS41 DGEQTEPSRMGSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNIS
2250 2260 2270 2280 2290 2300
2130 2140 2150 2160 2170 2180
pF1KA1 QPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPAS-NLGLEDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQ
::::::::.::.: .: .. :... . :: :.::: ::::::::..:
CCDS41 QPGTEIFNMPAITGTGLMTYRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGKYDQWEESPPLSANA
2310 2320 2330 2340 2350 2360
2190 2200 2210 2220 2230 2240
pF1KA1 PMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTE
CCDS41 FNPLNASASLPAAMPITAADGRSDHTLTSPGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGDRP
2370 2380 2390 2400 2410 2420
2337 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:20:04 2016 done: Wed Nov 2 20:20:06 2016
Total Scan time: 7.770 Total Display time: 1.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]