Result of FASTA (omim) for
pFN21AA0721
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0721, 414 aa
1>>>pF1KA0721 414 - 414 aa - 414 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0975+/-0.000334; mu= 9.7272+/- 0.021
mean_var=135.8401+/-27.850, 0's: 0 Z-trim(118.7): 33 B-trim: 112 in 1/58
Lambda= 0.110042
statistics sampled from 31856 (31889) to 31856 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.374), width: 16
Scan time: 6.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003300 (OMIM: 604714,608800) testis-specific Y- ( 437) 1049 177.9 4.4e-44
NP_071400 (OMIM: 300564) testis-specific Y-encoded ( 693) 893 153.2 1.8e-36
XP_006724655 (OMIM: 300564) PREDICTED: testis-spec ( 694) 893 153.2 1.8e-36
NP_277047 (OMIM: 614721) testis-specific Y-encoded ( 417) 784 135.8 2e-31
NP_003299 (OMIM: 480100) testis-specific Y-encoded ( 308) 607 107.6 4.5e-23
NP_001307893 (OMIM: 480100) testis-specific Y-enco ( 221) 565 100.8 3.5e-21
NP_001184171 (OMIM: 480100) testis-specific Y-enco ( 294) 532 95.7 1.7e-19
NP_003002 (OMIM: 600960) protein SET isoform 2 [Ho ( 277) 528 95.0 2.5e-19
XP_016870505 (OMIM: 600960) PREDICTED: protein SET ( 296) 528 95.0 2.6e-19
NP_001234930 (OMIM: 600960) protein SET isoform 4 ( 266) 527 94.8 2.7e-19
NP_001234929 (OMIM: 600960) protein SET isoform 3 ( 268) 520 93.7 5.8e-19
NP_001116293 (OMIM: 600960) protein SET isoform 1 ( 290) 520 93.7 6.2e-19
XP_016870504 (OMIM: 600960) PREDICTED: protein SET ( 309) 520 93.8 6.5e-19
XP_016870502 (OMIM: 600960) PREDICTED: protein SET ( 309) 520 93.8 6.5e-19
XP_016870503 (OMIM: 600960) PREDICTED: protein SET ( 309) 520 93.8 6.5e-19
XP_016885216 (OMIM: 300564) PREDICTED: testis-spec ( 737) 484 88.3 6.7e-17
XP_016885215 (OMIM: 300564) PREDICTED: testis-spec ( 738) 484 88.3 6.7e-17
XP_016885553 (OMIM: 480100) PREDICTED: testis-spec ( 288) 418 77.6 4.6e-14
NP_004529 (OMIM: 300117) nucleosome assembly prote ( 506) 198 42.8 0.0023
>>NP_003300 (OMIM: 604714,608800) testis-specific Y-enco (437 aa)
initn: 1057 init1: 731 opt: 1049 Z-score: 912.3 bits: 177.9 E(85289): 4.4e-44
Smith-Waterman score: 1342; 53.6% identity (70.2% similar) in 446 aa overlap (1-414:1-437)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETVA--
:::::: .. :: .. :.. .: : : ::...:::::::. : :. ::::
NP_003 MSGLDGVKRTTPLQTHSIIISDQVPSDQDAHQYLRLRDQSEATQVMAEPGEGGSETVALP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 ------EGGASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSS
:::. :: . : . .. :.:.:: .: :::::.. : ..:: :::.. ::: :
NP_003 PPPPSEEGGVPQDAAGRGGTPQIRVVGGRGHVAIKAGQEEGQPPAEGLAAASVVMAADRS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KA0 QKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAK--EVTTKKRA-ISAAVE-----
:.: : :: :::: ::: .:.. : .:. :: : : : .::::
NP_003 LKKGVQGGE-------KALEICGAQRSASELTAGAEAEAEEVKTGKCATVSAAVAERESA
130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KA0 ---KEGEA-GAAMEEKKVVQK------------EKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLE
::: : .:::. :.. : .. ..:: : . :: ::
NP_003 EVVKEGLAEKEVMEEQMEVEEQPPEGEEIEVAEEDRLEEEAREEEGPWPLHEALRMDPLE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 AIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMI
::. ::..::::::::: :::.::::::: ...::..:::::::::.:::::::::: ::
NP_003 AIQLELDTVNAQADRAFQQLEHKFGRMRRHYLERRNYIIQNIPGFWMTAFRNHPQLSAMI
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 SGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLST
::: .::::. ::::.::.:::.::::::.:. ::::::. .::::: :::::::::::
NP_003 RGQDAEMLRYITNLEVKELRHPRTGCKFKFFFRRNPYFRNKLIVKEYEVRSSGRVVSLST
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 PIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMG
:: :.::..::. :.::.. : :::.::::::: : :.:::::: .::::::::::.
NP_003 PIIWRRGHEPQSFIRRNQD--LICSFFTWFSDHSLPESDKIAEIIKEDLWPNPLQYYLLR
360 370 380 390 400 410
390 400 410
pF1KA0 EGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQSG
:: ::. : : :.::: : : ::::
NP_003 EGVRRARRRPLREPVEIPRPFGFQSG
420 430
>>NP_071400 (OMIM: 300564) testis-specific Y-encoded-lik (693 aa)
initn: 871 init1: 549 opt: 893 Z-score: 775.7 bits: 153.2 E(85289): 1.8e-36
Smith-Waterman score: 893; 42.5% identity (67.8% similar) in 369 aa overlap (28-392:40-402)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETV
: .: :.:::::.::.:. : .: .
NP_071 AKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQVLADMRGVGLGPA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AEGGASQDPVDCGPALRVPVAGSR--GGAAT-KAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSSQK
.. : . :.. : .: ..: .::: :..::: . ::. .: .
NP_071 LPPPPPYVILEEGGIRAYFTLGAECPGWDSTIESGYGEAPPPTESLEALPTPEASGGSLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISAAVEKEGEAGAAME
:. . . .:. :::.:.: : . : . :.:: . : . : : : .
NP_071 IDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKE----EAIIIVEDEDEDERESMRS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EKKVVQKEKKVAGGVKEETRPR-APKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFG
.. ..... ::.:.: : : .... ...:: :. .: :: .: .:::.:.:::
NP_071 SRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDLEAVNIKAGKAFLRLKRKFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 RMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAG
.::: ..::..:::.:::::: :: :::..: .:. .:::..::. ::.:..:.: :
NP_071 QMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDEDIFRYLTNLQVQDLRHISMG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 CKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPS
:.:. :: :::: : .:::..: :::.:: ::::::::::.:::. : :.... :
NP_071 YKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWHRGQEPQARRHGNQDAS--HS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 FFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQS
::.:::.::: : ::::::::..:: :::.::: .: :
NP_071 FFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKRKKQEMKKRKTRGRCEVVI
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 G
NP_071 MEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETTDNEITDINENICDSENPD
430 440 450 460 470 480
>>XP_006724655 (OMIM: 300564) PREDICTED: testis-specific (694 aa)
initn: 871 init1: 549 opt: 893 Z-score: 775.7 bits: 153.2 E(85289): 1.8e-36
Smith-Waterman score: 893; 42.5% identity (67.8% similar) in 369 aa overlap (28-392:40-402)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETV
: .: :.:::::.::.:. : .: .
XP_006 AKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQVLADMRGVGLGPA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AEGGASQDPVDCGPALRVPVAGSR--GGAAT-KAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSSQK
.. : . :.. : .: ..: .::: :..::: . ::. .: .
XP_006 LPPPPPYVILEEGGIRAYFTLGAECPGWDSTIESGYGEAPPPTESLEALPTPEASGGSLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISAAVEKEGEAGAAME
:. . . .:. :::.:.: : . : . :.:: . : . : : : .
XP_006 IDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKE----EAIIIVEDEDEDERESMRS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EKKVVQKEKKVAGGVKEETRPR-APKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFG
.. ..... ::.:.: : : .... ...:: :. .: :: .: .:::.:.:::
XP_006 SRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDLEAVNIKAGKAFLRLKRKFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 RMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAG
.::: ..::..:::.:::::: :: :::..: .:. .:::..::. ::.:..:.: :
XP_006 QMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDEDIFRYLTNLQVQDLRHISMG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 CKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPS
:.:. :: :::: : .:::..: :::.:: ::::::::::.:::. : :.... :
XP_006 YKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWHRGQEPQARRHGNQDAS--HS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 FFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQS
::.:::.::: : ::::::::..:: :::.::: .: :
XP_006 FFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKRKKQEMKKRKTRGRCEVVI
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 G
XP_006 MEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETTDNEITDINENICDSENPD
430 440 450 460 470 480
>>NP_277047 (OMIM: 614721) testis-specific Y-encoded-lik (417 aa)
initn: 1034 init1: 523 opt: 784 Z-score: 685.3 bits: 135.8 E(85289): 2e-31
Smith-Waterman score: 1008; 43.3% identity (67.2% similar) in 439 aa overlap (1-413:1-416)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLA--------APDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGG
::: . : : :.. : . ::: : ::: .: :.: :.:.:.::.:..: :
NP_277 MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KA0 SLETVA--------EGGASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAAS
.::..: : .: . :.::: :::. .::..: ::.. : : .. : : .
NP_277 GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAADT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 AAEAADSS---QKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISA
. .. .. ::. ..:. :::::.:: :.:...: : :.: : . :. .:
NP_277 VFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKK--------GA
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 AVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQA
: :. . .: ::: ::.. :: . : : .. ::.:: .. .: :.::::
NP_277 A--GENTSVSAGEEK----KEERDAG-----SGP--PATEGSMDTLENVQLKLENMNAQA
180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 DRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMIN
:::.:.: ::::..: :..::. .:::::::: ::.:::::. ....:....: :. .
NP_277 DRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYLNS
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 LEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAH
:::::: : : :.:: :. ::::.:. :.::: ::.::: ::::.: :.: :.
NP_277 LEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQSL
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KA0 IHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPR-------RG
. : :.: :::.:::.:: .: :.:.:::. ::::::::.::..:: : .:
NP_277 SQGNPENNR--SFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEG
340 350 360 370 380 390
400 410
pF1KA0 IRGPPRQPVESARSFRFQSG
.:: .::.:... ::
NP_277 RQGPGKQPMETTQPGVSQSN
400 410
>>NP_003299 (OMIM: 480100) testis-specific Y-encoded pro (308 aa)
initn: 536 init1: 399 opt: 607 Z-score: 535.2 bits: 107.6 E(85289): 4.5e-23
Smith-Waterman score: 607; 38.6% identity (66.7% similar) in 264 aa overlap (131-394:42-297)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 EAASAAEAADSSQKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAIS
.:: :. : . . ..:.. :
NP_003 PERLRQGFCGVGRAAQALVCASAKEGTAFRMEAVQEGAAGVESEQAALGEEAVLLLDDIM
20 30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 AAVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQ
: :: .: . .:... .:. .... : : :: . : :.. :: ::::
NP_003 AEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPGPGPMTPESAP------EELLAVQVELEPVNAQ
80 90 100 110 120
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 ADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMI
: .:: . ..:. : :. :..::. .::..::::.... ::::.: .:. .::::: ::.
NP_003 ARKAFSRQREKMERRRKPHLDRRGAVIQSVPGFWANVIANHPQMSALITDEDEDMLSYMV
130 140 150 160 170 180
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 NLEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQA
.::: : ::: ::. ..:..::::.:. ..::: . .: ::::.:. : ..
NP_003 SLEVGEEKHPVHLCKIMLFFRSNPYFQNKVITKEYLVNITEYRASHSTPIEWY--PDYEV
190 200 210 220 230 240
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 HIHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPR
. .: :. :. .::::::::.. ..::::. .:: :::::: . :..:
NP_003 EAYRRRHHNSSLNFFNWFSDHNFAGSNKIAEILCKDLWRNPLQYYKRMKPPEEGTETSGD
250 260 270 280 290 300
410
pF1KA0 QPVESARSFRFQSG
NP_003 SQLLS
>>NP_001307893 (OMIM: 480100) testis-specific Y-encoded (221 aa)
initn: 536 init1: 399 opt: 565 Z-score: 501.2 bits: 100.8 E(85289): 3.5e-21
Smith-Waterman score: 565; 46.2% identity (74.2% similar) in 182 aa overlap (213-394:31-210)
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHMQR
:: ::::: .:: . ..:. : :. :..:
NP_001 MRPEGSLTYRVPERLRQGFCGVGRAAQALVELEPVNAQARKAFSRQREKMERRRKPHLDR
10 20 30 40 50 60
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 RSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIFQG
:. .::..::::.... ::::.: .:. .::::: ::..::: : ::: ::. ..:..
NP_001 RGAVIQSVPGFWANVIANHPQMSALITDEDEDMLSYMVSLEVGEEKHPVHLCKIMLFFRS
70 80 90 100 110 120
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPSFFNWFSDHS
::::.:. ..::: . .: ::::.:. : ... .: :. :. .::::::::.
NP_001 NPYFQNKVITKEYLVNITEYRASHSTPIEWY--PDYEVEAYRRRHHNSSLNFFNWFSDHN
130 140 150 160 170
370 380 390 400 410
pF1KA0 LLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQSG
. ..::::. .:: :::::: . :..:
NP_001 FAGSNKIAEILCKDLWRNPLQYYKRMKPPEEGTETSGDSQLLS
180 190 200 210 220
>>NP_001184171 (OMIM: 480100) testis-specific Y-encoded (294 aa)
initn: 470 init1: 399 opt: 532 Z-score: 471.2 bits: 95.7 E(85289): 1.7e-19
Smith-Waterman score: 532; 37.8% identity (66.4% similar) in 241 aa overlap (131-371:42-274)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 EAASAAEAADSSQKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAIS
.:: :. : . . ..:.. :
NP_001 PERLRQGFCGVGRAAQALVCASAKEGTAFRMEAVQEGAAGVESEQAALGEEAVLLLDDIM
20 30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 AAVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQ
: :: .: . .:... .:. .... : : :: . : :.. :: ::::
NP_001 AEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPGPGPMTPESAP------EELLAVQVELEPVNAQ
80 90 100 110 120
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 ADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMI
: .:: . ..:. : :. :..::. .::..::::.... ::::.: .:. .::::: ::.
NP_001 ARKAFSRQREKMERRRKPHLDRRGAVIQSVPGFWANVIANHPQMSALITDEDEDMLSYMV
130 140 150 160 170 180
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 NLEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQA
.::: : ::: ::. ..:..::::.:. ..::: . .: ::::.:. : ..
NP_001 SLEVGEEKHPVHLCKIMLFFRSNPYFQNKVITKEYLVNITEYRASHSTPIEWY--PDYEV
190 200 210 220 230 240
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 HIHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPR
. .: :. :. .::::::::.. ..:::
NP_001 EAYRRRHHNSSLNFFNWFSDHNFAGSNKIAESPDRSYVRTCGAIPCNTTRG
250 260 270 280 290
410
pF1KA0 QPVESARSFRFQSG
>>NP_003002 (OMIM: 600960) protein SET isoform 2 [Homo s (277 aa)
initn: 494 init1: 341 opt: 528 Z-score: 468.1 bits: 95.0 E(85289): 2.5e-19
Smith-Waterman score: 528; 37.2% identity (68.8% similar) in 218 aa overlap (177-387:7-222)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KKAKEVTTKKRAISAAVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDS
:: .:: . .:: . . . ..
NP_003 MSAPAAKVSKKELNSNHDGADETSEKEQQ--EAIEH
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 LEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSP
.. ...:.. .: ::.. .:..:.:....:. .:.:: .: .::.::::.: ::::.:
NP_003 IDEVQNEIDRLNEQASEEILKVEQKYNKLRQPFFQKRSELIAKIPNFWVTTFVNHPQVSA
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 MISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSL
... .::. :.:. .:: :.. ..: .. : :. ::::.:. : ::.. :: :
NP_003 LLGEEDEEALHYLTRVEVTEFEDIKSGYRIDFYFDENPYFENKVLSKEFHLNESGDPSSK
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370
pF1KA0 STPIRWHRGQD-------PQAHIHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWP
:: :.:. :.: : . :.:. . :::.::.::: :...:.:: ..::
NP_003 STEIKWKSGKDLTKRSSQTQNKASRKRQHEEPESFFTWFTDHSDAGADELGEVIKDDIWP
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410
pF1KA0 NPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQSG
:::::::.
NP_003 NPLQYYLVPDMDDEEGEGEEDDDDDEEEEGLEDIDEEGDEDEGEEDEDDDEGEEGEEDEG
220 230 240 250 260 270
>>XP_016870505 (OMIM: 600960) PREDICTED: protein SET iso (296 aa)
initn: 494 init1: 341 opt: 528 Z-score: 467.7 bits: 95.0 E(85289): 2.6e-19
Smith-Waterman score: 528; 37.2% identity (68.8% similar) in 218 aa overlap (177-387:7-222)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KKAKEVTTKKRAISAAVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDS
:: .:: . .:: . . . ..
XP_016 MSAPAAKVSKKELNSNHDGADETSEKEQQ--EAIEH
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 LEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSP
.. ...:.. .: ::.. .:..:.:....:. .:.:: .: .::.::::.: ::::.:
XP_016 IDEVQNEIDRLNEQASEEILKVEQKYNKLRQPFFQKRSELIAKIPNFWVTTFVNHPQVSA
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 MISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSL
... .::. :.:. .:: :.. ..: .. : :. ::::.:. : ::.. :: :
XP_016 LLGEEDEEALHYLTRVEVTEFEDIKSGYRIDFYFDENPYFENKVLSKEFHLNESGDPSSK
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370
pF1KA0 STPIRWHRGQD-------PQAHIHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWP
:: :.:. :.: : . :.:. . :::.::.::: :...:.:: ..::
XP_016 STEIKWKSGKDLTKRSSQTQNKASRKRQHEEPESFFTWFTDHSDAGADELGEVIKDDIWP
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410
pF1KA0 NPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQSG
:::::::.
XP_016 NPLQYYLVPDMDDEEGEGEEDDDDDEEEEGLEDIDEEGDEDEGEEDEDDDEGEEGEVKEN
220 230 240 250 260 270
>>NP_001234930 (OMIM: 600960) protein SET isoform 4 [Hom (266 aa)
initn: 494 init1: 341 opt: 527 Z-score: 467.5 bits: 94.8 E(85289): 2.7e-19
Smith-Waterman score: 527; 39.4% identity (70.9% similar) in 203 aa overlap (195-387:9-211)
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 KEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQ---ELSNVNAQA
: :. .. ....: ::. :.. .: ::
NP_001 MMPRSHQPPPPPHEKEQQEAIEHIDEVQNEIDRLNEQA
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 DRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMIN
.. .:..:.:....:. .:.:: .: .::.::::.: ::::.: ... .::. :.:.
NP_001 SEEILKVEQKYNKLRQPFFQKRSELIAKIPNFWVTTFVNHPQVSALLGEEDEEALHYLTR
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330
pF1KA0 LEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQD----
.:: :.. ..: .. : :. ::::.:. : ::.. :: : :: :.:. :.:
NP_001 VEVTEFEDIKSGYRIDFYFDENPYFENKVLSKEFHLNESGDPSSKSTEIKWKSGKDLTKR
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 ---PQAHIHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRG
: . :.:. . :::.::.::: :...:.:: ..:::::::::.
NP_001 SSQTQNKASRKRQHEEPESFFTWFTDHSDAGADELGEVIKDDIWPNPLQYYLVPDMDDEE
160 170 180 190 200 210
400 410
pF1KA0 IRGPPRQPVESARSFRFQSG
NP_001 GEGEEDDDDDEEEEGLEDIDEEGDEDEGEEDEDDDEGEEGEEDEGEDD
220 230 240 250 260
414 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 19:34:58 2016 done: Wed Nov 2 19:34:59 2016
Total Scan time: 6.310 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]