Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0721
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0721, 414 aa
1>>>pF1KA0721 414 - 414 aa - 414 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9971+/-0.000799; mu= 10.5553+/- 0.048
mean_var=129.0873+/-26.183, 0's: 0 Z-trim(111.8): 29 B-trim: 30 in 2/51
Lambda= 0.112884
statistics sampled from 12644 (12671) to 12644 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.389), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5106.1 TSPYL4 gene_id:23270|Hs108|chr6 ( 414) 2809 468.5 5.3e-132
CCDS42682.1 TSPYL6 gene_id:388951|Hs108|chr2 ( 410) 1211 208.2 1.2e-53
CCDS34518.1 TSPYL1 gene_id:7259|Hs108|chr6 ( 437) 1049 181.8 1.1e-45
CCDS14350.1 TSPYL2 gene_id:64061|Hs108|chrX ( 693) 893 156.6 6.8e-38
CCDS34927.1 TSPYL5 gene_id:85453|Hs108|chr8 ( 417) 784 138.7 1e-32
CCDS48202.1 TSPY4 gene_id:728395|Hs108|chrY ( 314) 619 111.7 9.9e-25
CCDS48204.1 TSPY3 gene_id:728137|Hs108|chrY ( 308) 617 111.4 1.2e-24
CCDS65365.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY ( 308) 617 111.4 1.2e-24
CCDS59533.1 TSPY8 gene_id:728403|Hs108|chrY ( 308) 616 111.2 1.4e-24
CCDS48205.1 TSPY1 gene_id:7258|Hs108|chrY ( 308) 607 109.8 3.8e-24
CCDS35465.1 TSPY2 gene_id:64591|Hs108|chrY ( 308) 604 109.3 5.3e-24
CCDS83519.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY ( 294) 542 99.2 5.6e-21
CCDS76071.1 TSPY1 gene_id:7258|Hs108|chrY ( 294) 532 97.5 1.7e-20
CCDS6907.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9 ( 277) 528 96.9 2.6e-20
CCDS59150.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9 ( 266) 527 96.7 2.8e-20
CCDS59149.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9 ( 268) 520 95.5 6.2e-20
CCDS48037.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9 ( 290) 520 95.6 6.6e-20
CCDS72821.1 SETSIP gene_id:646817|Hs108|chr1 ( 302) 491 90.9 1.8e-18
>>CCDS5106.1 TSPYL4 gene_id:23270|Hs108|chr6 (414 aa)
initn: 2809 init1: 2809 opt: 2809 Z-score: 2483.3 bits: 468.5 E(32554): 5.3e-132
Smith-Waterman score: 2809; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETVAEG
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CCDS51 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETVAEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSSQKNGCQLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 GASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSSQKNGCQLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISAAVEKEGEAGAAMEEKKVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 EPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISAAVEKEGEAGAAMEEKKVVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 KEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPSFFNWFSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPSFFNWFSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KA0 HSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 HSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQSG
370 380 390 400 410
>>CCDS42682.1 TSPYL6 gene_id:388951|Hs108|chr2 (410 aa)
initn: 1187 init1: 891 opt: 1211 Z-score: 1076.9 bits: 208.2 E(32554): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1211; 50.6% identity (73.7% similar) in 407 aa overlap (19-414:11-410)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETVA--
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CCDS42 MSLPESPHSPATLDYALEDP--HQGQRSREKSKATEVMADMFDGRLEPIVFP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 ------EGGASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSS
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CCDS42 PPRLPEEGVAPQDPADGGHTFHILVDAGRSHGAIKAGQEVTPPPAEGLEAASASLTTDGS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KA0 QKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAI-SAAVEKE--GEA
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CCDS42 LKNGFPGEETHGLGGEKALETCGAGRSESEVIAEGKAEDVKPEECAMFSAPVDEKPGGEE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 GAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLE
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CCDS42 MDVAEENRAIDEVNREAG---PGPGPGPLNVGLHLNPLESIQLELDSVNAEADRALLQVE
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 RKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMINLEVEELKH
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CCDS42 RRFGQIHEYYLEQRNDIIRNIPGFWVTAFRHHPQLSAMIRGQDAEMLSYLTNLEVKELRH
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 PRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAHIHRNREGN
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CCDS42 PRTGCKFKFFFQRNPYFRNKLIVKVYEVRSFGQVVSFSTLIMWRRGHGPQSFIHRNR--H
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 TIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSF
.: :::.::::::: : ::::.::: .:: :::::::.:: .:. : :.::: : :
CCDS42 VICSFFTWFSDHSLPESDRIAQIIKEDLWSNPLQYYLLGEDAHRARRRLVREPVEIPRPF
350 360 370 380 390 400
410
pF1KA0 RFQSG
:: :
CCDS42 GFQCG
410
>>CCDS34518.1 TSPYL1 gene_id:7259|Hs108|chr6 (437 aa)
initn: 1057 init1: 731 opt: 1049 Z-score: 933.9 bits: 181.8 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1342; 53.6% identity (70.2% similar) in 446 aa overlap (1-414:1-437)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETVA--
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CCDS34 MSGLDGVKRTTPLQTHSIIISDQVPSDQDAHQYLRLRDQSEATQVMAEPGEGGSETVALP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 ------EGGASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSS
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CCDS34 PPPPSEEGGVPQDAAGRGGTPQIRVVGGRGHVAIKAGQEEGQPPAEGLAAASVVMAADRS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KA0 QKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAK--EVTTKKRA-ISAAVE-----
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CCDS34 LKKGVQGGE-------KALEICGAQRSASELTAGAEAEAEEVKTGKCATVSAAVAERESA
130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KA0 ---KEGEA-GAAMEEKKVVQK------------EKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLE
::: : .:::. :.. : .. ..:: : . :: ::
CCDS34 EVVKEGLAEKEVMEEQMEVEEQPPEGEEIEVAEEDRLEEEAREEEGPWPLHEALRMDPLE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 AIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMI
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CCDS34 AIQLELDTVNAQADRAFQQLEHKFGRMRRHYLERRNYIIQNIPGFWMTAFRNHPQLSAMI
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 SGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLST
::: .::::. ::::.::.:::.::::::.:. ::::::. .::::: :::::::::::
CCDS34 RGQDAEMLRYITNLEVKELRHPRTGCKFKFFFRRNPYFRNKLIVKEYEVRSSGRVVSLST
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 PIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMG
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CCDS34 PIIWRRGHEPQSFIRRNQD--LICSFFTWFSDHSLPESDKIAEIIKEDLWPNPLQYYLLR
360 370 380 390 400 410
390 400 410
pF1KA0 EGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQSG
:: ::. : : :.::: : : ::::
CCDS34 EGVRRARRRPLREPVEIPRPFGFQSG
420 430
>>CCDS14350.1 TSPYL2 gene_id:64061|Hs108|chrX (693 aa)
initn: 871 init1: 549 opt: 893 Z-score: 793.8 bits: 156.6 E(32554): 6.8e-38
Smith-Waterman score: 893; 42.5% identity (67.8% similar) in 369 aa overlap (28-392:40-402)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETV
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CCDS14 AKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQVLADMRGVGLGPA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AEGGASQDPVDCGPALRVPVAGSR--GGAAT-KAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSSQK
.. : . :.. : .: ..: .::: :..::: . ::. .: .
CCDS14 LPPPPPYVILEEGGIRAYFTLGAECPGWDSTIESGYGEAPPPTESLEALPTPEASGGSLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISAAVEKEGEAGAAME
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CCDS14 IDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKE----EAIIIVEDEDEDERESMRS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EKKVVQKEKKVAGGVKEETRPR-APKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFG
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CCDS14 SRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDLEAVNIKAGKAFLRLKRKFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 RMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAG
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CCDS14 QMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDEDIFRYLTNLQVQDLRHISMG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 CKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPS
:.:. :: :::: : .:::..: :::.:: ::::::::::.:::. : :.... :
CCDS14 YKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWHRGQEPQARRHGNQDAS--HS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 FFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQS
::.:::.::: : ::::::::..:: :::.::: .: :
CCDS14 FFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKRKKQEMKKRKTRGRCEVVI
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 G
CCDS14 MEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETTDNEITDINENICDSENPD
430 440 450 460 470 480
>>CCDS34927.1 TSPYL5 gene_id:85453|Hs108|chr8 (417 aa)
initn: 1034 init1: 523 opt: 784 Z-score: 701.0 bits: 138.7 E(32554): 1e-32
Smith-Waterman score: 1008; 43.3% identity (67.2% similar) in 439 aa overlap (1-413:1-416)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGLDGGNKLPLAQTGGLA--------APDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGG
::: . : : :.. : . ::: : ::: .: :.: :.:.:.::.:..: :
CCDS34 MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KA0 SLETVA--------EGGASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAAS
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CCDS34 GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAADT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 AAEAADSS---QKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISA
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CCDS34 VFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKK--------GA
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 AVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQA
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CCDS34 A--GENTSVSAGEEK----KEERDAG-----SGP--PATEGSMDTLENVQLKLENMNAQA
180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 DRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMIN
:::.:.: ::::..: :..::. .:::::::: ::.:::::. ....:....: :. .
CCDS34 DRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYLNS
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 LEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAH
:::::: : : :.:: :. ::::.:. :.::: ::.::: ::::.: :.: :.
CCDS34 LEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQSL
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KA0 IHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPR-------RG
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CCDS34 SQGNPENNR--SFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEG
340 350 360 370 380 390
400 410
pF1KA0 IRGPPRQPVESARSFRFQSG
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CCDS34 RQGPGKQPMETTQPGVSQSN
400 410
>>CCDS48202.1 TSPY4 gene_id:728395|Hs108|chrY (314 aa)
initn: 574 init1: 437 opt: 619 Z-score: 557.5 bits: 111.7 E(32554): 9.9e-25
Smith-Waterman score: 619; 38.3% identity (68.2% similar) in 264 aa overlap (131-394:42-303)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 EAASAAEAADSSQKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAIS
.:: :. : . . ..:.. :
CCDS48 PERLRQGFCGVGRAAQALVCASAKEGTAFRMEAVQEGAAGVESEQAALGEEAVLLLDDIM
20 30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 AAVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQ
: :: .:. .. ::. .:...... . . : .. .. : :.. :: ::::
CCDS48 AEVEVVAEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPGPGPMTPESALEELLAVQVELEPVNAQ
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 ADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMI
: .:: . ..:. : :. :..::. .::..::::.... ::::.: .:. .::::: ::.
CCDS48 ARKAFSRQREKMERRRKPHLDRRGAVIQSVPGFWANVIANHPQMSALITDEDEDMLSYMV
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 NLEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQA
.::::: ::: ::. ..:..::::.:. ..::: . .: ::::.:. : ..
CCDS48 SLEVEEEKHPVHLCKIMLFFRSNPYFQNKVITKEYLVNITEYRASHSTPIEWY--PDYEV
200 210 220 230 240
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 HIHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPR
. .: :. :. .::::::::.. ..::::. .:: :::::: . :..:
CCDS48 EAYRRRHHNSSLNFFNWFSDHNFAGSNKIAEILCKDLWRNPLQYYKRMKPPEEGTETSGD
250 260 270 280 290 300
410
pF1KA0 QPVESARSFRFQSG
CCDS48 SQLLS
310
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CCDS65 SQLLS
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CCDS59 AEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPG----PGPMTPE--SALEELLAVQVELEPVNAQ
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pF1KA0 QPVESARSFRFQSG
CCDS59 SQLLS
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pF1KA0 QPVESARSFRFQSG
CCDS48 SQLLS
414 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]