Result of FASTA (omim) for
pFN21AA0519
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0519, 919 aa
1>>>pF1KA0519 919 - 919 aa - 919 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0078+/-0.000373; mu= 18.8566+/- 0.023
mean_var=92.2444+/-18.823, 0's: 0 Z-trim(114.4): 37 B-trim: 31 in 1/54
Lambda= 0.133538
statistics sampled from 24263 (24300) to 24263 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 11.960
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001431 (OMIM: 605744) exostosin-like 3 [Homo sa ( 919) 6245 1213.9 0
XP_011542742 (OMIM: 605744) PREDICTED: exostosin-l ( 919) 6245 1213.9 0
NP_997005 (OMIM: 133701,608210,616682) exostosin-2 ( 718) 915 187.0 2.8e-46
NP_001171554 (OMIM: 133701,608210,616682) exostosi ( 728) 915 187.0 2.9e-46
XP_011518253 (OMIM: 133701,608210,616682) PREDICTE ( 731) 915 187.0 2.9e-46
NP_000392 (OMIM: 133701,608210,616682) exostosin-2 ( 751) 915 187.0 3e-46
XP_011518252 (OMIM: 133701,608210,616682) PREDICTE ( 764) 915 187.0 3e-46
NP_000118 (OMIM: 133700,215300,608177) exostosin-1 ( 746) 711 147.7 2e-34
XP_005245836 (OMIM: 601738) PREDICTED: exostosin-l ( 640) 546 115.9 6.5e-25
NP_004446 (OMIM: 601738) exostosin-like 1 [Homo sa ( 676) 546 115.9 6.8e-25
NP_001028197 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isofo ( 330) 418 91.0 1e-17
XP_005270678 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 330) 418 91.0 1e-17
NP_001430 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isoform ( 330) 418 91.0 1e-17
XP_011539296 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 338) 418 91.0 1e-17
XP_011539297 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 338) 418 91.0 1e-17
NP_001248370 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isofo ( 338) 418 91.0 1e-17
NP_001248369 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isofo ( 329) 337 75.4 5.1e-13
XP_016856140 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 329) 337 75.4 5.1e-13
XP_011539298 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 337) 337 75.4 5.2e-13
XP_016856139 (OMIM: 601738) PREDICTED: exostosin-l ( 491) 237 56.3 4.4e-07
NP_001248371 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isofo ( 147) 190 46.9 8.9e-05
>>NP_001431 (OMIM: 605744) exostosin-like 3 [Homo sapien (919 aa)
initn: 6245 init1: 6245 opt: 6245 Z-score: 6499.7 bits: 1213.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6245; 100.0% identity (100.0% similar) in 919 aa overlap (1-919:1-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTGYTMLRNGGAGNGGQTCMLRWSNRIRLTWLSFTLFVILVFFPLIAHYYLTTLDEADEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTGYTMLRNGGAGNGGQTCMLRWSNRIRLTWLSFTLFVILVFFPLIAHYYLTTLDEADEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GKRIFGPRVGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKRIFGPRVGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRGCRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRGCRLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 STFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGERED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGERED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 YRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIGVPIMVVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIGVPIMVVRT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVD
850 860 870 880 890 900
910
pF1KA0 SVLFKTRLPHDKTKCFKFI
:::::::::::::::::::
NP_001 SVLFKTRLPHDKTKCFKFI
910
>>XP_011542742 (OMIM: 605744) PREDICTED: exostosin-like (919 aa)
initn: 6245 init1: 6245 opt: 6245 Z-score: 6499.7 bits: 1213.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6245; 100.0% identity (100.0% similar) in 919 aa overlap (1-919:1-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTGYTMLRNGGAGNGGQTCMLRWSNRIRLTWLSFTLFVILVFFPLIAHYYLTTLDEADEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTGYTMLRNGGAGNGGQTCMLRWSNRIRLTWLSFTLFVILVFFPLIAHYYLTTLDEADEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GKRIFGPRVGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKRIFGPRVGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRGCRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRGCRLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 STFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGERED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGERED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 YRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIGVPIMVVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIGVPIMVVRT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVD
850 860 870 880 890 900
910
pF1KA0 SVLFKTRLPHDKTKCFKFI
:::::::::::::::::::
XP_011 SVLFKTRLPHDKTKCFKFI
910
>>NP_997005 (OMIM: 133701,608210,616682) exostosin-2 iso (718 aa)
initn: 1126 init1: 496 opt: 915 Z-score: 951.7 bits: 187.0 E(85289): 2.8e-46
Smith-Waterman score: 1218; 32.9% identity (57.2% similar) in 794 aa overlap (140-916:48-712)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LNLKIEACKKSIENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSL---PIRLLPEKDDA
:: . : : :. :. :: :.
NP_997 MKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPHSIESSNDWNVEKRSIRDVPVVRLPA--DS
20 30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 GLPPPKATRGCRLHNCFDYSRCPLT--SGFPVYVYDSDQFV--FGSYLDPLVKQAFQATA
.: .. .::.:.::: :: .. . . ::.: ..: :: .. ... ..
NP_997 PIPE-RGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTISREYNELL
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270
pF1KA0 RA---NVYVTENADIACLYVILVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIIN-L
: . : :.. . :::.: . ... . :: : . . .: .: : ::...: :
NP_997 MAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNT-LRIKETAQAMAQLSRW-DRGTNHLLFNML
140 150 160 170 180 190
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVK
: .: ::..: . : : :: :.:. . :. .: ...: . :
NP_997 PGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSI-PVYSPLSAE--VDLPEKGPGP
200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RKYLFTFQGEKIESLRSSLQEARSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEF
:.:.. : :.. : : .: :.:.: .. ..:::
NP_997 RQYFL---------LSSQV-----------GLHPEYRED-----LEALQVKHGESVLVLD
250 260 270 280
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TCKNQPKPSLPTEWALCGERE--DRLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALE
: : . : .. : ... : ..:. .:: ... :: : :. : ..:.
NP_997 KCTNLSEGVLSVR-KRCHKHQVFDYPQVLQEATFCVVLR--GARL----GQAV-LSDVLQ
290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNEAALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLW
.: ::::.... ::....:.:..:..:::. ....:. .:.:. . .. :.::.:..:
NP_997 AGCVPVVIADSYILPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQARWFW
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLG
:.::.. .: ..: .: :: : : : :
NP_997 EAYFQSIKAIALATLQIINDRIY-PYAAISYEEW--------------------------
400 410 420
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 PVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDFYRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGF
..:: .. :. . .:. : :..:
NP_997 ---NDPPAVK-----------------WGSVSNPLFL-------PLIP------------
430 440 450
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVW
: . : ::...:::.: : :. . ... .: :.:..:::
NP_997 -PQSQG--------------------FTAIVLTYDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVW
460 470 480
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 NSP-KLPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDA-HLRHDEI
:. : : :: ::: : ::. :::: .:.:.:::.:..::::::.:.:::: : ::.
NP_997 NNQNKNPPEDSLWPKIRVPLKVVRTAENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDEL
490 500 510 520 530 540
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 MFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYS
.::..:::: ::.::.::: : :: ..: :.:... :.:::::::::.:::. :::.
NP_997 QFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYT
550 560 570 580 590 600
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCP--QALSHDDSH
: :: :.. :: ..:::::::::::...: : :::: : :.:: : ..:: :..:
NP_997 YKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLSLDQTH
610 620 630 640 650 660
880 890 900 910
pF1KA0 FHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKTRLPHDKTKCFKFI
. :: .::: :..:.: ::: .. :.: ::.: .: .: : :
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XP_011 QFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYT
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820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCP--QALSHDDSH
: :: :.. :: ..:::::::::::...: : :::: : :.:: : ..:: :..:
XP_011 YKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLSLDQTH
660 670 680 690 700 710
880 890 900 910
pF1KA0 FHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKTRLPHDKTKCFKFI
. :: .::: :..:.: ::: .. :.: ::.: .: .: : :
XP_011 MVERSECINKFASVFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFP-EKLKSFPNIGSL
720 730 740 750 760
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. : .:: :::: ... : . : . :. ... . : . . :::.:. . .
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.... : ..::.::. . :: : . : .:... .: :::...:.:.. . ..
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:. ..: . . .:. : ...: : .: . . . : . ::.
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....::.::.. . . .. .::. .. .::.:.: .::::.:::....: :.: .
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:. :: . : : ::
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. :: :: :: :::. ...::. : : . :
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pF1KA0 WPDIGVPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDR
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NP_000 IVGYPARSHFWDNSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQ
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pF1KA0 YINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCP--GCPQALSH--DDSHFHERHKCINFF
::::: :::::: .:. ::::::.. .. : . :. : .:: .:..:.: :
NP_000 LANCEDILMNFLVSAVTKLPPIKVTQKKQYKETMMGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTF
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.:::::... : .: . .. . : :.... : :.. . : .
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:. .: : :...: : :. . : : :
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.:: :: . :. :.:...::.: :.
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:. .: . .::.:.: .:::..:::.......:.: .:. ::
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::. : : : ::
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:: :. . :. :.. : : :: : .:..
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pF1KA0 VMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPK-LPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNS
.. . . .. .. . : . ...:.:.. . :::. ::. .::. :. ...
XP_005 LIWVGPPGQPPLKLIQAVAGSQHCAQILVLWSNERPLPSR---WPETAVPLTVIDGHRK-
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pF1KA0 LNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQS
...:: :.. :.:.::::.: . : .:. :.: ::. .:.::: : :: : .
XP_005 VSDRFYPYSTIRTDAILSLDARSSLSTSEVDFAFLVWQSFPERMVGFLTSSHFWDEAHGG
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: :... . :.::::: :::.:.:: :... .:.:.: ..:: .: :. :::.:. .:
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pF1KA0 RKPPIKVT--SRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSV
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910
pF1KA0 LFKTRLPHDKTKCFKFI
:::
XP_005 LFKDPVSVQRKKYRSLEKP
630 640
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NP_004 CR-GDGLKVFVYPA----VGTISE--THRRILASIEGSRFYTFSPAGACLLLLLSLDAQT
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pF1KA0 PVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQ
. :.: . :.::... : ... . :.::::... . .
NP_004 G----------ECSSMPLQWNRGRNHLVLRLHPAPCPRTF----QLGQAMVAEASPTVDS
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.:::::... : .: . .. . : :.... : :.. . : .
NP_004 FRPGFDVALPFLPEAHPLRGGAPGQLRQHSPQPGVALLALEEE-----RGGWRTADT---
190 200 210 220 230 240
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pF1KA0 EMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGEREDRLELL
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NP_004 ---GSSACPWDGR---------------------CEQDPGP---------GQTQ-RQETL
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pF1KA0 KLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNEAALVV
.:: :: . :. :.:...::..: .::.:. . .::......:..::.:.
NP_004 PNATFCLI-SGHRPE------AASRFLQALQAGCIPVLLSPRWELPFSEVIDWTKAAIVA
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pF1KA0 PKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPI
. .: :. .: . .::.:.: .:::..:::.......:.: .:. ::
NP_004 DERLPLQVLAALQEMSPARVLALRQQTQFLWDAYFSSVEKVIHTTLEVIQDRI-------
330 340 350 360 370
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pF1KA0 REEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDFYRSWN
::. : : : ::
NP_004 ---------------FGTS--------------------AHPSLL-------------WN
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pF1KA0 CAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTV
:: :. . :. :.. : : :: : .:..
NP_004 SPPGA--LLALSTFSTS-PQDFPFYYLQQGSRPEG---------------------RFSA
390 400 410 420
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pF1KA0 VMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPK-LPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNS
.. . . .. .. . : . ...:.:.. . :::. ::. .::. :. ...
NP_004 LIWVGPPGQPPLKLIQAVAGSQHCAQILVLWSNERPLPSR---WPETAVPLTVIDGHRK-
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pF1KA0 LNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQS
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NP_004 VSDRFYPYSTIRTDAILSLDARSSLSTSEVDFAFLVWQSFPERMVGFLTSSHFWDEAHGG
480 490 500 510 520 530
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 WLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHIT
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NP_004 WGYTAERTNEFSMVLTTAAFYHRYYHTLFTHSLPKALRTLADEAPTCVDVLMNFIVAAVT
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:::
NP_004 LFKDPVSVQRKKYRSLEKP
660 670
919 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]