Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0519
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0519, 919 aa
1>>>pF1KA0519 919 - 919 aa - 919 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4311+/-0.000923; mu= 16.1333+/- 0.056
mean_var=90.0474+/-18.036, 0's: 0 Z-trim(107.4): 19 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.135157
statistics sampled from 9566 (9582) to 9566 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 3.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6070.1 EXTL3 gene_id:2137|Hs108|chr8 ( 919) 6245 1228.3 0
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CCDS53618.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 ( 751) 915 189.0 2.9e-47
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CCDS775.1 EXTL2 gene_id:2135|Hs108|chr1 ( 330) 418 91.9 2.1e-18
>>CCDS6070.1 EXTL3 gene_id:2137|Hs108|chr8 (919 aa)
initn: 6245 init1: 6245 opt: 6245 Z-score: 6577.4 bits: 1228.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6245; 100.0% identity (100.0% similar) in 919 aa overlap (1-919:1-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTGYTMLRNGGAGNGGQTCMLRWSNRIRLTWLSFTLFVILVFFPLIAHYYLTTLDEADEA
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CCDS60 MTGYTMLRNGGAGNGGQTCMLRWSNRIRLTWLSFTLFVILVFFPLIAHYYLTTLDEADEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GKRIFGPRVGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GKRIFGPRVGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRGCRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRGCRLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 STFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 STFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGERED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGERED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQI
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pF1KA0 PAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 YRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIGVPIMVVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIGVPIMVVRT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDI
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pF1KA0 PHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVD
850 860 870 880 890 900
910
pF1KA0 SVLFKTRLPHDKTKCFKFI
:::::::::::::::::::
CCDS60 SVLFKTRLPHDKTKCFKFI
910
>>CCDS7908.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 (718 aa)
initn: 1126 init1: 496 opt: 915 Z-score: 962.2 bits: 189.0 E(32554): 2.8e-47
Smith-Waterman score: 1218; 32.9% identity (57.2% similar) in 794 aa overlap (140-916:48-712)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LNLKIEACKKSIENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSL---PIRLLPEKDDA
:: . : : :. :. :: :.
CCDS79 MKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPHSIESSNDWNVEKRSIRDVPVVRLPA--DS
20 30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 GLPPPKATRGCRLHNCFDYSRCPLT--SGFPVYVYDSDQFV--FGSYLDPLVKQAFQATA
.: .. .::.:.::: :: .. . . ::.: ..: :: .. ... ..
CCDS79 PIPE-RGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTISREYNELL
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270
pF1KA0 RA---NVYVTENADIACLYVILVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIIN-L
: . : :.. . :::.: . ... . :: : . . .: .: : ::...: :
CCDS79 MAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNT-LRIKETAQAMAQLSRW-DRGTNHLLFNML
140 150 160 170 180 190
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVK
: .: ::..: . : : :: :.:. . :. .: ...: . :
CCDS79 PGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSI-PVYSPLSAE--VDLPEKGPGP
200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RKYLFTFQGEKIESLRSSLQEARSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEF
:.:.. : :.. : : .: :.:.: .. ..:::
CCDS79 RQYFL---------LSSQV-----------GLHPEYRED-----LEALQVKHGESVLVLD
250 260 270 280
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TCKNQPKPSLPTEWALCGERE--DRLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALE
: : . : .. : ... : ..:. .:: ... :: : :. : ..:.
CCDS79 KCTNLSEGVLSVR-KRCHKHQVFDYPQVLQEATFCVVLR--GARL----GQAV-LSDVLQ
290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNEAALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLW
.: ::::.... ::....:.:..:..:::. ....:. .:.:. . .. :.::.:..:
CCDS79 AGCVPVVIADSYILPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQARWFW
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLG
:.::.. .: ..: .: :: : : : :
CCDS79 EAYFQSIKAIALATLQIINDRIY-PYAAISYEEW--------------------------
400 410 420
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 PVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDFYRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGF
..:: .. :. . .:. : :..:
CCDS79 ---NDPPAVK-----------------WGSVSNPLFL-------PLIP------------
430 440 450
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVW
: . : ::...:::.: : :. . ... .: :.:..:::
CCDS79 -PQSQG--------------------FTAIVLTYDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVW
460 470 480
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 NSP-KLPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDA-HLRHDEI
:. : : :: ::: : ::. :::: .:.:.:::.:..::::::.:.:::: : ::.
CCDS79 NNQNKNPPEDSLWPKIRVPLKVVRTAENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDEL
490 500 510 520 530 540
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 MFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYS
.::..:::: ::.::.::: : :: ..: :.:... :.:::::::::.:::. :::.
CCDS79 QFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYT
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820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCP--QALSHDDSH
: :: :.. :: ..:::::::::::...: : :::: : :.:: : ..:: :..:
CCDS79 YKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLSLDQTH
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880 890 900 910
pF1KA0 FHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKTRLPHDKTKCFKFI
. :: .::: :..:.: ::: .. :.: ::.: .: .: : :
CCDS79 MVERSECINKFASVFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFP-EKLKSFPNIGSL
670 680 690 700 710
>>CCDS53619.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 (728 aa)
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Smith-Waterman score: 1158; 32.2% identity (56.9% similar) in 794 aa overlap (140-916:48-722)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LNLKIEACKKSIENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSL---PIRLLPEKDDA
:: . : : :. :. :: :.
CCDS53 MKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPHSIESSNDWNVEKRSIRDVPVVRLPA--DS
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170 180 190 200 210 220
pF1KA0 GLPPPKATRGCRLHNCFDYSRCPLT--SGFPVYVYDSDQFV--FGSYLDPLVKQAFQATA
.: .. .::.:.::: :: .. . . ::.: ..: :: .. ... ..
CCDS53 PIPE-RGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTISREYNELL
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270
pF1KA0 RA---NVYVTENADIACLYVILVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIIN-L
: . : :.. . :::.: . ... . :: : . . .: .: : ::...: :
CCDS53 MAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNT-LRIKETAQAMAQLSRW-DRGTNHLLFNML
140 150 160 170 180 190
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVK
: .: ::..: . : : :: :.:. . :. .: ...: . :
CCDS53 PGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSI-PVYSPLSAE--VDLPEKGPGP
200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RKYLFTFQGEKIESLRSSLQEARSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEF
:.:.. : :.. : : .: :.:.: .. ..:::
CCDS53 RQYFL---------LSSQV-----------GLHPEYRED-----LEALQVKHGESVLVLD
250 260 270 280
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TCKNQPKPSLPTEWALCGERE--DRLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALE
: : . : .. : ... : ..:. .:: ... :: : :. : ..:.
CCDS53 KCTNLSEGVLSVR-KRCHKHQVFDYPQVLQEATFCVVLR--GARL----GQAV-LSDVLQ
290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNEAALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLW
.: ::::.... ::....:.:..:..:::. ....:. .:.:. . .. :.:: :.
CCDS53 AGCVPVVIADSYILPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQ-LFME
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLG
. . .. . . ..: : : . : .. :. :: . . :
CCDS53 PARRENWSAANHQMNSLIWPREQWDSQIINDRI---YPY----AAISYEEWND-------
400 410 420 430 440
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 PVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDFYRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGF
:: .. :. . .:. : :..:
CCDS53 -----PPAVK-----------------WGSVSNPLFL-------PLIP------------
450 460
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVW
: . : ::...:::.: : :. . ... .: :.:..:::
CCDS53 -PQSQG--------------------FTAIVLTYDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVW
470 480 490
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 NSP-KLPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDA-HLRHDEI
:. : : :: ::: : ::. :::: .:.:.:::.:..::::::.:.:::: : ::.
CCDS53 NNQNKNPPEDSLWPKIRVPLKVVRTAENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDEL
500 510 520 530 540 550
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 MFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYS
.::..:::: ::.::.::: : :: ..: :.:... :.:::::::::.:::. :::.
CCDS53 QFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYT
560 570 580 590 600 610
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCP--QALSHDDSH
: :: :.. :: ..:::::::::::...: : :::: : :.:: : ..:: :..:
CCDS53 YKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLSLDQTH
620 630 640 650 660 670
880 890 900 910
pF1KA0 FHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKTRLPHDKTKCFKFI
. :: .::: :..:.: ::: .. :.: ::.: .: .: : :
CCDS53 MVERSECINKFASVFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFP-EKLKSFPNIGSL
680 690 700 710 720
>>CCDS53618.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 (751 aa)
initn: 1126 init1: 496 opt: 915 Z-score: 961.9 bits: 189.0 E(32554): 2.9e-47
Smith-Waterman score: 1218; 32.9% identity (57.2% similar) in 794 aa overlap (140-916:81-745)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LNLKIEACKKSIENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSL---PIRLLPEKDDA
:: . : : :. :. :: :.
CCDS53 MKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPHSIESSNDWNVEKRSIRDVPVVRLPA--DS
60 70 80 90 100
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pF1KA0 GLPPPKATRGCRLHNCFDYSRCPLT--SGFPVYVYDSDQFV--FGSYLDPLVKQAFQATA
.: .. .::.:.::: :: .. . . ::.: ..: :: .. ... ..
CCDS53 PIPE-RGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTISREYNELL
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270
pF1KA0 RA---NVYVTENADIACLYVILVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIIN-L
: . : :.. . :::.: . ... . :: : . . .: .: : ::...: :
CCDS53 MAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNT-LRIKETAQAMAQLSRW-DRGTNHLLFNML
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVK
: .: ::..: . : : :: :.:. . :. .: ...: . :
CCDS53 PGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSI-PVYSPLSAE--VDLPEKGPGP
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RKYLFTFQGEKIESLRSSLQEARSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEF
:.:.. : :.. : : .: :.:.: .. ..:::
CCDS53 RQYFL---------LSSQV-----------GLHPEYRED-----LEALQVKHGESVLVLD
290 300 310
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TCKNQPKPSLPTEWALCGERE--DRLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALE
: : . : .. : ... : ..:. .:: ... :: : :. : ..:.
CCDS53 KCTNLSEGVLSVR-KRCHKHQVFDYPQVLQEATFCVVLR--GARL----GQAV-LSDVLQ
320 330 340 350 360
460 470 480 490 500 510
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.: ::::.... ::....:.:..:..:::. ....:. .:.:. . .. :.::.:..:
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:.::.. .: ..: .: :: : : : :
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..:: .. :. . .:. : :..:
CCDS53 ---NDPPAVK-----------------WGSVSNPLFL-------PLIP------------
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: . : ::...:::.: : :. . ... .: :.:..:::
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:. : : :: ::: : ::. :::: .:.:.:::.:..::::::.:.:::: : ::.
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.::..:::: ::.::.::: : :: ..: :.:... :.:::::::::.:::. :::.
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: :: :.. :: ..:::::::::::...: : :::: : :.:: : ..:: :..:
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. :: .::: :..:.: ::: .. :.: ::.: .: .: : :
CCDS53 MVERSECINKFASVFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFP-EKLKSFPNIGSL
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.... : ..::.::. . :: : . : .:... .: :::...:.:.. . ..
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....::.::.. . . .. .::. .. .::.:.: .::::.:::....: :.: .
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:. :: . : : ::
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. :: :: :: :::. ...::. : : . :
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:: . : .::.:. :. . . :: . : : ...:.:: : ::..
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:: .::..:.. :.. ...::::...: :.:.::.:.:. : :. :.: ::. .:
CCDS63 WPATAVPVVVIEGESKVMSSRFLPYDNIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPER
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:::.:.: : :: .. : :.:... . ::::::::..:::: ::::. .: ....:::.
CCDS63 IVGYPARSHFWDNSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQ
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::::: :::::: .:. ::::::.. .. : . :. : .:: .:..:.: :
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CCDS63 ASWFGYMPLIHSQMRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL
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CCDS27 LFKDPVSVQRKKYRSLEKP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]