Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0424
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0424, 516 aa
1>>>pF1KA0424 516 - 516 aa - 516 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4557+/-0.00101; mu= 8.6268+/- 0.061
mean_var=159.1557+/-34.400, 0's: 0 Z-trim(109.7): 129 B-trim: 276 in 1/51
Lambda= 0.101663
statistics sampled from 10949 (11098) to 10949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.341), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 516) 3567 535.5 5.5e-152
CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 495) 3435 516.1 3.6e-146
CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 463) 3132 471.6 8.2e-133
CCDS55429.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 414) 2840 428.8 5.9e-120
CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 574) 2163 329.6 5.8e-90
CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 596) 2163 329.6 6e-90
CCDS9305.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 652) 2163 329.6 6.4e-90
CCDS53857.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (1277) 2163 329.9 1.1e-89
CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 690) 2107 321.4 2e-87
CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 670) 2044 312.2 1.2e-84
CCDS73553.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 512) 1677 258.3 1.5e-68
CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8 (1606) 644 107.2 1.5e-22
CCDS13410.1 PREX1 gene_id:57580|Hs108|chr20 (1659) 573 96.8 2.1e-19
CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385) 445 77.9 8.1e-14
CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219) 441 77.3 1.1e-13
>>CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX (516 aa)
initn: 3567 init1: 3567 opt: 3567 Z-score: 2842.1 bits: 535.5 E(32554): 5.5e-152
Smith-Waterman score: 3567; 100.0% identity (100.0% similar) in 516 aa overlap (1-516:1-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDIL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 YYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 REERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 REERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQY
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KA0 LVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
490 500 510
>>CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX (495 aa)
initn: 3435 init1: 3435 opt: 3435 Z-score: 2737.7 bits: 516.1 E(32554): 3.6e-146
Smith-Waterman score: 3435; 100.0% identity (100.0% similar) in 495 aa overlap (22-516:1-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQW
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDIL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 YYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAF
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 REERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 REERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQY
400 410 420 430 440 450
490 500 510
pF1KA0 LVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
460 470 480 490
>>CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX (463 aa)
initn: 3129 init1: 3129 opt: 3132 Z-score: 2497.9 bits: 471.6 E(32554): 8.2e-133
Smith-Waterman score: 3132; 98.5% identity (99.1% similar) in 461 aa overlap (56-516:3-463)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 ELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLD
:. .. ::::::::::::::::::::::
CCDS55 MQWIRGGSGMLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLD
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 PNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDAC
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 MELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHS
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 DYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEM
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 AWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFN
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 VSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQA
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 AMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFW
400 410 420 430 440 450
510
pF1KA0 QNFSRLTPFKK
:::::::::::
CCDS55 QNFSRLTPFKK
460
>>CCDS55429.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX (414 aa)
initn: 2840 init1: 2840 opt: 2840 Z-score: 2267.1 bits: 428.8 E(32554): 5.9e-120
Smith-Waterman score: 2840; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (103-516:1-414)
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 EEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQ
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 CRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFW
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 IYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQ
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDI
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 LDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYE
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEK
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 IGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVF
340 350 360 370 380 390
500 510
pF1KA0 EFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
400 410
>>CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (574 aa)
initn: 2143 init1: 1140 opt: 2163 Z-score: 1728.5 bits: 329.6 E(32554): 5.8e-90
Smith-Waterman score: 2163; 61.5% identity (83.9% similar) in 517 aa overlap (4-516:65-574)
10 20 30
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
::. ..: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS66 GSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
::.::.:::::::::. .:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . . : ...
CCDS66 VIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPSEEQDEEAS-QSR
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 GRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIE
: .:..:::.::: :::.::: :::::.::::::..::::. ::. :: .::::::
CCDS66 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 DIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMK
:::.:: :..:::::::...::::::: :::..:.:: ::::::::: ::.::..:::
CCDS66 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: . ::
CCDS66 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
.:.::. ::::::.::.:::::.::.:.. ::: ::::::::::..::.. : . :
CCDS66 YEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQ-G
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
..:::.:::::::.: :::::.:::.::::::.:::..:.::. :::: : :.:.:::::
CCDS66 KSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFK
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVP
: .. :.:..:: ::: :.: :::.: .::. ::::...:.:::::::. : ....:.
CCDS66 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAG
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500
pF1KA0 --KQKGVNSARSVPPSYPPPQD--PLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
:.:: : : :: : :... . .: .. :.::: ..::::..: ::..:.
CCDS66 HGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFN
520 530 540 550 560
510
pF1KA0 RLTPFKK
:::::.:
CCDS66 RLTPFRK
570
>>CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (596 aa)
initn: 2143 init1: 1140 opt: 2163 Z-score: 1728.3 bits: 329.6 E(32554): 6e-90
Smith-Waterman score: 2163; 61.5% identity (83.9% similar) in 517 aa overlap (4-516:87-596)
10 20 30
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
::. ..: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS66 GSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
::.::.:::::::::. .:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . . : ...
CCDS66 VIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPSEEQDEEAS-QSR
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 GRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIE
: .:..:::.::: :::.::: :::::.::::::..::::. ::. :: .::::::
CCDS66 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
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160 170 180 190 200 210
pF1KA0 DIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMK
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CCDS66 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
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220 230 240 250 260 270
pF1KA0 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: . ::
CCDS66 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
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280 290 300 310 320 330
pF1KA0 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
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360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
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400 410 420 430 440 450
pF1KA0 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVP
: .. :.:..:: ::: :.: :::.: .::. ::::...:.:::::::. : ....:.
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460 470 480 490 500
pF1KA0 --KQKGVNSARSVPPSYPPPQD--PLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
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510
pF1KA0 RLTPFKK
:::::.:
CCDS66 RLTPFRK
590
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10 20 30
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
::. ..: :::.:::::: ..::.:::::
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CCDS93 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
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:::.:: :..:::::::...::::::: :::..:.:: ::::::::: ::.::..:::
CCDS93 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
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pF1KA0 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: . ::
CCDS93 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
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pF1KA0 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
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pF1KA0 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
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pF1KA0 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVP
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pF1KA0 --KQKGVNSARSVPPSYPPPQD--PLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
:.:: : : :: : :... . .: .. :.::: ..::::..: ::..:.
CCDS93 HGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFN
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510
pF1KA0 RLTPFKK
:::::.:
CCDS93 RLTPFRK
650
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10 20 30
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
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CCDS53 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
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pF1KA0 DIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMK
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CCDS53 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
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pF1KA0 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: . ::
CCDS53 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
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pF1KA0 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
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CCDS53 YEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQ-G
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pF1KA0 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
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CCDS53 KSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFK
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pF1KA0 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVP
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CCDS53 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAG
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pF1KA0 --KQKGVNSARSVPPSYPPPQD--PLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
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CCDS53 HGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFN
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510
pF1KA0 RLTPFKK
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CCDS53 RLTPFRK
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10 20 30
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
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pF1KA0 EDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLM
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CCDS21 EDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLT
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CCDS21 KLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEA
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pF1KA0 ALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPY
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pF1KA0 GRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAF
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CCDS21 RLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASK-
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pF1KA0 TPFKK
.::.:
CCDS21 APFRK
690
>>CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 (670 aa)
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10 20 30
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
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CCDS42 SEEDLYDDLHSSSHHYSHPGGGGEQLAINELISDGSVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
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pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
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CCDS42 VIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDE-----PAD-DDAPLAGNSGAEDG
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pF1KA0 GRPLQN-RDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNI
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CCDS42 GAEAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNI
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pF1KA0 EDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLM
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CCDS42 EDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLT
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pF1KA0 KDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAA
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CCDS42 KLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEA
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pF1KA0 ALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPY
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CCDS42 ALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQ
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pF1KA0 GRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAF
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CCDS42 AKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAF
520 530 540 550 560 570
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pF1KA0 KLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKV
.:: : . ::. ..: :.: :::.:: .::..:: :.. :: :.: :..:: ... :
CCDS42 RLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASK-
580 590 600 610 620 630
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pF1KA0 PKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLT
:. ... .. . :::. : . ..: . :::
CCDS42 --QQVTGKPKGRRTAAPPPRLPGPYPADIIPFSEPQSQAS
640 650 660 670
pF1KA0 PFKK
516 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 18:53:28 2016 done: Wed Nov 2 18:53:29 2016
Total Scan time: 3.090 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]