Result of FASTA (omim) for
pFN21AA0339
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0339, 1707 aa
1>>>pF1KA0339 1707 - 1707 aa - 1707 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 19.7737+/-0.000511; mu= -42.6633+/- 0.032
mean_var=912.9090+/-187.082, 0's: 0 Z-trim(125.8): 145 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.042448
statistics sampled from 50270 (50473) to 50270 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.801), E-opt: 0.2 (0.592), width: 16
Scan time: 17.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055527 (OMIM: 611052) histone-lysine N-methyltr (1707) 11558 724.5 2e-207
XP_006721169 (OMIM: 611052) PREDICTED: histone-lys (1707) 11558 724.5 2e-207
XP_016879398 (OMIM: 611052) PREDICTED: histone-lys (1707) 11558 724.5 2e-207
XP_005255780 (OMIM: 611052) PREDICTED: histone-lys (1707) 11558 724.5 2e-207
NP_055863 (OMIM: 611055) histone-lysine N-methyltr (1923) 1561 112.3 4.4e-23
XP_006719359 (OMIM: 611055) PREDICTED: histone-lys (1966) 1531 110.5 1.6e-22
XP_005253915 (OMIM: 611055) PREDICTED: histone-lys (1966) 1531 110.5 1.6e-22
XP_016883035 (OMIM: 606834) PREDICTED: histone-lys (1703) 550 50.3 0.00017
XP_016883034 (OMIM: 606834) PREDICTED: histone-lys (2527) 550 50.4 0.00024
XP_011525863 (OMIM: 606834) PREDICTED: histone-lys (2527) 550 50.4 0.00024
NP_055542 (OMIM: 606834) histone-lysine N-methyltr (2715) 550 50.5 0.00026
XP_016883033 (OMIM: 606834) PREDICTED: histone-lys (2685) 532 49.3 0.00055
XP_006718902 (OMIM: 159555,605130) PREDICTED: hist (3133) 517 48.5 0.0012
XP_011541135 (OMIM: 159555,605130) PREDICTED: hist (3166) 517 48.5 0.0012
NP_005924 (OMIM: 159555,605130) histone-lysine N-m (3969) 517 48.5 0.0014
NP_001184033 (OMIM: 159555,605130) histone-lysine (3972) 517 48.5 0.0014
XP_011541133 (OMIM: 159555,605130) PREDICTED: hist (4002) 517 48.5 0.0014
XP_011541132 (OMIM: 159555,605130) PREDICTED: hist (4004) 517 48.5 0.0014
XP_011541131 (OMIM: 159555,605130) PREDICTED: hist (4005) 517 48.5 0.0014
>>NP_055527 (OMIM: 611052) histone-lysine N-methyltransf (1707 aa)
initn: 11558 init1: 11558 opt: 11558 Z-score: 3844.8 bits: 724.5 E(85289): 2e-207
Smith-Waterman score: 11558; 100.0% identity (100.0% similar) in 1707 aa overlap (1-1707:1-1707)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SENSYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFR
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NP_055 SENSYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SSDANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPGAPFAENTAERFPPSYTSYLPPEPSRP
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NP_055 SSDANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPGAPFAENTAERFPPSYTSYLPPEPSRP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TDQDYRPPASEAPPPEPPEPGGGGGGGGPSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESV
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NP_055 TDQDYRPPASEAPPPEPPEPGGGGGGGGPSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSSMVLGARDTGSEVPSGSGHGPCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSSMVLGARDTGSEVPSGSGHGPCT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
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NP_055 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PQQPPPPPPPPPPPPPYLASLPLGYPPHQPAYLLPPRPDGPPPPEYPPPPPPPPHIYDFV
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NP_055 PQQPPPPPPPPPPPPPYLASLPLGYPPHQPAYLLPPRPDGPPPPEYPPPPPPPPHIYDFV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 NSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQMLTRLHQLRQGKGLIAASAGPPGGAFGEAFLPFPP
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NP_055 NSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQMLTRLHQLRQGKGLIAASAGPPGGAFGEAFLPFPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PQEAAYGLPYALYAQGQEGRGAYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELA
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NP_055 PQEAAYGLPYALYAQGQEGRGAYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EGKTLPTAGTVGRVLAMLVQEMKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNA
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NP_055 EGKTLPTAGTVGRVLAMLVQEMKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AKQQAKEEDKEKTKLKEPGLLSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEP
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NP_055 AKQQAKEEDKEKTKLKEPGLLSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEP
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910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SEISEASEEKRPRPSTPAEEDEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SEISEASEEKRPRPSTPAEEDEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LDSEGEEASQESSSEKDEEDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LDSEGEEASQESSSEKDEEDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
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NP_055 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 PAPAPRPDERPSSPIPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVPAPEPPPATPPQAKFPGPASRKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PAPAPRPDERPSSPIPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVPAPEPPPATPPQAKFPGPASRKAP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 RGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVLADLA
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NP_055 RGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVLADLA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LTPARRGLPALPAVEDSEATETSDEAERPRPLLSHILLEHNYALAVKPTPPAPALRPPEP
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NP_055 LTPARRGLPALPAVEDSEATETSDEAERPRPLLSHILLEHNYALAVKPTPPAPALRPPEP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 VPAPAALFSSPADEVLEAPEVVVAEAEEPKPQQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEESSDSS
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NP_055 VPAPAALFSSPADEVLEAPEVVVAEAEEPKPQQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEESSDSS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 SSSDGEGALRRRSLRSHARRRRPPPPPPPPPPRAYEPRSEFEQMTILYDIWNSGLDSEDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSSDGEGALRRRSLRSHARRRRPPPPPPPPPPRAYEPRSEFEQMTILYDIWNSGLDSEDM
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KA0 SYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQTGSARSEGYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQTGSARSEGYY
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 PISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 NQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700
pF1KA0 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
:::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
1690 1700
>>XP_006721169 (OMIM: 611052) PREDICTED: histone-lysine (1707 aa)
initn: 11558 init1: 11558 opt: 11558 Z-score: 3844.8 bits: 724.5 E(85289): 2e-207
Smith-Waterman score: 11558; 100.0% identity (100.0% similar) in 1707 aa overlap (1-1707:1-1707)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SENSYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SENSYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFR
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 SSDANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPGAPFAENTAERFPPSYTSYLPPEPSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SSDANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPGAPFAENTAERFPPSYTSYLPPEPSRP
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430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TDQDYRPPASEAPPPEPPEPGGGGGGGGPSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TDQDYRPPASEAPPPEPPEPGGGGGGGGPSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESV
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490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSSMVLGARDTGSEVPSGSGHGPCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSSMVLGARDTGSEVPSGSGHGPCT
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pF1KA0 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PQQPPPPPPPPPPPPPYLASLPLGYPPHQPAYLLPPRPDGPPPPEYPPPPPPPPHIYDFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PQQPPPPPPPPPPPPPYLASLPLGYPPHQPAYLLPPRPDGPPPPEYPPPPPPPPHIYDFV
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pF1KA0 NSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQMLTRLHQLRQGKGLIAASAGPPGGAFGEAFLPFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQMLTRLHQLRQGKGLIAASAGPPGGAFGEAFLPFPP
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pF1KA0 PQEAAYGLPYALYAQGQEGRGAYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PQEAAYGLPYALYAQGQEGRGAYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EGKTLPTAGTVGRVLAMLVQEMKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EGKTLPTAGTVGRVLAMLVQEMKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AKQQAKEEDKEKTKLKEPGLLSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AKQQAKEEDKEKTKLKEPGLLSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SEISEASEEKRPRPSTPAEEDEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SEISEASEEKRPRPSTPAEEDEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LDSEGEEASQESSSEKDEEDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LDSEGEEASQESSSEKDEEDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_006 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
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XP_006 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
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XP_016 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
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XP_016 PISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKL
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XP_016 NQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIG
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XP_016 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
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XP_016 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
1690 1700
>>XP_005255780 (OMIM: 611052) PREDICTED: histone-lysine (1707 aa)
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XP_005 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
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XP_005 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
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XP_005 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
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XP_005 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
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XP_005 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
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XP_005 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PAPAPRPDERPSSPIPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVPAPEPPPATPPQAKFPGPASRKAP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KA0 RGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVLADLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVLADLA
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XP_005 LTPARRGLPALPAVEDSEATETSDEAERPRPLLSHILLEHNYALAVKPTPPAPALRPPEP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSSDGEGALRRRSLRSHARRRRPPPPPPPPPPRAYEPRSEFEQMTILYDIWNSGLDSEDM
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XP_005 PISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKL
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XP_005 NQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
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XP_005 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
1690 1700
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::..:::.:.: :::::.:.: .
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pF1KA0 GSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNGTPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTP
. : .: .... .:. .:...: ..::: ::::..:: : :::.:.::
NP_055 NETLQLSDALKRLKDGGLSAGCGSGSSSVTPNSGGTPFSQDTAYSSCRLDTPNSYGQ---
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::: : : .::.::::.::: . : :: :: :... ::..:::
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pF1KA0 ASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFRSSDANYPAYYESWNR
.. : ::.:..::: .:: .. .....::. :... . ..
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:: :: .:: :: .:. .:. ::: : ::. : . .
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: :: ::: :: :: . : : : :. . .. . ::. :: ::. :
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. : : :.::::::::::::::.:. :: :::: . :.: . .. . . .
NP_055 LESSPAGPEKPHDSLDSRIEMLLKEQRTKLLFLREPDSDTELQMEGSPISSSSSQLSPLA
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: :.. : ::: :. ...::..:: : : :::
NP_055 PFGTNSQPGFRGPTPPSSRPSSTGLEDISPTPLPDSDEDEELDLGLGPRPPPEPGPPDPA
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570 580 590
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NP_055 GLLSQTAEVALDLVGDRTPTSEKMDEGQQ-SSGEDMEISDDEMPSAPITSADCPKPMVVT
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pF1KA0 ----------------PAPTPPQQPP-PPPPPPPPP------PPYLASLPLGYPPHQPAY
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.:: : : :::: :: :: :: .. : .... ::.::::::::::::::.:
NP_055 TVPPPPLPAPPGVPPPPILPPLPPFPPGLFP-VMQVDMSHVLGGQWGGMPMSFQMQTQVL
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pF1KA0 TRLHQLRQGKG------LIAASAGPPGGAFGEAFLPFPPPQEAAYGLPYALYAQGQEGRG
.:: :.: ..::.:. ... : :. .:: : :..: .: :::
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: : :::. . : ::.: : .:: :: ....:
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pF1KA0 MKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNAAKQ-QAKEEDKEKTKLKEPGL
.:.::.::::::::: ::: :::.::..::. :: . .:. . :.::. : : . .
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: : .:.:. : : :....: :::::.:::::::::::: . . ....:: :::: ..:
NP_055 L-LESWGKGEGL-GYEGLGLGIGLRGAIRLPSFKVKRKEPPDTTSSGDQKRLRPSTSVDE
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.... :.:.. : . ::: . .. . . . ::: ::: .:: ::..:
NP_055 EDEESERERDRDMADTP-CELAKRDPKGVGVRRRPARPLELDSGGEEDEKESLSEEQEST
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pF1KA0 EDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESD-SSSKCSLYADSDGENDS---TSDSE
:..:: ::.:..:. : . . . :...::.. : .. . .::: :. :: .:
NP_055 EEEEEAEEEEEEEDDDDDDSDDRDESENDDEDTALSEASEKDEGDSDEEETVSIVTSKAE
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pF1KA0 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSES-----SSEDEEEEER-------------P-----
..::: :: :: ::: :: ::::. . :.:::::. :
NP_055 ATSSSESSESSEFESSSESSPSSSEDEEEVVAREEEEEEEEEEMVAEESMASAGPEDFEQ
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pF1KA0 ----AALPSASPP------------------PREVPV---PTPAPVEVPVPERVAGSPVT
::: ..: :.: : : :: : : :
NP_055 DGEEAALAPGAPAVDSLGMEEEVDIETEAVAPEERPSMLDEPPLPVGVEEPADSREPPEE
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pF1KA0 PLPEQEA----SPARPAGPTEESPPSAPLR-P-------PEPPAGPPAPAPRPDERPSSP
: ::. :: :: .: :: .: : : :::: : : : : :
NP_055 PGLSQEGAMLLSPEPPAKEVEARPPLSPERAPEHDLEVEPEPPMMLPLPLQPPLPPPRPP
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pF1KA0 IPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVP-APEPPPATP----PQAK---------FPG--PASRK
: :::. . .: .. : : . :: :: :: :: :
NP_055 RPPSPPPEPETTDASHPSVPPEPLAEDHPPHTPGLCGSLAKSQSTETVPATPGGEPPLSG
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pF1KA0 APRGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVL--
. :. . ..: . : : .: :: :. :: .::. . : :
NP_055 GSSGLSLSSPQVPGSPFSYPAPSPS-LSSGGLPRTPGRDFSFTPTFSEPSGPLLLPVCPL
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pF1KA0 ---------ADLALTPA--RRGLP-----------ALPAVEDSEATETSDEAERPRP-LL
. :: .:. . ::: ::::: ..: .: : : ::
NP_055 PTGRRDERSGPLA-SPVLLETGLPLPLPLPLPLPLALPAVLRAQA-----RAPTPLPPLL
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pF1KA0 SHILLEHNYALAVKP-----TPPA------PALRPPE-----------PVPAPAALFSSP
: . :: .::. : .::: : . .: :
NP_055 PAPLASCPPPMKRKPGRPRRSPPSMLSLDGPLVRPPAGAALGRELLLLPGQPQTPVFPST
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pF1KA0 ADEV----------LEAPEVVVAEAEEPKP-----QQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEES
: . :: . : : . . .: ... :. ..
NP_055 HDPRTVTLDFRNAGIPAPPPPLPPQPPPPPPPPPVEPTKLPFKELDNQWPSEAIPPGPRG
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pF1KA0 SDSSSSSDGEGALRRRSLRSHARRRRP---PPPPPP---PPPRAYEPRSEFEQMTILYDI
: . : : : : ..:. :: : :: ..::::::.:::::::
NP_055 RDEVTEEYMELAKSRGPWRRPPKKRHEDLVPPAGSPELSPPQPLFRPRSEFEEMTILYDI
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pF1KA0 WNSGLDSEDMSYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQ
::.:.: ::. .: .:::::::: .: :::::: ::.: :.:.. :.:.: .:: :::
NP_055 WNGGIDEEDIRFLCVTYERLLQQDNGMDWLNDTLWVYHPSTSLSSAKKKKR-DDGIREHV
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:: :::::.: :.::.: .::. .:. . .:::: ..:. ::::::::
NP_055 TGCARSEGFYTIDKKDKLRYLNSSRASTDE-PPADTQGMSIPAQPHASTRAGSERRSEQR
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pF1KA0 RLLSAIGTSAIMDSDLLKLNQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQN
::::.. : ::::::.::::::::::.: .:.::.::::::::::::::::::::::
NP_055 RLLSSFTGSC--DSDLLKFNQLKFRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQN
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pF1KA0 IRQMVADMREKRYVQEGIGSSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIE
:::..:::::::: .:::::::.::::::::::::::::.:::::: :.:::::::::.:
NP_055 IRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSCNPNCYAKVITVE
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pF1KA0 SQKKIVIYSKQPIGVDEEITYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
::::::::::: :.:.::::::::::.:: :::::::.:.:::.::
NP_055 SQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIEDVKIPCLCGSENCRGTLN
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>--
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10 20 30 40
pF1KA0 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHF
: .:.. . .::.:::..::: :.. .:.::::: ::
NP_055 MENSHPPHHHHQQPPPQPGPSGERR-NHHWRSYKLMIDPA----LKKGHHKLYRYDGQHF
10 20 30 40 50
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pF1KA0 SVNDSKYIPVEDLQDPRC-HVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVR
:. :. ::: ..::: . .::... : :::::.::::.: .: :.::::.::::.:
NP_055 SLAMSSNRPVEIVEDPRVVGIWTKNKELELSVPKFKIDEFYVGPVPPKQVTFAKLNDNIR
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pF1KA0 ETFLKDMCRKYGEVEEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIH
:.::.:::.::::::::::: .:.:.::::.:.:.:...::::..:..:: :::::::::
NP_055 ENFLRDMCKKYGEVEEVEILYNPKTKKHLGIAKVVFATVRGAKDAVQHLHSTSVMGNIIH
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..:: ::.
NP_055 VELDTKGETRMRFYELLVTGRYTPQTLPVGELDAVSPIVNETLQLSDALKRLKDGGLSAG
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pF1KA0 PTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNGTPCSQDTSFSSSR
.:. .:...: ..::: ::::..:: :
XP_006 PVGELDAVSPIVNETLQLSDALKRLKDGGLSAGCGSGSSSVTPNSGGTPFSQDTAYSSCR
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pF1KA0 QDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTS----------FKPRRSEN
:::.:.:: ::: : : .::.::::.::: . : :: :: :.
XP_006 LDTPNSYGQ-------GTPLTPRLGTPFSQDSSYSSRQPTPSYLFSQDPAVTFKARRHES
270 280 290 300 310
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pF1KA0 SYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFRSSD
.. ::..::: .. : ::.:. :::. .::. .. .....::. :...
XP_006 KFTDAYNRRHEHHYVHNSPAVTAVAG---ATAAFRGSSDLPFGAVGGTGGSSGPPFKAQP
320 330 340 350 360 370
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pF1KA0 ANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPG-----APFAENTAERFPPSYTSYLPPEPS
. .. :: :: .:: :: .:. .:. ::: : ::.
XP_006 QDSATFA--------HTP-PPAQAT--PAPGFKSAFSPYQTPVAH-FPPP-----PEEPT
380 390 400 410
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pF1KA0 -------RPTDQDYRPPASEAPPPEPP-EPGG----GGGGGGPSPEREEVRTSPRPA---
: . . : : :::: :: :: . : : : :. . .. . ::.
XP_006 ATAAFGARDSGEFRRAP---APPPLPPAEPLAKEKPGTPPGPPPPDTNSMELGGRPTFGW
420 430 440 450 460 470
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pF1KA0 SPARSGSPAPETTNESV--PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLA---SDTEEEEENSS
:: ::. : . : : :.::::::::::::::.:. :: :::: . :.:
XP_006 SPEPCDSPGTPTLESSPAGPEKPHDSLDSRIEMLLKEQRTKLLFLREPDSDTELQMEGSP
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pF1KA0 MVLGARDTGSEVPSGSG-----HGPCTPP---PAPANFEDVAPT-------------GSG
. .. . . .: :.. .:: ::: :. ...::..:: : :
XP_006 ISSSSSQLSPLAPFGTNSQPGFRGP-TPPSSRPSSTGLEDISPTPLPDSDEDEELDLGLG
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590
pF1KA0 -----EPGA---------TRE---------SPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSP
::: : : .: .. ..... :::.:::::::. ..:
XP_006 PRPPPEPGPPDPAGLLSQTAEVALDLVGDRTPTSEKMDEGQQ-SSGEDMEISDDEMPSAP
600 610 620 630 640 650
600 610
pF1KA0 ------P----------------------PAPTPPQQPP-PPPPPPPPP------PPYLA
: : : :: :: ::::::::: :: :
XP_006 ITSADCPKPMVVTPGAAAVAAPSVLAPTLPLPPPPGFPPLPPPPPPPPPQPGFPMPPPLP
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pF1KA0 SLPLGYPPHQPAYLLPP----RPDG-PPPPEYPPPPPPPPHIYDFVNSLELMDRLGAQWG
: :: .:: .:: : : :::: :: :: :: .. : .... ::.:::
XP_006 PPPPPPPPAHPAVTVPPPPLPAPPGVPPPPILPPLPPFPPGLFP-VMQVDMSHVLGGQWG
720 730 740 750 760
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.:: :: ....:.:.::.::::::::: ::: :::.::..::. :: . .:. . :.
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XP_011 AAGAMGSSHGGPGDSSEEESSPTSRYIHFPVTVVSAPGLAPSATPGAPRIEQLDGVDDGT
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XP_011 DSEAEAVQQPRGQGTPPSGPGVVRAGVLGAAGDRARPPEDLPSEIVDFVLKNLGGPGDGG
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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