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# NO CUT ENZYMES (  202 enzymes) #
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AatII       Acc65I      AccI        AccII       AccIII      
AciI        AclI        AcyI        AfaI        AflII       
AflIII      AgeI        AhdI        Alw44I      AlwI        
AlwNI       AocI        Aor51HI     ApaI        ApaLI       
AscI        Asp700I     Asp718I     AspEI       AspHI       
AspI        AvaI        AvaII       AviII       AvrII       
BalI        BamHI       BanI        BanII       BbeI        
BbsI        BbvCI       BcgI        BciVI       BcnI        
BfaI        BfrI        BglI        BglII       BlnI        
BlpI        BmyI        Bpu1102I    BpuAI       BsaBI       
BsaHI       BsaI        BsaWI       BseAI       BseRI       
BsgI        BsiEI       BsiHKAI     BsiWI       BsiYI       
BslI        BsmAI       BsmBI       BsmI        BsoBI       
Bsp1286I    Bsp1407I    BspDI       BspEI       BspHI       
BspLU11I    BsrBI       BsrDI       BsrFI       BsrGI       
BssHII      BssKI       BssSI       Bst1107I    BstAPI      
BstBI       BstEII      BstNI       BstPI       BstUI       
BstXI       BstYI       BstZ17I     Bsu36I      CelII       
CfoI        Cfr10I      ClaI        CpoI        DraI        
DraII       DrdI        DsaI        EaeI        EagI        
Eam1105I    EarI        EclXI       Eco47III    Eco52I      
Eco81I      EcoNI       EcoO109I    EcoO65I     EcoRI       
EcoRII      EcoRV       FauI        FseI        FspI        
HaeII       HapII       HhaI        Hin1I       HinP1I      
HinfI       HpaI        HpaII       KasI        KpnI        
Ksp632I     KspI        MaeI        MaeIII      MamI        
MboII       MfeI        MflI        MluI        MluNI       
MroI        MscI        MslI        MspA1I      MspI        
MunI        MvaI        MvnI        NaeI        NarI        
NciI        NcoI        NdeI        NgoMIV      NheI        
NotI        NruI        NspV        PacI        PaeR7I      
PflFI       PflMI       PinAI       PleI        PmeI        
PpuMI       PshAI       Psp1406I    PvuI        PvuII       
RcaI        RsaI        RsrII       SacI        SacII       
SalI        SapI        SbfI        ScaI        ScrFI       
SexAI       SfaNI       SfiI        SfoI        SfuI        
SgrAI       SmaI        SmlI        SnaBI       SpeI        
Sse8387I    SspBI       SspI        StuI        SwaI        
TfiI        Tsp45I      TspRI       Tth111I     Van91I      
XbaI        XcmI        XhoI        XhoII       XmaCI       
XmaI        XmnI        


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# ONE CUT ENZYMES (   45 enzymes) #
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AcsI          262  GAATTT               [GA]^AATT[CT]
AluI          287  AGCT                 AG^CT
ApoI          262  GAATTT               [GA]^AATT[CT]
AseI          301  ATTAAT               AT^TAAT
AsnI          301  ATTAAT               AT^TAAT
BbrPI          87  CACGTG               CAC^GTG
BbvI           49  GCTGC                GCAGC(8/12)
BclI          110  TGATCA               T^GATCA
BpmI          269  CTGGAG               CTGGAG(16/14)
BsaAI          87  CACGTG               [CT]AC^GT[GA]
BsaJI          41  CCTTGG               C^C[ACGT][ACGT]GG
BsmFI         246  GGGAC                GGGAC(10/14)
BspMI          52  GCAGGT               ACCTGC(4/8)
BsrI          231  CCAGT                ACTGG(1/-1)
Cac8I         218  GCATGC               GC[ACGT]^[ACGT]GC
Cfr13I         97  GGGCC                G^G[ACGT]CC
DdeI           81  CTCAG                C^T[ACGT]AG
DraIII         87  CACGTGGTG            CAC[ACGT][ACGT][ACGT]^GTG
EcoT14I        41  CCTTGG               C^C[AT][AT]GG
EcoT22I       216  ATGCAT               ATGCA^T
FbaI          110  TGATCA               T^GATCA
Fnu4HI         49  GCTGC                GC^[ACGT]GC
HaeIII         98  GGCC                 GG^CC
HgaI           46  GACGC                GACGC(5/10)
HincII         73  GTTGAC               GT[CT]^[GA]AC
HindII         73  GTTGAC               GT[CT]^[GA]AC
HindIII       286  AAGCTT               A^AGCTT
ItaI           49  GCTGC                GC^[ACGT]GC
MnlI          132  CCTC                 CCTC(7/6)
MwoI           40  GCCTTGGACGC          GC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GC
NlaIII        219  CATG                 CATG^
NlaIV         271  GGAGCC               GG[ACGT]^[ACGT]CC
NsiI          216  ATGCAT               ATGCA^T
NspI          218  GCATGC               [GA]CATG^[CT]
PmaCI          87  CACGTG               CAC^GTG
PmlI           87  CACGTG               CAC^GTG
PshBI         301  ATTAAT               AT^TAAT
PstI           50  CTGCAG               CTGCA^G
Sau96I         97  GGGCC                G^G[ACGT]CC
SfcI           50  CTGCAG               C^T[GA][CT]AG
SphI          218  GCATGC               GCATG^C
StyI           41  CCTTGG               C^C[AT][AT]GG
TaqI           14  TCGA                 T^CGA
TseI           49  GCTGC                G^C[AT]GC
TthHB8I        14  TCGA                 T^CGA


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# TWO CUT ENZYMES (   10 enzymes) #
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BstF5I        177  GGATG                GGATG(2/0)
              189  GGATG               
DpnII          12  GATC                 ^GATC
              111  GATC                
FokI          177  GGATG                GGATG(9/13)
              189  GGATG               
MaeII          88  ACGT                 A^CGT
              152  ACGT                
MboI           12  GATC                 ^GATC
              111  GATC                
MseI          239  TTAA                 T^TAA
              302  TTAA                
NdeII          12  GATC                 ^GATC
              111  GATC                
Sau3AI         12  GATC                 ^GATC
              111  GATC                
Tru9I         239  TTAA                 T^TAA
              302  TTAA                
Tsp509I       263  AATT                 ^AATT
              308  AATT                


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# 3 OR MORE CUT ENZYMES (    1 enzymes) #
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HphI