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# NO CUT ENZYMES ( 183 enzymes) #
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AatII Acc65I AccI AccII AccIII
AclI AcyI AflII AgeI AhdI
Alw44I AlwI AlwNI AocI Aor51HI
ApaLI AscI AseI AsnI Asp700I
Asp718I AspEI AspHI AspI AviII
AvrII BalI BamHI BanI BbeI
BbrPI BbsI BbvCI BbvI BcgI
BclI BcnI BfaI BfrI BglI
BglII BlnI BlpI Bpu1102I BpuAI
BsaAI BsaBI BsaHI BsaI BsaWI
BseAI BseRI BsgI BsiEI BsiHKAI
BsiWI BsmBI BsmI Bsp1407I BspDI
BspEI BspHI BsrBI BsrFI BsrGI
BssHII BssSI Bst1107I BstBI BstUI
BstXI BstYI BstZ17I Bsu36I Cac8I
CelII CfoI Cfr10I ClaI CpoI
DpnII DraIII DrdI EaeI EagI
Eam1105I EarI EclXI Eco47III Eco52I
Eco81I EcoNI EcoT22I FauI FbaI
Fnu4HI FseI FspI HaeII HapII
HgaI HhaI Hin1I HinP1I HincII
HindII HpaI HpaII ItaI KasI
KpnI Ksp632I KspI MaeI MamI
MboI MfeI MflI MluI MluNI
MroI MscI MspI MunI MvnI
NaeI NarI NciI NdeI NdeII
NgoMIV NheI NotI NruI NsiI
NspV PacI PaeR7I PflFI PflMI
PinAI PmaCI PmeI PmlI PpuMI
PshBI Psp1406I PstI PvuI RcaI
RsrII SacI SacII SalI SapI
Sau3AI SbfI ScaI SexAI SfaNI
SfiI SfoI SfuI SgrAI SmaI
SnaBI SpeI SphI Sse8387I SspBI
SspI StuI SwaI TseI Tth111I
Van91I XbaI XcmI XhoI XhoII
XmaCI XmaI XmnI
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# ONE CUT ENZYMES ( 32 enzymes) #
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AciI 448 CCGC CCGC(-3/-1)
ApaI 625 GGGCCC GGGCC^C
AvaI 806 CCCGAG C^[CT]CG[GA]G
BsmFI 650 GGGAC GGGAC(10/14)
BsoBI 806 CCCGAG C^[CT]CG[GA]G
BspMI 419 GCAGGT ACCTGC(4/8)
BsrDI 935 CATTGC GCAATG(2/0)
BstAPI 206 GCATAACATGC GCA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT]TGC
BstEII 230 GGTCACC G^GT[ACGT]ACC
BstPI 230 GGTCACC G^GT[ACGT]ACC
DdeI 250 CTCAG C^T[ACGT]AG
DraI 570 TTTAAA TTT^AAA
DraII 625 GGGCCCC [GA]G^G[ACGT]CC[CT]
DsaI 87 CCATGG C^C[GA][CT]GG
EcoO109I 625 GGGCCCC [GA]G^G[ACGT]CC[CT]
EcoO65I 230 GGTCACC G^GT[ACGT]ACC
EcoRI 92 GAATTC G^AATTC
EcoT14I 87 CCATGG C^C[AT][AT]GG
HaeIII 626 GGCC GG^CC
HindIII 859 AAGCTT A^AGCTT
MspA1I 884 CAGCTG C[AC]G^C[GT]G
MwoI 206 GCATAACATGC GC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GC
NcoI 87 CCATGG C^CATGG
PleI 201 GACTC GAGTC(4/5)
PshAI 761 GACAATGGTC GAC[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GTC
PvuII 884 CAGCTG CAG^CTG
SfcI 137 CTACAG C^T[GA][CT]AG
SmlI 727 CTTGAG C^T[CT][GA]AG
StyI 87 CCATGG C^C[AT][AT]GG
TaqI 478 TCGA T^CGA
Tsp45I 231 GTCAC ^GT[GC]AC
TthHB8I 478 TCGA T^CGA
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# TWO CUT ENZYMES ( 25 enzymes) #
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AcsI 92 GAATTC [GA]^AATT[CT]
889 GAATTT
AflIII 748 ACATGT A^C[GA][CT]GT
946 ACATGT
ApoI 92 GAATTC [GA]^AATT[CT]
889 GAATTT
AvaII 401 GGTCC G^G[AT]CC
422 GGTCC
BanII 531 GAGCCC G[GA]GC[CT]^C
625 GGGCCC
BciVI 349 GGATAC GTATCC(6/5)
969 GTATCC
BmyI 531 GAGCCC G[AGT]GC[ACT]^C
625 GGGCCC
BpmI 683 CTCCAG CTGGAG(16/14)
964 CTGGAG
BsaJI 87 CCATGG C^C[ACGT][ACGT]GG
128 CCCAGG
BsiYI 41 CCTCTGTTGGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
413 CCAAATGCAGG
BslI 41 CCTCTGTTGGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
413 CCAAATGCAGG
Bsp1286I 531 GAGCCC G[AGT]GC[ACT]^C
625 GGGCCC
BspLU11I 748 ACATGT A^CATGT
946 ACATGT
BsrI 581 ACTGG ACTGG(1/-1)
963 ACTGG
BssKI 9 CCTGG ^CC[ACGT]GG
129 CCAGG
BstNI 9 CCTGG CC^[AT]GG
129 CCAGG
EcoRII 9 CCTGG ^CC[AT]GG
129 CCAGG
EcoRV 36 GATATC GAT^ATC
908 GATATC
MaeII 516 ACGT A^CGT
924 ACGT
MaeIII 231 GTCAC ^GT[ACGT]AC
734 GTAAC
MseI 571 TTAA T^TAA
838 TTAA
MvaI 9 CCTGG CC^[AT]GG
129 CCAGG
ScrFI 9 CCTGG CC^[ACGT]GG
129 CCAGG
Tru9I 571 TTAA T^TAA
838 TTAA
TspRI 15 CAGTG CA[GC]TG[ACGT][ACGT]^
426 CACTG
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# 3 OR MORE CUT ENZYMES ( 18 enzymes) #
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AfaI AluI BsmAI BstF5I Cfr13I
FokI HinfI HphI MboII MnlI
MslI NlaIII NlaIV NspI RsaI
Sau96I TfiI Tsp509I