Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0529
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0529, 952 aa
1>>>pF1KSDA0529 952 - 952 aa - 952 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2422+/-0.00111; mu= 16.9012+/- 0.067
mean_var=90.3516+/-17.940, 0's: 0 Z-trim(105.0): 105 B-trim: 44 in 1/46
Lambda= 0.134929
statistics sampled from 8067 (8176) to 8067 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 4.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 6535 1283.1 0
CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 4983 981.0 0
CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 963) 1642 330.6 8.8e-90
CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 916) 1639 330.0 1.3e-89
CCDS58250.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 235) 1554 313.2 3.9e-85
CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 1461 295.4 3.6e-79
CCDS58832.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 313) 1135 231.7 1.8e-60
CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604) 1124 229.9 3.1e-59
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 1108 226.8 2.4e-58
CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318) 881 182.6 4.5e-45
CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372) 881 182.6 4.7e-45
CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1384) 881 182.6 4.7e-45
CCDS56254.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1419) 881 182.6 4.8e-45
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 664 140.3 1.9e-32
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 664 140.3 2e-32
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 560 119.9 1.5e-26
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 551 118.0 3.3e-26
CCDS10607.1 USP31 gene_id:57478|Hs108|chr16 (1352) 559 119.9 3.4e-26
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 544 116.7 9.2e-26
CCDS58516.1 USP43 gene_id:124739|Hs108|chr17 (1118) 547 117.5 1.5e-25
CCDS45610.1 USP43 gene_id:124739|Hs108|chr17 (1123) 547 117.5 1.5e-25
CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 479 104.1 6.9e-22
CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 479 104.1 7.4e-22
CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 565) 395 87.8 6.7e-17
CCDS680.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 828) 368 82.6 3.5e-15
CCDS679.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 911) 368 82.6 3.8e-15
CCDS678.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 942) 368 82.6 3.9e-15
CCDS43892.1 USP20 gene_id:10868|Hs108|chr9 ( 914) 351 79.3 3.8e-14
>>CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (952 aa)
initn: 6535 init1: 6535 opt: 6535 Z-score: 6873.0 bits: 1283.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6535; 100.0% identity (100.0% similar) in 952 aa overlap (1-952:1-952)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKETRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKETRLW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKNSNYCLPSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 NKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKNSNYCLPSYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 NPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 DGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD CLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRNNTEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 CLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRNNTEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDND
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KSD YQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
910 920 930 940 950
>>CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (981 aa)
initn: 6521 init1: 4983 opt: 4983 Z-score: 5240.1 bits: 981.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6467; 97.0% identity (97.0% similar) in 981 aa overlap (1-952:1-981)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKETRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKETRLW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KSD NKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTP-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPGASNFSTLPK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KSD ----------------NVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ISPSSLSNNYNNMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD NSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPR
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD AFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAE
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD VRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENL
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD SSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPVCLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPVCLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRN
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KSD NTEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NTEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDE
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KSD PDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLG
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KSD NTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKP
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KSD PKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSY
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KSD SRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKD
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KSD DGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLE
910 920 930 940 950 960
940 950
pF1KSD SDEDSNDNDNDIENENCMHTN
:::::::::::::::::::::
CCDS58 SDEDSNDNDNDIENENCMHTN
970 980
>>CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (963 aa)
initn: 3610 init1: 1550 opt: 1642 Z-score: 1725.3 bits: 330.6 E(32554): 8.8e-90
Smith-Waterman score: 3644; 58.1% identity (77.1% similar) in 977 aa overlap (8-940:12-956)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMG
: .::.:... :..:.:..: :::.:::::::::::::::::: :..:
CCDS27 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DQNVYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARK
..:..:::::::::..: ..:.:::::::::::.:.:::.::::..:: .:::.::.::
CCDS27 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKE
:::.:.::::::::::: :::::::.. .::.. .::::::: :::::.::.:.:: :.:
CCDS27 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KSD TRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPR---------GPS--
:::::::::::.: :.: :.:.:::::::::::::: .:::::::: .::
CCDS27 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKSSTAPSRN
190 200 210 220 230 240
230 240 250
pF1KSD ---TPNVKNSNYCLPSYTAYKN------------------------YDYSEPGRNNEQPG
.:. . : : : . : :. .:: .. :::
CCDS27 FTTSPKSSASPYSSVSASLIANGDSTSTCGMHSSGVSRGGSGFSASYNCQEPPSSHIQPG
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KSD LCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIK
::::.:::::::::::.:::::: :::.:::.:.:. :.: ::::::.::::..::::::
CCDS27 LCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIK
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KSD QMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQL
:::::. ..:.:: ::::::::::::::::::: :::::::::::::::::..::::..:
CCDS27 QMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLEL
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KSD KDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLP
:::.:::: :::.:::::: ::::.::: ::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS27 KDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLP
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KSD LPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYN
::.::.:..::.:: :: .: ::.:.:: .: . ::: ::: :::: :..:.:.:.::
CCDS27 LPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYN
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KSD HRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPVCLREKFRHSSYTHHTGSS
::::.:: :::.:. :: ::::.:.:. . .. .: : .:: .::. . : : ..:.
CCDS27 HRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECVTLPVYFRERKSRPSSTS-SASA
550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLH--CCKDQNINGNGP
:.:::.:..::... : ..::. . :. :::: : . :. : : . :.
CCDS27 LYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGAC---NGSRNSC
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620 630 640 650 660 670
pF1KSD NGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKGQL
.: :: ::: .: . .: ::.:.: .:: :.: ::. :. :::
CCDS27 EGEDEE----EMEHQE------EGKEQLSETEGS-GEDEPGND-PSET---TQKKIKGQP
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680 690 700 710 720 730
pF1KSD TGHKKRLFTFQF-NNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFD
::::::.. :. :..::: . : . :.:. :: ::.::: . .. :.:
CCDS27 C--PKRLFTFSLVNSYGTADINSLAAD-------GKLLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYD
710 720 730 740 750
740 750 760 770 780 790
pF1KSD ENAAEDFEKHESV-EYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKL
:. .: .::: :. . . :: : :.:::::::: : :: .:::::::::.:::::::.
CCDS27 EQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKF
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800 810 820 830 840 850
pF1KSD DLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSN
:::::: .::::::::::.:: ::::::.:.::: :.::::. : .: : :.::::::
CCDS27 DLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSN
820 830 840 850 860 870
860 870 880 890 900 910
pF1KSD HYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFF
:::.:: :::::.:::: .:::::::::.:: :::::::.::::::::::.: :.
CCDS27 HYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDD----EFY
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pF1KSD PLDRETKGASAATGI-PLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
....:. : : :.. .:..
CCDS27 KTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
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:::::. : .::.:... :..:.:..: :::.:::::::::::::::::: :..:
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..:..:::::::::..: ..:.:::::::::::.:.:::.::::..:: .:::.::.::
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:::.:.::::::::::: :::::::.. .::.. .::::::: :::::.::.:.:: :.:
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:::::::::::.: :.: :.:.:::::::::::::: .:::::::: .: . ..:..
CCDS27 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPR--QTLQSNGSGFS-
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pF1KSD PSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEE
.:. .:: .. :::::::.:::::::::::.:::::: :::.:::.:.:. :
CCDS27 ------ASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAE
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pF1KSD LNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELL
.: ::::::.::::..:::::::::::. ..:.:: ::::::::::::::::::: ::::
CCDS27 INRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELL
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD AFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKST
:::::::::::::..::::..::::.:::: :::.:::::: ::::.::: ::::::::
CCDS27 AFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKST
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pF1KSD LVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDL
::::::::.:::::::::::::::.::.:..::.:: :: .: ::.:.:: .: . ::
CCDS27 LVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDL
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pF1KSD CTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHV
: ::: :::: :..:.:.:.::::::.:: :::.:. :: ::::.:.:. . .. .: :
CCDS27 CEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECV
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pF1KSD IIPVCLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTET
.:: .::. . : : ..:.:.:::.:..::... : ..::. . :. ::::
CCDS27 TLPVYFRERKSRPSSTS-SASALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQPLPD
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pF1KSD EETEGSLH--CCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSED
: . :. : : . :. .: :: ::: .: . .: ::.:.: .::
CCDS27 EFGSSPLEPGAC---NGSRNSCEGEDEE----EMEHQE------EGKEQLSETEGS-GED
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pF1KSD SVGGDNDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQF-NNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQL
:.: ::. :. ::: ::::::.. :. :..::: . : . :
CCDS27 EPGND-PSET---TQKKIKGQ--PCPKRLFTFSLVNSYGTADINSLAAD-------GKLL
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pF1KSD RLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESV-EYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEK
.:. :: ::.::: . .. :.::. .: .::: :. . . :: : :.:::::::: :
CCDS27 KLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMET
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pF1KSD LGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLD
:: .:::::::::.:::::::.:::::: .::::::::::.:: ::::::.:.::: :.
CCDS27 LGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLN
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pF1KSD MSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQI
::::. : .: : :.:::::::::.:: :::::.:::: .:::::::::.:: ::::::
CCDS27 MSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQI
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pF1KSD VSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGI-PLESDEDSNDNDNDIENENCMH
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CCDS27 VTKAAYVLFYQRRDD----EFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
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pF1KSD TN
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CCDS58 MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNV
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CCDS58 YPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKETRLW
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pF1KSD NKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKNSNYCLPSYT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. . :
CCDS58 NKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKKPLEQSC
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pF1KSD MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY
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CCDS14 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV--------
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: :::. ..:: :.:. :..: ::: :.. ::.:::. .:. ::::: : .::
CCDS14 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP
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pF1KSD PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
:: :::.: . : :::: .:: : ....... : .::..:.: . . :. : .
CCDS14 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV
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pF1KSD PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKN
...:::: : .... : :. ::.: ::....: ...::::: . .: :
CCDS14 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPS--AQLHVMN
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240 250 260 270 280 290
pF1KSD SNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLND
.:. . .. :.. : :::.:::.:::::::::::.:::::.: :::::::.
CCDS14 NNM------SEEDEDFK--G----QPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNN
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300 310 320 330 340 350
pF1KSD KYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQD
: ::::: :::::.::::..::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: ::::.:
CCDS14 CYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHD
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pF1KSD CQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHG
::::.::::::::::::..:: :..: :: ::::. ::.:::.:: .::::.::: :::
CCDS14 SQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHG
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pF1KSD LFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIG
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CCDS14 LFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKG
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pF1KSD NILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INR
.: :::.::: .:: ..:.:.:...:::.... ..: ::::..::::.:.:.. :.
CCDS14 KISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEA
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pF1KSD TEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMC
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CCDS14 IEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLS
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pF1KSD RYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSEN
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CCDS14 RYVTKPNSDDEDDGD------------------EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP---
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CCDS14 EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE
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pF1KSD RHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDC
: . ..:.::.:..::::.:: :: . ::. : : : : :.:..:
CCDS14 VHAQ-----------PYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAP-VRLQEC
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CCDS14 IELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTL
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pF1KSD VDFPINDLDMSEFLINPN--AGPC--RYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYF
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CCDS14 VEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYF
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pF1KSD DDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSND
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CCDS14 DDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDV-ARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
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pF1KSD NDNDIENENCMHTN
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CCDS58 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK
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CCDS58 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKV---SFFL
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: . . .. :: .:
CCDS58 PRLECNGAILAHCNFCLPGSSNSPASASRVAPSHLANFFFFEMESHSVTKLECGGAVSAY
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pF1KSD DSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNVYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLP
:. ..: .: . .:: :: ..:
CCDS32 CLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVP
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: : :: . .:. .. . : .: .. . ... ::.
CCDS32 EPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMG
570 580 590 600 610 620
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:: . .: ::. .:: :.. . . . : .: . ::: : . :.
CCDS32 NVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIKEE-DMRLWLYNSENYLTLLDD
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pF1KSD PDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRN
: .. . . : :::: .:.: .::. : . ::. : .. :
CCDS32 EDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSF--IANSS---------KIDRHKVP---
690 700 710 720
260 270 280 290 300 310
pF1KSD NEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSY
. : :::::::::::::.:::.::: :::.::.. .. ::: ::.::.:..:: :
CCDS32 -TEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCY
730 740 750 760 770 780
320 330 340 350 360 370
pF1KSD AELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKK
..:....::: . :.: .. ....::.:.:.:::: :::::::::::::::::...:
CCDS32 GDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEK
790 800 810 820 830 840
380 390 400 410 420 430
pF1KSD PYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFC
::..:::.::::: :: :::.:::.:: ::.::.::: ..: . : :..::: ::::
CCDS32 PYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFN
850 860 870 880 890 900
440 450 460 470 480 490
pF1KSD YLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIV
.:.::::: . ::. ....: : :..: . . . : :: : :. ......
CCDS32 FLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDG-TTPVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQILL
910 920 930 940 950 960
500 510 520 530 540 550
pF1KSD TDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPVCLREKFRHSSYTH
..... . . : .:.. . . .::: . . :. . . .
CCDS32 AEVHGSNI-KNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVP--------VSPISASSPTQTDFSSS
970 980 990 1000 1010
560 570 580 590 600 610
pF1KSD HTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNING
. . .: .:: . . : .. : : :. ..: . :. ..:
CCDS32 PSTNEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVV--PCGTEKNFTNGM-VNGHMPSLPDSPFTG
1020 1030 1040 1050 1060 1070
620 630 640 650
pF1KSD NGPNGIHEEGSPSEME--TDEPDDESSQDQEL--PSENENSQSE--DSV-------GGDN
..:.. .:. ... . : . : : .. ... :.: ..
CCDS32 Y-IIAVHRKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPL
1080 1090 1100 1110 1120 1130
660 670 680 690 700 710
pF1KSD DSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLGNTDI--NYIKDDTRHIRFDDRQLR-LDE
... . : .. :.. . .. ::. . . : ..: . : .
CCDS32 PPQEASNHAQDCDDSM-GYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWYRF-CRGCKIDCGEDRAFIG
1140 1150 1160 1170 1180 1190
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEY--KPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGA
...:.:::: . .. . . ..::::: . .: ..: .:.. ::..:.::
CCDS32 NAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEP-INLDSCLRAFTSEEELGE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
780 790 800 810 820 830
pF1KSD EDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSE
.. .:: .:: : :::::::: :::.:..:::::.. : . .: :: ...: :
CCDS32 NEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESFDPSA
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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pF1KSD FLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSK
::. . . :..
CCDS32 FLVPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSLSANII
1320 1330 1340 1350 1360 1370
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pF1KSD RLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGT-WPRGPSTPNVKNSNYCL
: .: :... .: : .. .:.:...
CCDS11 LEWKSMPRLPTDLDIGGPWFPHYDFEWSCWVRAISQEDQLATCW-QAEHCGEVHNKDMSW
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pF1KSD P---SYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKY
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CCDS11 PEEMSFTA--NSSKIDRQKVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRH
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pF1KSD QEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQ
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CCDS11 LYELNRTNPIGMKGHMAKCYGDLVQELWSGTQKSVAPLKLRRTIAKYAPKFDGFQQQDSQ
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD ELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLF
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CCDS11 ELLAFLLDGLHEDLNRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIIVDLFHGQL
630 640 650 660 670 680
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNI
.: . : :..::: :::: .:.::::: . ::. ....: : :..: . . .
CCDS11 RSQVKCKTCGHISVRFDPFNFLSLPLPMDSYMDLEITVIKLDGTT-PVRYGLRLNMDEKY
690 700 710 720 730 740
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pF1KSD LDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDT
: : : :. ........... . . : .:.. .. . .::: . . .
CCDS11 TGLKKQLRDLCGLNSEQILLAEVHDSNI-KNFPQDNQKVQLSVSGFLCAFEIPVPSSPIS
750 760 770 780 790 800
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EHVIIPVCLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRNNTEDKLYNLLLLRMCRYVKIST
:. . . :. : .. : . .: . . : .. : : :
CCDS11 ASS--PTQIDFSSSPSTNGMFTLTTNGDLPKPIFIP-----NGMPNTVV--PCGTEKNFT
810 820 830 840 850
600 610 620 630 640
pF1KSD ETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELP------SENE
. ..: . :. ..: ..:.. .:. :... . .: ...
CCDS11 NGM-VNGHMPSLPDSPFTGY-IIAVHRKMMRTELYFLSPQENRPSLFGMPLIVPCTVHTR
860 870 880 890 900 910
650 660 670 680 690
pF1KSD NSQSEDSVGGDND--------SENGLCTED--TCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLGNTDINY
... :.: . . .: .. ..: .: : :. . :. .
CCDS11 KKDLYDAVWIQVSWLARPLPPQEASIHAQDRDNCMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPQYR
920 930 940 950 960 970
700 710 720 730 740 750
pF1KSD IKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEY--KPPKKP
. . .:: . . ...:.:: : . .. . . .:::::: . .:
CCDS11 FCRGCKIDCGEDRAFIGN--AYIAVDWHPTALHLRYQTSQERVVDKHESVEQSRRAQAEP
980 990 1000 1010 1020 1030
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pF1KSD FVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYM
..: .:.. ::..:.:: . .:: .:: : :::::::: ::: :..:::::.. .
CCDS11 -INLDSCLRAFTSEEELGESEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPFLIIHLKRFQFVNDQ
1040 1050 1060 1070 1080
820 830 840 850 860 870
pF1KSD RDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKW
: . .: : ...: : ::. . . :..
CCDS11 WIKSQKIVRFLRESFDPSAFLVPRDPALCQHKPLTPQGDELSKPRILAREVKKVDAQSSA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KSD YYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDED
CCDS11 GKEDMLLSKSPSSLSANISSSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRLRL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KSD PNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTE
::. :: ::::::::::.:: :::: : .
CCDS43 PTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGLVNLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRD
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD YFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSG
.: . ... :.:..:::: :..: ..: :.. .:.: : .:. :. : ::.:
CCDS43 FFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGFAVLLRALWKGTHHAFQPSKLKAIVASKASQFTG
530 540 550 560 570 580
350 360 370 380 390 400
pF1KSD YQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIV
: :.: ::..::::::::::::::..::: . :.:::::.:::::::. : ::::.::
CCDS43 YAQHDAQEFMAFLLDGLHEDLNRIQNKPYTETVDSDGRPDEVVAEEAWQRHKMRNDSFIV
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410 420 430 440 450 460
pF1KSD DIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVV
:.:.: .:: :::: :::.:.::::: :: .::: .:...: :. .: .::... :
CCDS43 DLFQGQYKSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLP-QKQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVS
650 660 670 680 690 700
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VPKIGNIL-DLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEI
: : .. .. .:: . ... .... ..::::.: ...:... : . ::.
CCDS43 VSKENSTASEVLDSLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRFHRVFLPSHSLDTVSPSDTLLCFEL
710 720 730 740 750 760
530 540 550
pF1KSD NINRTEDTEHVII------------PV-----CLR------EKFRHSSY-----------
.. :.:.. :. : : ::... .
CCDS43 -LSSELAKERVVVLEVQQRPQVPSVPISKCAACQRKQQSEDEKLKRCTRCYRVGYCNQLC
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pF1KSD --TH---HTG---SSLFGQPFLMAVPRNNTEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLH
:: : : .: :::..:: . :: . :: . : .
CCDS43 QKTHWPDHKGLCRPENIGYPFLVSVPASRLTYARLAQLLEGYARYSVSVFQPPFQPGRMA
830 840 850 860 870 880
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pF1KSD C------CKDQNINGNGPNGIHEEG--SPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSV
: .:. : :. .: :.. : :. : :: . . :
CCDS43 LESQSPGCTTLLSTGSLEAGDSERDPIQPPELQLVTPMAEG--DTGLP---RVWAAPDR-
890 900 910 920 930
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pF1KSD GGDNDSENGLCTEDTCKGQL------TGHK-KR----LFTFQFNNLGNTD------INYI
: : .:. .: .: . .:.. .: . .: . . . : :
CCDS43 -GPVPSTSGISSEMLASGPIEVGSLPAGERVSRPEAAVPGYQHPSEAMNAHTPQFFIYKI
940 950 960 970 980 990
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pF1KSD KDDTRHIRFDDR---QLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHES--VEYKPPK
...:. :..:. :.: . ::: : . . . : :....: :. . .
CCDS43 DSSNREQRLEDKGDTPLELGDDCSLALVWRNNERLQEFVLVASKELECAEDPGSAGEAAR
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pF1KSD KPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSR
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CCDS43 AGHFTLDQCLNLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWRLPNVLIVQLKRFSFRS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KSD YM-RDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPC-RYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAK---
.. :::.. ::.::. .::.:.: :. . :.: :: :::::: :::::: :.
CCDS43 FIWRDKINDLVEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLPSYDLYAVINHYGGMIGGHYTACARLPN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KSD ----NKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASA
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CCDS43 DRSSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRRRNSPVERPPRAGHSEHHPDLG
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KSD ATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
CCDS43 PAAEAAASQASRIWQELEAEEEPVPEGSGPLGPWGPQDWVGPLPRGPTTPDEGCLRYFVL
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952 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:57:59 2016 done: Thu Nov 3 01:58:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]