Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9689
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9689, 490 aa
1>>>pF1KE9689 490 - 490 aa - 490 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8731+/-0.000883; mu= 12.5996+/- 0.053
mean_var=133.4589+/-26.437, 0's: 0 Z-trim(111.2): 54 B-trim: 163 in 1/53
Lambda= 0.111020
statistics sampled from 12104 (12157) to 12104 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 3283 537.1 1.6e-152
CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 2145 354.9 1.2e-97
CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 898 155.1 1.5e-37
CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 873 151.1 2.3e-36
CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 311) 866 149.8 3.9e-36
CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 845 146.6 5.2e-35
CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 782 136.7 7.9e-32
CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 726 127.6 3.5e-29
CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 726 127.6 3.7e-29
CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 643 114.4 4.5e-25
CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 631 112.3 9.3e-25
CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 593 106.4 1e-22
CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 593 106.4 1.1e-22
CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 593 106.4 1.1e-22
CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 593 106.5 1.2e-22
CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 587 105.5 2.5e-22
CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 556 100.3 4.1e-21
CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 556 100.3 4.2e-21
CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 552 99.6 6.1e-21
CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 552 99.7 7e-21
CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 550 99.3 8.2e-21
CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 543 98.2 1.9e-20
CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 546 98.9 2.1e-20
CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 539 97.9 5.4e-20
CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 539 98.0 7.1e-20
CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 517 94.1 3.4e-19
CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 523 95.4 4.4e-19
CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 505 92.3 1.8e-18
CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 505 92.3 1.9e-18
CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 505 92.3 2e-18
CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 499 91.1 2.3e-18
CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 499 91.2 2.4e-18
CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 484 89.0 2.1e-17
CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 478 88.2 5.6e-17
CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 478 88.2 5.8e-17
CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 437 81.4 3.8e-15
CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 344 66.5 9.7e-11
>>CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 (490 aa)
initn: 3283 init1: 3283 opt: 3283 Z-score: 2851.7 bits: 537.1 E(32554): 1.6e-152
Smith-Waterman score: 3283; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIKGKWQQVRQELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIKGKWQQVRQELL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 EEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 RPLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RPLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 FDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 WKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 PTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 PWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 TNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKY
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE9 EKWMVEFGSA
::::::::::
CCDS31 EKWMVEFGSA
490
>>CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 (491 aa)
initn: 2117 init1: 1781 opt: 2145 Z-score: 1866.7 bits: 354.9 E(32554): 1.2e-97
Smith-Waterman score: 2145; 67.9% identity (85.1% similar) in 495 aa overlap (1-489:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIKGKWQQVRQELL
:.: : .:.: .:::::::::::.:::::::..:.... ::.: .. ::::: ::.
CCDS52 MSLLMISENVKLAREYALLGNYDSAMVYYQGVLDQMNKYLYSVKDTYLQQKWQQVWQEIN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 EEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREV
: ..::.:..::::::.:. : . .. .: : . :: :::.:.: : : ..
CCDS52 VEAKHVKDIMKTLESFKLDSTP-LKAAQHDLPASEGEVWSMPVPVERRPSPG---PRKRQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE9 RPLRKEMAGVGARGPVG-RAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGR--DDKGR--KNMQDGA-S
.. . : : . :.: :.... ..: : : : . ..::: :: . .: .
CCDS52 SSQYSDPKSHGNRPSTTVRVHR-SSAQNVHNDRGKAVRCREKKEQNKGREEKNKSPAAVT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 DGEMPKFDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFF
. : :::..::::::::::::::.:.::...::::::: ::::::.::::::::::.::
CCDS52 EPETNKFDSTGYDKDLVEALERDIISQNPNVRWDDIADLVEAKKLLKEAVVLPMWMPEFF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 KGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFE
:::::::::::::::::::::.::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 KGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTLLAKAVATECKTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 MARFYAPTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMV
:::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::. :::::::::::
CCDS52 MARFYSPATIFIDEIDSICSRRGTSEEHEASRRVKAELLVQMDGVGGTSENDDPSKMVMV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 LAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEKIEG
:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::.:.:::.:: :..: .:::..::
CCDS52 LAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPSAKGREELLRISLRELELADDVDLASIAENMEG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 YSGADITNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSA
::::::::::::::::::::::.::.::::: :::::..::.: :::.::::..:::::
CCDS52 YSGADITNVCRDASLMAMRRRIEGLTPEEIRNLSKEEMHMPTTMEDFEMALKKVSKSVSA
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE9 ADLEKYEKWMVEFGSA
::.:.::::. ::::
CCDS52 ADIERYEKWIFEFGSC
480 490
>>CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 (466 aa)
initn: 820 init1: 573 opt: 898 Z-score: 787.5 bits: 155.1 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 898; 46.5% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (188-489:162-465)
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 ARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAK
..:. .. ::: .::.:.:.:: :. ::
CCDS32 LALNTFDHNPDPSERLLKPLSAFIGMNSEMRELAAVVSRDIYLHNPNIKWNDIIGLDAAK
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 KLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTL
.:..:::: :. .:..: :: ::::.:. ::::::::.::::::::: :::::.:.::.
CCDS32 QLVKEAVVYPIRYPQLFTGILSPWKGLLLYGPPGTGKTLLAKAVATECKTTFFNISASTI
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 TSKYRGESEKLVRLLFEMARFYAPTTIFIDEIDSICSRRGTSD--EHEASRRVKSELLIQ
.::.::.::::::.:::.::..::.:::.::..:. :.:::.. :::.: :.:.:::.:
CCDS32 VSKWRGDSEKLVRVLFELARYHAPSTIFLDELESVMSQRGTASGGEHEGSLRMKTELLVQ
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 MDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINL-
:::.. ...: .:.::::.:.::..: :. ::::::: . ::. ..: .. :
CCDS32 MDGLA---RSED---LVFVLAASNLPWELDCAMLRRLEKRILVDLPSREARQAMIYHWLP
320 330 340 350 360
400 410 420 430 440
pF1KE9 -----REVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADITNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSK
: .:: ... .... :::::.:: :::.:.. .:. ...: .. .. .
CCDS32 PVSKSRALELHTELEYSVLSQETEGYSGSDIKLVCREAAMRPVRKIFDALENHQSESSDL
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490
pF1KE9 EELQMP-VTKGDFELALKKIAKSVSAADL-EKYEKWMVEFGSA
..:. :: .:: .: . :: .: ..: :. :: :
CCDS32 PRIQLDIVTTADFLDVLTHTKP--SAKNLAQRYSDWQREFESV
430 440 450 460
>>CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 (437 aa)
initn: 562 init1: 332 opt: 873 Z-score: 766.3 bits: 151.1 E(32554): 2.3e-36
Smith-Waterman score: 873; 45.6% identity (72.8% similar) in 320 aa overlap (154-460:71-381)
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 RKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDG
::: :... .:.: .... :.:. :.
CCDS45 HAIKYEAHSDKAKESIRAKCVQYLDRAEKLKDY-LRSKEKHGKKPVKENQSEGKGSDSDS
50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AGYD---KDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRP
: . : : : : .: ..:.:.:.:.: :: ::. :.:::.::. .: .: : : :
CCDS45 EGDNPEKKKLQEQLMGAVVMEKPNIRWNDVAGLEGAKEALKEAVILPIKFPHLFTGKRTP
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290
pF1KE9 WKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECG-TTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFY
:.:.:. :::::::..:::::::: . .:::.:::: : ::. :::::::. :::.:: .
CCDS45 WRGILLFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSVSSSDLMSKWLGESEKLVKNLFELARQH
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 APTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATN
:. :::::.::.:. :. .: ::.::.:.:.:.::.:::. :.: . .::.:::
CCDS45 KPSIIFIDEVDSLCGSRNE-NESEAARRIKTEFLVQMQGVGN---NNDGT---LVLGATN
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 FPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELD-PDIQLEDIAEKIEGYSGA
.:: .: :.:::.::::::::: .::......: . . : .....:.: ::::::
CCDS45 IPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEEAARAQMFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGA
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 DITNVCRDASLMAMRRRINGLS-------PEEIR-ALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAK
::. . :: ::: :.... . : . .. ..: : . ::
CCDS45 DISIIVRD-SLMQPVRKVQSATHFKKVCGPSRTNPSMMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMD
340 350 360 370 380 390
480 490
pF1KE9 SVSAADLEKYEKWMVEFGSA
CCDS45 VPGDKLLEPVVCMSDMLRSLATTRPTVNADDLLKVKKFSEDFGQES
400 410 420 430
>>CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1233 init1: 863 opt: 866 Z-score: 762.3 bits: 149.8 E(32554): 3.9e-36
Smith-Waterman score: 1104; 53.4% identity (68.1% similar) in 382 aa overlap (1-382:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIKGKWQQVRQELL
:.: : .:.: .:::::::::::.:::::::..:.... ::.: .. ::::: ::.
CCDS56 MSLLMISENVKLAREYALLGNYDSAMVYYQGVLDQMNKYLYSVKDTYLQQKWQQVWQEIN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 EEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREV
: ..::.:..::::::.:. : . .. .: : . :: :::.:.: : :.
CCDS56 VEAKHVKDIMKTLESFKLDSTP-LKAAQHDLPASEGEVWSMPVPVERRPSPGPRK-----
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 RPLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPK
: . : :....:::. :.. :.. :. .:
CCDS56 ------------RQSSQYSDPKSHGNRPSTT----VRVH------RSSAQNVHND-----
120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 FDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRP
:. ... .: :. :: :
CCDS56 --------------------RGKAVR------CREKKEQN--------------KG--RE
150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 WKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYA
::::::::::::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS56 EKGVLMVGPPGTGKTLLAKAVATECKTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYS
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 PTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNF
:.:::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::. :::::::::::::::::
CCDS56 PATIFIDEIDSICSRRGTSEEHEASRRVKAELLVQMDGVGGTSENDDPSKMVMVLAATNF
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 PWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADI
:::::::::::::::::::::.
CCDS56 PWDIDEALRRRLEKRIYIPLPSGMRP
290 300 310
>>CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 (444 aa)
initn: 610 init1: 331 opt: 845 Z-score: 742.0 bits: 146.6 E(32554): 5.2e-35
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120 130 140 150 160 170
pF1KE9 QIRRPNREVRPLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQD
....:: . . :. . :.:: : .:
CCDS11 KYEAQGDKAKQSIRAKCTEYLDRAEKLKEYLKNKEKKAQKPVKEGQPSPADEKG--NDSD
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GASDGEMPKFDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMP
: .... :. : : . :. :: . :...:.:.: :: ::. :.:::.::. .:
CCDS11 GEGESDDPE------KKKLQNQLQGAIVIERPNVKWSDVAGLEGAKEALKEAVILPIKFP
110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 DFFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECG-TTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVR
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CCDS11 HLFTGKRTPWRGILLFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSISSSDLVSKWLGESEKLVK
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LLFEMARFYAPTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSK
::..:: :. ::::::::.:. : . .: ::.::.:.:.:.::.::: ..::
CCDS11 NLFQLARENKPSIIFIDEIDSLCGSR-SENESEAARRIKTEFLVQMQGVG--VDNDG---
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400
pF1KE9 MVMVLAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELD-PDIQLEDIA
..::.:::.:: .: :.:::.::::::::: ..:: ..:..: .. . . ......
CCDS11 -ILVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEPHARAAMFKLHLGTTQNSLTEADFRELG
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 EKIEGYSGADITNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSK-------EELQMPVTKGDFE
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CCDS11 RKTDGYSGADISIIVRDALMQPVRKVQSATHFKKVRGPSRADPNHLVDDLLTPCSPGDPG
340 350 360 370 380 390
470 480 490
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CCDS11 AIEMTWMDVPGDKLLEPVVSMSDMLRSLSNTKPTVNEHDLLKLKKFTEDFGQEG
400 410 420 430 440
>>CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 (674 aa)
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70 80 90 100 110 120
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.: :. :: : . ..: .
CCDS55 PILNKACSKTEDNGPKEDSSLPTFKTAKEQLWVDQQKKYHQ--PQ-RASGSSYGGVKKSL
280 290 300 310 320
130 140 150 160 170 180
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.. .:: .:. : : ..: :... : . ::. : :
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330 340 350 360 370
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:.: .: . .:....: ..:.::: .: :: ..: :: :: ::.: :.: : ::
CCDS55 KNLEPKMIELIMNEIMDHGPPVNWEDIAGVEFAKATIKEIVVWPMLRPDIFTGLRGPPKG
380 390 400 410 420 430
250 260 270 280 290 300
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.:. ::::::::...: .:.. :.:::..:.:.::::. ::.::.:: :: .:: :..
CCDS55 ILLFGPPGTGKTLIGKCIASQSGATFFSISASSLTSKWVGEGEKMVRALFAVARCQQPAV
440 450 460 470 480 490
310 320 330 340 350 360
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::::::::. :.:: . :::.:::.:.:.:.:.::. . :. ..:..::: : .
CCDS55 IFIDEIDSLLSQRGDG-EHESSRRIKTEFLVQLDGATTSSEDR-----ILVVGATNRPQE
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pF1KE9 IDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINL--REVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADIT
:::: :::: ::.::::: :..: ... ::: .: . ..:.:... ...::::.:
CCDS55 IDEAARRRLVKRLYIPLPEASARKQIV-INLMSKEQCCLSEEEIEQIVQQSDAFSGADMT
560 570 580 590 600
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pF1KE9 NVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKYE
..::.::: .: .:. .: ... .... :.. ::: :.. . ::: ::: ::
CCDS55 QLCREASLGPIR----SLQTADIATITPDQVR-PIAYIDFENAFRTVRPSVSPKDLELYE
610 620 630 640 650 660
490
pF1KE9 KWMVEFGSA
.: ::
CCDS55 NWNKTFGCGK
670
>>CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 (584 aa)
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130 140 150 160 170 180
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.: .: : . . . : : ..
CCDS17 LSGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRN
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 -DKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRPWKGVL
:..:.. . .::. . ....:::: . ::. :.: :.:: :..: :.: : .:.:
CCDS17 VDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLL
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 MVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYAPTTIF
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CCDS17 LFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIF
350 360 370 380 390 400
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 IDEIDSI-CSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNFPWDI
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CCDS17 IDEVDSLLCERR--EGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSA--GDD---RVLVMGATNRPQEL
410 420 430 440 450 460
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 DEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQ--LEDIAEKIEGYSGADITN
:::. ::. ::.:. ::. . : ::: :: . .: : : ..:. .::::.:.:
CCDS17 DEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLK-NLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTA
470 480 490 500 510
430 440 450 460 470 480
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. .::.: .:. :.::... .: :.. . .:: .:::: .::: :: : .
CCDS17 LAKDAALGPIRE----LKPEQVKNMSASEMRN-IRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIR
520 530 540 550 560 570
490
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: .::
CCDS17 WNKDFGDTTV
580
>>CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 (616 aa)
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10 20 30 40
pF1KE9 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIK
:. .... .:. ...... . .
CCDS17 GGEAERVRVFHKQAFEYISIALRIDEDEKAGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVI----VT
110 120 130 140 150 160
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 GKWQQVRQELLEEYEQVKSIVSTLESFKI-DK-PPDFPVS-CQDEPFRDP---AVWPPPV
:. .: .. . ... ..: . . ... .: : .: : : . . : : .
CCDS17 GQGEQCERARRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLEKMQPVLPFSKSQTDVYNDSTNLACRNGHL
170 180 190 200 210 220
110 120 130 140 150
pF1KE9 PAEHRAPPQIRRPNREVR---PLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRA--
.: : :. . : .. : : . .:. : :. . : : .: :. .
CCDS17 QSESGAVPKRKDPLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPA
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 ----RGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDGAGY---DKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIA
.: .: : . . . : : .. :..:.. . .::. . ....::::
CCDS17 PTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIA
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 DLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFN
. ::. :.: :.:: :..: :.: : .:.:. ::::.::::::::::.: ..::::
CCDS17 GQDLAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFN
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.:...::::: ::.::::: :: .:: :. :::::.::. : :: ::.::::.:.
CCDS17 ISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERR--EGEHDASRRLKT
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CCDS17 EFLIEFDGVQSA--GDD---RVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLL
470 480 490 500 510
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CCDS17 K-NLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRE----LKPEQVKNMS
520 530 540 550 560 570
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:.. . .:: .:::: .::: :: : .: .::
CCDS17 ASEMRN-IRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
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>>CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 (806 aa)
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:. : . :.. :.::. ::..:. :.: :
CCDS65 ETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQ
440 450 460 470 480 490
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pF1KE9 LPMWMPD-FFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGE
:. :: :.: : ::::. :::: :::.::::.:.:: ..:..... : . . ::
CCDS65 YPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGE
500 510 520 530 540 550
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:: :: .:. :: :: ..:.::.::: . :: . : :. :: ...: .:::.
CCDS65 SEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGM---
560 570 580 590 600 610
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. .: :....::: : :: :. : ::.. :::::: :.:. .:: :::. .
CCDS65 ----STKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVA
620 630 640 650 660
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CCDS65 KDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDP
670 680 690 700 710 720
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pF1KE9 MPVTKGD-FELALKKIAKSVSAADLEKYEKWMVEFGSA
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CCDS65 VPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGS
730 740 750 760 770 780
>--
initn: 539 init1: 228 opt: 593 Z-score: 520.3 bits: 106.4 E(32554): 1.2e-22
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CCDS65 SPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALF
180 190 200 210 220 230
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:.: .: .:.:. ::::::::..:.:::.: :. :: ... . :: ::::. .: :
CCDS65 KAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAF
240 250 260 270 280 290
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CCDS65 EEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKR-EKTHGEVERRIVSQLLTLMDGL-------KQRAHVI
300 310 320 330 340
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CCDS65 VMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANE
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CCDS65 THGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLED-ETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNP
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CCDS65 SALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPG
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490 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 10:41:14 2016 done: Tue Nov 8 10:41:14 2016
Total Scan time: 2.220 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]