Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9680
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9680, 807 aa
1>>>pF1KE9680 807 - 807 aa - 807 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9257+/-0.00108; mu= 8.6617+/- 0.065
mean_var=135.3393+/-26.516, 0's: 0 Z-trim(106.8): 56 B-trim: 99 in 1/51
Lambda= 0.110246
statistics sampled from 9151 (9179) to 9151 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46422.1 EPC2 gene_id:26122|Hs108|chr2 ( 807) 5285 852.7 0
CCDS60511.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 ( 813) 2761 451.3 3e-126
CCDS73083.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 ( 763) 2481 406.8 7.2e-113
CCDS7172.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 ( 836) 2477 406.1 1.2e-112
>>CCDS46422.1 EPC2 gene_id:26122|Hs108|chr2 (807 aa)
initn: 5285 init1: 5285 opt: 5285 Z-score: 4549.7 bits: 852.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5285; 100.0% identity (100.0% similar) in 807 aa overlap (1-807:1-807)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSKLSFRARALDAAKPLPIYRGKDMPDLNDCVSINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAIS
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CCDS46 MSKLSFRARALDAAKPLPIYRGKDMPDLNDCVSINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AQQVFREKKESMVIPVPEAESNVNYYNRLYKGEFKQPKQFIHIQPFNLDNEQPDYDMDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQQVFREKKESMVIPVPEAESNVNYYNRLYKGEFKQPKQFIHIQPFNLDNEQPDYDMDSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DETLLNRLNRKMEIKPLQFEIMIDRLEKASSNQLVTLQEAKLLLNEDDYLIKAVYDYWVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DETLLNRLNRKMEIKPLQFEIMIDRLEKASSNQLVTLQEAKLLLNEDDYLIKAVYDYWVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 KRKNCRGPSLIPQIKQEKRDGSTNNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KRKNCRGPSLIPQIKQEKRDGSTNNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 FSRAITILEMIKRREKTKRELLHLTLEVVEKRYHLGDYGGEILNEVKISRSEKELYATPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSRAITILEMIKRREKTKRELLHLTLEVVEKRYHLGDYGGEILNEVKISRSEKELYATPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TLHNGNHHKVQECKTKHPHHLSLKEEASDVVRQKKKYPKKPKAEALITSQQPTPETLPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLHNGNHHKVQECKTKHPHHLSLKEEASDVVRQKKKYPKKPKAEALITSQQPTPETLPVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 NKSDIKQYDFHSSDEDEFPQVLSPVSEPEEENDPDGPCAFRRRAGCQYYAPRLDQANHSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NKSDIKQYDFHSSDEDEFPQVLSPVSEPEEENDPDGPCAFRRRAGCQYYAPRLDQANHSC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 ENSELADLDKLRYRHCLTTLTVPRRCIGFARRRIGRGGRVIMDRISTEHDPVLKQIDPEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENSELADLDKLRYRHCLTTLTVPRRCIGFARRRIGRGGRVIMDRISTEHDPVLKQIDPEM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 LNSFSSSSQTIDFSSNFSRTNASSKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLNLQDSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNSFSSSSQTIDFSSNFSRTNASSKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLNLQDSDS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 EECTSRKPGQTVNNKRVSAASVALLNTSKNGISVTGGITEEQFQTHQQQLVQMQRQQLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EECTSRKPGQTVNNKRVSAASVALLNTSKNGISVTGGITEEQFQTHQQQLVQMQRQQLAQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 LQQKQQSQHSSQQTHPKAQGSSTSDCMSKTLDSASAHFAASAVVSAPVPSRSEVAKEQNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LQQKQQSQHSSQQTHPKAQGSSTSDCMSKTLDSASAHFAASAVVSAPVPSRSEVAKEQNT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 GHNNINGVVQPSGTSKTLYSTNMALSSSPGISAVQLVRTVGHTTTNHLIPALCTSSPQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GHNNINGVVQPSGTSKTLYSTNMALSSSPGISAVQLVRTVGHTTTNHLIPALCTSSPQTL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 PMNNSCLTNAVHLNNVSVVSPVNVHINTRTSAPSPTALKLATVAASMDRVPKVTPSSAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PMNNSCLTNAVHLNNVSVVSPVNVHINTRTSAPSPTALKLATVAASMDRVPKVTPSSAIS
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE9 SIARENHEPERLGLNGIAETTVAMEVT
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SIARENHEPERLGLNGIAETTVAMEVT
790 800
>>CCDS60511.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 (813 aa)
initn: 2489 init1: 1551 opt: 2761 Z-score: 2380.1 bits: 451.3 E(32554): 3e-126
Smith-Waterman score: 2761; 55.2% identity (77.6% similar) in 829 aa overlap (1-807:1-813)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSKLSFRARALDAAKPLPIYRGKDMPDLNDCVSINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAIS
:::::::::::::.::::..: .:.:::.. .::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSKLSFRARALDASKPLPVFRCEDLPDLHEYASINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AQQVFREKKESMVIPVPEAESNVNYYNRLYKGEFKQPKQFIHIQPFNLDNEQPDYDMDSE
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CCDS60 AQQVYGEKRDNMVIPVPEAESNIAYYESIYPGEFKMPKQLIHIQPFSLDAEQPDYDLDSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DETLLNRLNRKMEIKPLQFEIMIDRLEKASSNQLVTLQEAKLLLNEDDYLIKAVYDYWVR
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CCDS60 DEVFVNKLKKKMDICPLQFEEMIDRLEKGSGQQPVSLQEAKLLLKEDDELIREVYEYWIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 KRKNCRGPSLIPQIKQEKRDGSTNNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRE
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CCDS60 KRKNCRGPSLIPSVKQEKRDGSSTNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 FSRAITILEMIKRREKTKRELLHLTLEVVEKRYHLGDYGGEILNEVKISRSE-KELYATP
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CCDS60 LSRAVTILEMIKRREKSKRELLHLTLEIMEKRYNLGDYNGEIMSEVMAQRQPMKPTYAIP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AT-LHNGNHHKVQECKTKHPHHLSLKEEASDVVRQKKKYPKKPK---AEALITSQQPTPE
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CCDS60 IIPITNSSQFKHQEAMDVKEFKVN-KQDKADLIRPKRKYEKKPKVLPSSAAATPQQTSPA
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 TLPVINKSDIKQYDFHSSDEDEFPQVLSPVSEPEEENDPDGPCAFRRRAGCQYYAPRLDQ
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CCDS60 ALPVFNAKDLNQYDFPSSDEEPLSQVLSGSSEAEEDNDPDGPFAFRRKAGCQYYAPHLDQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 A-NHSCENSELADLDKLRYRHCLTTLTVPRRCIGFARRRIGRGGRVIMDRISTEHDPVLK
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CCDS60 TGNWPWTSPKDGGLGDVRYRYCLTTLTVPQRCIGFARRRVGRGGRVLLDRAHSDYDSVFH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 QIDPEMLNSFSSSSQTIDFSSNFSRTNASSKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLN
..: :::.: . : .. .: :.::.:.: . .::.:: ::.::: . :.:: .
CCDS60 HLDLEMLSSPQHS--PVNQFANTSETNTSDKSFSK--DLSQILVNIKSCRWRHFRPRTPS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 LQDSDSEECTSRKPGQTVNNKRVSAASVALLNTSKNGISVTGG----ITEEQFQTHQQQL
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CCDS60 LHDSDNDELSCRKLYRSINRTGTAQPGTQTCSTSTQSKSSSGSAHFAFTAEQYQQHQQQL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 VQMQRQQLAQLQQKQQSQHSSQQTHPKAQGSSTSDCMSKTLDSASAHFAASAVVSAPVPS
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CCDS60 ALMQKQQLAQIQQQQANSNSSTNT---SQG-----FVSKTLDSASAQFAASALVTSEQLM
600 610 620 630 640
660 670 680 690
pF1KE9 RSEVAKEQNTGHNNINGVVQPSGTSKTLY---STNMAL-SSSPGISAVQLVR-------T
.. . : ..:::. ::. : :. .: :: .::. .. :.. .
CCDS60 GFKMKDDVVLG-IGVNGVLPASGVYKGLHLSSTTPTALVHTSPSTAGSALLQPSNITQTS
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KE9 VGHTTTNHLIPALCTSSPQTLPMNNSCLTNAVHLNNVSVVSPVNV-HINTRTSAPSPTAL
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CCDS60 SSHSALSHQVTAANSATTQVLIGNNIRLTVPSSVATVNSIAPINARHIPRTLSAVPSSAL
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800
pF1KE9 KLATVAASMDRVPKVTPSSAISSIARENHEPERLGLNGIAETTVAMEVT
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CCDS60 KLA--AAANCQVSKVPSSSSVDSVPRENHESEKPALNNIADNTVAMEVT
770 780 790 800 810
>>CCDS73083.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 (763 aa)
initn: 2209 init1: 1271 opt: 2481 Z-score: 2139.8 bits: 406.8 E(32554): 7.2e-113
Smith-Waterman score: 2481; 53.6% identity (76.3% similar) in 778 aa overlap (52-807:2-763)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 GKDMPDLNDCVSINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAISAQQVFREKKESMVIPVPEAES
:::::::::::::. ::...::::::::::
CCDS73 MEHHLQRAISAQQVYGEKRDNMVIPVPEAES
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 NVNYYNRLYKGEFKQPKQFIHIQPFNLDNEQPDYDMDSEDETLLNRLNRKMEIKPLQFEI
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CCDS73 NIAYYESIYPGEFKMPKQLIHIQPFSLDAEQPDYDLDSEDEVFVNKLKKKMDICPLQFEE
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 MIDRLEKASSNQLVTLQEAKLLLNEDDYLIKAVYDYWVRKRKNCRGPSLIPQIKQEKRDG
:::::::.:..: :.::::::::.::: ::. ::.::..::::::::::::..:::::::
CCDS73 MIDRLEKGSGQQPVSLQEAKLLLKEDDELIREVYEYWIKKRKNCRGPSLIPSVKQEKRDG
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 STNNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRREFSRAITILEMIKRREKTKREL
:..:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.:::::::::::.::::
CCDS73 SSTNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRDLSRAVTILEMIKRREKSKREL
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310
pF1KE9 LHLTLEVVEKRYHLGDYGGEILNEVKISRSE-KELYATPAT-LHNGNHHKVQECKTKHPH
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CCDS73 LHLTLEIMEKRYNLGDYNGEIMSEVMAQRQPMKPTYAIPIIPITNSSQFKHQEAMDVKEF
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 HLSLKEEASDVVRQKKKYPKKPK---AEALITSQQPTPETLPVINKSDIKQYDFHSSDED
... :.. .:..: :.:: :::: . : : :: .: .:::.: .:..:::: ::::.
CCDS73 KVN-KQDKADLIRPKRKYEKKPKVLPSSAAATPQQTSPAALPVFNAKDLNQYDFPSSDEE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE9 EFPQVLSPVSEPEEENDPDGPCAFRRRAGCQYYAPRLDQA-NHSCENSELADLDKLRYRH
. :::: :: ::.:::::: ::::.::::::::.:::. : . . . : .:::.
CCDS73 PLSQVLSGSSEAEEDNDPDGPFAFRRKAGCQYYAPHLDQTGNWPWTSPKDGGLGDVRYRY
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE9 CLTTLTVPRRCIGFARRRIGRGGRVIMDRISTEHDPVLKQIDPEMLNSFSSSSQTIDFSS
::::::::.:::::::::.::::::..:: ...: :....: :::.: . : .. .
CCDS73 CLTTLTVPQRCIGFARRRVGRGGRVLLDRAHSDYDSVFHHLDLEMLSSPQHSP--VNQFA
400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KE9 NFSRTNASSKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLNLQDSDSEECTSRKPGQTVNNK
: :.::.:.: . .::.:: ::.::: . :.:: .:.:::..: . :: ...:
CCDS73 NTSETNTSDKSFSK--DLSQILVNIKSCRWRHFRPRTPSLHDSDNDELSCRKLYRSINRT
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590 600 610
pF1KE9 RVSAASVALLNTSKNGISVTGG----ITEEQFQTHQQQLVQMQRQQLAQLQQKQQSQHSS
.. .. .:: .. : .:. .: ::.: :::::. ::.:::::.::.: ...::
CCDS73 GTAQPGTQTCSTSTQSKSSSGSAHFAFTAEQYQQHQQQLALMQKQQLAQIQQQQANSNSS
510 520 530 540 550 560
620 630 640 650 660 670
pF1KE9 QQTHPKAQGSSTSDCMSKTLDSASAHFAASAVVSAPVPSRSEVAKEQNTGHNNINGVVQP
.: .:: .:::::::::.:::::.:.. .. . : ..:::.
CCDS73 TNT---SQG-----FVSKTLDSASAQFAASALVTSEQLMGFKMKDDVVLG-IGVNGVLPA
570 580 590 600 610
680 690 700 710 720
pF1KE9 SGTSKTLY---STNMAL-SSSPGISAVQLVR-------TVGHTTTNHLIPALCTSSPQTL
::. : :. .: :: .::. .. :.. . .:.. .: . : ... :.:
CCDS73 SGVYKGLHLSSTTPTALVHTSPSTAGSALLQPSNITQTSSSHSALSHQVTAANSATTQVL
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770
pF1KE9 PMNNSCLTNAVHLNNVSVVSPVNV-HINTRTSAPSPTALKLATVAASMDRVPKVTPSSAI
:: :: . .:. ..:.:. :: :: .::::: ::. .: :: ::..
CCDS73 IGNNIRLTVPSSVATVNSIAPINARHIPRTLSAVPSSALKLA--AAANCQVSKVPSSSSV
680 690 700 710 720 730
780 790 800
pF1KE9 SSIARENHEPERLGLNGIAETTVAMEVT
.:. ::::: :. .::.::..:::::::
CCDS73 DSVPRENHESEKPALNNIADNTVAMEVT
740 750 760
>>CCDS7172.1 EPC1 gene_id:80314|Hs108|chr10 (836 aa)
initn: 2479 init1: 1551 opt: 2477 Z-score: 2135.8 bits: 406.1 E(32554): 1.2e-112
Smith-Waterman score: 2742; 54.3% identity (76.4% similar) in 844 aa overlap (1-807:1-836)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSKLSFRARALDAAKPLPIYRGKDMPDLNDCVSINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAIS
:::::::::::::.::::..: .:.:::.. .::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MSKLSFRARALDASKPLPVFRCEDLPDLHEYASINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AQQVFREKKESMVIPVPEAESNVNYYNRLYKGEFKQPKQFIHIQPFNLDNEQPDYDMDSE
::::. ::...:::::::::::. ::. .: ::::.:::.::::::.:: ::::::.:::
CCDS71 AQQVYGEKRDNMVIPVPEAESNIAYYESIYPGEFKMPKQLIHIQPFSLDAEQPDYDLDSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DETLLNRLNRKMEIKPLQFEIMIDRLEKASSNQLVTLQEAKLLLNEDDYLIKAVYDYWVR
::...:.:..::.: ::::: :::::::.:..: :.::::::::.::: ::. ::.::..
CCDS71 DEVFVNKLKKKMDICPLQFEEMIDRLEKGSGQQPVSLQEAKLLLKEDDELIREVYEYWIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 KRKNCRGPSLIPQIKQEKRDGSTNNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRE
::::::::::::..::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS71 KRKNCRGPSLIPSVKQEKRDGSSTNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE9 FSRAITILEMIKRREKTKRELLHLTLEVVEKRYHLGDYGGEILNEVKISRSE-KELYATP
.:::.:::::::::::.::::::::::..::::.::::.:::..:: .:. : :: :
CCDS71 LSRAVTILEMIKRREKSKRELLHLTLEIMEKRYNLGDYNGEIMSEVMAQRQPMKPTYAIP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 AT-LHNGNHHKVQECKTKHPHHLSLKEEASDVVRQKKKYPKKPK---AEALITSQQPTPE
. :... : :: . ... :.. .:..: :.:: :::: . : : :: .:
CCDS71 IIPITNSSQFKHQEAMDVKEFKVN-KQDKADLIRPKRKYEKKPKVLPSSAAATPQQTSPA
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 TLPVINKSDIKQYDFHSSDEDEFPQVLSPVSEPEEENDPDGPCAFRRRAGCQYYAPRLDQ
.:::.: .:..:::: ::::. . :::: :: ::.:::::: ::::.::::::::.:::
CCDS71 ALPVFNAKDLNQYDFPSSDEEPLSQVLSGSSEAEEDNDPDGPFAFRRKAGCQYYAPHLDQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 A-NHSCENSELADLDKLRYRHCLTTLTVPRRCIGFARRRIGRGGRVIMDRISTEHDPVLK
. : . . . : .:::.::::::::.:::::::::.::::::..:: ...: :..
CCDS71 TGNWPWTSPKDGGLGDVRYRYCLTTLTVPQRCIGFARRRVGRGGRVLLDRAHSDYDSVFH
420 430 440 450 460 470
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pF1KE9 QIDPEMLNSFSSSSQTIDFSSNFSRTNASSKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLN
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