Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9647
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9647, 1467 aa
1>>>pF1KE9647 1467 - 1467 aa - 1467 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1372+/-0.00102; mu= 6.1704+/- 0.062
mean_var=201.3964+/-40.912, 0's: 0 Z-trim(111.8): 75 B-trim: 120 in 1/50
Lambda= 0.090375
statistics sampled from 12618 (12691) to 12618 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16
Scan time: 4.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33765.2 RAD54L2 gene_id:23132|Hs108|chr3 (1467) 9838 1296.5 0
CCDS14435.1 ATRX gene_id:546|Hs108|chrX (2454) 616 94.2 5.2e-18
CCDS14434.1 ATRX gene_id:546|Hs108|chrX (2492) 616 94.2 5.3e-18
>>CCDS33765.2 RAD54L2 gene_id:23132|Hs108|chr3 (1467 aa)
initn: 9838 init1: 9838 opt: 9838 Z-score: 6938.4 bits: 1296.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9838; 100.0% identity (100.0% similar) in 1467 aa overlap (1-1467:1-1467)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSDESASGSDPDLDPDVELEDAEEEEEEEEVAVEECDRDDEEDLLDDPSLEGMCGTEHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSDESASGSDPDLDPDVELEDAEEEEEEEEVAVEECDRDDEEDLLDDPSLEGMCGTEHAQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LGEDGQQPPRCTSTTSSQSEPSEQLRRHQGKNLASEDPKKKRAQKPSHMRRNIRKLLRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGEDGQQPPRCTSTTSSQSEPSEQLRRHQGKNLASEDPKKKRAQKPSHMRRNIRKLLRED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 QLEPVTKAAQQEELERRKRLEQQRKDYAAPIPTVPLEFLPEEIALRASDGPQLPPRVLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QLEPVTKAAQQEELERRKRLEQQRKDYAAPIPTVPLEFLPEEIALRASDGPQLPPRVLAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 EVICLDSSSGSEDEKSSRDEVIELSSGEEDTLHIVDSSESVSEDDEEEEKGGTHVNDVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EVICLDSSSGSEDEKSSRDEVIELSSGEEDTLHIVDSSESVSEDDEEEEKGGTHVNDVLN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 QRDALGRVLVNLNHPPEEENVFLAPQLARAVKPHQIGGIRFLYDNLVESLERFKTSSGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QRDALGRVLVNLNHPPEEENVFLAPQLARAVKPHQIGGIRFLYDNLVESLERFKTSSGFG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 CILAHSMGLGKTLQVISFIDVLFRHTPAKTVLAIVPVNTLQNWLAEFNMWLPPPEALPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CILAHSMGLGKTLQVISFIDVLFRHTPAKTVLAIVPVNTLQNWLAEFNMWLPPPEALPAD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 NKPEEVQPRFFKVHILNDEHKTMASRAKVMADWVSEGGVLLMGYEMYRLLTLKKSFATGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NKPEEVQPRFFKVHILNDEHKTMASRAKVMADWVSEGGVLLMGYEMYRLLTLKKSFATGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 PKKTKKRSHPVIIDLDEEDRQQEFRREFEKALCRPGPDVVICDEGHRIKNCQASTSQALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PKKTKKRSHPVIIDLDEEDRQQEFRREFEKALCRPGPDVVICDEGHRIKNCQASTSQALK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 NIRSRRRVVLTGYPLQNNLIEYWCMVDFVRPDFLGTRQEFSNMFERPILNGQCIDSTPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NIRSRRRVVLTGYPLQNNLIEYWCMVDFVRPDFLGTRQEFSNMFERPILNGQCIDSTPQD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 VRLMRYRSHVLHSLLEGFVQRRGHTVLKIHLPAKEENVILVRLSKIQRDLYTQFMDRFRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRLMRYRSHVLHSLLEGFVQRRGHTVLKIHLPAKEENVILVRLSKIQRDLYTQFMDRFRD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 CGSSGWLGLNPLKAFCVCCKIWNHPDVLYEALQKESLANEQDLDVEELGSAGTSARCPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGSSGWLGLNPLKAFCVCCKIWNHPDVLYEALQKESLANEQDLDVEELGSAGTSARCPPQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 GTKGKGEDSTLASSMGEATNSKFLQGVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GTKGKGEDSTLASSMGEATNSKFLQGVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 PKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQSLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQSLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 SYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 CHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNPMLNFTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNPMLNFTR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 KEVENLLHFVEKEPAPQVSLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KEVENLLHFVEKEPAPQVSLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 TKAEKKAAKKSYEEDKRTSVPYTRPSYAQYYPASDQSLTSIPAFSQRNWQPTLKGDEKPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TKAEKKAAKKSYEEDKRTSVPYTRPSYAQYYPASDQSLTSIPAFSQRNWQPTLKGDEKPV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 ASVRPVQSTPIPMMPRHVPLGGSVSSASSTNPSMNFPINYLQRAGVLVQKVVTTTDIVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ASVRPVQSTPIPMMPRHVPLGGSVSSASSTNPSMNFPINYLQRAGVLVQKVVTTTDIVIP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 GLNSSTDVQARINAGESIHIIRGTKGTYIRTSDGRIFAVRATGKPKVPEDGRMAASGSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GLNSSTDVQARINAGESIHIIRGTKGTYIRTSDGRIFAVRATGKPKVPEDGRMAASGSQG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 PSCESTSNGRHSASSPKAPDPEGLARPVSPDSPEIISELQQYADVAAARESRQSSPSTNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PSCESTSNGRHSASSPKAPDPEGLARPVSPDSPEIISELQQYADVAAARESRQSSPSTNA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 ALPGPPAQLMDSSAVPGTALGTEPRLGGHCLNSSLLVTGQPCGDRHPVLDLRGHKRKLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALPGPPAQLMDSSAVPGTALGTEPRLGGHCLNSSLLVTGQPCGDRHPVLDLRGHKRKLAT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 PPAAQESSRRRSRKGHLPAPVQPYEHGYPVSGGFAMPPVSLNHNLTTPFTSQAGENSLFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PPAAQESSRRRSRKGHLPAPVQPYEHGYPVSGGFAMPPVSLNHNLTTPFTSQAGENSLFM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE9 GSTPSYYQLSNLLADARLVFPVTTDPLVPAGPVSSSSTATSVTASNPSFMLNPSVPGILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSTPSYYQLSNLLADARLVFPVTTDPLVPAGPVSSSSTATSVTASNPSFMLNPSVPGILP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE9 SYSLPFSQPLLSEPRMFAPFPSPVLPSNLSRGMSIYPGYMSPHAGYPAGGLLRSQVPPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SYSLPFSQPLLSEPRMFAPFPSPVLPSNLSRGMSIYPGYMSPHAGYPAGGLLRSQVPPFD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460
pF1KE9 SHEVAEVGFSSNDDEDKDDDVIEVTGK
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SHEVAEVGFSSNDDEDKDDDVIEVTGK
1450 1460
>>CCDS14435.1 ATRX gene_id:546|Hs108|chrX (2454 aa)
initn: 1619 init1: 582 opt: 616 Z-score: 436.8 bits: 94.2 E(32554): 5.2e-18
Smith-Waterman score: 1713; 33.2% identity (60.0% similar) in 1121 aa overlap (2-1035:1248-2311)
10 20 30
pF1KE9 MSDESASGSD-PDLDPDVELEDAEEEEEEEE
:::..:..: :. .. ::. .::
CCDS14 VTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEE
1220 1230 1240 1250 1260 1270
40 50 60 70 80
pF1KE9 VAVE---ECDRDDEEDLLDDPSLEGMCGTEHAQLGEDGQQPPRCTSTTSSQSEPSEQLRR
. . : : :.::. : . .: ::. : ....:.:. ..
CCDS14 AKNQVNSESDSDSEES--KKPRYRHRL-LRHKLTVSDGE------SGEEKKTKPKEH-KE
1280 1290 1300 1310 1320
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 HQGKN---LASEDPKKKRAQKPSHMRRNIRKLLREDQLEPVTKAAQQEELERRKRLEQQR
.:.: ..::: . . :. : . ... . ::. .: :..:.. :::. .: .:.
CCDS14 VKGRNRRKVSSEDSEDSDFQE-SGVSEEVSE--SEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
150 160 170 180 190
pF1KE9 KDY-----AAPIPTVPLEFLPEEIALRASDGPQLPPRVLAQEVICLDSSSGSEDEKSSRD
: . :: . . . . .: ::.: .. .:. :
CCDS14 KKRRRIKVQEDSSSENKSNSEEEEEEKEEEEEEEEEEEEEEEDENDDSKSPGKGRKKIR-
1390 1400 1410 1420 1430 1440
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 EVIELSSGEEDTLHIVDSSESVSEDDEEEEKGGTHVNDVLNQRDA-------LGRVLVNL
.... .. . .: . . : . :.:. .. .:.. .:: .....
CCDS14 KILKDDKLRTETQNALKEEEERRKRIAEREREREKLREVIEIEDASPTKCPITTKLVLDE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 NHPPEEENVFLAPQLARAVKPHQIGGIRFLYDNLVESLERFKTSSGFGCILAHSMGLGKT
.. .: : . ... .::::. :..:..: ::... : : : :::::: ::::::
CCDS14 DEETKEPLVQVHRNMVIKLKPHQVDGVQFMWDCCCESVKKTKKSPGSGCILAHCMGLGKT
1510 1520 1530 1540 1550 1560
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 LQVISFID--VLFRHTPAKTVLAIVPVNTLQNWLAEFNMWLPPPEALPADNKPEEVQPRF
:::.::. .: . .:.:.. :.:: ::. ::. : :.: :.:
CCDS14 LQVVSFLHTVLLCDKLDFSTALVVCPLNTALNWMNEFEKW---QEGLKDDEK--------
1570 1580 1590 1600 1610
380 390 400 410 420 430
pF1KE9 FKVHILNDEHKTMASRAKVMADWVSEGGVLLMGYEMYRLLTLKKSFATGRPKKTKKRSHP
..: : .. . :. .. : .:::...:::::: ..: :: :..:
CCDS14 LEVSELATVKRPQE-RSYMLQRWQEDGGVMIIGYEMYR------NLAQGRNVKSRK----
1620 1630 1640 1650 1660
440 450 460 470 480 490
pF1KE9 VIIDLDEEDRQQEFRREFEKALCRPGPDVVICDEGHRIKNCQASTSQALKNIRSRRRVVL
... :.::: :::: :.::::: .:: ...:.:...::::::..:
CCDS14 -------------LKEIFNKALVDPGPDFVVCDEGHILKNEASAVSKAMNSIRSRRRIIL
1670 1680 1690 1700
500 510 520 530 540 550
pF1KE9 TGYPLQNNLIEYWCMVDFVRPDFLGTRQEFSNMFERPILNGQCIDSTPQDVRLMRYRSHV
:: ::::::::: :::.:.. ..::. .:: : : :: :::: ::: :::.:. :.:.
CCDS14 TGTPLQNNLIEYHCMVNFIKENLLGSIKEFRNRFINPIQNGQCADSTMVDVRVMKKRAHI
1710 1720 1730 1740 1750 1760
560 570 580 590 600
pF1KE9 LHSLLEGFVQRRGHTVLKIHLPAKEENVILVRLSKIQRDLYTQFMDRFRDCGSS-----G
:. .: : :::. .:.: :: :.: :. ::...:: :: ..:.. :.. :
CCDS14 LYEMLAGCVQRKDYTALTKFLPPKHEYVLAVRMTSIQCKLYQYYLDHLTGVGNNSEGGRG
1770 1780 1790 1800 1810 1820
610 620 630 640 650
pF1KE9 WLGLNPLKAFCVCCKIWNHPDVLY-EALQKES------------LANEQDLDVEELGSAG
: . .. : . .::.:: : . ..::. .:...: :.:
CCDS14 KAGAKLFQDFQMLSRIWTHPWCLQLDYISKENKGYFDEDSMDEFIASDSDETSMSLSSDD
1830 1840 1850 1860 1870 1880
660 670 680 690 700
pF1KE9 TSARCPPQGTKGKGEDSTLASSMGEAT------NSKFLQGVGFNPFQERGNNIVTY----
. . .: ::: ..:. .:. . . ::. .: : . .: ::: .
CCDS14 YTKK-KKKGKKGKKDSSSSGSGSDNDVEVIKVWNSRS-RGGGEGNVDETGNNPSVSLKLE
1890 1900 1910 1920 1930 1940
710 720 730 740
pF1KE9 ---------------EWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQSL
.: ::..:. .. :::.: ::::::.... . ..:::.:::::::
CCDS14 ESKATSSSNPSSPAPDWYKDFVTDADAEVLEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVFSQSL
1950 1960 1970 1980 1990 2000
750 760 770 780 790 800
pF1KE9 STLALIEEFL--GKREVPC----PPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQF
.: :::.:: ..:: : .:.: ::.:::.:.:::::: : :.. ..:
CCDS14 ISLDLIEDFLELASREKTEDKDKPLIYKGEG--KWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAEEF
2010 2020 2030 2040 2050 2060
810 820 830 840 850 860
pF1KE9 NDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYI
:: .:. ::..::.:: ::.::..::::..::::::: .: :.. ::::.:: :: :.
CCDS14 NDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANRVIIFDASWNPSYDIQSIFRVYRFGQTKPVYV
2070 2080 2090 2100 2110 2120
870 880 890 900 910
pF1KE9 YRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNPMLNFTRKEVENLLHF---VEKEPAPQV
::..:. :.: ::::::..::..: ::::. . .:: .:. .: : . .: .
CCDS14 YRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVDQQQVERHFTMNELTELYTFEPDLLDDPNSEK
2130 2140 2150 2160 2170 2180
920 930 940 950 960 970
pF1KE9 SLNVKGI---KESVL-QLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEE
. . :...: .: .. :.. . ::.::: ......::. :.::: ::
CCDS14 KKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVGYH--EHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEA
2190 2200 2210 2220 2230 2240
980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 DKR-TSVPYTRPSYAQYYPASDQSLTS-IP-------AFSQRNWQPTL-KGDEKPVASVR
.:. .. .. :. .. :.: .: : :: :.:... . . .: :: : ..
CCDS14 EKKGLTMRFNIPTGTNLPPVSFNSQTPYIPFNLGALSAMSNQQLEDLINQGREKVVEATN
2250 2260 2270 2280 2290 2300
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 PVQSTPIPMMPRHVPLGGSVSSASSTNPSMNFPINYLQRAGVLVQKVVTTTDIVIPGLNS
: : . ..:
CCDS14 SV--TAVRIQPLEDIISAVWKENMNLSEAQVQALALSRQASQELDVKRREAIYNDVLTKQ
2310 2320 2330 2340 2350 2360
>>CCDS14434.1 ATRX gene_id:546|Hs108|chrX (2492 aa)
initn: 1619 init1: 582 opt: 616 Z-score: 436.7 bits: 94.2 E(32554): 5.3e-18
Smith-Waterman score: 1713; 33.2% identity (60.0% similar) in 1121 aa overlap (2-1035:1286-2349)
10 20 30
pF1KE9 MSDESASGSD-PDLDPDVELEDAEEEEEEEE
:::..:..: :. .. ::. .::
CCDS14 VTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEE
1260 1270 1280 1290 1300 1310
40 50 60 70 80
pF1KE9 VAVE---ECDRDDEEDLLDDPSLEGMCGTEHAQLGEDGQQPPRCTSTTSSQSEPSEQLRR
. . : : :.::. : . .: ::. : ....:.:. ..
CCDS14 AKNQVNSESDSDSEES--KKPRYRHRL-LRHKLTVSDGE------SGEEKKTKPKEH-KE
1320 1330 1340 1350 1360
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 HQGKN---LASEDPKKKRAQKPSHMRRNIRKLLREDQLEPVTKAAQQEELERRKRLEQQR
.:.: ..::: . . :. : . ... . ::. .: :..:.. :::. .: .:.
CCDS14 VKGRNRRKVSSEDSEDSDFQE-SGVSEEVSE--SEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQK
1370 1380 1390 1400 1410 1420
150 160 170 180 190
pF1KE9 KDY-----AAPIPTVPLEFLPEEIALRASDGPQLPPRVLAQEVICLDSSSGSEDEKSSRD
: . :: . . . . .: ::.: .. .:. :
CCDS14 KKRRRIKVQEDSSSENKSNSEEEEEEKEEEEEEEEEEEEEEEDENDDSKSPGKGRKKIR-
1430 1440 1450 1460 1470 1480
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 EVIELSSGEEDTLHIVDSSESVSEDDEEEEKGGTHVNDVLNQRDA-------LGRVLVNL
.... .. . .: . . : . :.:. .. .:.. .:: .....
CCDS14 KILKDDKLRTETQNALKEEEERRKRIAEREREREKLREVIEIEDASPTKCPITTKLVLDE
1490 1500 1510 1520 1530 1540
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 NHPPEEENVFLAPQLARAVKPHQIGGIRFLYDNLVESLERFKTSSGFGCILAHSMGLGKT
.. .: : . ... .::::. :..:..: ::... : : : :::::: ::::::
CCDS14 DEETKEPLVQVHRNMVIKLKPHQVDGVQFMWDCCCESVKKTKKSPGSGCILAHCMGLGKT
1550 1560 1570 1580 1590 1600
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 LQVISFID--VLFRHTPAKTVLAIVPVNTLQNWLAEFNMWLPPPEALPADNKPEEVQPRF
:::.::. .: . .:.:.. :.:: ::. ::. : :.: :.:
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..: : .. . :. .. : .:::...:::::: ..: :: :..:
CCDS14 LEVSELATVKRPQE-RSYMLQRWQEDGGVMIIGYEMYR------NLAQGRNVKSRK----
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... :.::: :::: :.::::: .:: ...:.:...::::::..:
CCDS14 -------------LKEIFNKALVDPGPDFVVCDEGHILKNEASAVSKAMNSIRSRRRIIL
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CCDS14 TGTPLQNNLIEYHCMVNFIKENLLGSIKEFRNRFINPIQNGQCADSTMVDVRVMKKRAHI
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:. .: : :::. .:.: :: :.: :. ::...:: :: ..:.. :.. :
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: . .. : . .::.:: : . ..::. .:...: :.:
CCDS14 KAGAKLFQDFQMLSRIWTHPWCLQLDYISKENKGYFDEDSMDEFIASDSDETSMSLSSDD
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. . .: ::: ..:. .:. . . ::. .: : . .: ::: .
CCDS14 YTKK-KKKGKKGKKDSSSSGSGSDNDVEVIKVWNSRS-RGGGEGNVDETGNNPSVSLKLE
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.: ::..:. .. :::.: ::::::.... . ..:::.:::::::
CCDS14 ESKATSSSNPSSPAPDWYKDFVTDADAEVLEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVFSQSL
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.: :::.:: ..:: : .:.: ::.:::.:.:::::: : :.. ..:
CCDS14 ISLDLIEDFLELASREKTEDKDKPLIYKGEG--KWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAEEF
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:: .:. ::..::.:: ::.::..::::..::::::: .: :.. ::::.:: :: :.
CCDS14 NDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANRVIIFDASWNPSYDIQSIFRVYRFGQTKPVYV
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::..:. :.: ::::::..::..: ::::. . .:: .:. .: : . .: .
CCDS14 YRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVDQQQVERHFTMNELTELYTFEPDLLDDPNSEK
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. . :...: .: .. :.. . ::.::: ......::. :.::: ::
CCDS14 KKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVGYH--EHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEA
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.:. .. .. :. .. :.: .: : :: :.:... . . .: :: : ..
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: : . ..:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]