Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9640
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9640, 1905 aa
1>>>pF1KE9640 1905 - 1905 aa - 1905 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3588+/- 0.001; mu= 8.4314+/- 0.061
mean_var=249.8273+/-49.583, 0's: 0 Z-trim(113.2): 124 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.081144
statistics sampled from 13723 (13847) to 13723 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.425), width: 16
Scan time: 6.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 12900 1524.7 0
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 12876 1521.9 0
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 7015 835.8 0
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 7014 835.7 0
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 5801 693.7 1.8e-198
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 5582 668.1 9.5e-191
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 1655 208.5 3.2e-52
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 1615 203.8 7.6e-51
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 1608 203.0 1.4e-50
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 1608 203.0 1.4e-50
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 1585 200.2 7.7e-50
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 1585 200.3 8.4e-50
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 1416 180.3 5.8e-44
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 1398 178.2 2.4e-43
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 1160 150.2 4e-35
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 1157 149.8 5.1e-35
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 1065 139.2 1.2e-31
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 1058 138.4 2.2e-31
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 1051 137.6 3.9e-31
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 1051 137.6 3.9e-31
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 1043 136.6 7.4e-31
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 1032 135.3 1.8e-30
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 1032 135.3 1.8e-30
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 959 126.6 3.9e-28
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 959 126.6 4.3e-28
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 813 109.7 9e-23
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 686 94.5 1.4e-18
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 686 94.6 1.5e-18
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 686 94.7 2e-18
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 686 94.7 2.1e-18
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 689 95.2 2.1e-18
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 636 88.7 8.6e-17
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 636 88.7 8.8e-17
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 636 88.7 9e-17
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 636 88.8 9.9e-17
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 636 88.8 1e-16
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 569 81.4 6.3e-14
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 538 77.5 4.5e-13
>>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905 aa)
initn: 12900 init1: 12900 opt: 12900 Z-score: 8168.1 bits: 1524.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12900; 99.9% identity (100.0% similar) in 1905 aa overlap (1-1905:1-1905)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEEDLSETETPKLKKKKKPKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEEDLSETETPKLKKKKKPKKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RDPKIPKSKRQKKELGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKLGPKKEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RDPKIPKSKRQKKELGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKLGPKKEKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 SKSKRKEEEEEDDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFSQFVRP
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFSQFVRP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESMVTATEVA
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CCDS76 LIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESMVTATEVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGGFGSKRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGGFGSKRKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 SSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVTAVDGYET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVTAVDGYET
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 DHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEAKEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEAKEDN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 SEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 WLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 WLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 QGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKNKDPKFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKNKDPKFAE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 MEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLF
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CCDS76 MEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 KQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 PYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 INWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 INWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 LLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 NLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 SKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 AAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 HEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 WNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 WNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 GSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETED
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 TELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE9 DLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE9 SRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE9 LRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE9 EFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE9 ENSLKEEESIEGEKEVKSTAPETAIECTQAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ENSLKEEESIEGEKEVKSTAPETAIECTQAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE9 EEPMETEPKGAADVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKEVMLQNGETPKDLNDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EEPMETEPKGAADVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKEVMLQNGETPKDLNDEK
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE9 QKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHGYA
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE9 RWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNM
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE9 SEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELLSDMKAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELLSDMKAD
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900
pF1KE9 VTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
1870 1880 1890 1900
>>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912 aa)
initn: 12398 init1: 12398 opt: 12876 Z-score: 8152.9 bits: 1521.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12876; 99.6% identity (99.6% similar) in 1912 aa overlap (1-1905:1-1912)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEEDLSETETPKLKKKKKPKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEEDLSETETPKLKKKKKPKKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE9 RDPKIPKSKRQKKE-------LGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKL
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 RDPKIPKSKRQKKERMLLCRQLGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 GPKKEKKSKSKRKEEEEEDDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKA
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 GPKKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 FSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VTATEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 VTATEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 FGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVT
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 AVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 AVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQ
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 WEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPL
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CCDS85 WEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPL
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::.:::::....:::::::::::::::.::::::.. : :: :: : . :::::: ::.
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::::::::::::::.: :::::::::::::.::::::::::::::.:::.::::: :.::
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:::::::. :::.:::::::::..:: ....: .:. ::::: ::::. ::. ..: :
CCDS32 HSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKY
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:: : . . :: .:: ::::::: ::... ::::::: ::.:::::::::::::::::
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CCDS32 CLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLE
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CCDS32 GFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKY
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:: :.::: :::::::::..:: :::::::: ::::..:.::::::::::::::::
CCDS32 DENE---GENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVR
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::. . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.
CCDS32 EED--KIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDA
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.:::.: :::.:::.::: ::::::: :. :: :.. :::.:::::::::::::
CCDS32 AQEDQD-------NQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG-RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVG
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CCDS32 GNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLC
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::::::.:::::::::::::::.::::::::::..::::::::.::::::::: :.
CCDS32 EPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSAD
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..... :.: . :: :: : .: ..: :::: .: : :. ::: . :
CCDS32 SKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAP---SEKGEGIRTPLEKEEAENQEE
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: :.. .: ..::.:: : :: ..: .. . : : :: :
CCDS32 KPEKNSRIGEKMETEADAPSPA---------PSLGE-RLEPRKIPLEDEVPGVPGEMEPE
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: .: :: .:. . :. ....:. : : :.: . . : :.:
CCDS32 PGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRELRPGPRDE
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CCDS32 PRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAG
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pF1KE9 IINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLR
:. :::::::::::: ..::.::::: : :.:::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS32 IVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLR
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE9 RAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEEL
::::::.:..:.::.:::..::::.::::::::::::::.::::::::::::::.:::::
CCDS32 RAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEEL
1880 1890 1900 1910 1920 1930
1860 1870 1880 1890 1900
pF1KE9 LSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
::::::::::::::..::::.:.:::::::.::::::... :: :
CCDS32 LSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPPGPYATPPGY
1940 1950 1960 1970 1980 1990
CCDS32 GAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALVSDGLDRKEPR
2000 2010 2020 2030 2040 2050
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10 20 30 40 50
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: :.:: ... :..: : . :.:. :
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10 20 30 40 50
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:: .. : : ...::. :: :: :..: .:.: ::.: ::.:...:
CCDS32 KKQKENKPGKPRKRKKR--DSE---EEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHRE
60 70 80 90 100
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:::::.: ..: : : . . : :::: :: ::.::..::::::::.:::::::::
CCDS32 KKEKKTKRRKKGE---GDGGQKQVEQKSSATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFS
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::.::::: ::::: .:::: .:::::::::.:::::::..: .:::::::.::.:
CCDS32 QFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWREFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSA
170 180 190 200 210 220
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.. .:: .:: ::::. :::.:::::::::. .:. : ::::::..: .
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::.:::::::: .:.:::...: ..:. :::.:..:..: : . :..
CCDS32 GKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSDEGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTK
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340 350 360 370 380
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. :. : .:::: ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KL-KRGRPGRKKKKVLGCPAVAGEEEV---DGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAY
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390 400 410 420 430 440
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:.:::::....:::::::::::::::.::::::.. : :: :: : . :::::: ::.:
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:: .:.:. :..:..: :.::.:: ::.::::: :.:::::::..:::::. ::.:
CCDS32 PPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYR
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pF1KE9 NYQRKNDMDEPPSGDFGGDEE--KSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNH
:::::::::::: :.:. :. :: ::: :::..:::::..::.::::::: .:::.::
CCDS32 NYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINH
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::::::. :::.:::::::::..:: ....: .:. ::::: ::::. ::. ..: :
CCDS32 SVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYK
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:: : . . :: .:: ::::::: ::... ::::::: ::.::::::::::::::::::
CCDS32 KKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTIL
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:::::::::::::::::::.::::: .::.::.::::::::::::::::.: :::: :::
CCDS32 KDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWAC
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CCDS32 LVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEG
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::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
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CCDS32 LTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSS
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:::.::::::..::: :::::::::::::::::::::..:::::::::::::: .:::::
CCDS32 GKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: .::
CCDS32 DRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKV
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::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
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: :.::: :::::::::..:: :::::::: ::::..:.:::::::::::::::::
CCDS32 ENE---GENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVRE
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pF1KE9 EEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGS
:. . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::..
CCDS32 ED--KIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAA
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:::.: :::.:::.::: ::::::: :. :: :.. :::.::::::::::::::
CCDS32 QEDQD-------NQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG-RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGG
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::::::::.:::::::::.::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS32 NIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCE
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:::::.:::::::::::::::.::::::::::..::::::::.::::::::: :.
CCDS32 PGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADS
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..... :.: . :: :: : .: ..: :::: .: : :. ::: . ::
CCDS32 KRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAP---SEKGEGIRTPLEKEEAENQEEK
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:.. .: ..::.:: : :: ..: .. . : : :: ::
CCDS32 PEKNSRIGEKMETEADAPSPA---------PSLGE-RLEPRKIPLEDEVPGVPGEMEPEP
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.: :: .:. . :. ....:. : : :.: . . : :.:
CCDS32 GYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRELRPGPRDEP
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: ....:. : :::::::::::::::.::::::::: . : :::::::::::::::
CCDS32 RSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAGI
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pF1KE9 INHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRR
. :::::::::::: ..::.::::: : :.:::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRR
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pF1KE9 AAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELL
:::::.:..:.::.:::..::::.::::::::::::::.::::::::::::::.::::::
CCDS32 AAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELL
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1860 1870 1880 1890 1900
pF1KE9 SDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
:::::::::::::..::::.:.:::::::.::::::... :: :
CCDS32 SDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPPGPYATPPGYG
1880 1890 1900 1910 1920 1930
CCDS32 AAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALVSDGLDRKEPRA
1940 1950 1960 1970 1980 1990
>>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966 aa)
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::.::::: ::::: .:::: .:::::::::.:::::::..: .:::::::.::.:
CCDS32 QFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWREFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSA
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CCDS32 GKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSDEGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTK
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CCDS32 PPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYR
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CCDS32 NYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINH
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::::::. :::.:::::::::..:: ....: .:. ::::: ::::. ::. ..: :
CCDS32 SVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYK
640 650 660 670 680 690
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CCDS32 ADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGD
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CCDS32 LVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEG
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pF1KE9 FLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYI
::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS32 FLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYI
940 950 960 970 980 990
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE9 LTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRAS
:::::::::.:::::::::::..:::::::::::::::::::.::.:.: :.:.:::..:
CCDS32 LTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE9 GKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAI
:::.::::::..::: :::::::::::::::::::::..:::::::::::::: .:::::
CCDS32 GKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAI
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE9 DRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: .::
CCDS32 DRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKV
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE9 MIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKD
::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS32 MIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKD
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE9 EATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVRE
: :.::: :::::::::..:: :::::::: ::::..:.:::::::::::::::::
CCDS32 ENE---GENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVRE
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE9 EEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGS
:. . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::..
CCDS32 ED--KIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAA
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE9 QEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGG
:::.: :::.:::.::: ::::::: :. :: :.. :::.::::::::::::::
CCDS32 QEDQD-------NQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG-RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGG
1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KE9 NIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCE
::::::::.:::::::::.::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS32 NIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCE
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE9 PGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPEL-----AEV
:::::.:::::::::::::::.::::::::::..::::::::.::::::::: :.
CCDS32 PGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADS
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE9 EENKKMSQPGSPSPKTPTPS---TPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESIEGEK
..... :.: . :: :: : .: ..: :::: .: : :. ::: . ::
CCDS32 KRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAP---SEKGEGIRTPLEKEEAENQEEK
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KE9 EVKSTAPETAIEC-TQAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEPMETEPKGAAD
:.. .: ..::.:: : :: ..: .. :.: : :.
CCDS32 PEKNSRIGEKMETEADAPSPA---------PSLGE-RLEPRKI------PLEDEVPGVPG
1590 1600 1610 1620
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KE9 VEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKEVMLQNGETPKDL---NDEKQKKNIKQRFM
. : : :.: : :. : . :. : :.: : ....:. : :::
CCDS32 EMEPE--------PGYRGDRE--KSEDVKGDRELRPG--PRDEPRSNGRREEKTEKPRFM
1630 1640 1650 1660 1670
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pF1KE9 FNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHGYARWQDIQNDPR
::::::::::::.::::::::: . : :::::::::::::::. :::::::::::: .
CCDS32 FNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQ
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KE9 YAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNMSEDPSHPSMA
.::.::::: : :.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:..:.::.::
CCDS32 FAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMA
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KE9 LNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELLSDMKADVTRLPATIAR
:..::::.::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::..:
CCDS32 LHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSR
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1880 1890 1900
pF1KE9 IPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
:::.:.:::::::.::::::... :: :
CCDS32 IPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPPGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGA
1860 1870 1880 1890 1900 1910
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:.::: . :. . . .::. .:. .: .: :::
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pF1KE9 KPKKPRDPKIPKSKRQKKELGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKLGP
:::: .. : :.::.::: : . :. :.::.. .:.::::::.:.:::::::
CCDS57 KPKKLKENKC-KGKRKKKE-----GSNDELSENEEDLEEKSESEGSDYSPNKKKKKKLKD
60 70 80 90 100
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pF1KE9 KKEKKSKSKRKEEEEEDDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFS
:::::.: :.:.:.:.:.:: ::::::.::. .::..:.:..::::::.:::::::::
CCDS57 KKEKKAKRKKKDEDEDDNDDGCLKEPKSSGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFS
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::.::::: ::::: .:::: ::::::::::.::::::::.:..:::.:::: .: ..
CCDS57 QFLRPLIAKKNPKIPMSKMMTVLGAKWREFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVETV-TISP
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:.:: : ::::::::::::::..:.: ::: :: : ::.: ::...::..
CCDS57 PLAVSPPQVPQPVPIRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGIS
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.:::..:: ..: :::::.:::.: :: :. :.. ...:... .:::. .
CCDS57 NKRKKGSSSEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR----RKKKR----IDD
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:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..::::::::::::::::::::
CCDS57 GDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQW
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: :.:..: :: :: :::::: :::::::::::::::::.::::::.::::::::
CCDS57 EPKDDDDEEEE-----GGCEEEEDDH-MEFCRVCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLP
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::::::::::::::: ::::::.:: :.: .::.: : : ::..:. : :::::: ::
CCDS57 EIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPE
450 460 470 480 490 500
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pF1KE9 RQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFG-GDEE-KSRKR
:.::::: :.::::::::.::::::. ::.::::::::::::: :.: :::. ::.::
CCDS57 REFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKR
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::::: .:.:::::::::::::::::::::::: :::: :::::::.:::::: .:: .:
CCDS57 KNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDD
570 580 590 600 610 620
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pF1KE9 VEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGR-PGKKLKK-VKLR--KLERPPETPTVDPTVKYER
..: :: .::.::.::::: ::. : : . ::: ::: : :.::.:: ::::::...
CCDS57 IDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDK
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pF1KE9 QPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHS
:: :.:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS57 QPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHS
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:::.::::::::::::::::::::::.:::::.:::.::..::::::::::::::.:::.
CCDS57 KGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKV
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:::::...:::::::::::::::.::::::.::::.:::::::::::::::::::.:..
CCDS57 FRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKI
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..::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:::::
CCDS57 DYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHM
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pF1KE9 LRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMD
:::::::::::::.::::::::::: :::::::.::::::::::..::::::::::..::
CCDS57 LRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMD
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pF1KE9 LKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQ
:::::::::::::::.::: .::: ::::.:...::::.:::::::.:.. :::::::::
CCDS57 LKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQ
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:::::::::::::.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS57 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMML
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pF1KE9 THLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDE-------------------ATDGG
::::::::::::.:::.::::::::::::::::::. .. ::
CCDS57 THLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGG
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pF1KE9 ---------------GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSF
::::. :::::::::: :: .::::::: :.:::::.::::::::
CCDS57 NLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSF
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pF1KE9 KVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIR
::::::::::. : :: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KVAQYVVREED-GVEE-VEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIR
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pF1KE9 KQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAP--RRPSRKGLRNDKDK
:::::::.::::..:::. :::::.::..::. ::::.:: :. :: ::. :..:.::
CCDS57 KQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDK
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pF1KE9 PLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA
::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::...::::::::::::::.:
CCDS57 PLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRA
1410 1420 1430 1440 1450 1460
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pF1KE9 YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::..:
CCDS57 YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYST
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KE9 PELA-EVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESI
:.: : :.:: .. : .:.::.:..:. : .: .: .... . .
CCDS57 PDLIPEGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLP-APLGLP----------DKMEAQLGY
1530 1540 1550 1560 1570
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pF1KE9 EGEKEVKSTAPETAIECTQAPAP----ASEDEKVVVEPPEGEEKV--EKAEVKERTEEPM
::. . :. .: :: :::.. : : ..:.. :. : :..
CCDS57 MDEKDPGAQKPRQPLEVQALPAALDRVESEDKH---ESPASKERAREERPEETEKAPPSP
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE9 ETEPKGAA--DVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEE---EEKKEVMLQ-NGETPKDLND
: :. . . ::. .: ..: ...: . .. :::. . : ::. .: .
CCDS57 EQLPREEVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIETQQNGDKEEDDEG
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE9 EKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHG
.:. :. : .::::::::::::::.:::::::::. . : :.::::::::::::::..::
CCDS57 KKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWHRRHDYWLLAGIVTHG
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE9 YARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYL
::::::::::::: :::::::.:...::.::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYL
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE9 NMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELLSDMK
::..::.::.::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::
CCDS57 NMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELLSDMK
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1860 1870 1880 1890 1900
pF1KE9 ADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
:::::::. ..::::::.:::::::.:::::.::: .:: :: :
CCDS57 ADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDPTIQQGAFGSSQMYSNNFGPNFR
1880 1890 1900 1910 1920 1930
CCDS57 GPGPGGIVNYNQMPLGPYVTDI
1940 1950
>>CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997 aa)
initn: 1697 init1: 630 opt: 1655 Z-score: 1051.0 bits: 208.5 E(32554): 3.2e-52
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510 520 530 540 550 560
pF1KE9 QPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMF
.:.::....:: ::.:.: .:: ..
CCDS47 VDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRI--
800 810 820 830 840 850
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 RNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKNKDPKF-AEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILN-
:.: : : :. . :: .:.:.... .:... . ::..
CCDS47 ---QQKI---------------KRFKAKQGQNKFLSEIEDELF----NPDYVEVDRIMDF
860 870 880 890
630 640 650 660 670
pF1KE9 -HSVDKKGH--VHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPG
.:.: .:. .:::.:: .:::....:: . :: : . . . ..:: : :
CCDS47 ARSTDDRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERR----QDID--QAKIEEFEKLMSRE---P-
900 910 920 930 940
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. ...:::: .: : : . :: ... :. ::.::.::: :.: . .
CCDS47 ------ETERVERPP----ADDWKKSESSREY--KNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRN
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:::::::::::.:. .::: .: .: .::::: :::::: ::::::. :. .. ::.:
CCDS47 CILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKG-IHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWT-ELNVVVY
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pF1KE9 VGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSID
:.. :: :. :. :.: .:. : .: :::...:..:.: : : .:
CCDS47 HGSQASRRTIQLYEMYFKD-------PQGRVIK-GSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIP
1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KE9 WACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHN
: :...:::::::: . :... :. ..:.::.:::::::::..:::: ::.:: : :: .
CCDS47 WRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPS
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:..::.:. :.:..::. .: : :::::: :: ::. : : :..:::. .:::::
CCDS47 ETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYY
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pF1KE9 KYILTRNFEALNARGGG--NQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAA---MEAPKMPNGM--
. :: .:: :. .::: : .:::..:.:.::::::::. : .: : ..
CCDS47 RAILEKNFTFLS-KGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAES
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pF1KE9 --YDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERID
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CCDS47 PDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERID
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: . ::.:: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::.::::::.::.::
CCDS47 GRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQ
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pF1KE9 SRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGS-----MSK
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CCDS47 ARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSK
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pF1KE9 QELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQG
.:..:.:. :. . :: : : :. . : : :: :.. : ..: .:
CCDS47 KEIEDLLRKGAYGALMDE---------EDEGSKFCEEDIDQI--LLRRTHTITIESEGKG
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pF1KE9 MNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN
:.: :..:. :.. .. . ::..:.: .. . . .::
CCDS47 -----STFAKASFVAS----GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKKAELDIDALNGRN
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pF1KE9 --LGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRK
. :.:::. .. .::. . :: .:: ::: . ::::. :
CCDS47 NLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELM--EFSDLESD----SEE------KPCAKPRRPQDK
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pF1KE9 GLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRG
. ... . :: :. : :.. : . .. .. . ::. : . : .
CCDS47 SQGYARSECF-----RVEKNLLVYGWG-RWTDILSHGRYKRQLTEQDVET---ICRTILV
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pF1KE9 KSEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQE
...:. .. :. : : ::: .: : : . :::
CCDS47 YCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADG-QTRAL-VNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPV
1650 1660 1670 1680 1690 1700
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pF1KE9 FEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEE
CCDS47 VQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADS
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CCDS13 EDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHP
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CCDS13 --GEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN-------------
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CCDS13 -----KQAQMKHIFTEPDEDLF----NPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCS
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CCDS13 LPYEESTWELEE----DVDPAKVKEFESLQVL------P-------EIKHVERP----AS
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CCDS13 DSWQKLEKSREYKNSN--QLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLS
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.. .: .::::. :::::: ::::::. :. .: ...: :.. :: .:.. :. ..:
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CCDS13 Q---GNPLSGV-----FKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLL
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CCDS13 EGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKL
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CCDS13 QSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLT-KGANQHN
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CCDS13 MPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPD--FQLQAMIQAAGKLVLI
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CCDS13 DKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKP
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...: ::: ::::::::::..::: ::.::::::.::.:: .: :::::.: : .::..
CCDS13 DSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLI
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pF1KE9 TRASVEERITQVAKKKMMLTHLVV----RPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEA
:: : :... . :. :. : . :. : : . . ..::.:..:.:. :. . ::
CCDS13 TRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDE-
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: : :. . : :. ..: :.. : ..: .: :.: :..:.
CCDS13 --------EDEGSKFCEEDIDQILQR---RTHTITIQSEGKG-----STFAKASFVAS--
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:.. .. . ::..:.: . . . . .. ..: . :.:::... ..
CCDS13 --GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNS
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.::. ..: : : : ::: :.:. ::: . : ::
CCDS13 FEEDE---------LMEFS----ELDSDSDER------PTRSRRLNDKARRYLRAECFRV
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pF1KE9 GGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA--YVSLFMR
:. ..:.. : . . .. ... . .: . . : : :..:. .. :.
CCDS13 EKNLLIFGWG-RWKDILTHGRFKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIW
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pF1KE9 HLCEPGADG-AETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEV
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CCDS13 ELITPTKDGQAQTLQN---HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVL
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CCDS45 QKIKR-----------F-----KLRQAQ-RAHFFADMEEEPF----NPDYVEVDRVLEVS
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:: :. ..::.:: .:::....:: .:::.. . :.: . .::
CCDS45 FCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQL----------QASRP
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CCDS45 -------DTRRLDRPPSNIWKKIDQSRDYK--------NGNQLREYQLEGLNWLLFNWYN
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CCDS45 RRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTG-IRGPFLIIAPLSTIANWEREFRTWT-DINV
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CCDS45 VVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYR--------FQAIITTFEMILGGCGELN
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pF1KE9 SIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPER
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CCDS45 AIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLR
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CCDS45 FPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQK
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pF1KE9 KYYKYILTRNFEALNARGGGNQV-SLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDG
:::. :: .:: :. .: ..: .:.:..:.:.::::::::. : . :.
CCDS45 KYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNP
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pF1KE9 SA-------LIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYER
.: .:...:::.:..:.: ..: :::.:::::::.. ::.:::.: :. : :::
CCDS45 AASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYER
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KE9 IDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQ
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CCDS45 IDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQ
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KE9 AFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLG--SKTGS---M
: .: ::::::: : .::.::: : :... . :. :. : . :.. : :..:. .
CCDS45 AQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRESNVGGIQQL
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 SKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTEL
::.:..:.:. :. . .: : : :. . : : :: :.. : ..:
CCDS45 SKKEIEDLLRRGAYGAIMEE---------EDEGSKFCEEDIDQI--LLRRTKTITIESEG
1350 1360 1370 1380 1390
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pF1KE9 QGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLA
.: :.: :..:. :.. .. . ::..:.: .. . . .
CCDS45 RG-----STFAKASFVAS----GNRTDISLD--------DPNFWQKWAKKAEIDIEAISG
1400 1410 1420 1430
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pF1KE9 RN--LGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPS
:: . :::::. : .. . :. .. : : :::: . :::
CCDS45 RNSLVIDTPRIRKQT---------RPFSATK-DELAELSEAESEGDE-----KPKLRRPC
1440 1450 1460 1470 1480
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE9 RKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDL
.. . . . :: :. : :.. : :. . .. .. . .: .. . : :
CCDS45 DRSNGYGRTECF-----RVEKNLLVYGWG-RWREILSHGRFKRQLNEHD---VEIICRAL
1490 1500 1510 1520 1530
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pF1KE9 RGKSEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKV
. .... .. :. : : ::
CCDS45 LAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFD
1540 1550 1560 1570 1580 1590
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510 520 530 540 550 560
pF1KE9 QPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMF
.::::....:: :: :..: :: :. . .
CCDS76 SEEDAAIVDKILSSRTVKKEISPGVMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQL-LKDKRIQ
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