Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9618
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9618, 399 aa
1>>>pF1KE9618 399 - 399 aa - 399 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3428+/-0.000756; mu= 13.4056+/- 0.046
mean_var=102.6008+/-20.551, 0's: 0 Z-trim(112.0): 22 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.126619
statistics sampled from 12807 (12824) to 12807 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.394), width: 16
Scan time: 3.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7691.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 ( 399) 2730 508.8 3.6e-144
CCDS53590.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 ( 257) 1755 330.5 1.1e-90
CCDS12523.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 389) 899 174.3 1.7e-43
CCDS46069.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 352) 882 171.2 1.4e-42
CCDS74361.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 234) 797 155.5 4.7e-38
CCDS7273.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 747) 681 134.6 2.8e-31
CCDS44412.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 452) 536 108.0 1.8e-23
CCDS81469.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 444) 462 94.5 2.1e-19
>>CCDS7691.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 (399 aa)
initn: 2730 init1: 2730 opt: 2730 Z-score: 2701.7 bits: 508.8 E(32554): 3.6e-144
Smith-Waterman score: 2730; 100.0% identity (100.0% similar) in 399 aa overlap (1-399:1-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAFWGWRAAAALRLWGRVVERVEAGGGVGPFQACGCRLVLGGRDDVSAGLRGSHGARGEP
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CCDS76 MAFWGWRAAAALRLWGRVVERVEAGGGVGPFQACGCRLVLGGRDDVSAGLRGSHGARGEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LDPARPLQRPPRPEVPRAFRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LDPARPLQRPPRPEVPRAFRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 GKLSLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GKLSLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 RFLLHVVDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLAWHPRSRDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RFLLHVVDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLAWHPRSRDV
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE9 AQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
370 380 390
>>CCDS53590.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 (257 aa)
initn: 1755 init1: 1755 opt: 1755 Z-score: 1741.9 bits: 330.5 E(32554): 1.1e-90
Smith-Waterman score: 1755; 100.0% identity (100.0% similar) in 257 aa overlap (143-399:1-257)
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 GSGGSSDKGKLSLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYD
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDG
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIV
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 FFGEPLPQRFLLHVVDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FFGEPLPQRFLLHVVDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLA
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390
pF1KE9 WHPRSRDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 WHPRSRDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
220 230 240 250
>>CCDS12523.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (389 aa)
initn: 984 init1: 610 opt: 899 Z-score: 894.2 bits: 174.3 E(32554): 1.7e-43
Smith-Waterman score: 985; 45.7% identity (70.8% similar) in 359 aa overlap (59-395:3-353)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 GPFQACGCRLVLGGRDDVSAGLRGSHGARGEPLDPARPLQRPPRPEVPRAFRRQPRAAAP
:: ::..::. .: . : .
CCDS12 MAEP-DPSHPLET-------QAGKVQEAQDSD
10 20
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 SFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK---GKLSLQDVAELIRARACQRVVVMVG
: .. ::. ...: . : . : ::. . .:.:. ::. .... :.::. .::
CCDS12 SDSEGGAAGGEADMDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRRVICLVG
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 AGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYK
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CCDS12 AGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFK
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 PNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTV--CQRPF
:.. :::.:::.::::::: :::::: :::..:. :::::::: .. :. :.. .
CCDS12 PTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEY
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 PGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSL
: .. .... .:.: : ..:::::::::: :: ::. . :: .::::..::::
CCDS12 PLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSL
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360
pF1KE9 EVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRD--------------LVGPLAWHPRS--RDVAQLGDV
.:.::::: . :.::::::.. : : . . .. :::: ::.
CCDS12 QVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGEC
270 280 290 300 310 320
370 380 390
pF1KE9 VHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
.: .:.::::: .:..:::.:: ...:
CCDS12 DQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPPAKDEARTTE
330 340 350 360 370 380
>>CCDS46069.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (352 aa)
initn: 962 init1: 610 opt: 882 Z-score: 878.1 bits: 171.2 E(32554): 1.4e-42
Smith-Waterman score: 968; 48.7% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (109-395:9-316)
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 FRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK--GKLSLQDVAELIRARA
:.... :..... .:.:. ::. ....
CCDS46 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSER
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 CQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLA
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CCDS46 CRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALA
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 KELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATC
::::::..::.. :::.:::.::::::: :::::: :::..:. :::::::: .. :
CCDS46 KELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHC
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 TV--CQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMAD
. :.. .: .. .... .:.: : ..:::::::::: :: ::. . :: .:
CCDS46 VSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVD
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350
pF1KE9 LLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRD--------------LVGPLAWHPRS--
:::..::::.:.::::: . :.::::::.. : : . . ..
CCDS46 LLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAY
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390
pF1KE9 RDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
:::: ::. .: .:.::::: .:..:::.:: ...:
CCDS46 RDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPP
280 290 300 310 320 330
CCDS46 AKDEARTTEREKPQ
340 350
>>CCDS74361.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (234 aa)
initn: 758 init1: 610 opt: 797 Z-score: 796.7 bits: 155.5 E(32554): 4.7e-38
Smith-Waterman score: 797; 52.3% identity (80.9% similar) in 220 aa overlap (109-323:9-228)
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 FRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK--GKLSLQDVAELIRARA
:.... :..... .:.:. ::. ....
CCDS74 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSER
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 CQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLA
:.::. .::::::: .::::::::..:::.::..: :::::::::. .: ..:.:::.::
CCDS74 CRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALA
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 KELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATC
::::::..::.. :::.:::.::::::: :::::: :::..:. :::::::: .. :
CCDS74 KELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHC
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 TV--CQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMAD
. :.. .: .. .... .:.: : ..:::::::::: :: ::. . :: .:
CCDS74 VSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVD
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 LLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLAWHPRSRDVAQLGDVVHGVESL
:::..::::.
CCDS74 LLLVMGTSLQGRGLAG
220 230
>>CCDS7273.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (747 aa)
initn: 694 init1: 266 opt: 681 Z-score: 674.9 bits: 134.6 E(32554): 2.8e-31
Smith-Waterman score: 683; 34.7% identity (63.7% similar) in 366 aa overlap (40-378:140-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 AALRLWGRVVERVEAGGGVGPFQACGCRLVLGGRDDVSAG----LRGSHGARGEPLDPAR
.: ::.. : : :. ... : :
CCDS72 PSREPPLADNLYDEDDDDEGEEEEEAAAAAIGYRDNLLFGDEIITNGFHSCESDEEDRAS
110 120 130 140 150 160
70 80 90 100 110
pF1KE9 PLQRP---PRPEV-PRAFRRQ-------PRAAAPSFFFSSIKGGR-RSISFSVGASSVVG
. :::.. : .: .: ::. ... .: . .... . ....
CCDS72 HASSSDWTPRPRIGPYTFVQQHLMIGTDPRTILKDLLPETIPPPELDDMTLWQIVINILS
170 180 190 200 210 220
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SGGSSDKGKL--SLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQY
. : : ...:...:.. :....:..:::.:. ::::::: .:.:. :
CCDS72 EPPKRKKRKDINTIEDAVKLLQ--ECKKIIVLTGAGVSVSCGIPDFRSR-DGIYARLAVD
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220
pF1KE9 --DLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQN
::: :.:.:.. .: ..:.::: .:::.:::...:.. : :. : .: ::: ::::
CCDS72 FPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQN
290 300 310 320 330 340
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 IDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTG----
:: ::.:.:: ..... ::.::.:.: .:. : .:.:.. . ::::: : .
CCDS72 IDTLEQVAGI--QRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPL
350 360 370 380 390 400
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 -VVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLI
..::.:::::: ::..: . : .:::...:.::.:.: : . .. ::..::
CCDS72 AIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILI
410 420 430 440 450 460
350 360 370 380 390
pF1KE9 NRDLVGPLAWHPRSR-DVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
::. :: :. . :: ::: .. : . ::
CCDS72 NRE---PL---PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPVKLSEITEKPPRTQ
470 480 490 500 510
CCDS72 KELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEK
520 530 540 550 560 570
>>CCDS44412.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (452 aa)
initn: 525 init1: 229 opt: 536 Z-score: 534.9 bits: 108.0 E(32554): 1.8e-23
Smith-Waterman score: 536; 41.1% identity (69.1% similar) in 207 aa overlap (179-378:1-199)
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 STPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNV
.:.. .: ..:.::: .:::.:::...:..
CCDS44 MFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSL
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 THYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDI
: :. : .: ::: :::::: ::.:.:: ..... ::.::.:.: .:. : .
CCDS44 CHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGI--QRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAV
40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 RADVMADRVPRCPVCTG-----VVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSL
:.:.. . ::::: : . ..::.:::::: ::..: . : .:::...:.::
CCDS44 RGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSL
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 EVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLAWHPRSR-DVAQLGDVVHGVESLVELLGWTE
.:.: : . .. ::..::::. :: :. . :: ::: .. : . ::
CCDS44 KVRPVALIPSSIPHEVPQILINRE---PL---PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEY
150 160 170 180 190 200
390
pF1KE9 EMRDLVQRETGKLDGPDK
CCDS44 AKLCCNPVKLSEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLD
210 220 230 240 250 260
>>CCDS81469.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (444 aa)
initn: 451 init1: 155 opt: 462 Z-score: 462.0 bits: 94.5 E(32554): 2.1e-19
Smith-Waterman score: 462; 41.0% identity (67.6% similar) in 188 aa overlap (198-378:12-191)
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYT
:.:::...:.. : :. : .: ::: ::
CCDS81 MCLCSGRKTILEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYT
10 20 30 40
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 QNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTG--
:::: ::.:.:: ..... ::.::.:.: .:. : .:.:.. . ::::: : .
CCDS81 QNIDTLEQVAGI--QRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADE
50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 ---VVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRL
..::.:::::: ::..: . : .:::...:.::.:.: : . .. ::..
CCDS81 PLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQI
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390
pF1KE9 LINRDLVGPLAWHPRSR-DVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
::::. :: :. . :: ::: .. : . ::
CCDS81 LINRE---PL---PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPVKLSEITEKPPR
160 170 180 190 200 210
CCDS81 TQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCME
220 230 240 250 260 270
399 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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