Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9571
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9571, 408 aa
1>>>pF1KE9571 408 - 408 aa - 408 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1491+/-0.000735; mu= 16.2382+/- 0.045
mean_var=183.4454+/-58.732, 0's: 0 Z-trim(114.7): 243 B-trim: 1653 in 2/49
Lambda= 0.094694
statistics sampled from 14660 (15224) to 14660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16
Scan time: 3.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 2812 396.2 3e-110
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 886 133.1 5.3e-31
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 732 112.0 1e-24
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 677 104.5 2e-22
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 654 101.5 1.9e-21
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 645 100.3 4.8e-21
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 562 88.9 1.1e-17
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 544 86.4 6e-17
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 477 77.1 3e-14
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 477 77.2 3.1e-14
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 472 76.5 5.3e-14
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 471 76.3 5.4e-14
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 464 75.4 1.1e-13
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 464 75.5 1.2e-13
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 459 74.7 1.7e-13
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 458 74.6 2.1e-13
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 448 73.3 5.4e-13
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 443 72.6 8.6e-13
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 440 72.0 9.8e-13
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 440 72.1 1e-12
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 440 72.1 1e-12
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 440 72.1 1e-12
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 440 72.1 1.1e-12
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 440 72.1 1.1e-12
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 422 69.7 6.2e-12
CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 ( 445) 409 67.9 2.1e-11
CCDS53867.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 387) 403 67.0 3.4e-11
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 399 66.4 4.6e-11
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 399 66.5 5.3e-11
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 399 66.6 5.5e-11
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 399 66.6 5.6e-11
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 399 66.6 5.6e-11
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 397 66.2 6.2e-11
>>CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 (408 aa)
initn: 2812 init1: 2812 opt: 2812 Z-score: 2092.8 bits: 396.2 E(32554): 3e-110
Smith-Waterman score: 2812; 100.0% identity (100.0% similar) in 408 aa overlap (1-408:1-408)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAPWPHENSSLAPWPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIV
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CCDS60 MAPWPHENSSLAPWPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 FTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRRLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE9 CRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
370 380 390 400
>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 (477 aa)
initn: 829 init1: 625 opt: 886 Z-score: 670.1 bits: 133.1 E(32554): 5.3e-31
Smith-Waterman score: 1283; 52.5% identity (69.6% similar) in 425 aa overlap (2-394:10-424)
10 20 30
pF1KE9 MAPWPHENSSLAPWPDLPT-----LAPNTANTSGLPGV---P------WEAA
: : . :: :: :: . :.: . .: :: . : : :.
CCDS75 MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 LAGALLALAVLATVGGNLLVIVAIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLA
. : :.:: :: :.::.::::::: ::::::.::.:. :::.::::::::::: .::..
CCDS75 M-GLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIV
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LTGHWPLGATGCELWTSVDVLCVTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAV
. :.: :. ::::::::::::::::::::..:.:::::.:.:.:: .:.:. :: :
CCDS75 VWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 VLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRVGADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLL
::..:: ::: ::. .:::. .: ::.::...:.:: :..: :.. :: ::::.::
CCDS75 CTVWAISALVSFLPILMHWWRAESD-EARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLC
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 VMLFVYARVFVVATRQLRLLRGELGRF-PPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVP----
.: ::: ::: : .:.. . . :: ::.:: : .::: ::: : :
CCDS75 IMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPARPPSPSPSPVPAP----APPPGPPRPAA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE9 -------ACGR----RPARLLPLREHRALCTLGLIMGTFTLCWLPFFLANVLRALGGPSL
: :: ::.::. :::..:: :::.:::.:::::::::::::..:. :
CCDS75 AAATAPLANGRAGKRRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRE-L
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 VPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRRLLCRCGRRLPPEPCAAA--RPALF
:: :. .::::::::::::.:::::::::.::. ::: :.:: . :. ::
CCDS75 VPDRLFVFFNWLGYANSAFNPIIYCRSPDFRKAFQGLLC-CARRAARRRHATHGDRPR--
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KE9 PSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
:: : . : .:
CCDS75 ASGCLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPG
420 430 440 450 460 470
>>CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 (413 aa)
initn: 1068 init1: 533 opt: 732 Z-score: 557.0 bits: 112.0 E(32554): 1e-24
Smith-Waterman score: 1048; 48.2% identity (72.0% similar) in 357 aa overlap (5-361:4-341)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAPWPHENSSLAPWPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIV
: ..:.. :. . ::. :. : : ... : ...: ::: : ::.:::.
CCDS42 MGQPGNGSAFLLAPN-GSHAPDHDVTQERDEV-WVVGM-GIVMSLIVLAIVFGNVLVIT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLC
::: ::::.:: :.:::: ::::::: ::: .:. : : .: ::.:::.::::
CCDS42 AIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRV
:::::::::..:::::.:.:.:..: .:.:: ::. ...::.::. .:: ::. .:.:.
CCDS42 VTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRG
. :: :..: :: : .:. :.. :: ::::.::..:.:::.::: : :::. .
CCDS42 -THQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGT
::: . .:. . .: . : : . . :.::.:: :::.::::
CCDS42 SEGRFHVQ--------NLSQVE------QDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGT
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRRLL
:::::::::..:..... .:. ... :::.::.::.::::::::::::: ::..::
CCDS42 FTLCWLPFFIVNIVHVIQD-NLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400
pF1KE9 CRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
:
CCDS42 CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNID
350 360 370 380 390 400
>>CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 (446 aa)
initn: 476 init1: 164 opt: 677 Z-score: 516.1 bits: 104.5 E(32554): 2e-22
Smith-Waterman score: 677; 33.2% identity (62.9% similar) in 367 aa overlap (39-395:25-378)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 SSLAPWPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIVAIAWTPRL
:.. .:.: .:.:. :: :: .:. .:
CCDS43 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QT-MTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLCVTASIET
.. .:: :: :::..::....::.: :. ..: ::.:. :..:.. :..: :::: .
CCDS43 RSKVTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGSF-CNIWVAFDIMCSTASILN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRVG----AD
::...:::: :...:.:: .: . : . ..:..:. .:: :.. .: .. .:
CCDS43 LCVISVDRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRGELG
..: . : . . :.. :: .:::.:. .:. .:.:.. .: .:.: . . :
CCDS43 GNATSLAETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQKQIRRI-AALE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGTFTL
: .. . . :: :. ::. .. :: ..: ::..:::.:.
CCDS43 R-AAVHAKNCQTTTGNGKPV-ECSQPES-------SFKMSFKRETKVLKTLSVIMGVFVC
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE9 CWLPFFLANVLRALGG-----PSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRR
::::::. : . . : : . . .: .. :.:.:::..::.:: . :::.::
CCDS43 CWLPFFILNCILPFCGSGETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYAFNADFRKAFST
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE9 LLCRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
:: : : : : .. .:. : :: .::
CCDS43 LLG-CYRLCPATNNAIETVSINNNGA-AMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDL
350 360 370 380 390 400
CCDS43 KKEEAAGIARPLEKLSPALSVILDYDTDVSLEKIQPITQNGQHPT
410 420 430 440
>>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 (520 aa)
initn: 672 init1: 390 opt: 654 Z-score: 498.4 bits: 101.5 E(32554): 1.9e-21
Smith-Waterman score: 745; 37.2% identity (66.5% similar) in 376 aa overlap (6-366:9-373)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MAPWPHENSSLAPWPDLPT---LAPN-TANTSGLPGVPWEAALA-GALLALAVLATV
:..:. : : .: . .:: :...: :: . :.. : .:. .: ..
CCDS43 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 GGNLLVIVAIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCEL
::.:::...: . .:.: :: :...:: :::.... :.: .:.: . :.: :: :..
CCDS43 VGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 WTSVDVLCVTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAP
:..::::: :::: .:::...:::..: :.: .:::.: : :.. :::.:...:..:
CCDS43 WAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISIGP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 IMSQWWRVGADAEAQRCHSNPRCCAFASNMP-YVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVA
... :. : . ..: ... : :.:.:: :::.:: :.: .: ::..::
CCDS43 LLG--WKEPAPNDDKECG--------VTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 TRQLRLLR-GELGRFP--PEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPL-RE
: . :. : . .. : . :... ... . .: . ..:. . ::
CCDS43 KRTTKNLEAGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSS-TKAKGHNPRSSIAVKLFKFSRE
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 HRALCTLGLIMGTFTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIY-
..: :::...: : :::::::.: : .: . : .: .. :::: :: .::.::
CCDS43 KKAAKTLGIVVGMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYP
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 CRSPDFRSAFRRLL-CRC---GRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDG
: : .:. :: :.: :.: :::
CCDS43 CSSKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDD
350 360 370 380 390 400
>>CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 (572 aa)
initn: 693 init1: 414 opt: 645 Z-score: 491.3 bits: 100.3 E(32554): 4.8e-21
Smith-Waterman score: 738; 37.7% identity (64.9% similar) in 382 aa overlap (7-371:64-429)
10 20 30
pF1KE9 MAPWPHENSSLAPWPDLPTLAPNTANTSGLPG--VP
.: : : : . .. .:... : :
CCDS13 GAAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVS
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 WEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIVAIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPA
... .:..:: .: .:.::::::...: . .:::.:: :...::.:::... :.: .
CCDS13 AQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 ATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLCVTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCA
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CCDS13 ATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKA
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 RTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRVGADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFY
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CCDS13 AAILALLWVVALVVSVGPLLG--WK-------EPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFY
220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 LPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRGELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPA
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CCDS13 LPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKR----ERGKASEVVLRIHCRGAATGADG--A
270 280 290 300 310
280 290 300 310 320
pF1KE9 CGRRPA-----------RLLPL-REHRALCTLGLIMGTFTLCWLPFFLANVLRALGGPSL
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CCDS13 HGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLF-PQL
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370
pF1KE9 VPGPA-FLALNWLGYANSAFNPLIY-CRSPDFRSAFRRLL-CRCGRRLPPEPCAAARPAL
:. . : .. :::: :: ::::: : : .:. :: ::: :.: :: .:
CCDS13 KPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQCRRRRRRRPLWRVYGHH
380 390 400 410 420 430
380 390 400
pF1KE9 FPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
CCDS13 WRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREW
440 450 460 470 480 490
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10 20 30 40
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:.:. . : : : :. :....
CCDS94 DFNSGEANTSDAFNWTVDSENRTNLSCEGCLSPSCLSLLHLQEKNWSALLT----AVVII
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50 60 70 80 90 100
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CCDS94 LTIAGNILVIMAVSLEKKLQNATNYFLMSLAIADMLLGFLVMPVSMLTILYGYRWPLPSK
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110 120 130 140 150 160
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CCDS94 LCAVWIYLDVLFSTASIMHLCAISLDRYVAIQNPIHHSRFNSRTKAFLKIIAVWTISVGI
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170 180 190 200 210 220
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CCDS94 SM-PI--PVFGLQDDSKVFKEGS----CLLADDN-FVLIGSFVSFFIPLTIMVITYFLTI
210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VVATRQLRLLRGELGRFPPEESPP-APSRSLAPAPV-GTCAPPEGVPACGRRPARLLPLR
.. : ..:: : :. ::. . : ::: . .
CCDS94 KSLQKEATLCVSDLGTRAKLASFSFLPQSSLSSEKLFQRSIHREPGSYTGRRTMQSIS-N
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 EHRALCTLGLIMGTFTLCWLPFFLANVLRALGGPSL---VPGPAFLALNWLGYANSAFNP
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CCDS94 EQKACKVLGIVFFLFVVMWCPFFITNIMAVICKESCNEDVIGALLNVFVWIGYLSSAVNP
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 LIYCR-SPDFRSAFRRLLCRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDG
:.: . .:::: : . .: . .: .. . .:: . .: .. :.
CCDS94 LVYTLFNKTYRSAFSRYI-QCQYKENKKPLQL----ILVNTIPALAYKSSQLQMGQKKNS
380 390 400 410 420 430
pF1KE9 ASWGVS
CCDS94 KQDAKTTDNDCSMVALGKQHSEEASKDNSDGVNEKVSCV
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10 20 30 40
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CCDS14 MVNLRNAVHSFLVHLIGLLVW-QSDISVSPVAAIVTDIFNTSDGGRFKFPDGVQNWPALS
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... .. :.:::.:::.:.. .:.. :: :. ::: ::...::::.: . :
CCDS14 ---IVIIIIMTIGGNILVIMAVSMEKKLHNATNYFLMSLAIADMLVGLLVMPLSLLAILY
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pF1KE9 GH-WPLGATGCELWTSVDVLCVTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVV
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CCDS14 DYVWPLPRYLCPVWISLDVLFSTASIMHLCAISLDRYVAIRNPIEHSRFNSRTKAIMKIA
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160 170 180 190 200 210
pF1KE9 LVWVVSAAVSFAPIMSQWWRVGADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLV
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CCDS14 IVWAISIGVS-VPIPV----IGLRDEEKVFVNNTTCVLNDPN--FVLIGSFVAFFIPLTI
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220 230 240 250 260 270
pF1KE9 MLFVYARVFVVATRQ-LRLLRGELGRFPPEESPP---APSRSLAPAPVGTCAPPEGVPAC
:...: .. : :: : ::.:. . :: : .:. : .. : . :
CCDS14 MVITYCLTIYVLRRQALMLLHGHTEE-PPGLSLDFLKCCKRNTAEEE-NSANPNQDQNAR
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280 290 300 310 320
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:. . : :..: .::... .: . : :::..:.: .: :
CCDS14 RRKKKERRPRGTMQAINNERKASKVLGIVFFVFLIMWCPFFITNILSVLCEKSCNQKLME
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330 340 350 360 370 380
pF1KE9 LALN---WLGYANSAFNPLIYCR-SPDFRSAFRRLLCRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGV
:: :.::. :..:::.: . .: :: : ::. .. .:
CCDS14 KLLNVFVWIGYVCSGINPLVYTLFNKIYRRAFSNYL-RCNYKVEKKPPVRQIPRVAATAL
350 360 370 380 390 400
390 400
pF1KE9 PAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
CCDS14 SGRELNVNIYRHTNEPVIEKASDNEPGIEMQVENLELPVNPSSVVSERISSV
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pF1KE9 MAPWPHENSSLAPWPDLPTLAPN-TANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVI
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pF1KE9 VAIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVL
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CCDS43 LAVGLNRRLRNLTNCFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVM
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:::: .: ...::: :: .:::: .::: . ..::.::.: ..:: : :
CCDS43 LCTASILNLFMISLDRYCAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGW--
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pF1KE9 VGADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLR
.. :... . . : : : :... :.::::::.: ..: :.: :: : .
CCDS43 -NSRNETSKGNHTTSKCKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAK---
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pF1KE9 GELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMG
:. : : . .:::.: ::. .::
CCDS43 ----RINHISSWKAAT-----------------------------IREHKATVTLAAVMG
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pF1KE9 TFTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCR-SPDFRSAFRR
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CCDS43 AFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQQ
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pF1KE9 LLCRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
:.: : :: . . . .: .. .:.. .::
CCDS43 LFC-C--RLANR--NSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWSGTEVTAPQGA
310 320 330 340 350
CCDS43 TDR
>>CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (397 aa)
initn: 646 init1: 366 opt: 477 Z-score: 369.0 bits: 77.2 E(32554): 3.1e-14
Smith-Waterman score: 637; 33.9% identity (60.8% similar) in 378 aa overlap (20-395:1-333)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MAPWPHENSSLAPWPDLPTLAPN-TANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVI
.::: ::.. : .. . ... ..::. .: ::.::..:
CCDS47 MAPNGTASSFCLDSTACKITIT-VVLAVLILITVAGNVVVC
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VAIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVL
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CCDS47 LAVGLNRRLRNLTNCFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVM
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pF1KE9 CVTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWR
:::: .: ...::: :: .:::: .::: . ..::.::.: ..:: : :
CCDS47 LCTASILNLFMISLDRYCAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGW--
110 120 130 140 150
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pF1KE9 VGADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLR
.. :... . . : : : :... :.::::::.: ..: :.: :: : .
CCDS47 -NSRNETSKGNHTTSKCKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAK---
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 GELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMG
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CCDS47 ----RINHISSWKAAT-----------------------------IREHKATVTLAAVMG
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300 310 320 330 340 350
pF1KE9 TFTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCR-SPDFRSAFRR
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CCDS47 AFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQQ
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pF1KE9 LLCRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
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CCDS47 LFC-C--RLANR--NSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWSGTEVTAPQGA
310 320 330 340 350
CCDS47 TDRPWLCLPECWSVELTHSFIHLFIHSFANIHPIPTTCQEL
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408 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]