Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9566
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9566, 353 aa
1>>>pF1KE9566 353 - 353 aa - 353 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5876+/-0.00109; mu= 14.8080+/- 0.064
mean_var=187.3064+/-75.102, 0's: 0 Z-trim(104.0): 186 B-trim: 1009 in 2/46
Lambda= 0.093713
statistics sampled from 7350 (7674) to 7350 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 2349 331.0 9.3e-91
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 1242 181.3 1.1e-45
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 1119 164.7 1.1e-40
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 724 111.3 1.3e-24
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 714 110.0 3.4e-24
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 613 96.4 4.5e-20
CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 552 88.1 1.3e-17
CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 535 85.7 6.3e-17
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 466 76.4 3.9e-14
CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 ( 334) 437 72.5 5.9e-13
CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 362) 426 71.0 1.7e-12
CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 377) 426 71.1 1.8e-12
>>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 (353 aa)
initn: 2349 init1: 2349 opt: 2349 Z-score: 1742.8 bits: 331.0 E(32554): 9.3e-91
Smith-Waterman score: 2349; 100.0% identity (100.0% similar) in 353 aa overlap (1-353:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRK
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CCDS70 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 FHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASLTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 FHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASLTNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACSSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACSSLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKLMKT
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CCDS70 PIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKLMKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLALLNSVVNPIIYSYKDEDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLALLNSVVNPIIYSYKDEDM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 YGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
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CCDS70 YGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
310 320 330 340 350
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 984 init1: 984 opt: 1242 Z-score: 933.9 bits: 181.3 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1242; 51.9% identity (80.8% similar) in 339 aa overlap (1-329:19-354)
10 20 30
pF1KE9 MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
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CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGL--GIT
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 FCLFIFFSNSLVIAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTV
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CCDS67 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 NRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFM
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CCDS67 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 GAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNV
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CCDS67 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 LSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFL
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CCDS67 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
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CCDS67 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KE9 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
CCDS67 SNDHSVV
360
>>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 1063 init1: 1030 opt: 1119 Z-score: 844.1 bits: 164.7 E(32554): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1119; 48.0% identity (78.7% similar) in 333 aa overlap (1-333:4-335)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIK
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CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWR-PKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIAS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASL
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CCDS12 NRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACS
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CCDS12 ATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKL
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CCDS12 RMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLSL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 MKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLALLNSVVNPIIYSYKD
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CCDS12 VKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYSCRD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 EDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
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CCDS12 AEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL
300 310 320 330 340 350
>>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa)
initn: 637 init1: 480 opt: 724 Z-score: 555.2 bits: 111.3 E(32554): 1.3e-24
Smith-Waterman score: 724; 37.1% identity (68.7% similar) in 313 aa overlap (27-335:38-341)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVI
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CCDS66 RLQPVRGNETLREHYQYVGKLAGRLKEASEGSTLTTVLFL--VICSFIVLENLMVLIAIW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 KNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTAS
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CCDS66 KNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLSPTVWFLREGSMFVALGAS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISAC
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CCDS66 TCSLLAIAIERHLTMIKMRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFTLGALPILGWNCLHNLPDC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVV-YLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPM
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CCDS66 STILPLYSKKYIAF-CISIFTAILVTIVILYARIYFLVKSSSRKVANHNN---SERS--M
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 KLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCR--QCGVQHVKRWFLLLALLNSVVNPIIY
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CCDS66 ALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLID-VACRVQACPILFKAQWFIVLAVLNSAMNPVIY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 SYKDEDMYGTMKKMIC-CFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKST
. ...: .. ...: :. . : :. ::: ..:
CCDS66 TLASKEMRRAFFRLVCNCLVRGRGARASPIQPALDPSRSKSSSSNNSSHSPKVKEDLPHT
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 S
CCDS66 APSSCIMDKNAALQNGIFCN
360 370
>>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 596 init1: 505 opt: 714 Z-score: 547.9 bits: 110.0 E(32554): 3.4e-24
Smith-Waterman score: 714; 35.7% identity (73.1% similar) in 294 aa overlap (21-310:38-329)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSL
..: .. ::. :. . ..: ::.. : .
CCDS77 LVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFI--LICCFIILENIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VIAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLD
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CCDS77 VLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLREGSMF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SSLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCL
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CCDS77 VALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPIMGWNCI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 CNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISR
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CCDS77 SALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKAS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE9 RRTP--MKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLD-GLNCRQCGVQHVKRWFLLLALLNSV
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CCDS77 RSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 VNPIIYSYKDEDMY-GTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGA
.:::::. ...: . .. : ::
CCDS77 TNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDNSSHPQKDE
310 320 330 340 350 360
>>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa)
initn: 590 init1: 387 opt: 613 Z-score: 473.9 bits: 96.4 E(32554): 4.5e-20
Smith-Waterman score: 613; 33.7% identity (66.3% similar) in 303 aa overlap (27-321:35-333)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVI
: . :.:... : :: . : :. ..
CCDS12 LLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVCLAV--CAFIVLENLAVLLVLG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 KNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTAS
.. .:: :.. ::..:. .:..:: ::. .. .::.. :. :: :.: . .::::
CCDS12 RHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSPALWFAREGGVFVALTAS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISAC
. .::.::.:: ... : .. :. . .:......: .:.:::::: ..::
CCDS12 VLSLLAIALERSLTMARRGPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLLGLLPALGWNCLGRLDAC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLS--PHTSGSISRR--R
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CCDS12 STVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARRLPARPGTAGTTSTRARR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE9 TP--MKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNC--RQCGVQHVKRWFLLLALLNSVV
: . :..:. .:: :::.:: : ...:::: . : : : : :: ::. ::..
CCDS12 KPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLD-VACPARTCPVLLQADPFLGLAMANSLL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 NPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVC
:::::. ..:. .. ...:: .... : ::
CCDS12 NPIIYTLTNRDLRHALLRLVCC-GRHSCGRDPSGSQQSASAAEASGGLRRCLPPGLDGSF
310 320 330 340 350 360
350
pF1KE9 NKSTS
CCDS12 SGSERSSPQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD
370 380 390
>>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa)
initn: 559 init1: 187 opt: 552 Z-score: 429.5 bits: 88.1 E(32554): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 552; 35.5% identity (67.4% similar) in 273 aa overlap (41-310:58-324)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 DFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRKFHFPFYYLLA
:: .. : ::.::. .. . . :: :.
CCDS12 HYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLVVL-ENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLV
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 NLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMS
:.. .:...: ::. .. .: . :. .::::.::: ..:.:: .:: : :: .
CCDS12 NITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFAT
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180
pF1KE9 IMRMRVHSNLTK-KRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLV
..: ..:. :: .:: .: : : .: ..: .: ::::::: .. :::: :.::. :..
CCDS12 MVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYIL
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 FWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFV
: :. : .... . .: . : ... : . . . :: .:.:::. .: ::.
CCDS12 F----CLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQA-SGQKAPRPAARRKARRLLKTVLMILLAFL
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVK--RWFLLLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKM
::: : . .:: : .. . .... :.: ::.:::.:::::::...... .. ..
CCDS12 VCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSF
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350
pF1KE9 ICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
.::
CCDS12 LCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSV
330 340 350 360 370 380
>>CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 (353 aa)
initn: 601 init1: 436 opt: 535 Z-score: 417.4 bits: 85.7 E(32554): 6.3e-17
Smith-Waterman score: 639; 33.0% identity (67.6% similar) in 315 aa overlap (1-311:9-306)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNECHYDKHMDFFYNRSNT-DTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLV
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CCDS12 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILC-----CA-IVVENLLV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 IAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDS
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CCDS12 LIAVARNSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLC
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CCDS12 TLSASVFSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 NISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRK-TNVLSPHTSGSISR
.. :::.. :.:.. :.. .. . .: .:..:.::: :. . ... .:.:
CCDS12 HLEACSTVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAAPQT------
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE9 RRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNC--RQCGVQHVKRWFLLLALLNSVV
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CCDS12 ----LALLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLD-YACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 NPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVC
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CCDS12 NPVIYTWRSRDLRREVLRPLQCWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTS
290 300 310 320 330 340
>>CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 (330 aa)
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Smith-Waterman score: 466; 31.9% identity (63.5% similar) in 307 aa overlap (32-327:45-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 NECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCV-GTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRK
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70 80 90 100 110
pF1KE9 FHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVF---LMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASL
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CCDS30 FRAPMFLLVGSLAVADLLAGLGLVLHFAAVFCIGSAEMSLVL------VGVLAMAFTASI
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120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TNLLVIAVERHMSIMR-MRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISAC
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CCDS30 GSLLAITVDRYLSLYNALTYYSETTVTRTYVMLALVWGGALGLGLLPVLAWNCLDGLTTC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTN--VLSPHTSGSISRRRTP
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CCDS30 GVVYPL-SKNHLVVLAIAFFMVFGIMLQLYAQICRIVCRHAQQIALQRHLLPA-SHYVAT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 MKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLALL----NSVVNP
: . :. .:::::..:: : : :: : : . :.:: ::..::
CCDS30 RKGIATLAVVLGAFAACWLPFTVYCLL--------GDAHSPPLYTYLTLLPATYNSMINP
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 IIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNK
:::.....:. .. . :: :. . : :: :: :
CCDS30 IIYAFRNQDVQKVLWAVCCCCSSSKIPFR-SRSPSDV
300 310 320 330
pF1KE9 STS
>>CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 (334 aa)
initn: 392 init1: 193 opt: 437 Z-score: 346.0 bits: 72.5 E(32554): 5.9e-13
Smith-Waterman score: 437; 28.6% identity (63.5% similar) in 304 aa overlap (32-327:49-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 NECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCV-GTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRK
::::. ::. : :..:. ...: .
CCDS93 AAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTL----ISCENAIVVLIIFHNPS
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70 80 90 100 110
pF1KE9 FHFPFYYLLANLAAADFFAGIA----YVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTAS
.. :.. :...:: ::..:::. .:: .. . ..: .:. ::. .:..::
CCDS93 LRAPMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAYLLQSEATKLVTI-------GLIVASFSAS
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LTNLLVIAVERHMSIMR-MRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISA
. .::.:.:.:..:.. . ::. : . ......:. .: .: .:..::::: . :.
CCDS93 VCSLLAITVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWNCLRDEST
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 CSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLS-PHTSGSISRRRTP
:: . :. ... .. .:: :. : .:. .:..: : :... .. : . :. :
CCDS93 CSVVRPL-TKNNAAILSVSFLFMFALMLQLYIQICKIVMRHAHQIALQHHFLATSHYVTT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 MKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLL-ALLNSVVNPIIY
: ..:. .::.:..:: : . :. . . . :: : ::..::.::
CCDS93 RKGVSTLAIILGTFAACWMPFTLYSLIADYT-----YPSIYTYATLLPATYNSIINPVIY
250 260 270 280 290 300
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pF1KE9 SYKDEDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
....... .. .::: . . .: :: :
CCDS93 AFRNQEIQKALC-LICCGCIPSSLAQRARSPSDV
310 320 330
353 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 19:14:13 2016 done: Sun Nov 6 19:14:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]