Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9563
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9563, 479 aa
1>>>pF1KE9563 479 - 479 aa - 479 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1802+/-0.000896; mu= 19.1968+/- 0.054
mean_var=125.8901+/-41.803, 0's: 0 Z-trim(107.9): 303 B-trim: 1171 in 2/48
Lambda= 0.114308
statistics sampled from 9327 (9857) to 9327 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 3247 547.4 1.2e-155
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 2918 493.1 2.5e-139
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 2916 492.7 3.1e-139
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 797 143.4 5.5e-34
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 782 140.8 2.7e-33
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 782 140.9 2.8e-33
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 782 140.9 2.9e-33
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 782 140.9 2.9e-33
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 753 136.2 8.9e-32
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 709 128.7 1e-29
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 685 124.7 1.6e-28
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 626 115.2 1.6e-25
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 608 112.1 1.2e-24
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 597 110.3 4.2e-24
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 541 101.1 2.5e-21
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 535 100.0 4.5e-21
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 523 98.0 1.8e-20
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 523 98.1 1.8e-20
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 517 97.0 3.5e-20
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 506 95.3 1.3e-19
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 506 95.3 1.4e-19
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 476 90.4 4.4e-18
CCDS53867.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 387) 475 90.1 4.4e-18
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 469 89.1 8.5e-18
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 469 89.1 8.7e-18
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 469 89.1 8.8e-18
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 469 89.1 8.8e-18
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 469 89.2 9.1e-18
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 469 89.2 9.4e-18
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 467 88.8 1.1e-17
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 467 88.8 1.1e-17
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 466 88.7 1.3e-17
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 456 87.1 4.3e-17
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 ( 419) 454 86.7 5.1e-17
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 529) 452 86.5 7.4e-17
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 546) 452 86.5 7.6e-17
CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 549) 452 86.5 7.6e-17
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 448 85.8 1.1e-16
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 444 85.0 1.5e-16
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 444 85.0 1.6e-16
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 424 81.8 1.7e-15
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 416 80.7 4.8e-15
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 404 78.6 1.8e-14
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 403 78.4 1.9e-14
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 396 77.2 4.2e-14
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 396 77.2 4.2e-14
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 389 76.1 9.1e-14
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 377 74.1 3.7e-13
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 374 73.4 4.3e-13
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 374 73.6 5.1e-13
>>CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (479 aa)
initn: 3247 init1: 3247 opt: 3247 Z-score: 2907.6 bits: 547.4 E(32554): 1.2e-155
Smith-Waterman score: 3247; 100.0% identity (100.0% similar) in 479 aa overlap (1-479:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 DAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 YLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE9 LAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLADKMLTTVEKKVMIHD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLADKMLTTVEKKVMIHD
430 440 450 460 470
>>CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (445 aa)
initn: 2940 init1: 2917 opt: 2918 Z-score: 2614.7 bits: 493.1 E(32554): 2.5e-139
Smith-Waterman score: 2918; 98.2% identity (98.9% similar) in 441 aa overlap (1-438:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 DAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 YLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE9 LAERPERPEFVLRA---CTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLADKMLTTVEKKVMI
::::::::::::. : ..
CCDS74 LAERPERPEFVLQNADYCRKKGHDS
430 440
>>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (432 aa)
initn: 2916 init1: 2916 opt: 2916 Z-score: 2613.1 bits: 492.7 E(32554): 3.1e-139
Smith-Waterman score: 2916; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 DAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 YLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE9 LAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLADKMLTTVEKKVMIHD
::::::::::::
CCDS74 LAERPERPEFVL
430
>>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 (520 aa)
initn: 626 init1: 268 opt: 797 Z-score: 723.7 bits: 143.4 E(32554): 5.5e-34
Smith-Waterman score: 797; 36.4% identity (69.3% similar) in 352 aa overlap (64-409:28-373)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 DGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITL
:...:. . . .. . .: .: . :
CCDS43 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFIL
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHF
..:.:: ::..:: ..:: :.::.::.::.::: .. .:.:: .. ...: :..:..
CCDS43 FAIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLG-YWVLGRI
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 FCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASI
::... :.::.::::::..::.::::::.:. : ::. . . .::::.::. :
CCDS43 FCDIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVI
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 TLPPLFGWAQNV-NDDKVCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAK
.. ::.:: . . :::: : .... :...:. .::::..:.: :: ..: .:.... :
CCDS43 SIGPLLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTT-K
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320
pF1KE9 HKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRLLKHE-RKNISI----FKREQKAAT
. : . : .. :. .. .. :. . .. :. :..:.. :.::.:::
CCDS43 NLEAGVMK-EMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAK
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 TLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFF
::::.:: : .::::::. : :. : : : .. .:::: :: .::.::
CCDS43 TLGIVVGMFILCWLPFFI---ALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCS
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 NRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRP
..... .. .: :: :. .:.
CCDS43 SKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSG
360 370 380 390 400 410
>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (429 aa)
initn: 644 init1: 324 opt: 782 Z-score: 711.2 bits: 140.8 E(32554): 2.7e-33
Smith-Waterman score: 782; 35.6% identity (62.6% similar) in 396 aa overlap (66-452:10-397)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 GADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEK-VVIGSILTLITLL
..:.: . . : ...: :: . :.
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILF
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 TIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFF
. :: ::..:: ..:.. ..: ::.::.::: .. .:.:: .. ...: : ::. :
CCDS60 GVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLG-YWAFGRVF
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
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.. .....: :: :. . : : : .: . .: .. . . .:... : :
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pF1KE9 PPVSVWVLQSPDHHNWLADKMLTTVEKKVMIHD
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CCDS60 DGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARVRSKSFLQVCCCVGPSTPSLDKNHQVPT
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CCDS34 CNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMA--LLCVWALSLV
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.:. .::.::.::.::: ....:.:: :.: . : : ::. ::.:. :.::.::::::
CCDS13 HLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPF-SATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASI
130 140 150 160 170 180
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CCDS13 LSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVPPDER
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: :... ::...:.. .::.::.:.. :: ..: .:: :... : : . : ..
CCDS13 FCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVAR-STTRSLEAGVKRERGKASEVV
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pF1KE9 LNGIVKLQKEVEECANLSRLLK-HE-RKNISI----FKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLP
: . . :. : : : :...:. :.::.::: ::.:.::.:..::.:
CCDS13 LRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFP
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::. :.. : . . : ....:::: :: .::.:: .:... .. ::
CCDS13 FFFVLPLGSLFPQLKPSEG------VFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLL
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pF1KE9 QCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDH
.:: : :.
CCDS13 RCQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGT
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:.: ..: ... :.: : ::. .. :.
CCDS59 SLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLLGFLVAATFAWNLLVLATILRVRT
20 30 40 50 60 70
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... . :..:.:..:. ::. :::. : .: : .: .:. .:...:: ::.::::::
CCDS59 FHRVPHNLVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRRWQLGRRLCQLWIACDVLCCTASIW
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CCDS59 NVTAIALDRYWSITRHMEYTLRTR-KCVSNVMIALTWALSAVISLAPLLFGWGETYSEGS
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CCDS59 EECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYKAAKFRVGSRKTNS---VSPISEAV
190 200 210 220 230 240
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CCDS59 EVKDSAKQPQMVFTVRHATVTFQPEGDTWR-EQKEQRAALMVGILIGVFVLCWIPFFLTE
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CCDS59 LISPL-----CSCDIPAIW-KSIFLWLGYSNSFFNPLIYTAFNKNYNSAFKNFFSRQH
310 320 330 340 350
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]