Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9560
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9560, 385 aa
1>>>pF1KE9560 385 - 385 aa - 385 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8393+/-0.000833; mu= 14.7015+/- 0.050
mean_var=155.9751+/-49.756, 0's: 0 Z-trim(109.9): 286 B-trim: 1327 in 2/48
Lambda= 0.102694
statistics sampled from 10618 (11192) to 10618 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 2562 391.8 5.5e-109
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 693 114.8 1.2e-25
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 693 114.9 1.2e-25
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 666 110.9 2e-24
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 615 103.4 4e-22
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 587 99.1 6.4e-21
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 587 99.1 6.4e-21
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 479 83.2 4.3e-16
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 477 82.8 5.1e-16
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 465 81.1 1.7e-15
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 454 79.4 5.5e-15
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 437 76.9 3.2e-14
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 436 76.8 3.4e-14
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 434 76.5 4.2e-14
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 432 76.2 5.2e-14
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 432 76.2 5.4e-14
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 431 76.0 5.5e-14
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 425 75.2 1.2e-13
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 422 74.7 1.5e-13
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 421 74.6 1.7e-13
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 420 74.4 1.8e-13
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 418 74.1 2.1e-13
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 418 74.1 2.2e-13
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 418 74.1 2.3e-13
CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 ( 358) 417 74.0 2.4e-13
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 416 73.8 2.7e-13
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 416 73.8 2.8e-13
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 404 72.0 9.2e-13
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 401 71.6 1.2e-12
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 400 71.4 1.4e-12
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 400 71.5 1.4e-12
CCDS12459.1 FFAR3 gene_id:2865|Hs108|chr19 ( 346) 399 71.3 1.5e-12
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 395 70.7 2.4e-12
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 393 70.4 2.9e-12
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 392 70.3 3.2e-12
CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 ( 346) 390 69.9 3.8e-12
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 389 69.9 4.5e-12
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 389 69.9 4.6e-12
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 389 69.9 4.6e-12
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 388 69.6 4.6e-12
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 389 69.9 4.6e-12
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 389 69.9 4.6e-12
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 389 69.9 4.7e-12
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 389 69.9 4.7e-12
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 389 69.9 4.8e-12
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 389 69.9 4.9e-12
CCDS9491.1 GPR18 gene_id:2841|Hs108|chr13 ( 331) 387 69.5 5.1e-12
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 389 70.0 5.2e-12
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 387 69.5 5.3e-12
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 387 69.6 5.6e-12
>>CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 (385 aa)
initn: 2562 init1: 2562 opt: 2562 Z-score: 2070.1 bits: 391.8 E(32554): 5.5e-109
Smith-Waterman score: 2562; 99.7% identity (100.0% similar) in 385 aa overlap (1-385:1-385)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MWGRLLLWPLVLGFSLSGGTQTPSVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MWGRLLLWPLVLGFSLSGGTQTPSVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LELPDSSRALLLGWVPTRLVPALYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAPRLPSTMLLMNLAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS12 LELPDSSRALLLGWVPTRLVPALYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAPRLPSTMLLMNLAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 ADLLLALALPPRIAYHLRGQRWPFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ADLLLALALPPRIAYHLRGQRWPFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PLRARALRGRRLALGLCMAAWLMAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PLRARALRGRRLALGLCMAAWLMAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 WQPAFTCLALLGCFLPLLAMLLCYGATLHTLAASGRRYGHALRLTAVVLASAVAFFVPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WQPAFTCLALLGCFLPLLAMLLCYGATLHTLAASGRRYGHALRLTAVVLASAVAFFVPSN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LLLLLHYSDPSPSAWGNLYGAYVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLLLLHYSDPSPSAWGNLYGAYVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSP
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE9 GDTVASKASAEGGSRGMGTHSSLLQ
:::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GDTVASKASAEGGSRGMGTHSSLLQ
370 380
>>CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 (352 aa)
initn: 676 init1: 467 opt: 693 Z-score: 574.0 bits: 114.8 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 693; 36.9% identity (69.6% similar) in 293 aa overlap (54-344:48-340)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 SVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDT-LELPDSSRALLLGWVPTRLVPA
: ..: . :.. ... . : . . :.:.::
CCDS58 FRGAPPNSFEEFPFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPA
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 LYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAPRLPSTMLLMNLATADLLLALALPPRIAYHLRGQRW
.: ::.:::.:::...::.: .. . .:.. ::: ::.:. ..:: .::::: :. :
CCDS58 IYLLVFVVGVPANAVTLWMLFFRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNW
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 PFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWL
:::. :: .:. .::.:: :.:::: .:..::::.:::. :.: . :: : .:
CCDS58 VFGEVLCRATTVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWA
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 MAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQ-PAFTCLALLGCFLPLLAML
. ::. . .: . :.. : . :::. ..: .: : ::..: ..:.. ..
CCDS58 TVFLYMLPFFILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLII
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 LCYGATLHTLAASGRRYGHALRLTAVVLASAVAFFVPSNLLLLLHYSDPSPSAWGNLYGA
::.: ..:: : .:. .. . ..:. . :.:::..:..:... . .::
CCDS58 YCYAAIIRTLNAYDHRWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFI
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 YVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHS
:. .: :..::::.:::.:. .:
CCDS58 YLIALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK
320 330 340 350
>>CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 (374 aa)
initn: 676 init1: 467 opt: 693 Z-score: 573.7 bits: 114.9 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 693; 36.9% identity (69.6% similar) in 293 aa overlap (54-344:70-362)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 SVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDT-LELPDSSRALLLGWVPTRLVPA
: ..: . :.. ... . : . . :.:.::
CCDS40 FRGAPPNSFEEFPFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPA
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 LYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAPRLPSTMLLMNLATADLLLALALPPRIAYHLRGQRW
.: ::.:::.:::...::.: .. . .:.. ::: ::.:. ..:: .::::: :. :
CCDS40 IYLLVFVVGVPANAVTLWMLFFRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNW
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 PFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWL
:::. :: .:. .::.:: :.:::: .:..::::.:::. :.: . :: : .:
CCDS40 VFGEVLCRATTVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWA
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 MAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQ-PAFTCLALLGCFLPLLAML
. ::. . .: . :.. : . :::. ..: .: : ::..: ..:.. ..
CCDS40 TVFLYMLPFFILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLII
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 LCYGATLHTLAASGRRYGHALRLTAVVLASAVAFFVPSNLLLLLHYSDPSPSAWGNLYGA
::.: ..:: : .:. .. . ..:. . :.:::..:..:... . .::
CCDS40 YCYAAIIRTLNAYDHRWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFI
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 YVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHS
:. .: :..::::.:::.:. .:
CCDS40 YLIALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK
340 350 360 370
>>CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 (397 aa)
initn: 462 init1: 252 opt: 666 Z-score: 551.8 bits: 110.9 E(32554): 2e-24
Smith-Waterman score: 666; 33.8% identity (64.8% similar) in 358 aa overlap (10-359:16-363)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MWGRLLLWPLVLGFSLSGGTQTPSVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVC
:. ..: :: : : ... : : :.: . :.
CCDS40 MRSPSAAWLLGAAILLAASLSCSGTIQGTSRSSKGRSLIGKVDGTSHVT-------GKGV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 ANDSDTLELPDSSRALLLGWVPTRLVPALYGLVLVVGLPANGLALWV-LATQAPRLPSTM
. .. .. . . : ..: : . : ..: .: .:.:::::.::.:::: : . :...
CCDS40 TVET-VFSVDEFSASVLTGKLTTVFLPIVYTIVFVVGLPSNGMALWVFLFRTKKKHPAVI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LLMNLATADLLLALALPPRIAYHLRGQRWPFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLD
. ::: :::: .. .: .::::..:. : .::: : . . .::.:: :.:... .:..
CCDS40 YMANLALADLLSVIWFPLKIAYHIHGNNWIYGEALCNVLIGFFYGNMYCSILFMTCLSVQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 RYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWLMAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALP
:: ..:.:. ... . .:.:. .: ::. ...:: . .::. . . . :::.::
CCDS40 RYWVIVNPM-GHSRKKANIAIGISLAIWLLILLVTIPLYVVKQTIFIPALNITTCHDVLP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 LDAQASHWQPAFTCLALLGCFL-PLLAMLLCYGATLHTLAASG------RRYGHALRLTA
. .. : ::. : :: : . : .. : .:. .. .:..: .
CCDS40 EQLLVGDMFNYFLSLAI-GVFLFPAFLTASAYVLMIRMLRSSAMDENSEKKRKRAIKLIV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 VVLASAVAFFVPSNLLLLLHYSDPSPSAWGNLYGAYVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAE
.::: . :.::::::..:: . .. ...:. :. .: :::::::.:::.::.:: .
CCDS40 TVLAMYLICFTPSNLLLVVHYFLIKSQGQSHVYALYIVALCLSTLNSCIDPFVYYFVSHD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KE9 FRDKVRAGLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHSSLLQ
:::... .:. ::
CCDS40 FRDHAKNALLCRSVRTVKQMQVSLTSKKHSRKSSSYSSSSTTVKTSY
360 370 380 390
>>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 (425 aa)
initn: 618 init1: 373 opt: 615 Z-score: 510.7 bits: 103.4 E(32554): 4e-22
Smith-Waterman score: 615; 33.6% identity (64.6% similar) in 345 aa overlap (53-384:72-415)
30 40 50 60 70
pF1KE9 PSVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDTLE--LP-----DSSRALLLGWV
: : :. :. :: :.: : .:.
CCDS40 SFLLRNPNDKYEPFWEDEEKNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWL
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 PTRLVPALYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAP-RLPSTMLLMNLATADLLLALALPPRIA
: .::..: :.::.:: : .:. :. . . :... ...:::::.:.. .:: .:.
CCDS40 -TLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKIS
110 120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 YHLRGQRWPFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLAL
:.. :. : :: ::..:::.: .::.:.::....:.::.::.:.:... . : :
CCDS40 YYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRAS
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 GLCMAAWLMAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQPAFTCLALLGCF
:.: : .: : ..:: :..::... . . :::.: ... :. .. . :
CCDS40 FTCLAIWALAIAGVVPLLLKEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFF
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 LPLLAMLLCYGATLHTLAASG----RRYGHALRLTAVVLASAVAFFVPSNLLLLLHYSDP
.::. .:: . .. :..:. . ..:: :.:.:. . : :.:.::. :::
CCDS40 VPLIISTVCYVSIIRCLSSSAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFL
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360
pF1KE9 S-PSAWGNLYGAYVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKAS
: :. : ::. . .:... :.::.::::.:.: . : . : . .: . ..:
CCDS40 SHTSTTEAAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSS
350 360 370 380 390 400
370 380
pF1KE9 AEGGSRGMGTHSSLLQ
.. . : : :: :
CCDS40 GQLMASKMDTCSSNLNNSIYKKLLT
410 420
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50 60 70 80 90 100
pF1KE9 PGQVCANDSDTLELPDSSRALLLGWVPTRLVPALYGLVLVVGLPANGLALWVLATQ-APR
.:..:.:: .:..:.: ..:::: . .::
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110 120 130 140 150 160
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::.....::...::.:: .:: .: :: ..: :: : ..:.:.:..::.:.: ..
CCDS14 SPSVIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVFGVLLCNVVTVAFYANMYSSILTMT
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.:..:.:....:: .. : :: :.. : ..::. . ::. :. . . :
CCDS14 CISVERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLLLTALSPLARTDLTYPVHALGIITC
120 130 140 150 160 170
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:.: . ... : . . .: ..:.. . :: :: :.: : :: . .:
CCDS14 FDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIFILLFLIPFVITVACYTATILKLLRTEEAHGREQRRRA
180 190 200 210 220 230
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CCDS14 VGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAHIV--SRLFYGKSYYHVYKLTLCLSCLNNCLDPFVY
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:..: ::. ..: : .: : ::. .. . ..: ...:
CCDS14 YFASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSARTTSVRSEAGAHPEGMEGATRPGLQ
300 310 320 330 340 350
CCDS14 RQESVF
>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX (359 aa)
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Smith-Waterman score: 587; 34.0% identity (66.3% similar) in 312 aa overlap (80-381:26-335)
50 60 70 80 90 100
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CCDS14 MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYSLVAAVSIPGNLFSLWVLCRRMGPR
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
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::.....::...::.:: .:: .: :: ..: :: : ..:.:.:..::.:.: ..
CCDS14 SPSVIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVFGVLLCNVVTVAFYANMYSSILTMT
60 70 80 90 100 110
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pF1KE9 AVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWLMAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLC
.:..:.:....:: .. : :: :.. : ..::. . ::. :. . . :
CCDS14 CISVERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLLLTALSPLARTDLTYPVHALGIITC
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 HDALP--LDAQASHWQPAFTCLALLGCFLPLLAMLLCYGAT----LHTLAASGR-RYGHA
:.: . ... : . . .: ..:.. . :: :: :.: : :: . .:
CCDS14 FDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIFILLFLIPFVITVACYTATILKLLRTEEAHGREQRRRA
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pF1KE9 LRLTAVVLASAVAFFVPSNLLLLLHYSDPSPSAWG-NLYGAYVPSLALSTLNSCVDPFIY
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CCDS14 VGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAHIV--SRLFYGKSYYHVYKLTLCLSCLNNCLDPFVY
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380
pF1KE9 YYVSAEFRDKVRAGL-FQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHSSLLQ
:..: ::. ..: : .: : ::. .. . ..: ...:
CCDS14 YFASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSARTTSVRSEAGAHPEGMEGATRPGLQ
300 310 320 330 340 350
CCDS14 RQESVF
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
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CCDS21 MSKRSWWAGSRKPPREMLKLSGSDSSQSMNGLEVAPPGLITNFSLATAEQC
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pF1KE9 DSSRALLLGWVPTRLVPALYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAPR-LPSTMLLMNLATADL
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CCDS21 GQETPL-----ENMLFASFYLLDFILALVGNTLALWLFIRDHKSGTPANVFLMHLAVADL
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pF1KE9 LLALALPPRIAYHLRGQRWPFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLR
.:.:: :..::. :..::::: ::::. .: .::.:. .:. .: ::.::.:::..
CCDS21 SCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLFYLNMYASIYFLTCISADRFLAIVHPVK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ARALRGRRLALGLCMAAWLMAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPL-DAQASHWQ
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CCDS21 SLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQTVQTNHT--VVC---LQLYREKASH--
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:.. ::. : :... . :: ...: . : .:.:. :.::: .. :::
CCDS21 HALVSLAVAFTF-PFITTVTCYLLIIRSLRQGLRVEKRLKTKAVRMIAIVLAIFLVCFVP
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 SNL---LLLLHYSDPSPSAWGNLYGAYVPSLA--LSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRA
.. . .::: . . : . : . .. :..::. .::..:..:. .::
CCDS21 YHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCLTSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCN
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pF1KE9 GLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHSSLLQ
CCDS21 LLCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
340 350 360
>>CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 (350 aa)
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pF1KE9 YDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDTLEL--P-DSSRALLLGWVPTRLVPA
.:.:::.: : :.. : :: :. .
CCDS33 MDSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTL--RVPDILALV
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....:..::. .:.:..:: : .: : ... ..:::.::.: :::: .. .. ..:
CCDS33 IFAVVFLVGVLGNALVVWVTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHW
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::: ::: . . . .::.:.::::..: ::.: . .:. . .:: :: : .::
CCDS33 PFGGAACSILPSLILLNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWG
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.: :..: : : . . .::: : . . :.. : .:: . :::.. .
CCDS33 LALLLTIPSFLYRVVREEYFPPKVLCGVDYSHDKRRER-AVAIVRL-VLGFLWPLLTLTI
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:: :.: . . : ..:.....:.:: :..: .. ... . .:: .. :
CCDS33 CYTFILLRTWSRRATRSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLKK
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pF1KE9 AYVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTH
.... .: :..:.:: .. :. ..: .:
CCDS33 LDSLCVSFAYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTV
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CCDS33 DTMAQKTQAV
350
>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 (346 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KE9 GDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDTLELPDSSRALLLGWVPTRLVPALYGLVLVVGLPA
..:: . .. : .: ... :. .
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTIENFKREFFPIVYLIIFFWGVLG
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pF1KE9 NGLALWVLATQAPRLPST-MLLMNLATADLLLALALPPRIAYHLRGQRWPFGEAACRLAT
:::...:. . :. ....::: .:::. .:: : :.:::. : ::. :::. .
CCDS94 NGLSIYVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMS
60 70 80 90 100 110
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pF1KE9 AALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWLMAAALALPLTL
.:: .::.:. .:...:. :.::.:::.: . . : : :: :.. : .. . :
CCDS94 YSLYVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMASSI-MLL
120 130 140 150 160 170
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pF1KE9 QRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQPAFTCLALLGCFLPLLAMLLCYGATLHTL--
. . .. : : : :. . : ..::.::.... .:: ...:
CCDS94 DSGS---EQNGSVTSCLELNLYKIAKLQTMNYIAL-VVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLK
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320
pF1KE9 ---AASGRRYGHALRLTAVVLASAVAF--FVPSNLLLLLHYSDPSPS-AWGNLYGAYVPS
:: : .: ::..... . : :.: . : .: . . . :. : : .
CCDS94 VEVPESGLRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHLTTWKVGLCKDRLHKALVIT
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 LALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHSSLLQ
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CCDS94 LALAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSALRKGHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETRV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]