Result of FASTA (omim) for
pFN21AE9551
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9551, 340 aa
1>>>pF1KE9551 340 - 340 aa - 340 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5160+/-0.000528; mu= 20.5402+/- 0.033
mean_var=91.2588+/-22.111, 0's: 0 Z-trim(108.4): 690 B-trim: 950 in 1/48
Lambda= 0.134257
statistics sampled from 15698 (16473) to 15698 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 7.220
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001035269 (OMIM: 606111) melanin-concentrating ( 340) 2294 455.3 8.8e-128
NP_115892 (OMIM: 606111) melanin-concentrating hor ( 340) 2294 455.3 8.8e-128
NP_005288 (OMIM: 601751) melanin-concentrating hor ( 422) 733 153.0 1e-36
XP_005261778 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29
NP_001265616 (OMIM: 182453) somatostatin receptor ( 418) 599 127.1 6.7e-29
XP_016884412 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29
NP_001042 (OMIM: 182453) somatostatin receptor typ ( 418) 599 127.1 6.7e-29
XP_006724374 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29
XP_011528651 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29
XP_016884413 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 588 124.9 2.7e-28
NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 576 122.6 1.4e-27
NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 534 114.5 4e-25
NP_001044 (OMIM: 182455) somatostatin receptor typ ( 364) 528 113.3 8.5e-25
NP_001166031 (OMIM: 182455) somatostatin receptor ( 364) 528 113.3 8.5e-25
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 527 113.1 1e-24
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 527 113.1 1e-24
NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 524 112.5 1.5e-24
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 517 111.2 3.9e-24
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 517 111.2 3.9e-24
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 517 111.2 3.9e-24
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 517 111.2 4e-24
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 517 111.2 4e-24
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 517 111.2 4e-24
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 517 111.2 4e-24
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 517 111.2 4.1e-24
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 517 111.2 4.1e-24
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 517 111.2 4.2e-24
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 517 111.3 4.5e-24
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 517 111.3 4.5e-24
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 475 103.0 1.1e-21
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 475 103.0 1.1e-21
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 475 103.0 1.1e-21
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 475 103.0 1.1e-21
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 475 103.0 1.1e-21
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 475 103.0 1.1e-21
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 475 103.0 1.1e-21
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 475 103.0 1.1e-21
NP_005277 (OMIM: 600731) neuropeptides B/W recepto ( 333) 473 102.6 1.3e-21
NP_005276 (OMIM: 600730) neuropeptides B/W recepto ( 328) 468 101.6 2.5e-21
NP_001269833 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 291) 455 99.0 1.3e-20
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 452 98.5 2.3e-20
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 452 98.5 2.3e-20
NP_001138753 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 319) 437 95.6 1.6e-19
NP_001272456 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 292) 434 94.9 2.3e-19
XP_016866395 (OMIM: 600018) PREDICTED: mu-type opi ( 300) 434 94.9 2.3e-19
NP_001138752 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 300) 434 94.9 2.3e-19
NP_001138759 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 300) 434 94.9 2.3e-19
NP_001272455 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 300) 434 94.9 2.3e-19
NP_001272457 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 314) 434 95.0 2.4e-19
>>NP_001035269 (OMIM: 606111) melanin-concentrating horm (340 aa)
initn: 2294 init1: 2294 opt: 2294 Z-score: 2415.1 bits: 455.3 E(85289): 8.8e-128
Smith-Waterman score: 2294; 100.0% identity (100.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNPFHASCWNTSAELLNKSWNKEFAYQTASVVDTVILPSMIGIICSTGLVGNILIVFTII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNPFHASCWNTSAELLNKSWNKEFAYQTASVVDTVILPSMIGIICSTGLVGNILIVFTII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RSRKKTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTIITSLDTCNQFAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSRKKTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTIITSLDTCNQFAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 SAIMTVMSVDRYFALVQPFRLTRWRTRYKTIRINLGLWAASFILALPVWVYSKVIKFKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAIMTVMSVDRYFALVQPFRLTRWRTRYKTIRINLGLWAASFILALPVWVYSKVIKFKDG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VESCAFDLTSPDDVLWYTLYLTITTFFFPLPLILVCYILILCYTWEMYQQNKDARCCNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VESCAFDLTSPDDVLWYTLYLTITTFFFPLPLILVCYILILCYTWEMYQQNKDARCCNPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VPKQRVMKLTKMVLVLVVVFILSAAPYHVIQLVNLQMEQPTLAFYVGYYLSICLSYASSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPKQRVMKLTKMVLVLVVVFILSAAPYHVIQLVNLQMEQPTLAFYVGYYLSICLSYASSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE9 INPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF
310 320 330 340
>>NP_115892 (OMIM: 606111) melanin-concentrating hormone (340 aa)
initn: 2294 init1: 2294 opt: 2294 Z-score: 2415.1 bits: 455.3 E(85289): 8.8e-128
Smith-Waterman score: 2294; 100.0% identity (100.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNPFHASCWNTSAELLNKSWNKEFAYQTASVVDTVILPSMIGIICSTGLVGNILIVFTII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 MNPFHASCWNTSAELLNKSWNKEFAYQTASVVDTVILPSMIGIICSTGLVGNILIVFTII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RSRKKTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTIITSLDTCNQFAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RSRKKTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTIITSLDTCNQFAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 SAIMTVMSVDRYFALVQPFRLTRWRTRYKTIRINLGLWAASFILALPVWVYSKVIKFKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 SAIMTVMSVDRYFALVQPFRLTRWRTRYKTIRINLGLWAASFILALPVWVYSKVIKFKDG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VESCAFDLTSPDDVLWYTLYLTITTFFFPLPLILVCYILILCYTWEMYQQNKDARCCNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 VESCAFDLTSPDDVLWYTLYLTITTFFFPLPLILVCYILILCYTWEMYQQNKDARCCNPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VPKQRVMKLTKMVLVLVVVFILSAAPYHVIQLVNLQMEQPTLAFYVGYYLSICLSYASSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 VPKQRVMKLTKMVLVLVVVFILSAAPYHVIQLVNLQMEQPTLAFYVGYYLSICLSYASSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE9 INPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 INPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF
310 320 330 340
>>NP_005288 (OMIM: 601751) melanin-concentrating hormone (422 aa)
initn: 683 init1: 399 opt: 733 Z-score: 780.0 bits: 153.0 E(85289): 1e-36
Smith-Waterman score: 733; 37.9% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (35-334:110-408)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 HASCWNTSAELLNKSWNKEFAYQTASVVDTVILPSMIGIICSTGLVGNILIVFTIIRSRK
.:.::..: :: :..:: ..:..... :
NP_005 GPNASNTSDGPDNLTSAGSPPRTGSISYINIIMPSVFGTICLLGIIGNSTVIFAVVKKSK
80 90 100 110 120 130
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ----KTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTIITSLDTCNQFAC
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NP_005 LHWCNNVPDIFIINLSVVDLLFLLGMPFMIHQLMGNGVWHFGETMCTLITAMDANSQFTS
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170
pF1KE9 SAIMTVMSVDRYFALVQPFRLTRWRT-RYKTIRINLGLWAASFILALPVWVYSKVIKFKD
. :.:.:..:::.: :.:. :..: :. : : ::: ::: :::.:...: :
NP_005 TYILTAMAIDRYLATVHPISSTKFRKPSVATLVICL-LWALSFISITPVWLYARLIPFPG
200 210 220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GVESCAFDLTSPD-DVLWYTLYLTITTFFFPLPLILVCYILILCYTWEMYQQNKDARCCN
:. .:.. : .:: :. :.::: . .: .:. .: . :. :: . . .. : .
NP_005 GAVGCGIRLPNPDTDLYWFTLYQFFLAFALPFVVITAAYVRIL-----QRMTSSVAPASQ
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 PSVPKQRVMKLTKMVLVLVVVFILSAAPYHVIQLVNLQMEQPTLAFYVGYYLSICLSYAS
:. . :. ..:. .... .::.. :::.:.::..:.. .:::.: : .: :.::.
NP_005 RSI-RLRTKRVTRTAIAICLVFFVCWAPYYVLQLTQLSISRPTLTFVYLYNAAISLGYAN
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340
pF1KE9 SSINPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF
: .:::.::.: .:.::: . :.. .. ..:
NP_005 SCLNPFVYIVLCETFRKRLVLSVKPAAQGQLRAVSNAQTADEERTESKGT
380 390 400 410 420
>>XP_005261778 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostatin re (418 aa)
initn: 421 init1: 227 opt: 599 Z-score: 639.8 bits: 127.1 E(85289): 6.7e-29
Smith-Waterman score: 600; 32.3% identity (62.5% similar) in 344 aa overlap (1-327:1-334)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNPFHASCWNTSAELLNKS--WNKEFAYQTASV--------VDTVILPSMIGIICSTGLV
:. .: : .:..: : : : . . ..:. :. :..: . ..: .::.
XP_005 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE9 GNILIVFTIIR-SRKKTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTII
:: :......: . . .: ..:: :::.:: . ..:.::: : : . : ::. .: ..
XP_005 GNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALS-YWPFGSLMCRLV
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 TSLDTCNQFACSAIMTVMSVDRYFALVQPFRLTRWRTRYKTIRINLGLWAASFILALPVW
..: :::. .::::::::.:.:.: : .:::: . .. ..:.:: ...:::
XP_005 MAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLPVV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 VYSKVIKFKDGVESCAFDLTSPDDVLW---YTLYLTITTFFFPLPLILVCYILILCYTWE
:.: : . :. .: .. : . : . .: . :: :: .: .::.::. .
XP_005 VFSGVPR---GMSTCHMQWPEPA-AAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKV--
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 MYQQNKDARCCNPSVPKQRVM--KLTKMVLVLVVVFILSAAPYHVIQLVNLQMEQPTL-A
.. : :: ..: ..:.::...:..:.: :..:...::. : :
XP_005 ---RSAGRRVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 FYVGYYLSICLSYASSSINPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF
:. :.: . : ::.: ::.:: .:: :.. . .. : ...
XP_005 FFGLYFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEE
300 310 320 330 340 350
XP_005 EDEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKS
360 370 380 390 400 410
>>NP_001265616 (OMIM: 182453) somatostatin receptor type (418 aa)
initn: 421 init1: 227 opt: 599 Z-score: 639.8 bits: 127.1 E(85289): 6.7e-29
Smith-Waterman score: 600; 32.3% identity (62.5% similar) in 344 aa overlap (1-327:1-334)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNPFHASCWNTSAELLNKS--WNKEFAYQTASV--------VDTVILPSMIGIICSTGLV
:. .: : .:..: : : : . . ..:. :. :..: . ..: .::.
NP_001 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE9 GNILIVFTIIR-SRKKTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTII
:: :......: . . .: ..:: :::.:: . ..:.::: : : . : ::. .: ..
NP_001 GNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALS-YWPFGSLMCRLV
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 TSLDTCNQFACSAIMTVMSVDRYFALVQPFRLTRWRTRYKTIRINLGLWAASFILALPVW
..: :::. .::::::::.:.:.: : .:::: . .. ..:.:: ...:::
NP_001 MAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLPVV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 VYSKVIKFKDGVESCAFDLTSPDDVLW---YTLYLTITTFFFPLPLILVCYILILCYTWE
:.: : . :. .: .. : . : . .: . :: :: .: .::.::. .
NP_001 VFSGVPR---GMSTCHMQWPEPA-AAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKV--
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 MYQQNKDARCCNPSVPKQRVM--KLTKMVLVLVVVFILSAAPYHVIQLVNLQMEQPTL-A
.. : :: ..: ..:.::...:..:.: :..:...::. : :
NP_001 ---RSAGRRVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 FYVGYYLSICLSYASSSINPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF
:. :.: . : ::.: ::.:: .:: :.. . .. : ...
NP_001 FFGLYFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEE
300 310 320 330 340 350
NP_001 EDEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKS
360 370 380 390 400 410
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]