Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9542
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9542, 757 aa
1>>>pF1KE9542 757 - 757 aa - 757 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5790+/-0.00173; mu= 10.2571+/- 0.101
mean_var=304.5722+/-79.342, 0's: 0 Z-trim(103.3): 235 B-trim: 389 in 1/49
Lambda= 0.073490
statistics sampled from 7115 (7352) to 7115 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 3.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 757) 5149 561.6 1.6e-159
CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 724) 4460 488.5 1.5e-137
CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 784) 4441 486.6 6.5e-137
CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 626) 4194 460.2 4.4e-129
CCDS75206.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 601) 3303 365.7 1.2e-100
CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 709) 3033 337.2 5.4e-92
CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 754) 2689 300.8 5.3e-81
CCDS53862.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 730) 1943 221.7 3.3e-57
>>CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (757 aa)
initn: 5149 init1: 5149 opt: 5149 Z-score: 2977.3 bits: 561.6 E(32554): 1.6e-159
Smith-Waterman score: 5149; 100.0% identity (100.0% similar) in 757 aa overlap (1-757:1-757)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 DLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 RMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 FGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 ESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 IVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 SMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWV
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE9 EMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
730 740 750
>>CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (724 aa)
initn: 4460 init1: 4460 opt: 4460 Z-score: 2582.7 bits: 488.5 E(32554): 1.5e-137
Smith-Waterman score: 4828; 95.5% identity (95.6% similar) in 757 aa overlap (1-757:1-724)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRA
: :.::::::::::::::::::::::::
CCDS58 N---------------------------------CVVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRA
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLY
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDK
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDEL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 DLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQ
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 RMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTC
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 FGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWM
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 ESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGF
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 IVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYG
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 SMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGT
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWV
630 640 650 660 670 680
730 740 750
pF1KE9 EMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
690 700 710 720
>>CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (784 aa)
initn: 4441 init1: 4441 opt: 4441 Z-score: 2571.5 bits: 486.6 E(32554): 6.5e-137
Smith-Waterman score: 5081; 96.4% identity (96.6% similar) in 784 aa overlap (1-757:1-784)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED
10 20 30 40 50 60
70 80 90
pF1KE9 NCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPEC-------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECSFHFFLFITLLFLVPHCHHALPLPL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 --LVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQ
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DSVVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 KLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 SPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 TVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 IQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNT
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 DGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 MGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYIC
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE9 IVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTES
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE9 IGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFI
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE9 VFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIH
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE9 RFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRL
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 NSYS
::::
CCDS75 NSYS
>>CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (626 aa)
initn: 4192 init1: 2750 opt: 4194 Z-score: 2430.9 bits: 460.2 E(32554): 4.4e-129
Smith-Waterman score: 4194; 99.8% identity (99.8% similar) in 627 aa overlap (131-757:1-626)
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 PVQCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNN
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 KITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYG
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRK
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 NKINHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NKINHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFD
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 YLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLE
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YLVKLKSL-LEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLE
220 230 240 250 260
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 NLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFV
270 280 290 300 310 320
470 480 490 500 510 520
pF1KE9 IGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRC
330 340 350 360 370 380
530 540 550 560 570 580
pF1KE9 VRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYS
390 400 410 420 430 440
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 VAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALC
450 460 470 480 490 500
650 660 670 680 690 700
pF1KE9 WIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYR
510 520 530 540 550 560
710 720 730 740 750
pF1KE9 QRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
570 580 590 600 610 620
>>CCDS75206.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (601 aa)
initn: 3264 init1: 3220 opt: 3303 Z-score: 1920.6 bits: 365.7 E(32554): 1.2e-100
Smith-Waterman score: 3818; 95.2% identity (95.6% similar) in 609 aa overlap (149-757:17-601)
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 RAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTK
::. . :::::::::::::::::::::::
CCDS75 MVTCTQNMKAALKSLLYHSRNLGYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTK
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180 190 200 210 220 230
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLP
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240 250 260 270 280 290
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:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS75 DKPLCQHMPRLHWL------------------------VMRKNKINHLNENTFAPLQKLD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWIT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFI
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRA
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLY
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDK
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250 260 270 280 290 300
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 PLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDEF
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::
CCDS58 ------------------------------------------------SLEGIEISNIQQ
310
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGF
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 IVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYG
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pF1KE9 SMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWV
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
680 690 700
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10 20 30 40
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: .:: : :. :. . .:. :::::::.:::::
CCDS93 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
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50 60 70 80 90 100
pF1KE9 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPV
. .::.: ::::: :::.::::..::. : .. .. : : ::.. . :
CCDS93 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQECFLKQYPQ
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110 120 130 140 150 160
pF1KE9 QCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKI
: :. ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: :
CCDS93 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 TSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLN
:: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::
CCDS93 RHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLN
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230 240 250 260 270 280
pF1KE9 SLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNK
::..: ..:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.
CCDS93 SLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQ
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pF1KE9 INHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYL
:. . :.::. :..: ::::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. :
CCDS93 IGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESL
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pF1KE9 VKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENL
.:.::.:: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:
CCDS93 KQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDL
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pF1KE9 LASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIG
::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..:: .:::: :::::::::.::: .:
CCDS93 LANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVG
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pF1KE9 GFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVR
::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.:: .:
CCDS93 IFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIR
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pF1KE9 PGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVA
::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..
CCDS93 PGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLG
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 IFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWI
::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::.:: .:. .:.:::::::.::.:::
CCDS93 IFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWI
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650 660 670 680 690 700
pF1KE9 PIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQR
:.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.::::::::::::: ::. .... ... ::
CCDS93 PVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QR
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750
pF1KE9 KSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
::. . .:. . :..:.:
CCDS93 KSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
720 730 740 750
>>CCDS53862.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 (730 aa)
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10 20 30 40
pF1KE9 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
: .:: : :. :. . .:. :::::::.:::::
CCDS53 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPV
. .::.: ::::: :::.::::..::. : .. .. : : ::.. . :
CCDS53 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQECFLKQYPQ
70 80 90 100 110
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pF1KE9 QCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKI
: :. ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: :
CCDS53 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI
120 130 140 150 160 170
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pF1KE9 TSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLN
:: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::
CCDS53 RHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 SLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNK
::..: ..:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..::::
CCDS53 SLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVL------
240 250 260 270 280
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pF1KE9 INHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYL
::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. :
CCDS53 ------------------DLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESL
290 300 310 320
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pF1KE9 VKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENL
.:.::.:: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:
CCDS53 KQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDL
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pF1KE9 LASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIG
::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..:: .:::: :::::::::.::: .:
CCDS53 LANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVG
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pF1KE9 GFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVR
::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.:: .:
CCDS53 IFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIR
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::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..
CCDS53 PGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLG
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CCDS53 IFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWI
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CCDS53 PVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QR
630 640 650 660 670 680
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CCDS53 KSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
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757 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 07:41:51 2016 done: Sun Nov 6 07:41:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]