Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9540
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9540, 430 aa
1>>>pF1KE9540 430 - 430 aa - 430 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7439+/-0.000753; mu= 16.6861+/- 0.046
mean_var=123.5835+/-33.609, 0's: 0 Z-trim(111.6): 289 B-trim: 1350 in 2/48
Lambda= 0.115370
statistics sampled from 12024 (12508) to 12024 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.384), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 2933 499.3 3e-141
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 1381 241.0 1.7e-63
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 1381 241.0 1.7e-63
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 1381 241.1 1.9e-63
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 563 104.8 1.5e-22
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 559 104.2 2.6e-22
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 553 103.1 4.8e-22
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 547 102.1 9.6e-22
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 513 96.5 5.2e-20
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 500 94.4 2.4e-19
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 491 92.9 6.8e-19
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 468 89.0 9.1e-18
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 444 85.0 1.4e-16
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 436 83.6 3.5e-16
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 435 83.5 4e-16
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 429 82.5 8.1e-16
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 421 81.2 2e-15
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 419 80.9 2.7e-15
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 401 77.8 2e-14
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 395 76.8 3.9e-14
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 382 74.7 1.9e-13
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 379 74.2 2.8e-13
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 363 71.5 1.6e-12
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 358 70.7 2.8e-12
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 357 70.5 3e-12
CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 436) 341 67.9 2.2e-11
CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 442) 340 67.7 2.5e-11
CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 532) 340 67.8 2.8e-11
CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 ( 447) 337 67.2 3.6e-11
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 333 66.5 5.4e-11
CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1 ( 326) 329 65.8 7.3e-11
>>CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 (430 aa)
initn: 2933 init1: 2933 opt: 2933 Z-score: 2649.5 bits: 499.3 E(32554): 3e-141
Smith-Waterman score: 2933; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEGEPSQPPNSSWPLSQNGTNTEATPATNLTFSSYYQHTSPVAAMFIVAYALIFLLCMVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MEGEPSQPPNSSWPLSQNGTNTEATPATNLTFSSYYQHTSPVAAMFIVAYALIFLLCMVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NTLVCFIVLKNRHMHTVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNATCKMSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NTLVCFIVLKNRHMHTVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNATCKMSG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LVQGMSVSASVFTLVAIAVERFRCIVHPFREKLTLRKALVTIAVIWALALLIMCPSAVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LVQGMSVSASVFTLVAIAVERFRCIVHPFREKLTLRKALVTIAVIWALALLIMCPSAVTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 TVTREEHHFMVDARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALIVVMYARIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TVTREEHHFMVDARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALIVVMYARIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RKLCQAPGPAPGGEEAADPRASRRRARVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLLIDYGQLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RKLCQAPGPAPGGEEAADPRASRRRARVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLLIDYGQLSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 PQLHLVTVYAFPFAHWLAFFNSSANPIIYGYFNENFRRGFQAAFRARLCPRPSGSHKEAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PQLHLVTVYAFPFAHWLAFFNSSANPIIYGYFNENFRRGFQAAFRARLCPRPSGSHKEAY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 SERPGGLLHRRVFVVVRPSDSGLPSESGPSSGAPRPGRLPLRNGRVAHHGLPREGPGCSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SERPGGLLHRRVFVVVRPSDSGLPSESGPSSGAPRPGRLPLRNGRVAHHGLPREGPGCSH
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE9 LPLTIPAWDI
::::::::::
CCDS53 LPLTIPAWDI
430
>>CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (420 aa)
initn: 1367 init1: 741 opt: 1381 Z-score: 1253.5 bits: 241.0 E(32554): 1.7e-63
Smith-Waterman score: 1381; 56.4% identity (82.7% similar) in 358 aa overlap (10-361:8-364)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MEGEPSQPPNSS--W-PL-SQNGTNTEATPATNLTFSSYYQHTSPVAAMFIVAYALIFLL
::: : :. . : :. . :.:. .:: : :::.::..: :::.:
CCDS35 MNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQPQVAAIFIISYFLIFFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 CMVGNTLVCFIVLKNRHMHTVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNATC
::.:::.:::::..:.:::::::.::::::.::::::::::: ::.::.:.:::: :. :
CCDS35 CMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 KMSGLVQGMSVSASVFTLVAIAVERFRCIVHPFREKLTLRKALVTIAVIWALALLIMCPS
:.::::::.::.:::::::::::.::.:.:.::. :::.. :.: : .::.::. :: ::
CCDS35 KISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFVIIMIIWVLAITIMSPS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 AVTLTVTREEHHFM-VDARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALIVVM
:: : : .:... . ....:.. :.: : : ::.. ::..::::::..::::::.:::.:
CCDS35 AVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIVIM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 YARIARKLCQAPGPAPGGEEAADPRA-SRRRARVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLLID
:.::. .: .: : : .. . .. ::.. ....::..:::.: :::::::.:..: :
CCDS35 YGRIGISLFRAAVPHTGRKNQEQWHVVSRKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 YGQLSAPQLHLVTVYAFPFAHWLAFFNSSANPIIYGYFNENFRRGFQAAFRARLCPRPSG
:..:: .:.....: .:::::::: :::.::::::.:::::::::: ::. .:: . .
CCDS35 YADLSPNELQIINIYIYPFAHWLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQK-RA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 SHKEAYSERPGGLLHRRVFVVVRPSDSGLPSESGPSSGAPRPGRLPLRNGRVAHHGLPRE
. :::.
CCDS35 KPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNS
360 370 380 390 400 410
>>CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (423 aa)
initn: 1367 init1: 741 opt: 1381 Z-score: 1253.5 bits: 241.0 E(32554): 1.7e-63
Smith-Waterman score: 1381; 56.4% identity (82.7% similar) in 358 aa overlap (10-361:11-367)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MEGEPSQPPNSS--W-PL-SQNGTNTEATPATNLTFSSYYQHTSPVAAMFIVAYALIFL
::: : :. . : :. . :.:. .:: : :::.::..: :::.
CCDS47 MFIMNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQPQVAAIFIISYFLIFF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LCMVGNTLVCFIVLKNRHMHTVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNAT
:::.:::.:::::..:.:::::::.::::::.::::::::::: ::.::.:.:::: :.
CCDS47 LCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 CKMSGLVQGMSVSASVFTLVAIAVERFRCIVHPFREKLTLRKALVTIAVIWALALLIMCP
::.::::::.::.:::::::::::.::.:.:.::. :::.. :.: : .::.::. :: :
CCDS47 CKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFVIIMIIWVLAITIMSP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SAVTLTVTREEHHFM-VDARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALIVV
::: : : .:... . ....:.. :.: : : ::.. ::..::::::..::::::.:::.
CCDS47 SAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIVI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 MYARIARKLCQAPGPAPGGEEAADPRA-SRRRARVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLLI
::.::. .: .: : : .. . .. ::.. ....::..:::.: :::::::.:..:
CCDS47 MYGRIGISLFRAAVPHTGRKNQEQWHVVSRKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 DYGQLSAPQLHLVTVYAFPFAHWLAFFNSSANPIIYGYFNENFRRGFQAAFRARLCPRPS
::..:: .:.....: .:::::::: :::.::::::.:::::::::: ::. .:: .
CCDS47 DYADLSPNELQIINIYIYPFAHWLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQK-R
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 GSHKEAYSERPGGLLHRRVFVVVRPSDSGLPSESGPSSGAPRPGRLPLRNGRVAHHGLPR
.. :::.
CCDS47 AKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTN
360 370 380 390 400 410
>>CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (522 aa)
initn: 1367 init1: 741 opt: 1381 Z-score: 1252.4 bits: 241.1 E(32554): 1.9e-63
Smith-Waterman score: 1381; 56.4% identity (82.7% similar) in 358 aa overlap (10-361:110-466)
10 20 30
pF1KE9 MEGEPSQPPNSS--W-PL-SQNGTNTEATPATNLTFSSY
::: : :. . : :. . :.:. .:
CCDS35 CCCRRAWWILVPAADRARRERFIMNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNY
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 YQHTSPVAAMFIVAYALIFLLCMVGNTLVCFIVLKNRHMHTVTNMFILNLAVSDLLVGIF
: : :::.::..: :::.:::.:::.:::::..:.:::::::.::::::.::::::::
CCDS35 YLHQPQVAAIFIISYFLIFFLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIF
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 CMPTTLVDNLITGWPFDNATCKMSGLVQGMSVSASVFTLVAIAVERFRCIVHPFREKLTL
::: ::.::.:.:::: :. ::.::::::.::.:::::::::::.::.:.:.::. :::.
CCDS35 CMPITLLDNIIAGWPFGNTMCKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTI
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 RKALVTIAVIWALALLIMCPSAVTLTVTREEHHFM-VDARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRR
. :.: : .::.::. :: :::: : : .:... . ....:.. :.: : : ::.. ::.
CCDS35 KTAFVIIMIIWVLAITIMSPSAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRK
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 VYTTVLFSHIYLAPLALIVVMYARIARKLCQAPGPAPGGEEAADPRA-SRRRARVVHMLV
.::::::..::::::.:::.::.::. .: .: : : .. . .. ::.. ....::.
CCDS35 IYTTVLFANIYLAPLSLIVIMYGRIGISLFRAAVPHTGRKNQEQWHVVSRKKQKIIKMLL
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 MVALFFTLSWLPLWALLLLIDYGQLSAPQLHLVTVYAFPFAHWLAFFNSSANPIIYGYFN
.:::.: :::::::.:..: ::..:: .:.....: .:::::::: :::.::::::.::
CCDS35 IVALLFILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYIYPFAHWLAFGNSSVNPIIYGFFN
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 ENFRRGFQAAFRARLCPRPSGSHKEAYSERPGGLLHRRVFVVVRPSDSGLPSESGPSSGA
:::::::: ::. .:: . .. :::.
CCDS35 ENFRRGFQEAFQLQLCQK-RAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYR
440 450 460 470 480 490
>>CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 (384 aa)
initn: 506 init1: 351 opt: 563 Z-score: 518.1 bits: 104.8 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 563; 33.4% identity (63.5% similar) in 329 aa overlap (20-344:16-335)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MEGEPSQPPNSSWPLSQNGTNTEATPATNLTFSSYYQHTSPVAAMFIVA--YALIFLLCM
.: : :.: . : :.: .: .: :. ...: .
CCDS34 MNSTLFSQVENHSVHSNFSEKNAQLLAFENDDCHL-PLAMIFTLALAYGAVIILGV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VGNTLVCFIVLKNRHMHTVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNATCKM
:: . .:.::...:..:::..:.::. :::::.:.:.: :.: .:. : : .: ::.
CCDS34 SGNLALIIIILKQKEMRNVTNILIVNLSFSDLLVAIMCLPFTFVYTLMDHWVFGEAMCKL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SGLVQGMSVSASVFTLVAIAVERFRCIVHPFREKLTLRKALVTIAVIWALALLIMCPSAV
. .:: .:...:.:.:: ::::: . :..: . . :.: : :::::.::. : .
CCDS34 NPFVQCVSITVSIFSLVLIAVERHQLIINPRGWRPNNRHAYVGIAVIWVLAVASSLPFLI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TLTVTREE-HHFMVDARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALIVVMYA
..: : .. .:: . .: :.. .: . : :::.:. :..:: .: . :
CCDS34 YQVMTDEPFQNVTLDAYKDKY---VCFDQFPSDSHRLSYTTLLLVLQYFGPLCFIFICYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RIARKLCQAPGPAPGGEEAADPRASRRRARVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLLIDYG-
.: .: . . .. . : . :. ::. ... :.. :::: . ..:..
CCDS34 KIYIRLKRRNNMMDKMRD--NKYRSSETKRINIMLLSIVVAFAVCWLPLTIFNTVFDWNH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 QLSAPQLHLVTVYAFPFAHWLAFFNSSANPIIYGYFNENFRRGFQAAFRARLCPRPSGSH
:. : : . : . : :.... .:::.::..:.::.: .: :
CCDS34 QIIATCNHNLL---FLLCHLTAMISTCVNPIFYGFLNKNFQRDLQFFFNFCDFRSRDDDY
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 KEAYSERPGGLLHRRVFVVVRPSDSGLPSESGPSSGAPRPGRLPLRNGRVAHHGLPREGP
CCDS34 ETIAMSTMHTDVSKTSLKQASPVAFKKINNNDDNEKI
350 360 370 380
>>CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 (431 aa)
initn: 455 init1: 308 opt: 559 Z-score: 513.9 bits: 104.2 E(32554): 2.6e-22
Smith-Waterman score: 559; 30.0% identity (65.1% similar) in 307 aa overlap (46-343:48-346)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 SQNGTNTEATPATNLTFSSYYQHTSPVAAMFIVAYALIFLLCMVGNTLVCFIVLKNRHMH
.... .::: : . ::.:: ..: ... :.
CCDS37 HNLTREQFIALYRLRPLVYTPELPGRAKLALVLTGVLIFALALFGNALVFYVVTRSKAMR
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 TVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNATCKMSGLVQGMSVSASVFTLV
::::.:: .::.::::. .::.:.:...:. .: ::: .::. .: . ..:..
CCDS37 TVTNIFICSLALSDLLITFFCIPVTMLQNISDNWLGGAFICKMVPFVQSTAVVTEILTMT
80 90 100 110 120 130
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CCDS73 NLCLMCVTVRQKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGETLCKMSA
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CCDS73 LSTVHTEVSKGSLRLSGRSNPI
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CCDS82 LNENFRIELKALL--SMCQRPPKPQEDRPPSPVPSFRVAWTEKNDGQRAPLANNLLPTSQ
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CCDS34 KTAKMLMVVLLVFALCYLPISVLNVLKRVFGMFRQASDREAVYACFTFSHWLVYANSAAN
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