Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9533
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9533, 410 aa
1>>>pF1KE9533 410 - 410 aa - 410 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9031+/-0.000673; mu= 20.2821+/- 0.041
mean_var=117.3263+/-39.784, 0's: 0 Z-trim(111.1): 165 B-trim: 1406 in 2/49
Lambda= 0.118407
statistics sampled from 11820 (12141) to 11820 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2 ( 410) 2723 476.3 2.3e-134
CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20 ( 418) 604 114.3 2.2e-25
CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 ( 412) 510 98.2 1.5e-20
CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 ( 426) 389 77.6 2.5e-14
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 343 69.7 5.7e-12
CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 289) 341 69.2 5.9e-12
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 341 69.3 6.8e-12
CCDS2170.1 GPR39 gene_id:2863|Hs108|chr2 ( 453) 334 68.2 1.8e-11
>>CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2 (410 aa)
initn: 2723 init1: 2723 opt: 2723 Z-score: 2525.6 bits: 476.3 E(32554): 2.3e-134
Smith-Waterman score: 2723; 99.3% identity (100.0% similar) in 410 aa overlap (1-410:1-410)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 METSSPRPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGNALSVHVVLKA
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CCDS16 METSSPRPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGNALSAHVVLKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RAGRAGRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGCRGYYFVHELCAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RAGRAGRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGCRGYYFVHELCAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 ATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLAMPMAVIMGQKHEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS16 ATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLALPMAVIMGQKHEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGVTVSHLLALCSQV
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CCDS16 ETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGVTVSHLLALCSQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHKDVRRIRSLQRSVQVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHKDVRRIRSLQRSVQVLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 AIVVMYVICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYMVTNTLFYVSSAVTPLLYNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 AIVVMYVICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYMVTNTLFYVSSAVTPLLYNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE9 VSSSFRRLFLEAVSSLCGEHHPMKRLPPKPQSPTLMDTASGFGDPPETRT
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 VSSSFRKLFLEAVSSLCGEHHPMKRLPPKPQSPTLMDTASGFGDPPETRT
370 380 390 400 410
>>CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20 (418 aa)
initn: 1014 init1: 431 opt: 604 Z-score: 569.3 bits: 114.3 E(32554): 2.2e-25
Smith-Waterman score: 981; 39.3% identity (72.4% similar) in 384 aa overlap (21-400:52-403)
10 20 30 40 50
pF1KE9 METSSPRPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGN
..: :.: ...::: ::.: ....:..::
CCDS13 AQAGLEEALLAPGFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGN
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100
pF1KE9 ALSVHVVLKARAGRA--GRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGC
.... .. . .. .. . ...:. ::::. :: ::...:::::.:.: :.::.::: ::
CCDS13 TVTAFTLARKKSLQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGC
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 RGYYFVHELCAYATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLAM
:::::... :.:::.:.::.::.:: ::.:.:..:..:.. ::. ... : :: ::.
CCDS13 RGYYFLRDACTYATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAV
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 PMAVIMGQKHELETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGV
:: ::... ..:::. . .. ::: . ....: ::::...::..:... . :: .
CCDS13 PMLFTMGEQN--RSADGQ-HAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTI
210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 TVSHLLALCSQVPSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHK-DVR
...: .. :. .:.: . . ::. : .
CCDS13 IANKLTVMVRQA-----------------AEQGQVCTV--------GGEHSTFSMAIEPG
260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 RIRSLQRSVQVLRAIVVMYVICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYMVTNTLF
:...:...:.::::.:. .:.::::::.::::.::. :. :: ::.::::::::::.::
CCDS13 RVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 YVSSAVTPLLYNAVSSSFRRLFLEAVSSLCGEHHPM-KRLPPKPQSPTLMDTASGFGDPP
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CCDS13 YVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLC----PVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLS
360 370 380 390 400
410
pF1KE9 ETRT
CCDS13 SNATRETLY
410
>>CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 (412 aa)
initn: 433 init1: 260 opt: 510 Z-score: 482.5 bits: 98.2 E(32554): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 514; 31.3% identity (58.1% similar) in 387 aa overlap (8-380:17-381)
10 20 30 40 50
pF1KE9 METSSPRPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGNA
:: :. : : : : : : ::. ....:..::.
CCDS94 MGSPWNGSDGPEGAREPPWPALPP---CDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LSVHVVLKARAGRAGRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGCRGY
..: .. . : :. .. :.:.. ::.:: :.: .:: . : ::::: : ::
CCDS94 VTVMLIGRYRDMRT-TTNLYLGSMAVSDLLILL-GLPFDLYRL-WRSRPWVFGPLLCRLS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 YFVHELCAYATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLAMPMA
.: : :.:::.: ...::.:: ::.:.::::: :.: ::.: :.:. ::..: : :.
CCDS94 LYVGEGCTYATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE9 VIMGQKHE--LETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGVT
..: ... . .. : : . . :.: : . : . : . .:
CCDS94 FLVGVEQDPGISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWL--------SRAPP---PSPPSGPE
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VSHLLALCSQV--PSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHKDVR
... :: :. :: . :. : . . .: :. . . :. .. .:
CCDS94 TAEAAALFSRECRPSPAQLGALR-VMLWVTTAYFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPLR
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 ------RIRSLQRSVQVLRAIVVMYVICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYM
: :. ...:.:: ..:. ..:::::.:. :..: . :. .. : .:: .
CCDS94 GPAASGRERGHRQTVRVLLVVVLAFIICWLPFHVGRIIYINTEDSR----MMYFSQYFNI
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KE9 VTNTLFYVSSAVTPLLYNAVSSSFR----RLFLEAVSSLCGEHHPMKRLPPKPQSPTLMD
:. :::.:....:.::: .:...: .:.: : : :
CCDS94 VALQLFYLSASINPILYNLISKKYRAAAFKLLLARKSRPRGFHRSRDTAGEVAGDTGGDT
340 350 360 370 380 390
400 410
pF1KE9 TASGFGDPPETRT
CCDS94 VGYTETSANVKTMG
400 410
>>CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 (426 aa)
initn: 514 init1: 181 opt: 389 Z-score: 370.7 bits: 77.6 E(32554): 2.5e-14
Smith-Waterman score: 552; 31.9% identity (61.9% similar) in 370 aa overlap (37-404:65-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 RPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGNALSVHVVLKARAGRAG
: : ::...::.::.:. :.:. .: :.
CCDS24 FDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTP
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGCRGYYFVHELCAYATVLSV
....:::.. ::.::::.:.::: .: .::...: :: .. :. :.::.:
CCDS24 T-NYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE-MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNV
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLAMPMAVIMGQKHELETADGE
..::.:: .:: .::.:::..: ..: ... :. .. ..: . . : .. :
CCDS24 TALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRG-
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGVTVSHLLALCSQVPSTSTP
: : : :: .. :. .. .:...:. : ::.:. ..: .::
CCDS24 PVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLPMAI------MSVLYLLIGLRL-------
220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 GSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHKDVRRIRSLQRSVQVLRAIVVMY
:: :..: . . .. . : .: :: . ...: ..::..
CCDS24 ---RRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYT----CRLQQHDRGRR-----QVTKMLFVLVVVF
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 VICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYMVTNTLFYVSSAVTPLLYNAVSSSFR
::: :.:: :.:. : . ::: :. ... ..... .::..::..:.::. .:: ::
CCDS24 GICWAPFHADRVMWSVV--SQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSSRFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE9 RLFLEAVSSLCGEHHPMKRLPPKPQSPTL--MDTASGFGDPPETRT
. : ::. : . : :: :. .: .: : :.: . :
CCDS24 ETFQEALC-LGACCH---RLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQ
370 380 390 400 410 420
CCDS24 QETDPS
>>CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 (415 aa)
initn: 409 init1: 148 opt: 343 Z-score: 328.3 bits: 69.7 E(32554): 5.7e-12
Smith-Waterman score: 491; 27.9% identity (61.1% similar) in 365 aa overlap (36-397:49-368)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 PRPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGNALSVHVVLKARAGRA
...:. :...:. ::.: :.:. .: ..
CCDS43 EDPFQKHLNSTEEYLAFLCGPRRSHFFLPVSVVYVPIFVVGVIGNVLVCLVILQHQAMKT
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGCRGYYFVHELCAYATVLS
....:::.. ::.::.:.:.:.: .: .::..:: .:: . : .:..::
CCDS43 PT-NYYLFSLAVSDLLVLLLGMPLEVYE-MWRNYPFLFGPVGCYFKTALFETVCFASILS
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLAMPMAVIMGQKHELETADG
.. .:.:: .:. .:.::. : ::. .... :. :. ...: . : : : . .:
CCDS43 ITTVSVERYVAILHPFRAKLQSTRRRALRILGIVWGFSVLFSLPNTSIHGIKFHY-FPNG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 EPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGVTVSHLLALCSQVPSTST
:.: .:::. . .:::. .. ..::... . : .:.:: . ..
CCDS43 SLVPGSATCTVIKPMWIYNFIIQVTSFLFYLLPMTVISVLY-----YLMALRLKKDKS--
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHKDVRRIRSLQRSV-QVLRAIVV
: ..:: .. :: : ..:: ..: ..:.
CCDS43 ----------LEADEG--------NANIQ---------------RPCRKSVNKMLFVLVL
250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 MYVICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYMVTNTLFYVSSAVTPLLYNAVSSS
...::: :.: ::.. .: . :.. : .. ..:....::.::::.:..:: .:
CCDS43 VFAICWAPFHIDRLFFSFVEE--WSESLAAVFNLVHVVSGVFFYLSSAVNPIIYNLLSRR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KE9 FRRLFLEAVSSLCGEHHPMK--RLPPKPQSPTLMDTASGFGDPPETRT
:. : ...::. . : .. .::: .. : .
CCDS43 FQAAFQNVISSFHKQWHSQHDPQLPPAQRNIFLTECHFVELTEDIGPQFPCQSSMHNSHL
340 350 360 370 380 390
CCDS43 PAALSSEQMSRTNYQSFHFNKT
400 410
>>CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 (289 aa)
initn: 362 init1: 272 opt: 341 Z-score: 328.1 bits: 69.2 E(32554): 5.9e-12
Smith-Waterman score: 349; 34.2% identity (59.1% similar) in 225 aa overlap (11-219:6-225)
10 20 30 40
pF1KE9 METSSPRPPRPSSNPGLSL-------DARLGVDT------RLWAKVLFTALYALIWAL--
:: .::..: :: : :. .:. :.... : ::
CCDS46 MWNATPSEEPGFNLTLADLDWDASPGNDSLGDELLQLFPAPLLAGVTATCVALFV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 -GAAGNALSVHVVLKARAGRAGRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFG
: ::: :.. :: . : :. .. :.:.. ::..: .:..: . : . :: ::
CCDS46 VGIAGNLLTMLVVSRFRELRT-TTNLYLSSMAFSDLLIFLC-MPLDLVRL-WQYRPWNFG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 DLGCRGYYFVHELCAYATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASL
:: :. . :: : :.:::::....::.:: .:.: ::::. ..: :.. .. . ::...
CCDS46 DLLCKLFQFVSESCTYATVLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIWAVAF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 GLAMPMAVIMGQKHELETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAF
: :. :..: .:: : : : : : :.. :. . : ::.
CCDS46 CSAGPIFVLVGVEHENGT-DPWDTNECRPTEFAVRSGLLTVMVWVSS-IFFFLPVFCLTV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LNGVTVSHLLALCSQVPSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHK
CCDS46 LYSLIGRKLWRRRRGDAVVGASLRDQNHKQTVKMLGGSQRALRLSLAGPILSLCLLPSL
240 250 260 270 280
>>CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 (366 aa)
initn: 486 init1: 272 opt: 341 Z-score: 327.1 bits: 69.3 E(32554): 6.8e-12
Smith-Waterman score: 448; 29.0% identity (55.9% similar) in 372 aa overlap (11-366:6-331)
10 20 30 40
pF1KE9 METSSPRPPRPSSNPGLSL-------DARLGVDT------RLWAKVLFTALYALIWAL--
:: .::..: :: : :. .:. :.... : ::
CCDS32 MWNATPSEEPGFNLTLADLDWDASPGNDSLGDELLQLFPAPLLAGVTATCVALFV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 -GAAGNALSVHVVLKARAGRAGRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFG
: ::: :.. :: . : :. .. :.:.. ::..: .:..: . : . :: ::
CCDS32 VGIAGNLLTMLVVSRFRELRT-TTNLYLSSMAFSDLLIFLC-MPLDLVRL-WQYRPWNFG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 DLGCRGYYFVHELCAYATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASL
:: :. . :: : :.:::::....::.:: .:.: ::::. ..: :.. .. . ::...
CCDS32 DLLCKLFQFVSESCTYATVLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIWAVAF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 GLAMPMAVIMGQKHELETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAF
: :. :..: .:: : : : : : :.. :. . : ::.
CCDS32 CSAGPIFVLVGVEHENGT-DPWDTNECRPTEFAVRSGLLTVMVWVSS-IFFFLPV-----
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LNGVTVSHLLALCSQVPSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHK
.: : : : :.. .:.. .: : . .
CCDS32 -----------FCLTV---------------LYS---LIGRKLWRRR--RGDAVVGASLR
230 240 250
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