FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9526, 438 aa
1>>>pF1KE9526 438 - 438 aa - 438 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9023+/-0.000867; mu= 19.9415+/- 0.052
mean_var=74.1800+/-15.156, 0's: 0 Z-trim(107.5): 85 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.148912
statistics sampled from 9498 (9589) to 9498 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 3.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 438) 3008 655.7 2.6e-188
CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 422) 2156 472.6 3.2e-133
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 447) 1513 334.5 1.3e-91
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 457) 1359 301.4 1.2e-81
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 416) 1335 296.2 3.9e-80
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 468) 1334 296.1 5e-80
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CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 409) 1313 291.5 1e-78
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs108|chr7 ( 423) 1165 259.7 3.9e-69
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 496) 987 221.5 1.4e-57
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 466) 887 200.0 4e-51
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 430) 819 185.4 9.5e-47
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 ( 477) 814 184.4 2.2e-46
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 ( 553) 769 174.8 2e-43
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 ( 463) 732 166.7 4.2e-41
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 438) 663 151.9 1.2e-36
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 415) 657 150.6 2.8e-36
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 397) 650 149.1 7.6e-36
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 411) 650 149.1 7.8e-36
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 247) 633 145.2 6.8e-35
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 387) 621 142.8 5.6e-34
CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 439) 605 139.4 6.7e-33
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 550) 605 139.5 7.8e-33
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 474) 600 138.4 1.5e-32
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 375) 586 135.3 1e-31
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 ( 461) 574 132.8 7e-31
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 314) 572 132.2 7.1e-31
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 401) 555 128.7 1.1e-29
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 444) 512 119.5 6.9e-27
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 508) 484 113.5 5e-25
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 240) 454 106.8 2.5e-23
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 ( 593) 387 92.7 1e-18
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 334 81.5 3.7e-15
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 334 81.5 3.8e-15
CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 ( 910) 271 68.0 4.5e-11
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 267 66.9 5.5e-11
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 267 66.9 6e-11
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 267 67.0 6.4e-11
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 267 67.0 6.8e-11
CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 267 67.0 7.1e-11
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 267 67.1 8e-11
CCDS59361.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 765) 266 66.8 8.4e-11
CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 266 66.8 8.8e-11
CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 742) 265 66.6 9.5e-11
CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 786) 265 66.6 9.9e-11
>>CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 (438 aa)
initn: 3008 init1: 3008 opt: 3008 Z-score: 3494.2 bits: 655.7 E(32554): 2.6e-188
Smith-Waterman score: 3008; 100.0% identity (100.0% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MRTLLPPALLTCWLLAPVNSIHPECRFHLEIQEEETKCAELLRSQTEKHKACSGVWDNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MRTLLPPALLTCWLLAPVNSIHPECRFHLEIQEEETKCAELLRSQTEKHKACSGVWDNIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 CWRPANVGETVTVPCPKVFSNFYSKAGNISKNCTSDGWSETFPDFVDACGYSDPEDESKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CWRPANVGETVTVPCPKVFSNFYSKAGNISKNCTSDGWSETFPDFVDACGYSDPEDESKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 TFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 DVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLVAMLPPRRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLVAMLPPRRC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 FLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 SIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKYQILFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKYQILFE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 LCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQ
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE9 FHRGSRAQSFLQTETSVI
::::::::::::::::::
CCDS59 FHRGSRAQSFLQTETSVI
430
>>CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 (422 aa)
initn: 2152 init1: 2152 opt: 2156 Z-score: 2505.2 bits: 472.6 E(32554): 3.2e-133
Smith-Waterman score: 2156; 93.7% identity (95.4% similar) in 347 aa overlap (92-438:80-422)
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 WRPANVGETVTVPCPKVFSNFYSKAGNISKNCTSDGWSETFPDFVDACGYSDPEDESKIT
: : . .: . .:. . :: ::
CCDS78 SEGSLPSWSSGPAGAKLNASHEGIGSSSDGNGDSKAATERVVSAMDTVRRKHPE----IT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKDD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLVAMLPPRRCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLVAMLPPRRCF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFIS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 IIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKYQILFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKYQILFEL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 CLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQF
350 360 370 380 390 400
430
pF1KE9 HRGSRAQSFLQTETSVI
:::::::::::::::::
CCDS78 HRGSRAQSFLQTETSVI
410 420
>>CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 (447 aa)
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Smith-Waterman score: 1513; 52.3% identity (76.9% similar) in 428 aa overlap (10-429:9-433)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRTLLPPALLTCWLLAPVN-SIHPECRFHLE--IQEEETKCAELLRSQTEKHKACSGVWD
:. :: :. ..: .: :. : . :. . :. : . ... .: :.::
CCDS56 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWD
10 20 30 40 50
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pF1KE9 NITCWRPANVGETVTVPCPKVFSNFY--SKAGNISKNCTSDGWSETFPDFVDACGYSDPE
:::::.::.::: : : ::..: : . : .:.::: ::::: :: . ::::... :
CCDS56 NITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQDMGVVSRNCTEDGWSEPFPHYFDACGFDEYE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 DES--KITFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRA
.:. . .:. :::.::.:::.::..:.:. .::: :::::::::.::.:::.::.:::
CCDS56 SETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 ISVLVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLV-
:::..:: .::. . . :: : : :: .::..::...:.:::..::::: ::::
CCDS56 ISVFIKDWILYAEQDSNHC---FISTVECKAVMVFFHYCVVSNYFWLFIEGLYLFTLLVE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 AMLPPRRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISI
...: :: : : .:::: ::::. .:.. :::..:::::: :: .. ::::. :.. ::
CCDS56 TFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMNDSTALWWVIKGPVVGSI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 IVNFVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISIS
.:::::::.:: ::.::: :::.:::..: : :::.::::::::::.:: ::: : ..:
CCDS56 MVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVS
300 310 320 330 340 350
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pF1KE9 SKYQILFELCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSR
.. ...::: ::::::.::::::::::.::: :.:::::: . . :.. :..
CCDS56 KRERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLAS
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KE9 NGSEGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
.: .:. :. :...:
CCDS56 SGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
420 430 440
>>CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (457 aa)
initn: 1111 init1: 652 opt: 1359 Z-score: 1579.4 bits: 301.4 E(32554): 1.2e-81
Smith-Waterman score: 1361; 46.9% identity (71.3% similar) in 463 aa overlap (1-438:1-457)
10 20 30 40
pF1KE9 MRTLLP-PALLTC-------WLLAPVNS----IHPECRFHLEIQEEETKCAELLRSQTEK
:: : :: : : :.:... .. :: . :. .. .: : ..: :.
CCDS26 MRPPSPLPARWLCVLAGALAWALGPAGGQAARLQEECDYVQMIEVQHKQCLE--EAQLEN
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 HK-ACSGVWDNITCWRPANVGETVTVPCPKVFSNFYSKAG-NISKNCTSDGWSETFPD-F
. .:: .:::.::: . :..:.. :: .:. : : : :.:..::..::.. : .
CCDS26 ETIGCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFKLFSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 VDACGYSDPE---DESKITFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIH
::: .: ::.. :: ::. ::.::..:: .: ... :: :::::::::::::
CCDS26 PIACGLDDKAASLDEQQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LNLFLSFILRAISVLVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYCIMANFFWLLV
..::.:::::: .:..:: .:..:. . .: . :::: ..::.:::.:::::::::
CCDS26 MHLFISFILRAAAVFIKDLALFDSGESDQCSEGS---VGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 EGLYLHTLL-VAMLPPRRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPW
:::::.::: :... :. : .:.:::::.:.. .:: ::...:: ::::: . :. :
CCDS26 EGLYLYTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTINSSL-W
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 WVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHY
:.:. ::: ::.:::.::: ::::::::: ::. .:.: :.:::.:::::::::::::
CCDS26 WIIKGPILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 MVFAVFPISISSKYQILFELCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASR
..:: :: ... . ...::: .:::::.:::.::::::.::: ::.:::: .
CCDS26 IMFAFFPDNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGW
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KE9 DYRVCGSSFSRNGSEGALQFHR------GSRAQSFLQTETSVI
. . : . ::. . : :.: .: .:.:.:..
CCDS26 NPKYRHPSGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
420 430 440 450
>>CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (416 aa)
initn: 1111 init1: 652 opt: 1335 Z-score: 1552.1 bits: 296.2 E(32554): 3.9e-80
Smith-Waterman score: 1335; 48.9% identity (74.2% similar) in 423 aa overlap (29-438:2-416)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRTLLPPALLTCWLLAPVNSIHPECRFHLEIQEEETKCAELLRSQTEKHK-ACSGVWDNI
.:.:... : : ..: :.. .:: .:::.
CCDS58 MIEVQHKQ--CLE--EAQLENETIGCSKMWDNL
10 20
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 TCWRPANVGETVTVPCPKVFSNFYSKAG-NISKNCTSDGWSETFPD-FVDACGYSDPE--
::: . :..:.. :: .:. : : : :.:..::..::.. : . ::: .:
CCDS58 TCWPATPRGQVVVLACPLIFKLFSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPYPIACGLDDKAAS
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 -DESKITFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAI
::.. :: ::. ::.::..:: .: ... :: :::::::::::::..::.::::::
CCDS58 LDEQQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAA
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SVLVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLL-VA
.:..:: .:..:. . .: . :::: ..::.:::.::::::::::::::.::: :.
CCDS58 AVFIKDLALFDSGESDQCSEGS---VGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVS
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 MLPPRRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISII
.. :. : .:.:::::.:.. .:: ::...:: ::::: . :. ::.:. ::: ::.
CCDS58 FFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTINSSL-WWIIKGPILTSIL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 VNFVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISS
:::.::: ::::::::: ::. .:.: :.:::.:::::::::::::..:: :: ...
CCDS58 VNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKP
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 KYQILFELCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRN
. ...::: .:::::.:::.::::::.::: ::.:::: . . . : . :
CCDS58 EVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWNPKYRHPSGGSN
330 340 350 360 370 380
420 430
pF1KE9 GSEGALQFHR------GSRAQSFLQTETSVI
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CCDS58 GATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
390 400 410
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10 20 30 40 50
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:. :: :. ..: .: :. : . :. . :. : . ... .: :.::
CCDS54 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWD
10 20 30 40 50
60 70 80 90
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CCDS54 NITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCT
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
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CCDS54 EDGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFR
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160 170 180 190 200 210
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:::::::.::.:::.::.::::::..:: .::. . . :: : : :: .::..::
CCDS54 KLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHC---FISTVECKAVMVFFHYC
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220 230 240 250 260 270
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...:.:::..::::: :::: ...: :: : : .:::: ::::. .:.. :::..::::
CCDS54 VVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGC
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280 290 300 310 320 330
pF1KE9 WDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTL
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CCDS54 WDMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYLRLARSTL
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340 350 360 370 380 390
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:::::::.:: ::: : ..:.. ...::: ::::::.::::::::::.::: :.:::::
CCDS54 LLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWR
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400 410 420 430
pF1KE9 SRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
: . . :.. :.. .: .:. :. :...:
CCDS54 SWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
420 430 440 450 460
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10 20 30 40
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.. :: :.::.: : .. :. : . ::. .: :: : ::
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CCDS21 TEQPVPGCEGMWDNISCW-PSSVPGRMVEVECPRFLRMLTSRNGSLFRNCTQDGWSETFP
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::: . : .:.. .. . .:..::.::: ::. : .. ::: ::.::::::::
CCDS21 RPNLACGVNVNDSSNEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFRRLHCTRNYI
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170 180 190 200 210 220
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:..::.::::::.: ..:: ::.::. . .: . .:::: .:..:::::::. :::
CCDS21 HMHLFVSFILRALSNFIKDAVLFSSDDVTYC---DAHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSWLL
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230 240 250 260 270 280
pF1KE9 VEGLYLHTLL-VAMLPPRRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVP
:::::::::: .... :. . ... .::: :.. .. :. :: .:::.:::: : ..
CCDS21 VEGLYLHTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIARHFLEDVGCWDINANASI
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290 300 310 320 330 340
pF1KE9 WWVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVH
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CCDS21 WWIIRGPVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFGIH
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pF1KE9 YMVFAVFPISISSKYQILFELCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSAS
:.::: : . . . :..::: :::::::::::::::::.::: :...::.
CCDS21 YIVFAFSPED-AMEIQLFFELALGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHLREFPL
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pF1KE9 RDYRVCGSSFSRNGSEGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
CCDS21 HPVASFSNSTKASHLEQSQGTCRTSII
420 430 440
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pF1KE9 HPECRFHLEIQEEETKCAELLRSQTEKHKACSGVWDNITCWRPANVGETVTVPCPKVFSN
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CCDS58 MRAGRRPRLGPWAGGCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFKL
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: : : :.:..::..::.. : . ::: .: ::. . :: ::. ::.::..
CCDS58 FSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPYPIACGLDDKAASLDEQTM-FYGSVKTGYTIGYGL
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:: .: ... :: :::::::::::::..::.:::::: .:..:: .:..:. . .: .
CCDS58 SLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLALFDSGESDQCSEGS
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CCDS58 ---VGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTF
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pF1KE9 IGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKLTSPDV
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CCDS58 TMVWTIARIHFEDYGCWDTINSSL-WWIIKGPILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDI
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pF1KE9 GGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKYQILFELCLGSFQGLVVAVLY
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CCDS58 RKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILY
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CCDS58 CFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWNPKYRHPSGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSS
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430
pF1KE9 FLQTETSVI
.:.:.:..
CCDS58 SFQAEVSLV
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pF1KE9 MRTLLPPALLTCWLLAPVNSI----HPECRFHLEIQEEETKCAELLRSQTEKHKACSGVW
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CCDS54 DGLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFSHFSSESGAVKRDCTITGWSEPFPPYPVACPVPLELL
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. ... :: :::.:.:.:...: .. :: .:.::: :::.: .:: .:::.: .:
CCDS54 AEEESYFSTVKIIYTVGHSISIVALFVAITILVALRRLHCPRNYVHTQLFTTFILKAGAV
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..:: .:. :. : :: : : ::.:.. .. :.:: :::.:..::. ::.. :
CCDS54 FLKDAALFHSDDTDHCS---FSTVLCKVSVAASHFATMTNFSWLLAEAVYLNCLLASTSP
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pF1KE9 P-RRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVN
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CCDS54 SSRRAFWWLVLAGWGLPVLFTGTWVSCKLAFEDIACWDLDDTSPYWWIIKGPIVLSVGVN
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pF1KE9 FVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKY
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CCDS54 FGLFLNIIRILVRKLEPAQGSLHTQSQYWRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFNFLPDNAGLGI
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.. .:: ::::::..::.::::::.::. :..:::... : . :. .. ::...
CCDS54 RLPLELGLGSFQGFIVAILYCFLNQEVRTEISRKWHGHDPELLPAWRTRAKWTTPSRSAA
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pF1KE9 EGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
.
CCDS54 KVLTSMC
420
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CCDS56 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWD
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pF1KE9 NITCWRPANVGETVTVPCPKVF----------------SNF-------YSKAGNISKNCT
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CCDS56 EDGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFR
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pF1KE9 KLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYC
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CCDS56 KLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHC---FISTVECKAVMVFFHYC
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pF1KE9 IMANFFWLLVEGLYLHTLLV-AMLPPRRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGC
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CCDS56 VVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGC
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CCDS56 WDMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKCY
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pF1KE9 --------------------KRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKYQILFELCL
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CCDS56 CKPQRAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGL
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pF1KE9 GSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQFHR
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CCDS56 GSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSI
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CCDS56 LSKSSSQIRMSGLPADNLAT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]