Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9523
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9523, 461 aa
1>>>pF1KE9523 461 - 461 aa - 461 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6973+/-0.00112; mu= 15.2592+/- 0.066
mean_var=70.7690+/-14.969, 0's: 0 Z-trim(102.5): 82 B-trim: 390 in 1/48
Lambda= 0.152459
statistics sampled from 6887 (6971) to 6887 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 ( 461) 3157 704.1 7.7e-203
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 474) 1872 421.5 9.5e-118
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 508) 1209 275.7 8e-74
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 438) 723 168.7 1.1e-41
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 411) 722 168.5 1.2e-41
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 397) 721 168.3 1.3e-41
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 447) 710 165.9 7.8e-41
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 416) 703 164.3 2.1e-40
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 457) 703 164.3 2.3e-40
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 409) 698 163.2 4.5e-40
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 387) 685 160.3 3.1e-39
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 ( 440) 682 159.7 5.5e-39
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 415) 672 157.5 2.4e-38
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 375) 626 147.4 2.5e-35
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 466) 626 147.4 3e-35
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 468) 625 147.2 3.5e-35
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 314) 585 138.3 1.1e-32
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 401) 575 136.2 6.2e-32
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 438) 574 136.0 7.8e-32
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 430) 562 133.3 4.8e-31
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 444) 532 126.7 4.8e-29
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs108|chr7 ( 423) 527 125.6 9.8e-29
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 ( 593) 521 124.4 3.3e-28
CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 422) 499 119.5 7e-27
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 240) 494 118.2 9.2e-27
CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 439) 454 109.6 6.9e-24
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 550) 454 109.6 8.4e-24
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 ( 477) 439 106.3 7.3e-23
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 ( 553) 439 106.3 8.3e-23
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 496) 431 104.5 2.6e-22
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 ( 463) 417 101.4 2e-21
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 349 86.6 1.1e-16
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 349 86.6 1.2e-16
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 247) 341 84.6 1.3e-16
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 308 77.5 4.8e-14
CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 308 77.5 5.1e-14
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 308 77.6 5.9e-14
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 294 74.4 3.2e-13
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 294 74.4 3.5e-13
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 294 74.4 3.8e-13
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 292 74.0 5.4e-13
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 291 73.9 1.1e-12
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 291 73.9 1.2e-12
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs108|chr22 (3014) 283 72.3 7.7e-12
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 275 70.4 1.4e-11
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 275 70.4 1.4e-11
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 266 68.4 4.4e-11
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 266 68.4 4.5e-11
CCDS58644.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 821) 263 67.7 5.3e-11
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 266 68.4 5.3e-11
>>CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 (461 aa)
initn: 3157 init1: 3157 opt: 3157 Z-score: 3755.1 bits: 704.1 E(32554): 7.7e-203
Smith-Waterman score: 3157; 100.0% identity (100.0% similar) in 461 aa overlap (1-461:1-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEKKCTLYFLVLLPFFMILVTAELEESPEDSIQLGVTRNKIMTAQYECYQKIMQDPIQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MEKKCTLYFLVLLPFFMILVTAELEESPEDSIQLGVTRNKIMTAQYECYQKIMQDPIQQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 EGVYCNRTWDGWLCWNDVAAGTESMQLCPDYFQDFDPSEKVTKICDQDGNWFRHPASNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EGVYCNRTWDGWLCWNDVAAGTESMQLCPDYFQDFDPSEKVTKICDQDGNWFRHPASNRT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 WTNYTQCNVNTHEKVKTALNLFYLTIIGHGLSIASLLISLGIFFYFKSLSCQRITLHKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 WTNYTQCNVNTHEKVKTALNLFYLTIIGHGLSIASLLISLGIFFYFKSLSCQRITLHKNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 FFSFVCNSVVTIIHLTAVANNQALVATNPVSCKVSQFIHLYLMGCNYFWMLCEGIYLHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 FFSFVCNSVVTIIHLTAVANNQALVATNPVSCKVSQFIHLYLMGCNYFWMLCEGIYLHTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IVVAVFAEKQHLMWYYFLGWGFPLIPACIHAIARSLYYNDNCWISSDTHLLYIIHGPICA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IVVAVFAEKQHLMWYYFLGWGFPLIPACIHAIARSLYYNDNCWISSDTHLLYIIHGPICA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ALLVNLFFLLNIVRVLITKLKVTHQAESNLYMKAVRATLILVPLLGIEFVLIPWRPEGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ALLVNLFFLLNIVRVLITKLKVTHQAESNLYMKAVRATLILVPLLGIEFVLIPWRPEGKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 AEEVYDYIMHILMHFQGLLVSTIFCFFNGEVQAILRRNWNQYKIQFGNSFSNSEALRSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AEEVYDYIMHILMHFQGLLVSTIFCFFNGEVQAILRRNWNQYKIQFGNSFSNSEALRSAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE9 YTVSTISDGPGYSHDCPSEHLNGKSIHDIENVLLKPENLYN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 YTVSTISDGPGYSHDCPSEHLNGKSIHDIENVLLKPENLYN
430 440 450 460
>>CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 (474 aa)
initn: 1851 init1: 1851 opt: 1872 Z-score: 2227.4 bits: 421.5 E(32554): 9.5e-118
Smith-Waterman score: 1872; 57.8% identity (81.6% similar) in 445 aa overlap (4-442:8-449)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MEKKCTLYFLVL------LPFFMILVTAELEESPEDSIQLGVTRNKIMTAQYECYQ
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CCDS56 MRFTFTSRCLALFLLLNHPTPILPAFSNQTYPTIEPKPFLYV---VGRKKMMDAQYKCYD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 KIMQDPIQQAEGVYCNRTWDGWLCWNDVAAGTESMQLCPDYFQDFDPSEKVTKICDQDGN
...: : :.:: ::::::::::::.:. ::. :.:.::::: :::::::::: ::. :
CCDS56 RMQQLPAYQGEGPYCNRTWDGWLCWDDTPAGVLSYQFCPDYFPDFDPSEKVTKYCDEKGV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 WFRHPASNRTWTNYTQCNVNTHEKVKTALNLFYLTIIGHGLSIASLLISLGIFFYFKSLS
::.:: .::::.:::.::. : ::.:.: :.::.:.::.::: .:.:::::: .:.::.
CCDS56 WFKHPENNRTWSNYTMCNAFTPEKLKNAYVLYYLAIVGHSLSIFTLVISLGIFVFFRSLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 CQRITLHKNLFFSFVCNSVVTIIHLTAVANNQALVATNPVSCKVSQFIHLYLMGCNYFWM
:::.:::::.:.... ::.. ::::. :. : :: .:::::. .:.: :.:.::::::
CCDS56 CQRVTLHKNMFLTYILNSMIIIIHLVEVVPNGELVRRDPVSCKILHFFHQYMMACNYFWM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LCEGIYLHTLIVVAVFAEKQHLMWYYFLGWGFPLIPACIHAIARSLYYNDNCWISSDTHL
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CCDS56 LCEGIYLHTLIVVAVFTEKQRLRWYYLLGWGFPLVPTTIHAITRAVYFNDNCWLSVETHL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LYIIHGPICAALLVNLFFLLNIVRVLITKLKVTHQAESNLYMKAVRATLILVPLLGIEFV
:::::::. :::.::.::::::::::.::.. ::.:::..:.:::.::.::::::::.::
CCDS56 LYIIHGPVMAALVVNFFFLLNIVRVLVTKMRETHEAESHMYLKAVKATMILVPLLGIQFV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 LIPWRPEGKIAEEVYDYIMHILMHFQGLLVSTIFCFFNGEVQAILRRNWNQYKIQFGNSF
..:::: .:. ..:::.:: :.::::..:.::.:: :.:::. ..:.: :.:::... .
CCDS56 VFPWRPSNKMLGKIYDYVMHSLIHFQGFFVATIYCFCNNEVQTTVKRQWAQFKIQWNQRW
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE9 SNSEALRSASYTVSTISDGPGYSHDCPSEHLNGKSIHDIENVLLKPENLYN
. . ::: .... : . : .: :
CCDS56 GRRPSNRSARAAAAAAEAGDIPIYICHQELRNEPANNQGEESAEIIPLNIIEQESSA
420 430 440 450 460 470
>>CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 (508 aa)
initn: 1201 init1: 1201 opt: 1209 Z-score: 1438.8 bits: 275.7 E(32554): 8e-74
Smith-Waterman score: 1830; 55.7% identity (78.7% similar) in 461 aa overlap (4-442:26-483)
10 20 30
pF1KE9 MEKKCTLYFLVL------LPFFMILVTAELEESPEDSI
.: ::.: :: : . .: .: .
CCDS55 MQFSGEKISGQRDLQKSKMRFTFTSRCLALFLLLNHPTPILPAFSNQTYPTIEPKPFLYV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 QLGVTRNKIMTAQYECYQKIMQDPIQQAEGVYCNRTWDGWLCWNDVAAGTESMQLCPDYF
: :.:.: :::.::....: : :.:: ::::::::::::.:. ::. :.:.:::::
CCDS55 ---VGRKKMMDAQYKCYDRMQQLPAYQGEGPYCNRTWDGWLCWDDTPAGVLSYQFCPDYF
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 QDFDPSEKVTKICDQDGNWFRHPASNRTWTNYTQCNVNTHEKVKTALNLFYLTIIGHGLS
:::::::::: ::. : ::.:: .::::.:::.::. : ::.:.: :.::.:.::.::
CCDS55 PDFDPSEKVTKYCDEKGVWFKHPENNRTWSNYTMCNAFTPEKLKNAYVLYYLAIVGHSLS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190
pF1KE9 IASLLISLGIFFYFK----------------SLSCQRITLHKNLFFSFVCNSVVTIIHLT
: .:.:::::: .:. ::.:::.:::::.:.... ::.. ::::.
CCDS55 IFTLVISLGIFVFFRKLTTIFPLNWKYRKALSLGCQRVTLHKNMFLTYILNSMIIIIHLV
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200 210 220 230 240 250
pF1KE9 AVANNQALVATNPVSCKVSQFIHLYLMGCNYFWMLCEGIYLHTLIVVAVFAEKQHLMWYY
:. : :: .:::::. .:.: :.:.::::::::::::::::::::::.:::.: :::
CCDS55 EVVPNGELVRRDPVSCKILHFFHQYMMACNYFWMLCEGIYLHTLIVVAVFTEKQRLRWYY
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 FLGWGFPLIPACIHAIARSLYYNDNCWISSDTHLLYIIHGPICAALLVNLFFLLNIVRVL
.:::::::.:. ::::.:..:.:::::.: .::::::::::. :::.::.::::::::::
CCDS55 LLGWGFPLVPTTIHAITRAVYFNDNCWLSVETHLLYIIHGPVMAALVVNFFFLLNIVRVL
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 ITKLKVTHQAESNLYMKAVRATLILVPLLGIEFVLIPWRPEGKIAEEVYDYIMHILMHFQ
.::.. ::.:::..:.:::.::.::::::::.::..:::: .:. ..:::.:: :.:::
CCDS55 VTKMRETHEAESHMYLKAVKATMILVPLLGIQFVVFPWRPSNKMLGKIYDYVMHSLIHFQ
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE9 GLLVSTIFCFFNGEVQAILRRNWNQYKIQFGNSFSNSEALRSASYTVSTISDGPGYSHDC
:..:.::.:: :.:::. ..:.: :.:::... .. . ::: .... : . :
CCDS55 GFFVATIYCFCNNEVQTTVKRQWAQFKIQWNQRWGRRPSNRSARAAAAAAEAGDIPIYIC
420 430 440 450 460 470
440 450 460
pF1KE9 PSEHLNGKSIHDIENVLLKPENLYN
.: :
CCDS55 HQELRNEPANNQGEESAEIIPLNIIEQESSA
480 490 500
>>CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 (438 aa)
initn: 592 init1: 218 opt: 723 Z-score: 862.1 bits: 168.7 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 723; 33.0% identity (62.8% similar) in 409 aa overlap (7-403:11-405)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MEKKCTLYFLVLLPFFMILVTAELEESPEDSIQLGVTRNKIMTAQYECY-QKIMQD
:: :: .. :. :. . .: :. ... . : : : . ::
CCDS56 MRGPSGPPGLLYVPHLLLCLLCLLPPPLQYAAGQS-QM--PKDQPLWALLEQYCHTIMTL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 PIQQAEGVYCNRTWDGW-LCWNDVAAGTESMQLCPDYFQD--FDPSEKVTKICDQDGNWF
.. ::: : : :: :::. . ::.::. .. .... . : ..:.:
CCDS56 TNLSGPYSYCNTTLDQIGTCWPRSAAGALVERPCPEYFNGVKYNTTRNAYRECLENGTW-
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE9 RHPASNRTWTNYTQCNVNTHEKVKTALNLFY-----LTIIGHGLSIASLLISLGIFFYFK
::. ::.::. .: . .: : .. .:: .:.:.:. .. .:. ..
CCDS56 ---ASK---INYSQCEPILDDK-QRKYDLHYRIALVVNYLGHCVSVAALVAAFLLFLALR
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SLSCQRITLHKNLFFSFVCNSVVTIIHLTAVANNQALVATNPVSCKVSQFIHLYLMGCNY
:. : : ..: ::. .:. .:. .. : : .. . .: : :. : :.. :.
CCDS56 SIRCLRNVIHWNLITTFILRNVMWFL-LQLV--DHEVHESNEVWCRCITTIFNYFVVTNF
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 FWMLCEGIYLHTLIVVAVFAEKQHLMWYYFLGWGFPLIPACIHAIARSLYYNDNCWISSD
:::. :: :::: ::.. .:. . . :.:: .:. ::.. : :..::....
CCDS56 FWMFVEGCYLHTAIVMTYSTERLRKCLFLFIGWCIPFPIIVAWAIGKLYYENEQCWFGKE
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 THLL--YIIHGPICAALLVNLFFLLNIVRVLITKLKVTHQAESNLYMKAVRATLILVPLL
: :: .::: .::.:. ::.::::.:.:::... .:. : :::.:::.:.:::
CCDS56 PGDLVDYIYQGPIILVLLINFVFLFNIVRILMTKLRASTTSETIQYRKAVKATLVLLPLL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 GIEFVLIPWRP-EGKIAEEVYDYIMHILMHFQGLLVSTIFCFFNGEVQAILRRNWNQYKI
:: ..:. : : ... .. :. .:. :::..::...:::::::.. .:. :....
CCDS56 GITYMLFFVNPGEDDLSQIMFIYFNSFLQSFQGFFVSVFYCFFNGEVRSAVRKRWHRWQD
350 360 370 380 390 400
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pF1KE9 QFGNSFSNSEALRSASYTVSTISDGPGYSHDCPSEHLNGKSIHDIENVLLKPENLYN
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CCDS54 TAAV
410
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440
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461 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 18:10:36 2016 done: Sun Nov 6 18:10:36 2016
Total Scan time: 2.430 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]