Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9519
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9519, 358 aa
1>>>pF1KE9519 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7744+/-0.000741; mu= 14.6732+/- 0.044
mean_var=99.3480+/-24.138, 0's: 0 Z-trim(110.8): 206 B-trim: 1362 in 2/49
Lambda= 0.128675
statistics sampled from 11612 (11872) to 11612 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 ( 358) 2397 455.2 3.9e-128
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 790 156.9 2.4e-38
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 416 87.5 2.1e-17
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 412 86.7 3.3e-17
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 409 86.2 4.9e-17
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 409 86.2 5.4e-17
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 396 83.7 2.6e-16
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 373 79.5 5e-15
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 367 78.4 1.1e-14
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 359 76.9 3.2e-14
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 356 76.3 4.7e-14
CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 ( 337) 353 75.7 6.2e-14
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 352 75.6 7.3e-14
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 352 75.6 7.4e-14
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 344 74.1 2.1e-13
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 339 73.2 4.2e-13
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 338 73.0 4.5e-13
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 338 73.0 4.6e-13
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 331 71.7 1.1e-12
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 326 70.7 2.1e-12
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 326 70.8 2.2e-12
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 326 70.8 2.2e-12
CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 323 70.1 2.8e-12
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 323 70.2 3.2e-12
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 319 69.5 5.3e-12
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 316 68.9 7.7e-12
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 315 68.7 8.1e-12
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 315 68.7 9e-12
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 314 68.5 1e-11
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 306 67.1 2.9e-11
CCDS8165.1 GPR152 gene_id:390212|Hs108|chr11 ( 470) 307 67.3 3e-11
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 305 66.8 3.1e-11
CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3 ( 333) 303 66.4 3.9e-11
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 303 66.5 4.1e-11
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 301 66.2 5.9e-11
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 300 65.9 6e-11
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 300 65.9 6.1e-11
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 298 65.6 7.8e-11
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 297 65.4 8.7e-11
>>CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 (358 aa)
initn: 2397 init1: 2397 opt: 2397 Z-score: 2413.9 bits: 455.2 E(32554): 3.9e-128
Smith-Waterman score: 2397; 100.0% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAALLGLPGNGFVVWSLAGWRPARGRPLAATL
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CCDS96 MSVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAALLGLPGNGFVVWSLAGWRPARGRPLAATL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQAWPLGQAGCKAVYYVCALSMYASVLLTGLLSLQRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 VLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQAWPLGQAGCKAVYYVCALSMYASVLLTGLLSLQRC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALLLAVPAAVYRHLWRDRVCQLCHPSPVHAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 LAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALLLAVPAAVYRHLWRDRVCQLCHPSPVHAAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 HLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLARLRGARWGSGRHGARVGRLVSAIVLAFGLLWAPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 HLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLARLRGARWGSGRHGARVGRLVSAIVLAFGLLWAPY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 HAVNLLQAVAALAPPEGALAKLGGAGQAARAGTTALAFFSSSVNPVLYVFTAGDLLPRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 HAVNLLQAVAALAPPEGALAKLGGAGQAARAGTTALAFFSSSVNPVLYVFTAGDLLPRAG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 PRFLTRLFEGSGEARGGGRSREGTMELRTTPQLKVVGQGRGNGDPGGGMEKDGPEWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 PRFLTRLFEGSGEARGGGRSREGTMELRTTPQLKVVGQGRGNGDPGGGMEKDGPEWDL
310 320 330 340 350
>>CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 (352 aa)
initn: 716 init1: 379 opt: 790 Z-score: 801.8 bits: 156.9 E(32554): 2.4e-38
Smith-Waterman score: 796; 45.7% identity (71.1% similar) in 322 aa overlap (25-331:21-336)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MSVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAALL--GLPGNGFVVWSLAGWRPARGRPLAA
:..::.. : :::::.:::::. . . : ..:
CCDS96 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVWSI--LKRMQKRSVTA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 TLVLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQAWPLGQAGCKAVYYVCALSMYASVLLTGLLSLQ
.::.::::: :::: .:.:. ::.. .: .: :::. .:::..:::::::: .::.
CCDS96 LMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCGVSMYASVLLITAMSLD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 RCLAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALLLAVPAAVYRHL--WRDRVCQLC---HP
: :::.:::.. .::. :.:::.: ..:. ..:::.:. .:: . :. . .:: .:
CCDS96 RSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVPWKTNM-SLCFPRYP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SPVHAAAHLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLARLRGARWGSGRHGARVGRLVSAIVLAF
: : : :: .:..:.:.::: ... :: ::.. :. :.. :.:::: :.:.:
CCDS96 SEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRF---RRSRRTGRLVVLIILTF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 GLLWAPYHAVNLLQAVAALAPPEGALAKLGGAGQAARAGTTALAFFSSSVNPVLYVFTAG
. .: :::.::: .: ::: ..:. .: . :: ::::.:::::::::. ..:
CCDS96 AAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALAFLSSSVNPVLYACAGG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE9 DLLPRAGPRFLTRLFEGSG-EA----RGG--GRS-REGTMELRTTPQLKVVGQGRGNGDP
:: :: :...:.::.: :: ::: :.. : : :. :
CCDS96 GLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAALEPGPSESLTASSPLKLNE
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE9 GGGMEKDGPEWDL
CCDS96 LN
>>CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 (385 aa)
initn: 288 init1: 190 opt: 416 Z-score: 426.0 bits: 87.5 E(32554): 2.1e-17
Smith-Waterman score: 416; 34.2% identity (59.9% similar) in 322 aa overlap (13-319:71-375)
10 20 30 40
pF1KE9 MSVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAALLGLPGNGFVV
::.: .: . :. :. ..:::.::...
CCDS12 SILPAPRGYPGQVCANDSDTLELPDSSRALLLGWVPTRLV-PALYGLVLVVGLPANGLAL
50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 WSLAGWRPARGRPLAATLVLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTR-QAWPLGQAGCKAVYYVC
: :: : : .. :...:: :: . : : .:. : : ::.:.:.:. . .
CCDS12 WVLATQAP---RLPSTMLLMNLAAADLLLALALPPRIAYHLRGQRWPFGEAACRLATAAL
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 ALSMYASVLLTGLLSLQRCLAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALLLAVPAAVYRH
::.:::: . .::.: ::...:. : ::. :: : .:.:: : ::.: .. :.
CCDS12 YGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWLMAAALALPLTLQRQ
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210
pF1KE9 LWR----DRVCQLCHPS-PVHA-AAH----LSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLARLRGA
.: ::: ::: . :. : :.: .. .: . ::. :: ::..:: : .
CCDS12 TFRLARSDRV--LCHDALPLDAQASHWQPAFTCLALLGCFLPLLAMLLCYGATLHTLAA-
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 RWGSGRHGARVGRLVSAIVLAFGLLWAPYHAVNLLQAVAALAPPEGALAKLGGAGQAARA
:::. ... :: .:.::: .. : . ::: . : .: ..: :: .
CCDS12 ---SGRRYGHALRL-TAVVLASAV--AFFVPSNLLLLLHYSDPSPSAWGNLYGA----YV
280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KE9 GTTALAFFSSSVNPVLYVFTAGDLLP--RAG--PRFLTRLFEGSGEARGGGRSREGTMEL
. ::. ..: :.: .: ...... ::: : ... :.::.:
CCDS12 PSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHSSL
330 340 350 360 370 380
330 340 350
pF1KE9 RTTPQLKVVGQGRGNGDPGGGMEKDGPEWDL
CCDS12 LQ
>>CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 (362 aa)
initn: 282 init1: 84 opt: 412 Z-score: 422.4 bits: 86.7 E(32554): 3.3e-17
Smith-Waterman score: 412; 35.6% identity (61.5% similar) in 317 aa overlap (19-323:40-339)
10 20 30 40
pF1KE9 MSVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAALLGLPGNGFVVWS-LAG
::: . : .: ::: :::.:. . ::.
CCDS11 SWGHYSGDEEDAYSAEPLPELCYKADVQAFSRAFQPSVSLTVAALGLAGNGLVLATHLAA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 WRPARGRPLAATLVLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQAWPLGQAGCKAVYYVCALSMYA
: ::. : .: : :.::::: . : : :.: . :.: ::.: :... . . :..:
CCDS11 RRAARS-PTSAHL-LQLALADLLLALTLP-FAAAGALQGWSLGSATCRTISGLYSASFHA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 SVLLTGLLSLQRCLAVTRPFLA-PRLRSPALARRLLLAVWLAALLLAVPAAVYRHL-WRD
. :. . .: .: .:..: . : :: .:. :. . . ::: .::::.:: .. . :.
CCDS11 GFLFLACISADRYVAIARALPAGPRPSTPGRAHLVSVIVWLLSLLLALPALLFSQDGQRE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE9 --RVCQLCHP----SPVHAAAHLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLARLRGARWGSGRHG
: :.: : . :..:. .. .: .:.::.:.:..::.. : .:: : :.
CCDS11 GQRRCRLIFPEGLTQTVKGASAVAQVAL-GFALPLGVMVACYALLGRTLLAAR-GPERR-
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 ARVGRLVSAIVLAFGLLWAPYHAVNLLQAVAALAPPEGALAKLGGAGQAARAGTTALAFF
:. :.: :.: :: .: :: . ::... :: : . . ..: :..::.
CCDS11 -RALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERS-CPASKRKDVALLVTSGLALA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 SSSVNPVLYVFTAGDLLPRAGPRF---LTRLFEGSGEARGGGRSREGTMELRTTPQLKVV
..:::::.: : :: : ::..: : .: . :.:
CCDS11 RCGLNPVLYAFL--------GLRFRQDLRRLLRG-GSCPSGPQPRRGCPRRPRLSSCSAP
310 320 330 340 350
340 350
pF1KE9 GQGRGNGDPGGGMEKDGPEWDL
CCDS11 TETHSLSWDN
360
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
initn: 332 init1: 121 opt: 409 Z-score: 419.3 bits: 86.2 E(32554): 4.9e-17
Smith-Waterman score: 409; 33.1% identity (58.6% similar) in 326 aa overlap (2-319:36-346)
10 20 30
pF1KE9 MSVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAA
: : :: . . : . .:: :. :
CCDS14 SDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDF-SLNFDRAFLPALYSLLF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 LLGLPGNGFVVWSLAGWRPARGRPLAATLVLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQAWPLGQ
:::: ::: :. : . : : . . :..::::.:: ..: ::... . : : .:.
CCDS14 LLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSS--TDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQ-WVFGS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 AGCKAVYYVCALSMYASVLLTGLLSLQRCLAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALL
. ::.. . ...::..:: . .:..: : ... : :: . :::: ::
CCDS14 GLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE9 LAVPAAVYRHLWRD-RV----CQLCHPSPVHAAAHLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLA
.:.: .. .: :. :: :. : .: :. ...:.::. .: ::. ::
CCDS14 FALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQ-VGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILA
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 RLRGARWGSGRHGARVGRLVSAIVLAFGLLWAPYHAVNLLQAVAALAPPEGALAKLGGAG
: .: :.. :. ::: ..:.::.: :.::: : :.. . : ::::. :
CCDS14 VLLVSR---GQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDL----GALARNCGRE
250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 Q---AARAGTTALAFFSSSVNPVLYVFTAGDLLPRAGPRFLTRLFEGSGEARGGGRSREG
. .:.. :..:... .::.::.:.. . : .: :: : . :: :
CCDS14 SRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMW-MLLLRL--GCPNQRGLQRQPSS
300 310 320 330 340 350
330 340 350
pF1KE9 TMELRTTPQLKVVGQGRGNGDPGGGMEKDGPEWDL
CCDS14 SRRDSSWSETSEASYSGL
360
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 332 init1: 121 opt: 409 Z-score: 418.6 bits: 86.2 E(32554): 5.4e-17
Smith-Waterman score: 409; 33.1% identity (58.6% similar) in 326 aa overlap (2-319:83-393)
10 20 30
pF1KE9 MSVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAA
: : :: . . : . .:: :. :
CCDS48 SDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDF-SLNFDRAFLPALYSLLF
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 LLGLPGNGFVVWSLAGWRPARGRPLAATLVLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQAWPLGQ
:::: ::: :. : . : : . . :..::::.:: ..: ::... . : : .:.
CCDS48 LLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSS--TDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQ-WVFGS
120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 AGCKAVYYVCALSMYASVLLTGLLSLQRCLAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALL
. ::.. . ...::..:: . .:..: : ... : :: . :::: ::
CCDS48 GLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLL
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200
pF1KE9 LAVPAAVYRHLWRD-RV----CQLCHPSPVHAAAHLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLA
.:.: .. .: :. :: :. : .: :. ...:.::. .: ::. ::
CCDS48 FALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQ-VGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILA
230 240 250 260 270 280
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270 280 290 300 310 320
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CCDS48 SRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMW-MLLLRL--GCPNQRGLQRQPSS
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330 340 350
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CCDS48 SRRDSSWSETSEASYSGL
400 410
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CCDS14 MSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYRGLQPLPGGQDSQCG
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CCDS14 EEPSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGRARRNSL--RIIFAIE
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CCDS14 STFVGSWLPFSA---LRAVFHLAR-LGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAFVNSCANPLI
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:.. .. ::
CCDS14 YLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAANTASASW
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CCDS10 LWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIVVKVRAAGVRVGCVRRRSERKVTRMVLVVVL
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240 250 260 270 280 290
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.:. : :. .::... ..:: : : : : : .. :.. .: .::::: :
CCDS10 VFAGCWLPFFTVNIVNLAVAL-PQEPASAGL-------YFFVVILSYANSCANPVLYGFL
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CCDS32 GNVLVMFGIV--RYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKA
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CCDS32 VLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPI
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CCDS11 MALTPESPSSFPGLAATGSSVPEPPGGPNATLNSSWASPTEPSSLEDLVATGTIGTLLSA
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