Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9518
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9518, 322 aa
1>>>pF1KE9518 322 - 322 aa - 322 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5008+/-0.00105; mu= 15.4801+/- 0.062
mean_var=114.6252+/-32.918, 0's: 0 Z-trim(104.8): 140 B-trim: 978 in 2/49
Lambda= 0.119794
statistics sampled from 7920 (8080) to 7920 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 2132 379.8 1.6e-105
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 1779 318.8 3.6e-87
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 1663 298.7 3.9e-81
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 1341 243.1 2.3e-64
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 725 136.6 2.5e-32
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 657 124.9 8.4e-29
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 617 118.0 1e-26
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 606 116.1 4e-26
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 546 105.6 4.8e-23
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 465 91.8 9.3e-19
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 2132 init1: 2132 opt: 2132 Z-score: 2008.1 bits: 379.8 E(32554): 1.6e-105
Smith-Waterman score: 2132; 100.0% identity (100.0% similar) in 322 aa overlap (1-322:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
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CCDS78 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAVSTER
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CCDS78 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAVSTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSDFIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSDFIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFLFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 WIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 WIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDASE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
::::::::::::::::::::::
CCDS78 VDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1779 init1: 1779 opt: 1779 Z-score: 1678.4 bits: 318.8 E(32554): 3.6e-87
Smith-Waterman score: 1779; 83.2% identity (92.2% similar) in 322 aa overlap (1-322:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
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CCDS78 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAVSTER
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CCDS78 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAISTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSDFIT
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CCDS78 CLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGANSVWCETSDFIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFLFL
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CCDS78 IAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWALFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 WIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDASE
::.: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :
CCDS78 RIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDTPE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
:::::: ::.: ::::::::::
CCDS78 VDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1663 init1: 1663 opt: 1663 Z-score: 1570.0 bits: 298.7 E(32554): 3.9e-81
Smith-Waterman score: 1663; 79.4% identity (89.1% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
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CCDS78 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAVSTER
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CCDS78 VSIYILNLAAADFLFLSFQIIRLPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAISTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSDFIT
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CCDS78 CLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSDFIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFLFL
:::::::::::: ::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::: :.
CCDS78 VAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALIY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 WIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDASE
.:.. :::.:::.:: . ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS78 RMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDKPE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
::.: :::::: ::::::::
CCDS78 VDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
310 320
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 1118 init1: 997 opt: 1341 Z-score: 1269.1 bits: 243.1 E(32554): 2.3e-64
Smith-Waterman score: 1341; 65.3% identity (81.8% similar) in 329 aa overlap (1-320:1-329)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDPTISTLDTELTPINGTEETL---CYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMR
:::: . :: : .::....: : :.:: . : ...::::.::. :::::: :::
CCDS78 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RNAFSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSL--LS--FISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFL
:::::.:.:.::.:::::: ..: : :: : :: .. ... :: .:.::::.:
CCDS78 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSML
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SAVSTERCLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWC
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CCDS78 STVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 QTSDFITVAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFG
:: ::::.:::::: .:::::::.::.::::::: .::::::.:::::::::::::::::
CCDS78 QTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IQFFLFLWIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQN--LKLVL
::.::.::: : .:::::.: ::. ::.:::::::::::::::::.. :. :::.:
CCDS78 IQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLAL
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE9 QRALQDASEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
:::::: .:::.. : . . :.: : :
CCDS78 QRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
310 320 330
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 501 init1: 272 opt: 725 Z-score: 693.9 bits: 136.6 E(32554): 2.5e-32
Smith-Waterman score: 725; 42.1% identity (69.8% similar) in 321 aa overlap (1-309:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
:. :... : . .: .. . . : :. :. .. : :..::..:.:::: ::.::
CCDS31 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE9 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIP--HTISKI---LYPVMMFSYFAGLSFLSA
: ::::::::::.::: . . : ::. . : .: .:. . .:.:.: .:::.:.:
CCDS31 FCIYILNLAAADLLFLFS--MASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 VSTERCLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCG-FLFSGADSAWCQ
.::.::::::.:::..:::: :::: :: :::.: :: . : .:. :: . : :
CCDS31 ISTQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDR--CF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TSDFITVAWLI-FLCVVLCGSSLVLLIRILCGS---RKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGL
:.. .: .. : :. :::.:.. . .: :. : :::.:..: .:::::.:.:
CCDS31 RVDMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQP-TRLFVVVLASVLVFLICSL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 PFGIQFFLFLWIHVDREV-LFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFR-QRQNRQNLK
:..: .:.. :. . :. ..: .: . :...:::::.:::.::: : .: ..:
CCDS31 PLSIYWFVLYWLSLPPEMQVLCFS--LSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSLG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE9 LVLQRALQDASEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
:::.::.. :.. ::. :
CCDS31 TVLQQALREEPELE--GGETPTVGTNEMGA
300 310 320
>>CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 593 init1: 396 opt: 657 Z-score: 630.6 bits: 124.9 E(32554): 8.4e-29
Smith-Waterman score: 657; 39.7% identity (69.5% similar) in 292 aa overlap (16-301:15-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
::..: . .. : . :: ..: :: ::..:::::. . ::
CCDS41 MMEPREAGQHVGAANGAQEDVAFN--LIILSLTEGLGLGGLLGNGAVLWLLSSNVYRNP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE9 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIY---SLLS-FISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAV
:.::.:..: ::..::. ... .::. ...: .. : . .: :..:::.:.::
CCDS41 FAIYLLDVACADLIFLGCHMVAIVPDLLQGRLDFPGFVQTSLATLRFFCYIVGLSLLAAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 STERCLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTS
:.:.::..:.: :: :.:: ::.. ::.: ::: :: .: : .:. . :.:
CCDS41 SVEQCLAALFPAWYSCRRPRHLTTCVCALTWALCLLLHLLLSGACTQFFGEPSRHLCRTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 DFITVAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQF
..... : .:: ..::.::.::.:. : .. : . ::::::.::.::::::: .
CCDS41 WLVAAVLLALLCCTMCGASLMLLLRVERGPQRPPPRGFPGLILLTVLLFLFCGLPFGIYW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 FL--FLWIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRA
. .:: .. . : : :....:.. .:.:..:: .:: . : : :.::::::
CCDS41 LSRNLLW-YIPH--YFYHF---SFLMAAVHCAAKPVVYFCLGSAQGR--RLPLRLVLQRA
240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE9 LQDASEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
: : .:.
CCDS41 LGDEAELGAVRETSRRGLVDIAA
290 300 310
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 613 init1: 278 opt: 617 Z-score: 593.0 bits: 118.0 E(32554): 1e-26
Smith-Waterman score: 617; 38.7% identity (72.1% similar) in 269 aa overlap (37-297:42-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 TLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNAFSIYIL
.: ::.. :...::.: ::::: :..::
CCDS52 EEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRRNPFTVYIT
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NLAAADFLFLSGRLIYSL---LSF-ISIPHTISKILYPV-MMFSYFAGLSFLSAVSTERC
.:. ::. .: .: :. :.. .: : . . : ..:.: .:: .:.:.:.:::
CCDS52 HLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLLTAISVERC
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE9 LSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAW-CQTSD-FI
::::.::::::::: . ::.::.:::::: : . .:...: . : :.. ::
CCDS52 LSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSRNDCRAVIIFI
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TV-AWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFL
.. ..:.: ..: :: .:...: .. ..::..:..:...::. ..:. . ..:
CCDS52 AILSFLVFTPLMLV-SSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIFAMPMRLLYLL
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 FLWIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDA
. . : ..: .:...:..::::::.::::::: .... ...::.:: ::..:
CCDS52 Y----YEYWSTFGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLTRAFKDE
260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE9 SEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
CCDS52 MQPRRQKDNCNTVTVETVV
310 320
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
initn: 596 init1: 265 opt: 606 Z-score: 582.4 bits: 116.1 E(32554): 4e-26
Smith-Waterman score: 606; 36.7% identity (69.2% similar) in 286 aa overlap (36-312:53-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 STLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNAFSIYI
.. : ::.::..:::..: ..:: ::::.
CCDS81 EAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYF
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110
pF1KE9 LNLAAADFLFLSGRLIYSLL-------SFISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAVST
:.::.:: .: .. ..:.: .: . ... ..: : ...:.:.: :::.
CCDS81 LHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCM---FLTGVSLLPAVSA
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ERCLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSD-
::: ::..: :: .:: .::::::.:::.:::: . :. ..: :: :: .: :. :
CCDS81 ERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAACRHMDI
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 FITVAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLT-RLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQF
:. . ... : .. :.:.... : .:. . .: .:: : :::. .. .::..
CCDS81 FLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYLGIDW
200 210 220 230 240 250
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]