Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9513
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9513, 365 aa
1>>>pF1KE9513 365 - 365 aa - 365 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5750+/-0.000766; mu= 14.8461+/- 0.046
mean_var=131.0138+/-41.688, 0's: 0 Z-trim(109.1): 239 B-trim: 1290 in 2/47
Lambda= 0.112051
statistics sampled from 10245 (10655) to 10245 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 2.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 2498 415.6 3.5e-116
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 1242 212.5 4.7e-55
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 840 147.6 1.7e-35
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 772 136.5 3.2e-32
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 694 123.9 2e-28
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 683 122.2 7.3e-28
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 642 115.5 7e-26
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 608 110.0 3.3e-24
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 538 98.8 8.7e-21
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 536 98.5 1.1e-20
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 534 98.0 1.2e-20
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 529 97.3 2.3e-20
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 526 96.7 3e-20
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 522 96.1 5e-20
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 518 95.5 7.7e-20
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 518 95.5 8.1e-20
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 518 95.5 8.2e-20
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 514 94.9 1.3e-19
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 514 94.9 1.3e-19
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 514 94.9 1.3e-19
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 514 94.9 1.3e-19
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 514 94.9 1.3e-19
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 514 94.9 1.3e-19
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 513 94.6 1.3e-19
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 514 94.9 1.3e-19
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 514 94.9 1.3e-19
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 514 94.9 1.4e-19
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 514 95.0 1.5e-19
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 510 94.2 1.9e-19
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 509 94.0 2.1e-19
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 506 93.5 3e-19
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 506 93.5 3e-19
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 500 92.6 5.9e-19
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 500 92.6 6.4e-19
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 496 91.9 9e-19
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 496 91.9 9.1e-19
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 496 91.9 9.2e-19
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 496 91.9 9.3e-19
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 491 91.1 1.5e-18
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 486 90.2 2.5e-18
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 486 90.2 2.6e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 485 90.1 3.1e-18
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 484 90.0 3.5e-18
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 481 89.5 5.1e-18
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 478 89.0 7.1e-18
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 475 88.5 9.6e-18
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 471 87.9 1.5e-17
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 469 87.5 1.8e-17
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 469 87.6 1.9e-17
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 467 87.3 2.4e-17
>>CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX (365 aa)
initn: 2498 init1: 2498 opt: 2498 Z-score: 2199.4 bits: 415.6 E(32554): 3.5e-116
Smith-Waterman score: 2498; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSNKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSNKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 TTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSSSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSSSR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASANSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASANSC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCSTP
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 RADRL
:::::
CCDS14 RADRL
>>CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 (377 aa)
initn: 1217 init1: 875 opt: 1242 Z-score: 1101.9 bits: 212.5 E(32554): 4.7e-55
Smith-Waterman score: 1242; 58.8% identity (79.6% similar) in 313 aa overlap (22-332:20-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
:. : :.::::..::::::.:: : :: ::: .:..:
CCDS82 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVPGLCLNAVALYIF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
. ::. :.:..:::::::.::.::. ::: :.:::: .::::.: .::.:::::: :::
CCDS82 LCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSNKG
::.:::::::::: ::. .:::.::::: : : . :::..: .: .: :.::::: .:
CCDS82 CSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVTTSARG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 TTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSSSR
: ::::. :: :...: .::...::::.:: : :::: :::::: .: :.. . :
CCDS82 GRVTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGTSGGLPR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE9 LR--SLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASAN
. :.:::::::.:::.::.:::.:::.:: : :. .:..:: .:..:::::::::::
CCDS82 AKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKVTRPLASAN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 SCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCS
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CCDS82 SCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARRRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSSED
300 310 320 330 340 350
360
pF1KE9 TPRADRL
CCDS82 SRRTESTPAGSENTKDIRL
360 370
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 814 init1: 494 opt: 840 Z-score: 750.8 bits: 147.6 E(32554): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 840; 41.7% identity (68.8% similar) in 321 aa overlap (33-342:49-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 STESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLFIF
:.: ::. : .::..:. :. ..:.:.:
CCDS31 AGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSVAIWMFVF
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLYCS
...::.. ..:::.:::.: ::::.::.::.:: .. : :: .::. ::.:. ::: :
CCDS31 HMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIFHVNLYGS
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE9 VLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAV--WLVVAGCLVPNLFFVTTS-NK
.:::::::.::: :. .::..: :: . . .:..: ::.:. . : ::. :. :
CCDS31 ILFLTCISAHRYSGVVYPLKSL--GRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISPILFYSGTGVRK
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GTTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRL-YQPLPGSAQSS
. :. :.::: : . : .: . .: :: .. : ::::..: : :. : .:
CCDS31 NKTITCYDTTSDEYLRSYFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLDNSPL--
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 SRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARL---LEADCRVLNIVNVVYKVTRPLA
: .:. . .::::::: ..:::. .:. ::: : : . : ..:.::: ::
CCDS31 -RRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRGLA
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 SANSCLDPVLYLLTGDKYRRQL----RQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAAT
: :::.::.::.:.:: .::.: :. .. . .. . ...: :::
CCDS31 SLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDTSL
320 330 340 350 360 370
360
pF1KE9 PQDSSCSTPRADRL
>>CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 754 init1: 406 opt: 772 Z-score: 692.0 bits: 136.5 E(32554): 3.2e-32
Smith-Waterman score: 772; 42.7% identity (65.5% similar) in 316 aa overlap (10-320:9-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
..::: : : . :.:: .::: :..:.. :: :: .. .
CCDS82 MEWDNGTGQALGLPP--------TTCVYRENFKQLLLPPVYSAVLAAGLPLNICVITQI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
: ::.: ..:::.: ::. ::: ::: :: .::::: :..:::::: ::.
CCDS82 CTSRRALTRTAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFGDFACRLVRFLFYANLH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE9 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRAL--RWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSN
:.::::::: .::::::::: : :: : : :.:.::::.:. .:. .:..:.
CCDS82 GSILFLTCISFQRYLGICHPLAPWHKRGGR-RAAWLVCVAVWLAVTTQCLPTAIFAATGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 KGTTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRL-YQPLPGSAQS
. . ..:.: . : ::. .. :. . : .: . :.:: :.: :: : :. .
CCDS82 QRNRTVCYDLSPPALATHYMPYGMALTVIGFLLPFAALLACYCLLACRLCRQDGPAEPVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 SSRL-RSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEA-DCRVLNIVNVVYKVTRPLA
. : .. : .:: ..::. :.:::::.: : .: . : ::. ..:: :::.:
CCDS82 QERRGKAARMAVVVAAAFAISFLPFHITKTAYLAVRSTPGVPCTVLEAFAAAYKGTRPFA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 SANSCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDS
:::: :::.:. .: :.::. ..:
CCDS82 SANSVLDPILFYFTQKKFRRRPHELLQKLTAKWQRQGR
300 310 320
>>CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 670 init1: 514 opt: 694 Z-score: 623.7 bits: 123.9 E(32554): 2e-28
Smith-Waterman score: 694; 34.9% identity (66.8% similar) in 292 aa overlap (26-315:23-311)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDED--FKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLW
.: ::. .:. ::: :...:..:. :: ..
CCDS94 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNC-TDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVIS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LFIFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWN
.::..::: ... :..:: .: ::. ::: ::.:::. ..: :: .:::.:: :..:
CCDS94 TYIFKMRPWKSSTIIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIRFSFHFN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LYCSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSN
:: :.:::::.:. :: : ::. . . : : . : .::.. ..: :..:..:
CCDS94 LYSSILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFSIHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTFLITSTN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 KGTTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSS
. . : : : .:.. .. . . : .: ... .:: . . : . : ...:
CCDS94 RTNRSACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTHGL--QTDSC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 SRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASAN
. .. : ..: .: :::.:::: :.: .::: .: . : .. .: :.::::. :
CCDS94 LKQKARRLTILLLLAFYVCFLPFHILRVIRIESRLLSISCSIENQIHEAYIVSRPLAALN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 SCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCS
. . .::....:....
CCDS94 TFGNLLLYVVVSDNFQQAVCSTVRCKVSGNLEQAKKISYSNNP
300 310 320 330
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
initn: 495 init1: 378 opt: 683 Z-score: 613.7 bits: 122.2 E(32554): 7.3e-28
Smith-Waterman score: 683; 36.0% identity (62.8% similar) in 347 aa overlap (3-336:23-362)
10 20 30
pF1KE9 MASTESSLLRSLGLSPGPG-----SSEVELDCWFDEDFKF
: :. . .: ..: :: : . .: . ..
CCDS21 MSKRSWWAGSRKPPREMLKLSGSDSSQSMNGLEVAP-PGLITNFSLATAEQCGQETPLEN
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 ILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLFIFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYY
.:. : . :.:.: :. .::::: . . ....:::..: :: ::: . :.
CCDS21 MLFASFYLLDFILALVGNTLALWLFIRDHKSGTPANVFLMHLAVADLSCVLVLPTRLVYH
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 AAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLYCSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLL
. :::::: :... :::: :.: :. ::::::. :.:.: ::...:. :: : :
CCDS21 FSGNHWPFGEIACRLTGFLFYLNMYASIYFLTCISADRFLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 CLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSNKGTTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLV
: .:.::: ..: : : . . ::.: . : :. .:.. : :: : : ..
CCDS21 CAFLWVVVAVAMAPLLVSPQTVQTNHTVVCLQLYR-EKASHHALVSLAVA---FTFPFIT
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 TLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSSSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLA-RLL
:..:: :. : : : : ... . ...: ::.::..: :::::.:..:..: : :
CCDS21 TVTCYLLIIRSLRQGL--RVEKRLKTKAVRMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE9 EADCRVLNIVNVVYKVTRPLASANSCLDPVLYLLTGDKYRRQL-RQLCGG---GKP---Q
:.: . :. .. ..: :.: :. :::..:.....:.:. : ::: : : .
CCDS21 GASCATQRILALANRITSCLTSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFE
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KE9 PRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCSTPRADRL
.: :::.
CCDS21 GKTNESSLSAKSEL
360
>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 462 init1: 229 opt: 642 Z-score: 578.2 bits: 115.5 E(32554): 7e-26
Smith-Waterman score: 642; 33.4% identity (66.6% similar) in 296 aa overlap (27-318:9-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
:.....::. : ...:::::: : ....:
CCDS94 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
: :. . :.:::..::.:: :.:..:: :.:....: :::: .::. .::: :.:
CCDS94 ICVLKVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRN-WPFGDLLCKISVMLFYTNMY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSNKG
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CCDS94 GSILFLTCISVDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE9 TTV--LCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLL-FGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQS
... : .. . :. . .. : .: .....: ... . : .:. : ..
CCDS94 NNASEACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 SSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLE-ADCRVLNIVNVVYKVTRPLAS
.. . :. : : : .: ::::..:. .: :.: ..: :. : ..: .: .:
CCDS94 INKTKVLKMIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ANSCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSS
.: :.::..: .:.: . ...
CCDS94 SNCCFDPIVYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNE
290 300 310 320 330 340
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 426 init1: 231 opt: 608 Z-score: 548.1 bits: 110.0 E(32554): 3.3e-24
Smith-Waterman score: 608; 33.2% identity (65.8% similar) in 307 aa overlap (14-317:18-322)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPT
: : :.. .. : :..::. : . :.:::.::: :. .
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LWLFIFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFY
:..: ::.. . :: .. .::.:: :.: .:: :.: . ::::: .::. :
CCDS14 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFY-NFNRHWPFGDTLCKISGTAFL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 WNLYCSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVW-LVVAGCLVPNLFFVT
:.: :.:::::::: :.:.: .:.:. : ....: .:: ::..: . .:: .:
CCDS14 TNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TSNKGTTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLL-FGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGS
. :..::. : . . . :. . . .. : .: .... : ... : : .: :
CCDS14 NVNNATTT-CFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATLS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 AQSSSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLE-ADCRVLNIVNVVYKVTRP
.... . :. :.: ..::.:::::.. . .: :.: ..: . .....: .:
CCDS14 QIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPITLC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LASANSCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQ
::. : :.:: .: .: .......
CCDS14 LATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTT
300 310 320 330 340 350
>>CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 (397 aa)
initn: 446 init1: 328 opt: 538 Z-score: 486.6 bits: 98.8 E(32554): 8.7e-21
Smith-Waterman score: 538; 32.1% identity (63.2% similar) in 296 aa overlap (36-321:76-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 SSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLFIFRLR
..::. :..:::.:: :. .::.:.:: .
CCDS40 SHVTGKGVTVETVFSVDEFSASVLTGKLTTVFLPIVYTIVFVVGLPSNGMALWVFLFRTK
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLYCSVLF
.. :: .:::.: : :. .: : :. :.: .: .:. . .:: :.:::.::
CCDS40 KKHPAVIYMANLALADLLSVIWFPLKIAYHIHGNNWIYGEALCNVLIGFFYGNMYCSILF
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVP-----NLFFVTTSNKG
.::.::.:: : .:. : . .: . ::.::.. .: . .:. . :
CCDS40 MTCLSVQRYWVIVNPMGHSR-KKANIAIGISLAIWLLILLVTIPLYVVKQTIFIPALNIT
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230
pF1KE9 TTVLCHDTTRPEEF---DHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQS
: :::. ::.. : . .: : ..:. : : ..: : :: : : . .
CCDS40 T---CHDVL-PEQLLVGDMFNYFLSLAIGV-FLFPAFLTASAYVLMIRMLRSSAMDENSE
230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 SSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASA
..: :... :..::... .::.: .. ...:. :.... . . : ..: :. :..
CCDS40 KKRKRAIKLIVTVLAMYLICFTPSNLLLVVHYF--LIKSQGQ--SHVYALYIVALCLSTL
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 NSCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQ--LCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDS
:::.:: .: ... .: . .. ::
CCDS40 NSCIDPFVYYFVSHDFRDHAKNALLCRSVRTVKQMQVSLTSKKHSRKSSSYSSSSTTVKT
340 350 360 370 380 390
>>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 (425 aa)
initn: 413 init1: 350 opt: 536 Z-score: 484.5 bits: 98.5 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 536; 30.7% identity (62.3% similar) in 316 aa overlap (36-346:103-411)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 SSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLFIFRLR
...: :. :::..: :: .. .::....
CCDS40 SINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMK
80 90 100 110 120 130
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLYCSVLF
...::.::: .:.:.: :: : :: . . : ::.:.:.:: :: :.: :.:.
CCDS40 VKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILL
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVW-LVVAGCLVPNLF-FVTTSNKGTTV
.: ::. :.:.. .:...: : :.. :::.: :..:: .:: :. : . : ..
CCDS40 MTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAG-VVPLLLKEQTIQVPGLNI
200 210 220 230 240 250
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pF1KE9 L-CHDTTRPEEFD-HYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSSSRL
:::. .. .:... :: ...: :: ... ::: . : : . . :. :..
CCDS40 TTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSS--SAVANRSKKS
260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASANSCL
:.: :.:. .: .:: : .. .: . . . . . .: . ..: . :.
CCDS40 RALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHY---SFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCVSSISCCI
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 DPVLYLLTGDKYRRQLRQ-LCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCSTP
::..: .... .: . . :: . .: . :: :.. :. :
CCDS40 DPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDT-CSSNLNNSIYKKLLT
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 RADRL
365 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 12:48:22 2016 done: Sun Nov 6 12:48:23 2016
Total Scan time: 2.680 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]