Result of FASTA (omim) for
pFN21AE9512
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9512, 532 aa
1>>>pF1KE9512 532 - 532 aa - 532 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5183+/-0.000455; mu= 13.4675+/- 0.028
mean_var=175.0341+/-40.782, 0's: 0 Z-trim(113.7): 510 B-trim: 1292 in 1/52
Lambda= 0.096942
statistics sampled from 22419 (23120) to 22419 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 9.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036257 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholine ( 532) 3565 511.8 2e-144
NP_001307846 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholi ( 532) 3565 511.8 2e-144
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45
XP_011543044 (OMIM: 118510) PREDICTED: muscarinic ( 460) 1093 166.0 2.2e-40
NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine ( 460) 1093 166.0 2.2e-40
NP_000732 (OMIM: 118495) muscarinic acetylcholine ( 479) 961 147.6 8.2e-35
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32
NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32
NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32
XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic ( 466) 897 138.6 4e-32
NP_001006630 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32
NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32
NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine ( 466) 897 138.6 4e-32
NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32
NP_001006632 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32
NP_009163 (OMIM: 604525) histamine H3 receptor [Ho ( 445) 522 86.1 2.4e-16
XP_005260323 (OMIM: 604525) PREDICTED: histamine H ( 453) 522 86.1 2.4e-16
NP_001091683 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 464 78.1 7e-14
NP_000852 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor [Ho ( 487) 464 78.1 7e-14
XP_016861772 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 464 78.1 7e-14
XP_011531954 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 464 78.1 7e-14
NP_001091681 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 464 78.1 7e-14
XP_011531955 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 464 78.1 7e-14
NP_001091682 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 464 78.1 7e-14
XP_016861773 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 464 78.1 7e-14
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 452 76.3 2e-13
NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390) 444 75.2 4.2e-13
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 436 74.1 9.6e-13
NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic ( 477) 430 73.3 1.9e-12
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 420 71.7 3.7e-12
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 420 71.7 3.8e-12
>>NP_036257 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholine rece (532 aa)
initn: 3565 init1: 3565 opt: 3565 Z-score: 2713.7 bits: 511.8 E(85289): 2e-144
Smith-Waterman score: 3565; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE9 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
490 500 510 520 530
>>NP_001307846 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholine r (532 aa)
initn: 3565 init1: 3565 opt: 3565 Z-score: 2713.7 bits: 511.8 E(85289): 2e-144
Smith-Waterman score: 3565; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE9 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
490 500 510 520 530
>>XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: muscarin (590 aa)
initn: 1722 init1: 1153 opt: 1203 Z-score: 927.9 bits: 181.5 E(85289): 6.1e-45
Smith-Waterman score: 1748; 53.7% identity (76.3% similar) in 540 aa overlap (8-529:48-578)
10 20 30
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVT
: .. .:: . .:: : .:.:. :: .:
XP_016 SSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGT--TDDPLGGHTVWQVVFIAFLT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 AVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQLKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWA
....:.::.::.::..:::::.::::::::.::::::::::::..::::.::::.:.:::
XP_016 GILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWA
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LGSLACDLWLALDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLI
::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::.:
XP_016 LGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 SFILWAPAILCWQYLVGKRTVPLDECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIY
::.::::::: :::.::::::: :: :::::::::::::::::::.::..::::: :::
XP_016 SFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIY
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 RETEKRTKDLADLQGSDSVTKAEKRKPAH-RALFRSC--LRCPRPTLAQRERNQAS----
.:::::::.:: ::.: :.:: .. .: . ::: . . .. . .: . .
XP_016 KETEKRTKELAGLQASG--TEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHF
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320
pF1KE9 WSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQLTTCSSYPSSEDEDKPA-TDPVLQVVYKSQG
: ... .. . .: . : .: . . .. . ::..:: . : . ..: : :
XP_016 WFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPG
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 KES-------PG-EEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPNYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKF
. . :. ..... : : .: : .:.: . .. ... ::: . . ..
XP_016 HSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLE-RKADKLQAQKSVDDGGSF-PKSFSKLPIQL
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KE9 RLVVKADGNQETNNGCHK-VKIMPCPFPVAKEPS-TKGLNPNPSHQMTKRKRVVLVKERK
. .: . ....:.. : . .: : :: . .: . . :.:::::. ::::.:
XP_016 ESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSF---KEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKK
440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE9 AAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLGYWLCYVNSTVNPICYALCN
:::::::::::::::::::::::::.::::.:.: :.:.:::::::.::::::.::::::
XP_016 AAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCN
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530
pF1KE9 RTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
.::: ::::::::. ::: ... : : .:
XP_016 KTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
550 560 570 580 590
>>XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: muscarin (590 aa)
initn: 1722 init1: 1153 opt: 1203 Z-score: 927.9 bits: 181.5 E(85289): 6.1e-45
Smith-Waterman score: 1748; 53.7% identity (76.3% similar) in 540 aa overlap (8-529:48-578)
10 20 30
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVT
: .. .:: . .:: : .:.:. :: .:
XP_016 SSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGT--TDDPLGGHTVWQVVFIAFLT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 AVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQLKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWA
....:.::.::.::..:::::.::::::::.::::::::::::..::::.::::.:.:::
XP_016 GILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWA
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LGSLACDLWLALDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLI
::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::.:
XP_016 LGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 SFILWAPAILCWQYLVGKRTVPLDECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIY
::.::::::: :::.::::::: :: :::::::::::::::::::.::..::::: :::
XP_016 SFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIY
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
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pF1KE9 WSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQLTTCSSYPSSEDEDKPA-TDPVLQVVYKSQG
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XP_016 WFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPG
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10 20 30
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Smith-Waterman score: 1748; 53.7% identity (76.3% similar) in 540 aa overlap (8-529:48-578)
10 20 30
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pF1KE9 WSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQLTTCSSYPSSEDEDKPA-TDPVLQVVYKSQG
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390 400 410 420 430
pF1KE9 RLVVKADGNQETNNGCHK-VKIMPCPFPVAKEPS-TKGLNPNPSHQMTKRKRVVLVKERK
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Smith-Waterman score: 1748; 53.7% identity (76.3% similar) in 540 aa overlap (8-529:48-578)
10 20 30
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]