Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9512
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9512, 532 aa
1>>>pF1KE9512 532 - 532 aa - 532 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5730+/-0.00108; mu= 13.0859+/- 0.064
mean_var=181.1065+/-59.082, 0's: 0 Z-trim(107.2): 226 B-trim: 1082 in 2/48
Lambda= 0.095303
statistics sampled from 9017 (9445) to 9017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 3565 503.4 2.6e-142
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 1203 178.7 1.6e-44
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 1093 163.5 5e-40
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 961 145.3 1.5e-34
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 897 136.5 6.5e-32
CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 ( 445) 522 84.9 2.1e-16
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 464 77.0 5.6e-14
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 455 75.7 1.2e-13
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 444 74.1 3.3e-13
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 436 73.1 7.3e-13
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 430 72.3 1.4e-12
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 420 70.8 3e-12
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 420 70.9 3.4e-12
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 420 70.9 3.5e-12
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 420 70.9 3.6e-12
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 420 70.9 3.6e-12
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 418 70.5 3.8e-12
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 420 71.0 3.8e-12
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 414 70.2 7.2e-12
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 408 69.2 9.6e-12
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 408 69.3 1.1e-11
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 404 68.7 1.6e-11
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 404 68.7 1.6e-11
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 404 68.7 1.7e-11
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 403 68.6 1.8e-11
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 401 68.2 1.9e-11
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 400 68.2 2.4e-11
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 396 67.6 3.5e-11
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 385 66.0 8.5e-11
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 385 66.0 9.1e-11
>>CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 (532 aa)
initn: 3565 init1: 3565 opt: 3565 Z-score: 2668.3 bits: 503.4 E(32554): 2.6e-142
Smith-Waterman score: 3565; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE9 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
490 500 510 520 530
>>CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 (590 aa)
initn: 1722 init1: 1153 opt: 1203 Z-score: 912.7 bits: 178.7 E(32554): 1.6e-44
Smith-Waterman score: 1748; 53.7% identity (76.3% similar) in 540 aa overlap (8-529:48-578)
10 20 30
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVT
: .. .:: . .:: : .:.:. :: .:
CCDS16 SSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGT--TDDPLGGHTVWQVVFIAFLT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 AVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQLKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWA
....:.::.::.::..:::::.::::::::.::::::::::::..::::.::::.:.:::
CCDS16 GILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWA
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LGSLACDLWLALDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLI
::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::.:
CCDS16 LGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 SFILWAPAILCWQYLVGKRTVPLDECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIY
::.::::::: :::.::::::: :: :::::::::::::::::::.::..::::: :::
CCDS16 SFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIY
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 RETEKRTKDLADLQGSDSVTKAEKRKPAH-RALFRSC--LRCPRPTLAQRERNQAS----
.:::::::.:: ::.: :.:: .. .: . ::: . . .. . .: . .
CCDS16 KETEKRTKELAGLQASG--TEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHF
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320
pF1KE9 WSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQLTTCSSYPSSEDEDKPA-TDPVLQVVYKSQG
: ... .. . .: . : .: . . .. . ::..:: . : . ..: : :
CCDS16 WFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPG
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 KES-------PG-EEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPNYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKF
. . :. ..... : : .: : .:.: . .. ... ::: . . ..
CCDS16 HSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLE-RKADKLQAQKSVDDGGSF-PKSFSKLPIQL
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KE9 RLVVKADGNQETNNGCHK-VKIMPCPFPVAKEPS-TKGLNPNPSHQMTKRKRVVLVKERK
. .: . ....:.. : . .: : :: . .: . . :.:::::. ::::.:
CCDS16 ESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSF---KEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKK
440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE9 AAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLGYWLCYVNSTVNPICYALCN
:::::::::::::::::::::::::.::::.:.: :.:.:::::::.::::::.::::::
CCDS16 AAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCN
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530
pF1KE9 RTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
.::: ::::::::. ::: ... : : .:
CCDS16 KTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
550 560 570 580 590
>>CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 (460 aa)
initn: 1637 init1: 1076 opt: 1093 Z-score: 832.2 bits: 163.5 E(32554): 5e-40
Smith-Waterman score: 1570; 52.3% identity (69.3% similar) in 505 aa overlap (28-532:23-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
:.: :. .:...:: :..::.::.::::::..
CCDS80 MNTSAPPAVSPNITVLAPGKGPWQVAFIGITTGLLSLATVTGNLLVLISFKVNTE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
:::::::.:::::::::::: :::::::::.:::.::::.::::::::::::::::::::
CCDS80 LKTVNNYFLLSLACADLIIGTFSMNLYTTYLLMGHWALGTLACDLWLALDYVASNASVMN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
::.::::::::.::::.:::::::.::..:::::::.::.::::::: ::::::.:::
CCDS80 LLLISFDRYFSVTRPLSYRAKRTPRRAALMIGLAWLVSFVLWAPAILFWQYLVGERTVLA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
.: :::::.: ::::::.::::.::.:: :: :::::::.:...:: ::::.. :.
CCDS80 GQCYIQFLSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIYRETENRARELAALQGSETPGKG-
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL
. .: :: : . .. :.: : .: .:
CCDS80 --------------------------GGSSSSSERSQPGAEGSPETPPGRCCRCCRAPRL
240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN
:. :.::. . .. . .:.:.: :: : . .: :.. . :
CCDS80 LQAYSWKEEEEEDEGS----MESLTSSEGEE-PGSEVVIKM---PMVDPEAQAPTKQPPR
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP
:: ...:: :..: .. . :: .:
CCDS80 S--SPNTVKRP---------------------TKKG--------------RDRAGKGQKP
330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG
..:..::: ::::.:::.::::::::::.::::::::::::::: ::: :::.::
CCDS80 RGKEQLAKRKTFSLVKEKKAARTLSAILLAFILTWTPYNIMVLVSTFCKDCVPETLWELG
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530
pF1KE9 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
:::::::::.::.::::::..:: ::..:::::: :.. :. : :
CCDS80 YWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRR------WRKIPKRPGSVHRTPS
410 420 430 440 450
CCDS80 RQC
460
>>CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 (479 aa)
initn: 1358 init1: 929 opt: 961 Z-score: 733.9 bits: 145.3 E(32554): 1.5e-34
Smith-Waterman score: 1369; 45.6% identity (68.3% similar) in 517 aa overlap (8-515:3-473)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQ-------PLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMI
: : :::. :.. .:.. :.. ::.::. .::.:.:::.:::.
CCDS44 MANFTPVNGSSGNQSVRLVTSSSHNRYETVEMVFIATVTGSLSLVTVVGNILVML
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 SFKVNSQLKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVA
:.::: ::.:::::.:.:::::::::: :::::::.::. : : ::...::::::::::.
CCDS44 SIKVNRQLQTVNNYFLFSLACADLIIGAFSMNLYTVYIIKGYWPLGAVVCDLWLALDYVV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLV
:::::::::.::::::: .:.:::: :.:: : ::.::. ::..::.::::::: ::..:
CCDS44 SNASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPARRTTKMAGLMIAAAWVLSFVLWAPAILFWQFVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GKRTVPLDECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGS
:::::: ..: :::::.:..::::::::::.:: .::.:: .: ...:.. .:
CCDS44 GKRTVPDNQCFIQFLSNPAVTFGTAIAAFYLPVVIMTVLYIHISLASRSRVHKHRP-EGP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 DSVTKAEKRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSAN
::. . :... .. : : : ::. :. . : : :
CCDS44 KE-KKAKTLAFLKSPLMKQSVKKPPPGEAAREE--------LRNGKLEEAPPPALPP---
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 WAKAEQLTTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEK
: :: ... . .. :: :. :.:. ::
CCDS44 -------------PPRPVADKDTSNESSSGSATQNTKERPATELST-----------TEA
290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 SDYDTPNYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEP
. : :.: : . : :. :...:.: ::. .. ..:.: :.. .:
CCDS44 TTPAMPAPPLQPRALN-PASRWS---KIQIVTKQTGNECVTA----IEIVPAT-PAGMRP
320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 STKGLNPNPS--HQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKC
... : ......:: . ..:::...:. :::::::.::::::.::::.:::..:
CCDS44 AANVARKFASIARNQVRKKRQMAARERKVTRTIFAILLAFILTWTPYNVMVLVNTFCQSC
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 VPVTLWHLGYWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKL
.: :.: .::::::::::.:: :::::: ::.:::. ::::...
CCDS44 IPDTVWSIGYWLCYVNSTINPACYALCNATFKKTFRHLLLCQYRNIGTAR
430 440 450 460 470
pF1KE9 P
>>CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 (466 aa)
initn: 1312 init1: 897 opt: 897 Z-score: 686.5 bits: 136.5 E(32554): 6.5e-32
Smith-Waterman score: 1280; 44.5% identity (68.8% similar) in 497 aa overlap (25-515:18-460)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
.. .::. :. :.. .::.::.::.:::.:.::: .
CCDS58 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
:.:::::.:.::::::::::.::::::: : ..: : :: ..::::::::::.:::::::
CCDS58 LQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
::.::::::: .:.:::: .::: : ::.::. ::..:::::::::: ::..:: :::
CCDS58 LLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVED
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
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CCDS58 GECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIK-------KDKKEPVA
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE9 KRKPAHRALFRSCLRCPR----PTLAQR-ERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWA
.. :. .: .. . : :. . :.:. . ... :. : . . :.:
CCDS58 NQDPVSPSLVQGRIVKPNNNNMPSSDDGLEHNKIQNGKAPRDPVTENCVQGEEKESSN--
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 KAEQLTTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSD
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CCDS58 ---DSTSVSAVASNMRDDEITQDE--NTVSTSLGHSKD------ENSKQTCIRIGTKT--
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pF1KE9 YDTPNYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPF-PVAKEPS
:::..:. . . : ....: :: .: .:. . ..:.:.
CCDS58 ---------------PKSDSCTPTNTTVEVVGSSGQ---NGDEKQNIVARKIVKMTKQPA
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pF1KE9 TKGLNPNPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPV
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CCDS58 KK--KPPPS------------REKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPN
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pF1KE9 TLWHLGYWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
:.: .::::::.:::.:: :::::: ::.:::: ::.:..:
CCDS58 TVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
420 430 440 450 460
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10 20 30 40 50
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: .. .::. :.. . :..::.:::..: .
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.:.:.: ::..::.:: .:...: : . ::. :.: :::..: : :::..::. ..:
CCDS13 DSSLRTQNNFFLLNLAISDFLVGAFCIPLYVPYVLTGRWTFGRGLCKLWLVVDYLLCTSS
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pF1KE9 VMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIM-IGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKR
..:...::.::..:.:: ..:::.. : .. . :.:...:.:..:::: :.:: :
CCDS13 AFNIVLISYDRFLSVTRAVSYRAQQGDTRRAVRKMLLVWVLAFLLYGPAILSWEYLSGGS
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..: .: .:. . . . .. :. : .:.. :: . ..::. :. :..
CCDS13 SIPEGHCYAEFFYNWYFLITASTLEFFTPFLSVTFFNLSIYLNIQRRTR----LR-LDGA
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pF1KE9 TKAEKRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAK
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CCDS13 REAAGPEPPPEA---------QPSPPPPPGCWGCWQKGHGEAMPLHR--YGVGEAAVGAE
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pF1KE9 AEQLTTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDY
: . : .. .. ...:. .:.:. : : :
CCDS13 AGEATLGGGGGGGS-----VASPT-----SSSGSSSRGTE--------------------
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pF1KE9 DTPNYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTK
::.: : :.. : :. : .
CCDS13 -------------RPRSLK------------RGSK----------------PSASSASLE
320 330
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pF1KE9 GLNPNPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCD-KCVPVT
:...:.: : : ..::.:..:..:. : . :.::...... . : .:::
CCDS13 KRMKMVSQSFTQRFR--LSRDRKVAKSLAVIVSIFGLCWAPYTLLMIIRAACHGHCVPDY
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pF1KE9 LWHLGYWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
.. ..:: ..::.:::. : ::...::..: :: : : :
CCDS13 WYETSFWLLWANSAVNPVLYPLCHHSFRRAFTKLL-CPQKLKIQPHSSLEHCWK
400 410 420 430 440
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pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
... ...: ... :.:. :.::. . . . .
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pF1KE9 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
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CCDS26 LHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFS
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pF1KE9 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
.... .::: :. .:: : :: ::. : ::..:: ::. :: :.... . .:
CCDS26 VFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSF-LWVIPILGWNHFMQQTSVRR
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pF1KE9 -DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKA
:.:. .: . . ::: ::.:. .: .: .::. .... . .. : .
CCDS26 EDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCQHRELINRSLPSFSE
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pF1KE9 EKRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQ
: .: . :. :.. ... : .:. . .: : .:: . : .
CCDS26 IKLRPEN----------PKGD-AKKPGKESPWEVLKRKPKDAGGGSVLKSPSQT-PKEMK
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. : .... :: : :..:. . . :. .... : .... . .:... .:
CCDS26 SPVVFSQEDDREVDKLYCFP-LDIVHMQAAAEGSSRDYVA--VNRSHGQLKTDEQGLNTH
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pF1KE9 NYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLN
. :.. ..: . . .: . :: : :.. . . : :
CCDS26 G------ASEISEDQMLGDSQSFSRTDSDTTTETAPGKGKLRSGSNTGLDYIKFTWKRLR
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pF1KE9 PNPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHL
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CCDS26 ---SHSRQYVSGLHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMF
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pF1KE9 GYWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
:: :.:::.::. : :::..:.:::: .: :
CCDS26 TIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHIRS
460 470 480
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:... : . . .: . :: ..: :. .. : ... : . :::::. ..
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.:.::.::.. :::::::..:. . . ...::: :..:.. :..: ..: . .:
CCDS42 KFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTA
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:. .: ::. ::::.:: :. :.. : ..: ..: ..:..: . . : . : . .
CCDS42 SIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQ
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pF1KE9 RTVPL--DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGS
... .: .:... . .....:..::.:. .:...: :...:.... . . .:
CCDS42 EAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGR
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pF1KE9 ---DSVTKAEKRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGP
......:. . ..: :: :
CCDS42 FHVQNLSQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQ
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:.:. . . :...: : ..:..:. .
CCDS49 TWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVM-LLALITLATTLSNAFVIATVYR
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. .:.: :: . ::: .::...:. : . : : . :::.::...::.::. : . .::
CCDS49 TRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQVVCDFWLSSDITCCTAS
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...: ::..:::..:: . : ::::::::..::.:.:..:. . : .. :. ...
CCDS49 ILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISISLPPFF-WRQAKAEEE
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pF1KE9 VPLDECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVT
: .:: .. .. : ....:::.:. .. :: ::: :...: . . . .:
CCDS49 V--SECVVN-TDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRILKQTPNRTGKRLT
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pF1KE9 KAEKRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKA
.:.
CCDS49 RAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERKA
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pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKV
..::: . . ... . ...::. :. .. .
CCDS34 SPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVIT-SLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIAL
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. .:..: :: . ::: .::..... . . . : ....:.::...:::..::: . ..:
CCDS34 ERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSS
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pF1KE9 VMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRT
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CCDS34 ILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWR-TPEDRS
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CCDS34 DP-DACTIS--KDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIR--------KTVK
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pF1KE9 KAEKRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKA
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CCDS34 KVEKTGADTR---HGASPAPQP---KKSVNGESGSRNWR----LGVESKAGG--------
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. :.. . .: : . :..: ...::
CCDS34 ---ALCANGAVRQGDDGAALE-VIEVHRVGNSKE--------------------------
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CCDS34 ---HLPLPSEAG-PT-------------------------------PCA-PASFE-----
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CCDS34 -RKNERNAEAKRK-MALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTL
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CCDS34 LGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
390 400 410 420
532 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 14:20:57 2016 done: Sun Nov 6 14:20:57 2016
Total Scan time: 2.890 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]