Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9511
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9511, 328 aa
1>>>pF1KE9511 328 - 328 aa - 328 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2607+/-0.00101; mu= 11.3886+/- 0.060
mean_var=137.0743+/-37.641, 0's: 0 Z-trim(107.0): 271 B-trim: 1146 in 2/47
Lambda= 0.109546
statistics sampled from 8936 (9324) to 8936 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 2.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 2134 349.1 2.9e-96
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 1304 217.9 9e-57
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 812 140.3 2.7e-33
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 806 139.3 4.8e-33
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 780 135.2 8.5e-32
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 772 133.9 2e-31
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 761 132.1 6.6e-31
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 748 130.1 2.8e-30
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 748 130.1 2.8e-30
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 748 130.1 2.9e-30
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 748 130.1 2.9e-30
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 748 130.1 2.9e-30
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 748 130.1 2.9e-30
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 748 130.1 3e-30
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 748 130.1 3e-30
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 748 130.2 3.1e-30
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 748 130.2 3.3e-30
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 740 128.8 6.5e-30
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 718 125.4 7.4e-29
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 718 125.4 7.5e-29
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 651 114.7 1e-25
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 644 113.6 2.1e-25
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 604 107.2 1.6e-23
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 572 102.3 7.1e-22
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 493 89.8 3.8e-18
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 481 87.9 1.3e-17
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 477 87.3 2.1e-17
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 477 87.3 2.1e-17
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 477 87.3 2.2e-17
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 476 87.1 2.3e-17
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 468 85.8 5.4e-17
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 467 85.7 6.4e-17
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 464 85.2 8.9e-17
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 464 85.2 8.9e-17
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 461 84.7 1.2e-16
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 458 84.3 1.7e-16
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 452 83.3 3.2e-16
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 452 83.3 3.3e-16
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 448 82.7 5e-16
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 448 82.7 5.1e-16
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 446 82.4 6.6e-16
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 445 82.2 7.1e-16
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 443 81.9 8.5e-16
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 441 81.6 1.1e-15
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 441 81.6 1.1e-15
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 436 80.8 1.9e-15
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 432 80.1 2.9e-15
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 431 80.0 3.2e-15
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 431 80.0 3.4e-15
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 431 80.0 3.4e-15
>>CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 (328 aa)
initn: 2134 init1: 2134 opt: 2134 Z-score: 1841.7 bits: 349.1 E(32554): 2.9e-96
Smith-Waterman score: 2134; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDNASFSEPWPANASGPDPALSCSNASTLAPLPAPLAVAVPVVYAVICAVGLAGNSAVLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDNASFSEPWPANASGPDPALSCSNASTLAPLPAPLAVAVPVVYAVICAVGLAGNSAVLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLRAPRMKTVTNLFILNLAIADELFTLVLPINIADFLLRQWPFGELMCKLIVAIDQYNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VLLRAPRMKTVTNLFILNLAIADELFTLVLPINIADFLLRQWPFGELMCKLIVAIDQYNT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FSSLYFLTVMSADRYLVVLATAESRRVAGRTYSAARAVSLAVWGIVTLVVLPFAVFARLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FSSLYFLTVMSADRYLVVLATAESRRVAGRTYSAARAVSLAVWGIVTLVVLPFAVFARLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 DEQGRRQCVLVFPQPEAFWWRASRLYTLVLGFAIPVSTICVLYTTLLCRLHAMRLDSHAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DEQGRRQCVLVFPQPEAFWWRASRLYTLVLGFAIPVSTICVLYTTLLCRLHAMRLDSHAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ALERAKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTTDLPQTPLVIAISYFITSLSYANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ALERAKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTTDLPQTPLVIAISYFITSLSYANS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 CLNPFLYAFLDASFRRNLRQLITCRAAA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CLNPFLYAFLDASFRRNLRQLITCRAAA
310 320
>>CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 (333 aa)
initn: 1327 init1: 657 opt: 1304 Z-score: 1132.7 bits: 217.9 E(32554): 9e-57
Smith-Waterman score: 1304; 63.7% identity (83.5% similar) in 322 aa overlap (5-324:15-333)
10 20 30 40
pF1KE9 MDNASFSEP-WPANASGPDPALSCSNASTLAPLPAPLAVAVPVVYAVICA
::: : ::.: . . ::. ::: : : .:.::. :::
CCDS13 MQAAGHPEPLDSRGSFSLPTMGANVSQDNG--TGHNATFSEPLPF-LYVLLPAVYSGICA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 VGLAGNSAVLYVLLRAPRMKTVTNLFILNLAIADELFTLVLPINIADFLLRQWPFGELMC
:::.::.::. :.::::.::::::.::::::.:: :::::::.:::. ::. ::::::.:
CCDS13 VGLTGNTAVILVILRAPKMKTVTNVFILNLAVADGLFTLVLPVNIAEHLLQYWPFGELLC
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 KLIVAIDQYNTFSSLYFLTVMSADRYLVVLATAESRRVAGRTYSAARAVSLAVWGIVTLV
::..:.:.:: :::.:::.:::.:::::::::..::.. ::: .:...:: :: ::..
CCDS13 KLVLAVDHYNIFSSIYFLAVMSVDRYLVVLATVRSRHMPWRTYRGAKVASLCVWLGVTVL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 VLPFAVFARL-DDEQGRRQCVLVFPQPEAFWWRASRLYTLVLGFAIPVSTICVLYTTLLC
:::: :: . ..: .: : :: :: :..:::.:::::::..:: ::::::: ::
CCDS13 VLPFFSFAGVYSNELQVPSCGLSFPWPEQVWFKASRVYTLVLGFVLPVCTICVLYTDLLR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 RLHAMRLDSHAKALERAKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTTDLPQTPLVIAI
::.:.:: : :::: .:...:: ::...::::::::::.::..:::::::::::::::..
CCDS13 RLRAVRLRSGAKALGKARRKVTVLVLVVLAVCLLCWTPFHLASVVALTTDLPQTPLVISM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE9 SYFITSLSYANSCLNPFLYAFLDASFRRNLRQLITCRAAA
:: :::::::::::::::::::: .::.:.:... :
CCDS13 SYVITSLSYANSCLNPFLYAFLDDNFRKNFRSILRC
300 310 320 330
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 805 init1: 401 opt: 812 Z-score: 711.3 bits: 140.3 E(32554): 2.7e-33
Smith-Waterman score: 812; 41.2% identity (70.2% similar) in 325 aa overlap (4-322:10-328)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDNASFSEPWPANASGPDPALSCSNASTLAPLPAPLAVA---VPVVYAVICAVG
.. ::: :... : : . .:.:. .: :: :::. .:.:: :.:.::
CCDS13 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWP-PDATLGNVSA-GPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LAGNSAVLYVLLRAPRMKTVTNLFILNLAIADELFTLVLPINIADFLLRQWPFGELMCKL
: ::: :.::.:: .:::..:::::.::::: : ::. :. : :::: :::.:
CCDS13 LLGNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMCRL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 IVAIDQYNTFSSLYFLTVMSADRYLVVLATAESRRVAGRTYSAARAVSLAVWGIVTLVVL
..:.: : :.:.. :::::.::::.:. ..: : :: .::.:: ::: ..:::
CCDS13 VMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARW--RTAPVARTVSAAVWVASAVVVL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 PFAVFARLDDEQGRRQCVLVFPQPEAFWWRASRLYTLVLGFAIPVSTICVLYTTLLCRLH
: .::. . .: : . .:.: : : . .:: .::: :. .::. : .. ...
CCDS13 PVVVFSGVP--RGMSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 AMRLDSHAKALER---AKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTTDLPQTPLVIAI
. : . .: ...::: .:::..:. .::: :... ..: .. ::. : ...
CCDS13 SAGRRVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE9 SYFITSLSYANSCLNPFLYAFLDASFRRNLRQLITCRAAA
.....: ::::: ::.::.::. :....:...
CCDS13 YFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEEEDEE
300 310 320 330 340 350
CCDS13 EEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKSSTMR
360 370 380 390 400 410
>>CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 741 init1: 379 opt: 806 Z-score: 706.8 bits: 139.3 E(32554): 4.8e-33
Smith-Waterman score: 806; 40.0% identity (72.1% similar) in 315 aa overlap (12-325:32-334)
10 20 30 40
pF1KE9 MDNASFSEPWPANASGPDPALSCSNASTLAPLPAPLAVAVP
:::::: : : ::.:: ::.:.
CCDS32 EPAPSAGAELQPPLFANASDAYPSACPSAGANASGPPGARS---ASSLA-----LAIAIT
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 VVYAVICAVGLAGNSAVLYVLLRAPRMKTVTNLFILNLAIADELFTLVLPINIADFLLRQ
..:...::::: :: :.. ..: .:::.::..:.:::.:: : : .::.. : .:..
CCDS32 ALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMET
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 WPFGELMCKLIVAIDQYNTFSSLYFLTVMSADRYLVVLATAESRRVAGRTYSAARAVSLA
::::::.:: ...:: :: :.:.. ::.::.:::..: ... . :: . :. ...
CCDS32 WPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKA--LDFRTPAKAKLINIC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 VWGIVTLVVLPFAVFARLDDEQGRRQCVLVFPQPEAFWWRASRLYTLVLGFAIPVSTICV
.: ... : .:. :.: ..: :.: ::.: .: .... .....:..:. : :
CCDS32 IWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LYTTLLCRLHAMRLDSHAKALERAKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTTDLPQ
: .: ::...:: : .: .:. .:.: .:...... ..::.: :. ..: .:. .
CCDS32 CYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDIDR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE9 T-PLVIAISYFITSLSYANSCLNPFLYAFLDASFRRNLRQLITCRAAA
:::.: .. .:.:::: ::: :::::: .:.: .::: ::
CCDS32 RDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQL--CRKPCGRPDPSSFSRAR
300 310 320 330 340
CCDS32 EATARERVTACTPSDGPGGGAAA
350 360 370
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 587 init1: 362 opt: 780 Z-score: 684.3 bits: 135.2 E(32554): 8.5e-32
Smith-Waterman score: 780; 37.1% identity (71.7% similar) in 318 aa overlap (9-324:30-339)
10 20 30
pF1KE9 MDNASFSEPWPANASG-PDPALSCSNASTLAPLPAPLAV
: . :.: .:. . :. .::. . :.
CCDS96 MFPNGTASSPSSSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGS-AI
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 AVPVVYAVICAVGLAGNSAVLYVLLRAPRMKTVTNLFILNLAIADELFTLVLPINIADFL
. .:.:.: ::: ::: :.::.:: .:::.::..::::::::::. : .:. ... :
CCDS96 LISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LRQWPFGELMCKLIVAIDQYNTFSSLYFLTVMSADRYLVVLATAESRRVAGRTYSAARAV
::.:::: :.:.:....: : :.:.: :::.:.:::..:. .. : : ..:..:
CCDS96 LRHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAARY--RRPTVAKVV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 SLAVWGIVTLVVLPFAVFARLD-DEQGRRQCVLVFPQPEAFWWRASRLYTLVLGFAIPVS
.:.:: . ::.::..::.: . .: : ...:.: : . :::...:: .::.
CCDS96 NLGVWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 TICVLYTTLLCRLHAMRLDSHAKALERAKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTT
.::. :. .. ... . : . . .:.....:..:. .. : ..:: :... .: . .
CCDS96 AICLCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLVNVFA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE9 DLPQTPLVIAISYFITSLSYANSCLNPFLYAFLDASFRRNLRQLITCRAAA
. .. ..: . . :.::::: ::.::.::. .:.:.. : : :
CCDS96 EQDDA----TVSQLSVILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSF-QRILCLSWMDNAAEEPVD
300 310 320 330 340 350
CCDS96 YYATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
360 370 380 390
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
initn: 772 init1: 369 opt: 772 Z-score: 677.8 bits: 133.9 E(32554): 2e-31
Smith-Waterman score: 772; 36.1% identity (68.8% similar) in 321 aa overlap (6-324:15-328)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDNASFSEPWPANASGPDPALSCSNASTLAPLPAPLAVAV-PVVYAVICAV
.: :. :.: ..: .... : . :: .: :.: .
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGS----VVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCII
10 20 30 40 50
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CCDS11 GLCGNTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICR
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CCDS11 VVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKW--RRPRTAKMITMAVWGVSLLVI
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CCDS11 LPIMIYAGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIK
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CCDS11 VKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMF
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CCDS11 DFVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSF-QNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNET
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CCDS11 TETQRTLLNGDLQTSI
360
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CCDS13 IDYYNMFTSTFTLTAMSVDRYVAICHPIRALDV--RTSSKAQAVNVAIWALASVVGVPVA
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CCDS13 IMGSAQVEDEE--IECLVEIPTPQDYWGPVFAICIFLFSFIVPVLVISVCYSLMIRRLRG
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CCDS13 VRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVGCWTPVQVFVLAQGLGVQPSSETAVAILRFC
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CCDS13 TALGYVNSCLNPILYAFLDENFKACFRKF--CCASALRRDVQVSDRVRSIAKDVALACKT
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CCDS13 SETVPRPA
370
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CCDS55 IPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTSSNIEQQNSTRIR
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CCDS55 QNTRDHPSTANTVDRTNHQS
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pF1KE9 ICVLYTTLLCRLHAMRLDSHAKALERAKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTTD
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CCDS47 ITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIHIYVIIKALVT
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CCDS47 IPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTSSNIEQQNSTRIR
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CCDS47 QNTRDHPSTANTVDRTNHQVRSL
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pF1KE9 AVPVVYAVICAVGLAGNSAVLYVLLRAPRMKTVTNLFILNLAIADELFTLVLPINIADFL
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CCDS47 TIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSVNYL
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pF1KE9 LRQWPFGELMCKLIVAIDQYNTFSSLYFLTVMSADRYLVVLATAESRRVAGRTYSAARAV
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CCDS47 MGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKA--LDFRTPRNAKII
140 150 160 170 180
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pF1KE9 SLAVWGIVTLVVLPFAVFARLDDEQGRRQCVLVFPQPEAFWWRASRLYTLVLGFAIPVST
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CCDS47 NVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICVFIFAFIMPVLI
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220 230 240 250 260 270
pF1KE9 ICVLYTTLLCRLHAMRLDSHAKALERAKKRVTFLVVAILAVCLLCWTPYHLSTVVALTTD
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CCDS47 ITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIHIYVIIKALVT
250 260 270 280 290 300
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pF1KE9 LPQTPLVIAISYFITSLSYANSCLNPFLYAFLDASFRRNLRQLITCRAAA
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CCDS47 QNTRDHPSTANTVDRTNHQRERRQKSDW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]