Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9509
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9509, 322 aa
1>>>pF1KE9509 322 - 322 aa - 322 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2911+/-0.000975; mu= 16.3130+/- 0.058
mean_var=105.5579+/-30.160, 0's: 0 Z-trim(105.1): 120 B-trim: 1007 in 2/47
Lambda= 0.124833
statistics sampled from 8111 (8259) to 8111 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16
Scan time: 2.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 2172 402.2 2.8e-112
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 1785 332.5 2.7e-91
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 1762 328.4 4.8e-90
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 1277 241.0 9.6e-64
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 688 134.9 8.1e-32
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 664 130.6 1.6e-30
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 579 115.3 6.6e-26
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 551 110.3 2.3e-24
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 503 101.6 8.1e-22
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 435 89.5 4.7e-18
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 2172 init1: 2172 opt: 2172 Z-score: 2129.1 bits: 402.2 E(32554): 2.8e-112
Smith-Waterman score: 2172; 99.7% identity (100.0% similar) in 322 aa overlap (1-322:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
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CCDS78 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAISTER
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CCDS78 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAISTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGADSVWCETSDFIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS78 CLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGANSVWCETSDFIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 IAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWALFS
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CCDS78 IAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWALFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDTPE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
::::::::::::::::::::::
CCDS78 VDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1785 init1: 1785 opt: 1785 Z-score: 1752.5 bits: 332.5 E(32554): 2.7e-91
Smith-Waterman score: 1785; 83.5% identity (92.2% similar) in 322 aa overlap (1-322:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
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CCDS78 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAISTER
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CCDS78 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFLSAVSTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGADSVWCETSDFIT
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CCDS78 CLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSDFIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 IAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWALFS
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CCDS78 VAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFLFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDTPE
::.: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :
CCDS78 WIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDASE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
:::::: ::.: ::::::::::
CCDS78 VDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1762 init1: 1762 opt: 1762 Z-score: 1730.1 bits: 328.4 E(32554): 4.8e-90
Smith-Waterman score: 1762; 82.8% identity (91.6% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
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CCDS78 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAISTER
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CCDS78 VSIYILNLAAADFLFLSFQIIRLPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAISTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGADSVWCETSDFIT
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CCDS78 CLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSDFIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 IAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWALFS
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CCDS78 VAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALIY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDTPE
:.::. .::.:::.:: . ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS78 RMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDKPE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE9 VDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
::.: : ::.:.::::::::
CCDS78 VDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
310 320
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 1252 init1: 946 opt: 1277 Z-score: 1257.9 bits: 241.0 E(32554): 9.6e-64
Smith-Waterman score: 1277; 62.9% identity (78.7% similar) in 329 aa overlap (1-320:1-329)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDSTIPVLGTELTPINGREETP---CYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMR
:: : :. ::: : .:: ... : :.:: . : ...::.:.::. :::::: :::
CCDS78 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RNAVSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPIS----KILSPVMTFPYFIGLSML
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CCDS78 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSML
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 SAISTERCLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGADSVWC
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CCDS78 STVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 ETSDFITIAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFG
.: :::: :::.:: .:::::::.:::::::::: .::::::.:::::::::::::::::
CCDS78 QTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IQWALFSRIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQN--LKLVL
::: :. : : :::::.: ::. ::.:::::::::::::::::.. :. :::.:
CCDS78 IQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLAL
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE9 QRALQDTPEVDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
:::::: :::.. : . : : :.: : :
CCDS78 QRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
310 320 330
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 651 init1: 276 opt: 688 Z-score: 684.7 bits: 134.9 E(32554): 8.1e-32
Smith-Waterman score: 688; 40.6% identity (68.6% similar) in 315 aa overlap (1-305:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
:..:. :: . .: . . . : ...:. .. : ...::..:.:::: ::.::
CCDS31 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE9 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLR---LINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAIS
::::::.:::.::: . :. :.: . .... .: : : .:::.:.:::
CCDS31 FCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTAIS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 TERCLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCD-FLFSGADSVWCETS
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CCDS31 TQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDR--CFRV
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 DFITIAWLV-FLCVVLCGSSLVLLVRILCGS---RKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPF
:.. : .. : :. :::.:.: . .: :..: :::.:..: .:::::.:.::.
CCDS31 DMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQP-TRLFVVVLASVLVFLICSLPL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 GIQWALFSRIHLDWKV-LFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFR-QRQNRQNLKLV
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CCDS31 SIYWFVLYWLSLPPEMQVLCFS--LSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSLGTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE9 LQRALQDTPEVDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
::.::.. ::. :::
CCDS31 LQQALREEPEL-EGGETPTVGTNEMGA
300 310 320
>>CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 567 init1: 410 opt: 664 Z-score: 661.5 bits: 130.6 E(32554): 1.6e-30
Smith-Waterman score: 664; 39.1% identity (67.3% similar) in 297 aa overlap (9-301:8-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
: .. :: .: . .: . .:: ..: .: ::..:::::. . ::
CCDS41 MMEPREAGQHVGAANGAQEDVAF--NLIILSLTEGLGLGGLLGNGAVLWLLSSNVYRNP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE9 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIR--HP--ISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAI
.::.:... ::..::. :.. :.. : : .. :. . : :..:::.:.:.
CCDS41 FAIYLLDVACADLIFLGCHMVAIVPDLLQGRLDFPGFVQTSLATLRFFCYIVGLSLLAAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 STERCLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGADSVWCETS
:.:.::. :.: :: :::::.:.. .:.: ::: :: .: : .:. . :.:
CCDS41 SVEQCLAALFPAWYSCRRPRHLTTCVCALTWALCLLLHLLLSGACTQFFGEPSRHLCRTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 DFITIAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQW
... . :..:: ..::.::.::.:. : .. : . ::::::.::.::::::: :
CCDS41 WLVAAVLLALLCCTMCGASLMLLLRVERGPQRPPPRGFPGLILLTVLLFLFCGLPFGIYW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 ALFSRIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQ
.:: .: : . :. :....:.. .:.:..:: .:: . : : :.:::::::
CCDS41 --LSR-NLLWYIPHYFYHF-SFLMAAVHCAAKPVVYFCLGSAQGR--RLPLRLVLQRALG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE9 DTPEVDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
: :.
CCDS41 DEAELGAVRETSRRGLVDIAA
300 310
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 552 init1: 262 opt: 579 Z-score: 578.6 bits: 115.3 E(32554): 6.6e-26
Smith-Waterman score: 579; 37.9% identity (71.4% similar) in 269 aa overlap (37-297:42-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 VLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNAVSIYIL
.: :... :...::.: ::::: ..::
CCDS52 EEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRRNPFTVYIT
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIR----HPISKI-LSPVMTFPYFIGLSMLSAISTERC
.: ::. .: .: : .. . : . . :: .. : : :: .:.:::.:::
CCDS52 HLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLLTAISVERC
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE9 LSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFC-DFLFSGADSVWCETSD-FI
::.:.::::.:.::.: :...:.:::::: : . .:...: : . . :.. ::
CCDS52 LSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSRNDCRAVIIFI
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TI-AWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWAL
.: ..::: ..: :: .:.:.: .. ..::..:..:...::. ..:. . . :
CCDS52 AILSFLVFTPLMLV-SSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIFAMPMRLLYLL
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 FSRIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDT
. . :.. : ..: .:...:..::::::.::::::: .... ...::.:: ::..:
CCDS52 YYEY---WST-FGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLTRAFKDE
260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE9 PEVDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
CCDS52 MQPRRQKDNCNTVTVETVV
310 320
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
initn: 511 init1: 227 opt: 551 Z-score: 551.1 bits: 110.3 E(32554): 2.3e-24
Smith-Waterman score: 551; 34.9% identity (64.7% similar) in 295 aa overlap (33-315:53-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 STIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNAVS
: :. .:: ::..:::..: ..:: :
CCDS81 EAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLV---GNGLVLWFFGFSIKRNPFS
30 40 50 60 70
70 80 90 100 110
pF1KE9 IYILNLVAADFLFLSGHIICSPLR-------LINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSA
::.:.:..:: .: .. . : : . . . . ..:. : .. :.:.: :
CCDS81 IYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCM---FLTGVSLLPA
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ISTERCLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGADSVWCET
.:.::: :...: :: :::. ::.:.:.:::.:::: . :. .:: :: :: .. :.
CCDS81 VSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAACRH
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SD-FITIAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLT-RLYVTILLTVLVFLLCGLPFG
: :. : ... : .. :.:.... : .:. . .: .:: : :::. .. .:
CCDS81 MDIFLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYLG
200 210 220 230 240 250
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280
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]