Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9505
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9505, 337 aa
1>>>pF1KE9505 337 - 337 aa - 337 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1261+/-0.000836; mu= 17.1906+/- 0.050
mean_var=90.3448+/-23.652, 0's: 0 Z-trim(107.5): 199 B-trim: 1091 in 2/48
Lambda= 0.134934
statistics sampled from 9373 (9612) to 9373 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 2.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 ( 337) 2293 456.6 1.3e-128
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 780 162.1 6.2e-40
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 ( 482) 456 99.2 7.5e-21
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 436 95.1 9.2e-20
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 436 95.2 1e-19
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 368 81.9 9.2e-16
CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 ( 358) 353 79.0 6.6e-15
CCDS8165.1 GPR152 gene_id:390212|Hs108|chr11 ( 470) 350 78.5 1.2e-14
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 343 77.0 2.6e-14
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 343 77.0 2.6e-14
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 331 74.7 1.3e-13
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 330 74.5 1.5e-13
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 330 74.5 1.5e-13
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 321 72.8 5.1e-13
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 317 72.0 9e-13
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 315 71.6 1.1e-12
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 311 70.8 1.9e-12
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 311 70.8 2e-12
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 307 70.0 3.2e-12
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 307 70.0 3.3e-12
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 307 70.0 3.4e-12
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 302 69.1 6.9e-12
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 300 68.7 8.3e-12
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 298 68.3 1.1e-11
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 298 68.3 1.2e-11
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 297 68.1 1.3e-11
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 296 67.9 1.6e-11
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 294 67.5 1.9e-11
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 294 67.5 1.9e-11
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 294 67.5 2e-11
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 294 67.5 2e-11
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 293 67.3 2.2e-11
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 292 67.1 2.5e-11
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 291 66.9 3e-11
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 285 65.8 6.6e-11
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 283 65.4 8.6e-11
>>CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 (337 aa)
initn: 2293 init1: 2293 opt: 2293 Z-score: 2422.5 bits: 456.6 E(32554): 1.3e-128
Smith-Waterman score: 2293; 100.0% identity (100.0% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MGNDSVSYEYGDYSDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAMVAWVA
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CCDS12 MGNDSVSYEYGDYSDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAMVAWVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GKVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 SVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRLHQEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRLHQEHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALLCWAARRCRPLGTAIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALLCWAARRCRPLGTAIVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 GFFVCWAPYHLLGLVLTVAAPNSALLARALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRAQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GFFVCWAPYHLLGLVLTVAAPNSALLARALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRAQLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE9 RSLPAACHWALRESQGQDESVDSKKSTSHDLVSEMEV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RSLPAACHWALRESQGQDESVDSKKSTSHDLVSEMEV
310 320 330
>>CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 797 init1: 601 opt: 780 Z-score: 830.5 bits: 162.1 E(32554): 6.2e-40
Smith-Waterman score: 803; 38.4% identity (68.5% similar) in 349 aa overlap (4-335:2-343)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MGNDSVSY---EYGDYSDLS----DRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGN
:: .: .:: :.: . . ::: ... . : : : ..:..::::: ::
CCDS33 MDSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDIL---ALVIFAVVFLVGVLGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 AMVAWVAGKVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSI
:.:.::.. :.: ..: :.:.:::::.: ::.:::: . :.. :::.:...: :::.
CCDS33 ALVVWVTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ILLTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYR
:::.::::.::::..::: .:.. : : .. . : . .::..:: ::::::.:: .::
CCDS33 ILLNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 RLHQEHFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALL--CWAARRC
...:.:: .. : :::. .. : ::. .:...::: ::.... :.. .: :. :
CCDS33 VVREEYFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRAT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 RPLGT-----AIVVGFFVCWAPYHLLGLVLTVAAPNSALLARALRAEPLIVGLALAHSCL
: : :.:..::. : ::.. :.... :.: . . . : :..: . :.
CCDS33 RSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLKKLDSLCVSFAYINCCI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE9 NPMLFLYFGRA---QLRRSLPAACHWALRESQGQDESVDSKKSTSHDLVSEMEV
::.... :.. .::.:::. ::. .. : .:: ... :. :
CCDS33 NPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSL----LRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
300 310 320 330 340 350
>>CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 (482 aa)
initn: 587 init1: 430 opt: 456 Z-score: 487.9 bits: 99.2 E(32554): 7.5e-21
Smith-Waterman score: 456; 40.2% identity (66.9% similar) in 169 aa overlap (32-197:20-183)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 GNDSVSYEYGDYSDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAMVAWVAG
.: . . . . ::.:.:::..: ::::
CCDS85 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYAS
.: :.. :.:::..::::::::::. . .: :.:::: :. .::::.:.:.::
CCDS85 LKMQRTVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFAS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE9 VLLLAALSADLCFLALGPAW---WSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRLHQE
:.::.:.: : :.... : : .: ::.. :: :..:... .: .::..
CCDS85 VFLLTAISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSI---CGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 HFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALLCWAARRCRPLGTAI
: : .: ::: .
CCDS85 DNHNR--CGYKFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWT
170 180 190 200 210 220
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
initn: 316 init1: 90 opt: 436 Z-score: 468.3 bits: 95.1 E(32554): 9.2e-20
Smith-Waterman score: 437; 31.7% identity (57.3% similar) in 356 aa overlap (3-334:22-362)
10 20 30 40
pF1KE9 MGNDSVSYEYGDY-SDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLP
: : ::.::. :: : . : .: : : ::
CCDS14 MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFD--R-AFLP
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KE9 -LYAAIFLVGVPGNAMVAWVAGKVARRRVGA---TWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIAR
::. .::.:. ::. :: : ..:: . . :.:::::::: : :.::. :: :
CCDS14 ALYSLLFLLGLLGNGAVAAVL--LSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 GGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVACG
.: .:. :.. ... ...::..:::: .: : . . . : ..:
CCDS14 --QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 AAWTLALLLTVPSAIYRRLHQEHFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAV
:.: : ::...:. :. :... .: .. . : :. ..... ::: ::...
CCDS14 AVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRT--ALRVLQLVAGFLLPLLVM
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE9 ASCHSALLCW-----AARRCRP--LGTAIVVGFFVCWAPYHLLGLV-----LTVAAPNSA
: :.. .: . :: : : ...::.: .::.::::. :: : . : : .
CCDS14 AYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCG
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KE9 LLARALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRAQLRRSLPAACHWALRESQG-------Q
.:. :. . ::. : ::::.:. . : ...:. . : : : :
CCDS14 RESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVG-VKFRERM-----WMLLLRLGCPNQRGLQ
300 310 320 330 340
320 330
pF1KE9 DESVDSKKSTSHDLVSEMEV
. .:....: . .::
CCDS14 RQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
350 360
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 316 init1: 90 opt: 436 Z-score: 467.6 bits: 95.2 E(32554): 1e-19
Smith-Waterman score: 437; 31.7% identity (57.3% similar) in 356 aa overlap (3-334:69-409)
10 20 30
pF1KE9 MGNDSVSYEYGDY-SDLSDRPVDCLDGACLAI
: : ::.::. :: : . : .
CCDS48 LYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNF
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80
pF1KE9 DPLRVAPLP-LYAAIFLVGVPGNAMVAWVAGKVARRRVGA---TWLLHLAVADLLCCLSL
: : : :: ::. .::.:. ::. :: : ..:: . . :.:::::::: : :.:
CCDS48 D--R-AFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVL--LSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTL
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 PILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQR
:. :: : .: .:. :.. ... ...::..:::: .: : . . .
CCDS48 PLWAVDAAV--QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGP
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 ACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRLHQEHFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLF
: ..: :.: : ::...:. :. :... .: .. . : :. .....
CCDS48 PARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRT--ALRVLQLVA
220 230 240 250 260
210 220 230 240 250
pF1KE9 GFLGPLVAVASCHSALLCW-----AARRCRP--LGTAIVVGFFVCWAPYHLLGLV-----
::: ::...: :.. .: . :: : : ...::.: .::.::::. ::
CCDS48 GFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMD
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 LTVAAPNSALLARALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRAQLRRSLPAACHWALRESQ
: . : : . .:. :. . ::. : ::::.:. . : ...:. . : :
CCDS48 LGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVG-VKFRERM-----WMLLLRL
330 340 350 360 370 380
320 330
pF1KE9 G-------QDESVDSKKSTSHDLVSEMEV
: : . .:....: . .::
CCDS48 GCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
390 400 410
>>CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 (385 aa)
initn: 315 init1: 260 opt: 368 Z-score: 396.5 bits: 81.9 E(32554): 9.2e-16
Smith-Waterman score: 372; 32.0% identity (57.3% similar) in 328 aa overlap (14-326:58-369)
10 20 30 40
pF1KE9 MGNDSVSYEYGDYSDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYA
:: . : : . :. : :..: ::.
CCDS12 ESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDTLELP-DSSRALLLGWVPTRLVP-ALYG
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 AIFLVGVPGNAMVAWVAGKVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYG
...::.:.:... :: . : : .. :..::.:::: :.:: . :: .::.:
CCDS12 LVLVVGLPANGLALWVLATQAPRLPSTMLLMNLAAADLLLALALPPRIAYHLRGQRWPFG
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 AVGCRALPSIILLTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVA---CGAAWT
..:: . . ::.:::::::.: : .::: . . : : ..: : :::
CCDS12 EAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDR-YLALVHPLRARALR--GRRLALGLCMAAWL
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210
pF1KE9 LALLLTVPSAIYRRLHQEHFPARLQC--VVDYGGSSST-ENAVTAIRFLFGFLGPLVAVA
.: :..: .. :. . :. : .. ...: . : : . .: :: ::.:.
CCDS12 MAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQPAFTCLALLGCFL-PLLAML
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KE9 SCHSALLCWAARRCRPLG-----TAIV----VGFFVCWAPYHLLGLVLTVAAPNSALLAR
:..: : : : : ::.: :.::: : .:: :.: . :. . .
CCDS12 LCYGATLHTLAASGRRYGHALRLTAVVLASAVAFFV---PSNLL-LLLHYSDPSPSAWGN
270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 ALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRAQLRRSLPAACHWALRESQGQDESVDSKKSTS
: ..:. .::..:... :. :..: .. :. ...: : ..: :: :
CCDS12 LYGAYVPSLALSTLNSCVDPFIY-YYVSAEFRDKVRAGL---FQRSPG--DTVASKASAE
320 330 340 350 360 370
330
pF1KE9 HDLVSEMEV
CCDS12 GGSRGMGTHSSLLQ
380
>>CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 (358 aa)
initn: 293 init1: 180 opt: 353 Z-score: 381.1 bits: 79.0 E(32554): 6.6e-15
Smith-Waterman score: 382; 31.8% identity (59.2% similar) in 299 aa overlap (47-326:32-320)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 SDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAMVAW-VAG-KVARRR-VGATWL
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CCDS96 SVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAALLGLPGNGFVVWSLAGWRPARGRPLAATLV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]