FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9504, 388 aa
1>>>pF1KE9504 388 - 388 aa - 388 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2563+/-0.000758; mu= 18.1973+/- 0.046
mean_var=101.9745+/-25.182, 0's: 0 Z-trim(110.9): 344 B-trim: 1438 in 2/48
Lambda= 0.127007
statistics sampled from 11362 (11993) to 11362 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 2564 480.2 1.4e-135
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 1462 278.3 8.3e-75
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 1157 222.4 5.3e-58
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 1121 215.8 5.2e-56
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 1060 204.7 1.3e-52
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 934 181.5 1.1e-45
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 871 170.0 3.2e-42
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 861 168.2 1.2e-41
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 861 168.2 1.2e-41
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 861 168.2 1.2e-41
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 861 168.2 1.2e-41
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 861 168.2 1.2e-41
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CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 861 168.2 1.2e-41
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 861 168.2 1.3e-41
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 861 168.3 1.4e-41
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 827 161.9 8.5e-40
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 766 150.7 1.8e-36
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 764 150.3 2.3e-36
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 743 146.4 3.2e-35
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 724 143.0 3.8e-34
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 715 141.3 1.1e-33
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 660 131.4 1.5e-30
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 638 127.3 2.3e-29
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 605 121.3 1.5e-27
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 591 118.6 8.5e-27
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 565 113.9 2.4e-25
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 565 113.9 2.4e-25
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 539 109.1 6.3e-24
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 537 108.7 8e-24
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 534 108.2 1.2e-23
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 534 108.2 1.2e-23
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 532 107.8 1.5e-23
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 532 107.9 1.6e-23
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 526 106.7 3.3e-23
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 524 106.4 4.3e-23
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 524 106.4 4.3e-23
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 513 104.4 1.9e-22
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 508 103.4 3.3e-22
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 506 103.1 4.1e-22
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 500 102.0 9.1e-22
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 500 102.0 9.3e-22
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 495 101.1 1.8e-21
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 493 100.7 2.3e-21
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 492 100.5 2.5e-21
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 483 98.9 7.8e-21
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 483 98.9 7.9e-21
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 483 98.9 8.1e-21
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 482 98.7 9.2e-21
>>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 2564 init1: 2564 opt: 2564 Z-score: 2547.8 bits: 480.2 E(32554): 1.4e-135
Smith-Waterman score: 2564; 99.5% identity (99.5% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSAPSTLPPGGEEGLGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSAPSTLPPGGEEGLGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAALRHWPFGSVLCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAALRHWPFGSVLCR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 IAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPAWSAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKMRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPAWSAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKMRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLVVTSLDATVNHVSLILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS42 VALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLFVTSLDATVNHVSLILS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 YANSCANPILYGFLSDNFRRSFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYYATALKSKGGAGCM
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YANSCANPILYGFLSDNFRRFFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYYATALKSKGGAGCM
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE9 CPPLPCQQEALQPEPGRKRIPLTRTTTF
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CPPLPCQQEALQPEPGRKRIPLTRTTTF
370 380
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 1407 init1: 709 opt: 1462 Z-score: 1456.5 bits: 278.3 E(32554): 8.3e-75
Smith-Waterman score: 1462; 62.9% identity (83.4% similar) in 356 aa overlap (2-354:12-361)
10 20 30 40
pF1KE9 MSAPSTLPPGGEEGLGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAG-MVA
:.:: : . :: :. :.:. :.. ...: . ... : .
CCDS96 MFPNGTASSPSSSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAIL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 IQCIYALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAAL
:. ::..:::::: ::..::.:::::::::::::::.::::.::::.::::::...:. :
CCDS96 ISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 RHWPFGSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLG
::::::..::: :::::..:::::..::::::::::::::::..:: ::::.:::..:::
CCDS96 RHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 VWLASLLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPA--WSAVFVVYTFLLGFLLPVLAI
::. :::: :::..:. : : .::::. :.:: : . ::.::::.:::::: ::
CCDS96 VWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDG-TVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAI
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 GLCYLLIVGKMRAVALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLVVTS
:::.::..::: :::.::::::.:::.::: .:.:::.:::.::::::::::.:. . .
CCDS96 CLCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLVNVFAEQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 LDATVNHVSLILSYANSCANPILYGFLSDNFRRSFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYY
::::...:.::.::::::::::::::::::.:::::.::: .: :::.:::
CCDS96 DDATVSQLSVILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRILCLS-----WMDNAAEEPVDYY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KE9 ATALKSKGGAGCMCPPLPCQQEALQPEPGRKRIPLTRTTTF
::::::.
CCDS96 ATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
360 370 380 390
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
initn: 765 init1: 765 opt: 1157 Z-score: 1154.8 bits: 222.4 E(32554): 5.3e-58
Smith-Waterman score: 1157; 50.6% identity (78.4% similar) in 352 aa overlap (18-363:11-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MSAPSTLPPGGEEGLGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLV
.: ... .... . .....::. . .: : . .: ::: .
CCDS10 MEPLFPASTPSWNASSPGAASGGGDNRTLVGPAPSAGARAVLVPVLYLLVCAA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAALRHWPFGSVLCR
:: ::.:::.:.::.:::::.::::.::::::: :.::..::.:.. : :::: ::::
CCDS10 GLGGNTLVIYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAASFWPFGPVLCR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLP
:...::.:.:::::::::.:::::.:::::: .: .::: :::: . ..:. :: ..::
CCDS10 LVMTLDGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPRVAKLASAAAWVLSLCMSLP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE9 IAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPA--WSAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKM
. .:::.. .:: .:: .::.:. :.:::..:: .:::. :.:.: ::::::: :.
CCDS10 LLVFADVQ--EGG---TCNASWPEPVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIVVKV
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RAVALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLVVT----SLDATVNH
::...:.: :::::.:.::.::.::.::. ::.::..:...::.:. .: .
CCDS10 RAAGVRVG-CVRRRSERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALPQEPASAGLYF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 VSLILSYANSCANPILYGFLSDNFRRSFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYYATALKSK
.:::::::::::.::::::::::.:::.::::: .:.:. . . . ....
CCDS10 FVVILSYANSCANPVLYGFLSDNFRQSFQKVLCLR----KGSGAKDADATEPRPDRIRQQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380
pF1KE9 GGAGCMCPPLPCQQEALQPEPGRKRIPLTRTTTF
: ::
CCDS10 QEA---TPPAHRAAANGLMQTSKL
350 360
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
initn: 1100 init1: 644 opt: 1121 Z-score: 1119.1 bits: 215.8 E(32554): 5.2e-56
Smith-Waterman score: 1121; 55.7% identity (85.1% similar) in 282 aa overlap (53-328:49-329)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 ANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTAT
:: .::..:: ::.:::.:::::::::: :
CCDS11 FDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCGNTLVIYVILRYAKMKTIT
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 NIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAALRHWPFGSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSV
:::.::::.:::::::..::.: ..:: :::::...::.:..:::.:.:::.:::::.:.
CCDS11 NIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSI
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 DRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACNLQW
:::.:::::...: .::: .::.:...:: .:::: ::: :.: : . :.. .:...:
CCDS11 DRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIYAGLRSNQWGRS-SCTINW
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 PHP--AWSAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKMRAVALRAGWQQRRRSEKKITRL
: :: . :..:::.::::.:. : ::::.:. :... ..:.: ..:..::::.::.
CCDS11 PGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRM
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310
pF1KE9 VLMVVVVFVLCWMPFYV--VQLLNLVVTSLDATVNHVSLI--LSYANSCANPILYGFLSD
: .::.::..::.:::. :. ...... : . ... :.:::::::::::.::::
CCDS11 VSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSD
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KE9 NFRRSFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYYATALKSKGGAGCMCPPLPCQQEALQPEPG
::..::: ::::
CCDS11 NFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNETTETQRTLLNGDLQTSI
320 330 340 350 360
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 949 init1: 577 opt: 1060 Z-score: 1058.0 bits: 204.7 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 1069; 50.3% identity (76.5% similar) in 340 aa overlap (1-326:3-328)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MSAPSTLPPGGE-EGLGTAWPSAA---NASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIY
: ::.. .: :. ..::: : :.:..:. : ::.: : : .:
CCDS13 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSG---------VLIPLVY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 ALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAALRHWPF
.::.:::.::.:::.:.::.. ..::.:.::::.:::::::..::.:.. :: .:::
CCDS13 LVVCVVGLLGNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 GSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLAS
::..:: :..:::.:.:::.:::::.:::::.::::: :.: .: ::. .. .::.::
CCDS13 GSLMCRLVMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVAS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 LLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPA--WSAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYL
.:.::...:. . : :: .. :..:::.:: : : :..:: :::. :.:.: ::::
CCDS13 AVVVLPVVVFSGV-P-RGMST--CHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYL
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE9 LIVGKMRAVALRAGW----QQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLV--VT
::: :.:... :. : :.:::::...::.:. ::..::::::::::....:.: .
CCDS13 LIVVKVRSAGRRV-WAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 SLDATVNHVSLI--LSYANSCANPILYGFLSDNFRRSFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPL
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CCDS13 EEPAFFGLYFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPE
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380
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CCDS13 KTEEEDEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEAST
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10 20 30 40 50
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CCDS32 MEPAPSAGAELQPPLFANASDAYPSACPSAGANA------SGPPGARSASSLALAIAITA
10 20 30 40 50
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CCDS32 LYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
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CCDS32 PFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWV
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CCDS32 LASGVGVPIMVMAVTRP-RDG-AVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVC
180 190 200 210 220 230
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CCDS32 YGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDIDRR
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290 300 310 320 330 340
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CCDS32 DPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCF-RQLCRKPCGRPDPSSFSRAREA
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350 360 370 380
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CCDS32 TARERVTACTPSDGPGGGAAA
360 370
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50 60 70 80 90 100
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CCDS61 PAIPVIITAVYSVVFVVGLVGNSLVMFVIIRYTKMKTATNIYIFNLALADALVTTTMPFQ
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CCDS61 STVYLMNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPLKA
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170 180 190 200 210 220
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CCDS61 KIINICIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVIECSLQFPDDDYSWWDLFMKICVFIFAF
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CCDS61 VIPVLIIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCWTPIHIFIL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
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CCDS61 VEALGSTSHSTAALSSYYFCIALGYTNSSLNPILYAFLDENFKRCF-RDFCFPLKMRMER
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
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CCDS61 QSTSRVRNTVQDPAYLRDIDGMNKPV
360 370 380
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130 140 150 160 170 180
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CCDS55 MFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKY
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190 200 210 220 230 240
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CCDS55 RQG--SIDCTLTFSHPTWYWENLLKICVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGS
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250 260 270 280 290 300
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CCDS55 KEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTN
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CCDS55 SCLNPVLYAFLDENFKRCF-REFCIPTSSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQS
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10 20 30 40 50 60
pF1KE9 GGEEGLGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLVGLVGNALVI
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CCDS47 NLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCPPTGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVM
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70 80 90 100 110 120
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CCDS47 YVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYN
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pF1KE9 MFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLPIAIFADTRP
::::.: : ..:::::.:: ::..: .: : ::.::. :. : . ::. ..: :.
CCDS47 MFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKY
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190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ARGGQAVACNLQWPHPAW--SAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKMRAVALRAGW
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CCDS47 RQG--SIDCTLTFSHPTWYWENLLKICVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGS
220 230 240 250 260 270
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CCDS47 KEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTN
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CCDS47 SCLNPVLYAFLDENFKRCF-REFCIPTSSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQV
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10 20 30 40 50 60
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CCDS47 NLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCPPTGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVM
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CCDS47 YVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYN
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130 140 150 160 170 180
pF1KE9 MFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLPIAIFADTRP
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CCDS47 MFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKY
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ARGGQAVACNLQWPHPAW--SAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKMRAVALRAGW
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CCDS47 RQG--SIDCTLTFSHPTWYWENLLKICVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGS
220 230 240 250 260 270
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pF1KE9 QQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLVVTSLDATVNHVS----LILSYAN
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CCDS47 KEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTN
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 SCANPILYGFLSDNFRRSFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYYATALKSKGGAGCMCPP
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CCDS47 SCLNPVLYAFLDENFKRCF-REFCIPTSSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQR
340 350 360 370 380
388 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 10:58:58 2016 done: Sun Nov 6 10:58:59 2016
Total Scan time: 2.690 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]