Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9503
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9503, 384 aa
1>>>pF1KE9503 384 - 384 aa - 384 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4077+/-0.000827; mu= 16.6186+/- 0.049
mean_var=151.1898+/-54.559, 0's: 0 Z-trim(108.8): 155 B-trim: 1398 in 2/46
Lambda= 0.104307
statistics sampled from 10210 (10479) to 10210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 2540 394.5 8.3e-110
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 852 140.5 2.4e-33
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 828 136.9 3e-32
CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 691 116.2 4.5e-26
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 622 105.8 6e-23
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 610 104.1 2.3e-22
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 566 97.4 2.1e-20
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 552 95.3 9e-20
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 384 70.0 3.5e-12
CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 ( 360) 374 68.5 1.1e-11
>>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa)
initn: 2540 init1: 2540 opt: 2540 Z-score: 2084.9 bits: 394.5 E(32554): 8.3e-110
Smith-Waterman score: 2540; 100.0% identity (100.0% similar) in 384 aa overlap (1-384:1-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV
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CCDS12 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP
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CCDS12 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 AARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 AVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDS
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE9 FRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
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CCDS12 FRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
370 380
>>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa)
initn: 822 init1: 418 opt: 852 Z-score: 712.1 bits: 140.5 E(32554): 2.4e-33
Smith-Waterman score: 858; 42.8% identity (69.0% similar) in 348 aa overlap (28-375:21-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV
::.. :.:::: . : : .. ..
CCDS66 MATALPPRLQPVRGNETLREHYQYVGKLAGRLKEASEGSTLTTVLFLVICSFI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL
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CCDS66 VLENLMVLIAIWKNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLSPTVWFL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP
::: .:.::.::: ::: : :: ::.. . :.: ::. .::.:::.: :: ::
CCDS66 REGSMFVALGASTCSLLAIAIERHLTMIK-MRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFTLGALP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRP
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CCDS66 ILGWNCLHNLPDCSTILPLYSKKYIAFCISIFTAILVTIVILYARIYFLVKSSSRKVANH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 AARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNS
... ::.::.... .:..::.::: :.: :: . . : : .:...::::::
CCDS66 NNSERSMALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLIDV-ACRVQACPILFKAQWFIVLAVLNS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 AVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDS
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CCDS66 AMNPVIYTLASKEMRRAFFR-LVCNCL---VRGRG---ARASPIQPA---LDPS-RSKSS
300 310 320 330 340
370 380
pF1KE9 FRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
.. : : ...: :
CCDS66 SSNNSSHSPKVKEDLPHTAPSSCIMDKNAALQNGIFCN
350 360 370
>>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 722 init1: 333 opt: 828 Z-score: 692.6 bits: 136.9 E(32554): 3e-32
Smith-Waterman score: 828; 41.0% identity (72.8% similar) in 334 aa overlap (1-326:1-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV
:. :..:.. .... . .:: :::..:.: . :.. . . . :..
CCDS77 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENS-IKLTSVVFILICCFI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL
.:::..:: .: . . .: .:: . :..:::::.:.:: ::.::::: :..:.::::::
CCDS77 ILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP
::: .:.::.::.:::: : ::. ::.. ..: ... :.. .:. ::... .:: ::
CCDS77 REGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNG-SNNFRLFLLISACWVISLILGGLP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE9 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQ-----
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CCDS77 IMGWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 KAPRPAAR--RKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWIL
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CCDS77 KNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDV-GCKVKTCDILFRAEYFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFL-CCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTD
.::::::..:::::.. ..:. :: . .. :: :
CCDS77 VLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDN
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE9 SSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
CCDS77 SSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
360 370 380
>>CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 (353 aa)
initn: 653 init1: 277 opt: 691 Z-score: 581.5 bits: 116.2 E(32554): 4.5e-26
Smith-Waterman score: 691; 41.8% identity (70.4% similar) in 280 aa overlap (54-333:41-314)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 LIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLVVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYY
: : .:.:::::: :.. . . . .:
CCDS12 PNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVVENLLVLIAVARNSKFHSAMYL
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 CLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGER
: :.. ::::.:.:..::.::::. :.::.:.::: ::: : .:.::.:::: : ::
CCDS12 FLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASVFSLLAIAIER
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 FATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKR
..... : :. :. :. .:: ::.. .:: ::.:::::: .. ::..::::.:.
CCDS12 HVAIAK-VKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACSTVLPLYAKH
140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 YILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVC
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CCDS12 YVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAAP----QTLALLKTVTIVLGVFIVC
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 WGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLC
: : :..:: : .. . . : ...:...::: .::.::..:::.. : :: :
CCDS12 WLPAFSILLLD-YACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVLRPLQ
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 CGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRS
: .:..:
CCDS12 CWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTSPTFLEGNTVV
310 320 330 340 350
>>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 588 init1: 233 opt: 622 Z-score: 525.4 bits: 105.8 E(32554): 6e-23
Smith-Waterman score: 622; 39.0% identity (64.0% similar) in 336 aa overlap (21-350:9-335)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGR-LAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCL
... : . ::.::. :... :.: . :: ::.: : :
CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVAL-GLTV--SVL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWF
:.: ::::.:::.:. : .. .:: : :.. .::..:.::: .. .: :: ::. ::
CCDS12 VLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGML
::.::: :.:.::. .:: : :: . : : . .:: .: :. : ::.:
CCDS12 LRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRS-VMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 PLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYI----LFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQ
: .:.::::.:::: . :: :. :. : :..: ..:. .. . : :: ..
CCDS12 PAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 KAP-RPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILA
.. .: :. . :.:::..:: ::.::: : .:: : .: . . . : ..:
CCDS12 HVSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCE--SCNVLAVEKYFLL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSS
:: :: :: .:: :. :. :. .:::.::: . : . . . :..::::
CCDS12 LAEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTR---ESVHYTSSAQGGASTRIML
290 300 310 320 330
360 370 380
pF1KE9 LRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
CCDS12 PENGHPLMDSTL
340 350
>>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa)
initn: 816 init1: 346 opt: 610 Z-score: 515.1 bits: 104.1 E(32554): 2.3e-22
Smith-Waterman score: 824; 42.7% identity (67.1% similar) in 377 aa overlap (22-383:12-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV
:..::::::..:.: : .:: : . .:. ..
CCDS12 MESGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVCLAVCAFI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL
::::: :: .. : : . .. : ..::::::.:::: ::.:::: :..:.:: ::
CCDS12 VLENLAVLLVLGRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSPALWFA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP
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CCDS12 REGGVFVALTASVLSLLAIALERSLTMARR-GPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLLGLLP
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE9 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAP-R
:::::: .: ::..::::.: :.:::.. :.:.::.: .::. :. :.:.... : :
CCDS12 ALGWNCLGRLDACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARRLPAR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE9 PA--------ARRKARRL--LKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGM
:. :::: : : :.:. ..::::..:::::: ::: :: . . :
CCDS12 PGTAGTTSTRARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLDV-ACPARTCPVLLQA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 DWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCL--ARAVEAHSG
: .:.::. :: .:::::.. .:.. .:.: ..::: : : :. : :.:: .:
CCDS12 DPFLGLAMANSLLNPIIYTLTNRDLRHALLRLVCCGRHSCG-RDPSGSQQSASAAEASGG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KE9 ASTTDSSLRP--RDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
: : :: ::. : .:. :.. .:. :
CCDS12 LRRC---LPPGLDGSFSGSERSS-PQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD
350 360 370 380 390
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 578 init1: 210 opt: 566 Z-score: 479.7 bits: 97.4 E(32554): 2.1e-20
Smith-Waterman score: 566; 35.0% identity (63.5% similar) in 337 aa overlap (1-324:1-328)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGG-----HSRLIVLHYNHSGR-LAGRGGPEDGGLGAL-RGLS
: : .: . : :..: . ... :.. ::.::. :: : . .. : ::.
CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLA----TEWNTVSKLVMGLG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VAASCLVVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRL
... ...: ::::..:: . : . .:: ..:.. .:...: ::. .. .: : ::
CCDS67 ITVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 APAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLA
. . :.::.::. :.:.::. .:: : :: :. : .. .. :: : . : .:
CCDS67 TVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNR-RVVVVIVVIWTMA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 ALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMG-LYGAIFRLVQA
..: .: .::::.: .. ::.. :::: :..: .:: : ..: ::. :: :.
CCDS67 IVMGAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE9 SGQKAPRPAAR-RKAR----RLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLR
.. : .. :. : :::::...: ::..:: : . ::: :: . . : .
CCDS67 RTMRMSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVLAYEK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 GMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSG
..: :: .:::.::::::.:..:. . ..:::
CCDS67 ---FFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
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CCDS67 ILAGVHSNDHSVV
360
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30 40 50 60 70 80
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:: .. : ::.::. .. . . :: :.
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:.. .:...: ::. .. .: . :. .::::.::: ..:.:: .:: : :: .
CCDS70 NLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMS
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..: ..:. :: .:: .: : : .: ..: .: ::::::: .. :::: :.::. :..
CCDS70 IMRMRVHSNLTK-KRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLV
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CCDS70 FWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFV
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270 280 290 300 310 320
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CCDS70 VCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVK--RWFLLLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKM
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.::
CCDS70 ICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
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: ..:.:.: :.::. . .. . : : :: . : . .. .:. .
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. :: :: ::.: :.. : .. . .....:::.: . ..: : .: .. :
CCDS30 GTLVSCENALVVAIIVGTPAFRAPMFLLVGSLAVADLLAGLG----LVLHFAAVFCIGSA
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. : :.: :..:: ::: . .:. .. .. . : ..:.: ...: : :
CCDS30 EMSLVLVGVLAMAFTASIGSLLAITVDRYLSLYNALTYYSETTVTRTYVMLALVWGGALG
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::.::.:.:::: .. :. . :: :: ... . : :.. .. ::. : :.:
CCDS30 LGLLPVLAWNCLDGLTTCGVVYPL-SKNHLVVLAIAFFMVFGIMLQLYAQICRIVCRHAQ
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CCDS30 QIALQRHLLPASHYVATRKGIATLAVVLGAFAACWLPFTVYCLLGDAHSPPLYT--YLT-
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 MDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGC----LRLGMRGPGDCLARAVEA
: :. :: .:::::.::...: . :: .:: : . . :.:.:
CCDS30 ----LLPATYNSMINPIIYAFRNQDV-QKVLWAVCCCCSSSKIPFRSRSPSDV
290 300 310 320 330
350 360 370 380
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10 20 30 40 50 60
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::. ....: : . : .:::. ::
CCDS24 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTL---LGLLSALENVAVLY
10 20 30 40 50
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pF1KE9 AITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGART-FRL-----APAQWFLREG
: : . :: : ... :.:: .::.:... . . :.. . : ..:. :
CCDS24 LILSSHQLRRKPSYLFIGS-----LAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIG
60 70 80 90 100 110
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. ...::. :::.:: .:. . : . .. .:. .:. :.:.::...:::.:
CCDS24 SVTMTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMG
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CCDS24 WTC-CPRP-CSELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLSGHQDR
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CCDS24 QVPGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALM-AHSLATTL-SDQVKKAFAFCSML
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CCDS24 KITPWPDSRDLDLSDC
350 360
384 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 13:34:39 2016 done: Sun Nov 6 13:34:40 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]